MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 40435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005362	TAAAAG	2	12	75052	75063	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	42518139
1502	NC_005362	A	6	6	75169	75174	100 %	0 %	0 %	0 %	42518139
1503	NC_005362	ATGCA	2	10	75244	75253	40 %	20 %	20 %	20 %	42518139
1504	NC_005362	TTGGTT	2	12	75292	75303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518139
1505	NC_005362	GAAA	2	8	75335	75342	75 %	0 %	25 %	0 %	42518139
1506	NC_005362	ATT	2	6	75408	75413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518139
1507	NC_005362	ATT	2	6	75461	75466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518139
1508	NC_005362	ACG	2	6	75504	75509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518139
1509	NC_005362	ATTT	2	8	75515	75522	25 %	75 %	0 %	0 %	42518139
1510	NC_005362	TAA	3	9	75571	75579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518139
1511	NC_005362	AAATT	2	10	75582	75591	60 %	40 %	0 %	0 %	42518139
1512	NC_005362	ATT	2	6	75689	75694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518140
1513	NC_005362	GGT	2	6	75767	75772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518140
1514	NC_005362	TGG	2	6	75775	75780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518140
1515	NC_005362	TGC	2	6	75802	75807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518140
1516	NC_005362	TATG	2	8	75847	75854	25 %	50 %	25 %	0 %	42518140
1517	NC_005362	AAG	2	6	75911	75916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518140
1518	NC_005362	CTT	2	6	75934	75939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518140
1519	NC_005362	TGA	2	6	75949	75954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518140
1520	NC_005362	GGC	2	6	76007	76012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42518140
1521	NC_005362	ATT	2	6	76064	76069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518140
1522	NC_005362	TGA	2	6	76081	76086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518140
1523	NC_005362	TGA	2	6	76090	76095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518140
1524	NC_005362	AGA	3	9	76115	76123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518140
1525	NC_005362	AAG	2	6	76125	76130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518140
1526	NC_005362	TTC	2	6	76131	76136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518140
1527	NC_005362	CATG	2	8	76156	76163	25 %	25 %	25 %	25 %	42518140
1528	NC_005362	AAT	2	6	76175	76180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518140
1529	NC_005362	GAT	2	6	76205	76210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518140
1530	NC_005362	TTG	2	6	76233	76238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518140
1531	NC_005362	TGG	2	6	76279	76284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518140
1532	NC_005362	TTA	2	6	76326	76331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518140
1533	NC_005362	TAC	2	6	76474	76479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518140
1534	NC_005362	CAC	3	9	76493	76501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518140
1535	NC_005362	TAC	2	6	76523	76528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518140
1536	NC_005362	ATG	2	6	76704	76709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518141
1537	NC_005362	ATA	2	6	76717	76722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518141
1538	NC_005362	ATT	2	6	76733	76738	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518141
1539	NC_005362	GCT	2	6	76740	76745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518141
1540	NC_005362	GCT	2	6	76776	76781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518141
1541	NC_005362	TAA	2	6	76790	76795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518141
1542	NC_005362	TCA	2	6	76800	76805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518141
1543	NC_005362	A	6	6	76829	76834	100 %	0 %	0 %	0 %	42518141
1544	NC_005362	A	6	6	76874	76879	100 %	0 %	0 %	0 %	42518141
1545	NC_005362	TGA	2	6	76922	76927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518141
1546	NC_005362	CAAT	2	8	77032	77039	50 %	25 %	0 %	25 %	42518141
1547	NC_005362	TTTAGA	2	12	77108	77119	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42518141
1548	NC_005362	AAG	2	6	77137	77142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518141
1549	NC_005362	A	6	6	77168	77173	100 %	0 %	0 %	0 %	42518141
1550	NC_005362	A	6	6	77283	77288	100 %	0 %	0 %	0 %	42518141
1551	NC_005362	AGA	3	9	77300	77308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518141
1552	NC_005362	ATTA	2	8	77311	77318	50 %	50 %	0 %	0 %	42518141
1553	NC_005362	ATC	2	6	77501	77506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518142
1554	NC_005362	ATC	2	6	77531	77536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518142
1555	NC_005362	AGT	2	6	77548	77553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518142
1556	NC_005362	AGA	2	6	77567	77572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518142
1557	NC_005362	CCTTG	2	10	77602	77611	0 %	40 %	20 %	40 %	42518142
1558	NC_005362	TAAG	2	8	77714	77721	50 %	25 %	25 %	0 %	42518142
1559	NC_005362	TCA	2	6	77916	77921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518142
1560	NC_005362	CAA	2	6	77953	77958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518142
1561	NC_005362	TCACTA	2	12	77970	77981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518142
1562	NC_005362	ATG	2	6	78010	78015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518142
1563	NC_005362	TTCA	2	8	78026	78033	25 %	50 %	0 %	25 %	42518142
1564	NC_005362	AAG	2	6	78112	78117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518142
1565	NC_005362	ATG	2	6	78220	78225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518142
1566	NC_005362	TAG	2	6	78268	78273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518142
1567	NC_005362	TAA	3	9	78319	78327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518142
1568	NC_005362	ATC	2	6	78386	78391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518142
1569	NC_005362	CCT	2	6	78426	78431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42518143
1570	NC_005362	TGC	2	6	78449	78454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518143
1571	NC_005362	AT	3	6	78465	78470	50 %	50 %	0 %	0 %	42518143
1572	NC_005362	ATA	2	6	78513	78518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518143
1573	NC_005362	CAA	2	6	78529	78534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518143
1574	NC_005362	TAA	2	6	78580	78585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518143
1575	NC_005362	ATAGC	2	10	78735	78744	40 %	20 %	20 %	20 %	42518143
1576	NC_005362	CAG	2	6	78751	78756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518143
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1578	NC_005362	ATC	2	6	78798	78803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518143
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1580	NC_005362	ACC	2	6	78878	78883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518143
1581	NC_005362	CAAC	2	8	78903	78910	50 %	0 %	0 %	50 %	42518143
1582	NC_005362	AAAG	2	8	78945	78952	75 %	0 %	25 %	0 %	42518143
1583	NC_005362	AAGG	2	8	78962	78969	50 %	0 %	50 %	0 %	42518143
1584	NC_005362	AAG	2	6	79014	79019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518143
1585	NC_005362	CATTT	2	10	79041	79050	20 %	60 %	0 %	20 %	42518143
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1587	NC_005362	TTC	2	6	79127	79132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518143
1588	NC_005362	TCTT	2	8	79152	79159	0 %	75 %	0 %	25 %	42518143
1589	NC_005362	TAA	2	6	79199	79204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518143
1590	NC_005362	GCTG	2	8	79296	79303	0 %	25 %	50 %	25 %	42518143
1591	NC_005362	ACC	2	6	79325	79330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518143
1592	NC_005362	TAA	2	6	79384	79389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518143
1593	NC_005362	AACC	2	8	79423	79430	50 %	0 %	0 %	50 %	42518143
1594	NC_005362	ACCAAT	2	12	79508	79519	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	42518143
1595	NC_005362	ACAT	2	8	79711	79718	50 %	25 %	0 %	25 %	42518143
1596	NC_005362	TAC	2	6	79751	79756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518143
1597	NC_005362	TAG	2	6	79765	79770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518143
1598	NC_005362	ATA	2	6	79823	79828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518144
1599	NC_005362	T	7	7	79850	79856	0 %	100 %	0 %	0 %	42518144
1600	NC_005362	TTTAAT	2	12	79864	79875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518144
1601	NC_005362	TAA	2	6	79888	79893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518144
1602	NC_005362	CAA	2	6	79908	79913	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518144
1603	NC_005362	ACC	2	6	79926	79931	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518144
1604	NC_005362	TGA	2	6	79959	79964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518144
1605	NC_005362	GCCCA	2	10	80117	80126	20 %	0 %	20 %	60 %	42518144
1606	NC_005362	ATC	3	9	80177	80185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518144
1607	NC_005362	CCG	2	6	80258	80263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42518144
1608	NC_005362	ATA	2	6	80276	80281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518144
1609	NC_005362	GCA	2	6	80348	80353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518144
1610	NC_005362	AGCC	2	8	80371	80378	25 %	0 %	25 %	50 %	42518144
1611	NC_005362	AAT	2	6	80386	80391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518144
1612	NC_005362	A	6	6	80393	80398	100 %	0 %	0 %	0 %	42518144
1613	NC_005362	GAA	2	6	80430	80435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518144
1614	NC_005362	CTT	2	6	80436	80441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518144
1615	NC_005362	T	8	8	80470	80477	0 %	100 %	0 %	0 %	42518144
1616	NC_005362	AGC	2	6	80479	80484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518144
1617	NC_005362	CTT	2	6	80505	80510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518144
1618	NC_005362	TCTT	2	8	80531	80538	0 %	75 %	0 %	25 %	42518144
1619	NC_005362	TAA	2	6	80547	80552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518144
1620	NC_005362	AAT	2	6	80560	80565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518144
1621	NC_005362	CAA	2	6	80571	80576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518144
1622	NC_005362	GAA	2	6	80599	80604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518144
1623	NC_005362	TGAT	2	8	80759	80766	25 %	50 %	25 %	0 %	42518144
1624	NC_005362	AAT	2	6	80815	80820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518144
1625	NC_005362	CTG	2	6	80877	80882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518144
1626	NC_005362	ACCA	2	8	80938	80945	50 %	0 %	0 %	50 %	42518144
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