MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 40435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005362	TCA	2	6	24876	24881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518105
502	NC_005362	TAAA	2	8	24888	24895	75 %	25 %	0 %	0 %	42518105
503	NC_005362	AAT	2	6	24909	24914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518105
504	NC_005362	TGA	2	6	24961	24966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518105
505	NC_005362	TTTA	2	8	24980	24987	25 %	75 %	0 %	0 %	42518105
506	NC_005362	AATT	2	8	25019	25026	50 %	50 %	0 %	0 %	42518105
507	NC_005362	TA	4	8	25028	25035	50 %	50 %	0 %	0 %	42518105
508	NC_005362	TA	4	8	25062	25069	50 %	50 %	0 %	0 %	42518105
509	NC_005362	T	7	7	25070	25076	0 %	100 %	0 %	0 %	42518105
510	NC_005362	TTA	2	6	25101	25106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518105
511	NC_005362	A	6	6	25106	25111	100 %	0 %	0 %	0 %	42518105
512	NC_005362	AATA	2	8	25115	25122	75 %	25 %	0 %	0 %	42518105
513	NC_005362	TAT	2	6	25130	25135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518105
514	NC_005362	TTCATC	2	12	25136	25147	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	42518105
515	NC_005362	ATT	2	6	25154	25159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518105
516	NC_005362	AT	3	6	25192	25197	50 %	50 %	0 %	0 %	42518105
517	NC_005362	TGATG	2	10	25198	25207	20 %	40 %	40 %	0 %	42518105
518	NC_005362	TAT	2	6	25249	25254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518105
519	NC_005362	ATT	2	6	25362	25367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518105
520	NC_005362	GTA	2	6	25675	25680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518106
521	NC_005362	ATC	2	6	25681	25686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518106
522	NC_005362	T	6	6	25763	25768	0 %	100 %	0 %	0 %	42518106
523	NC_005362	TAAA	2	8	25771	25778	75 %	25 %	0 %	0 %	42518106
524	NC_005362	A	7	7	25776	25782	100 %	0 %	0 %	0 %	42518106
525	NC_005362	ATG	2	6	25786	25791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518106
526	NC_005362	A	7	7	25810	25816	100 %	0 %	0 %	0 %	42518106
527	NC_005362	TAA	2	6	25823	25828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518106
528	NC_005362	TAATT	2	10	25856	25865	40 %	60 %	0 %	0 %	42518106
529	NC_005362	GAT	2	6	25896	25901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518106
530	NC_005362	TAC	2	6	25976	25981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518106
531	NC_005362	AATT	2	8	26059	26066	50 %	50 %	0 %	0 %	42518106
532	NC_005362	A	6	6	26083	26088	100 %	0 %	0 %	0 %	42518106
533	NC_005362	TTTA	2	8	26108	26115	25 %	75 %	0 %	0 %	42518106
534	NC_005362	GA	3	6	26169	26174	50 %	0 %	50 %	0 %	42518106
535	NC_005362	AAT	2	6	26175	26180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518106
536	NC_005362	AAG	2	6	26218	26223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518106
537	NC_005362	ATA	2	6	26230	26235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518106
538	NC_005362	TA	3	6	26388	26393	50 %	50 %	0 %	0 %	42518106
539	NC_005362	TGA	2	6	26441	26446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518106
540	NC_005362	AGA	2	6	26480	26485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518106
541	NC_005362	TAA	2	6	26498	26503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518106
542	NC_005362	AAT	2	6	26526	26531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518106
543	NC_005362	TGC	2	6	26537	26542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518106
544	NC_005362	ATT	2	6	26562	26567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518106
545	NC_005362	AAGA	2	8	26725	26732	75 %	0 %	25 %	0 %	42518107
546	NC_005362	ATA	2	6	26735	26740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518107
547	NC_005362	AAC	2	6	26764	26769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518107
548	NC_005362	CAT	2	6	26803	26808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518107
549	NC_005362	ATT	2	6	26809	26814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518107
550	NC_005362	CTTT	2	8	26825	26832	0 %	75 %	0 %	25 %	42518107
551	NC_005362	ATG	2	6	26843	26848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518107
552	NC_005362	TATT	2	8	26874	26881	25 %	75 %	0 %	0 %	42518107
553	NC_005362	A	7	7	26920	26926	100 %	0 %	0 %	0 %	42518107
554	NC_005362	TAA	3	9	26955	26963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518107
555	NC_005362	TGGA	2	8	26999	27006	25 %	25 %	50 %	0 %	42518107
556	NC_005362	ATA	2	6	27068	27073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518107
557	NC_005362	A	7	7	27082	27088	100 %	0 %	0 %	0 %	42518107
558	NC_005362	ATA	2	6	27090	27095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518107
559	NC_005362	A	6	6	27095	27100	100 %	0 %	0 %	0 %	42518107
560	NC_005362	TATTAG	2	12	27118	27129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42518107
561	NC_005362	CTT	2	6	27155	27160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518107
562	NC_005362	TAT	2	6	27185	27190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518107
563	NC_005362	TAT	2	6	27209	27214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518107
564	NC_005362	ATTGG	2	10	27221	27230	20 %	40 %	40 %	0 %	42518107
565	NC_005362	ATA	2	6	27291	27296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518107
566	NC_005362	ATG	2	6	27362	27367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518107
567	NC_005362	T	6	6	27392	27397	0 %	100 %	0 %	0 %	42518107
568	NC_005362	TATT	2	8	27461	27468	25 %	75 %	0 %	0 %	42518107
569	NC_005362	AT	3	6	27469	27474	50 %	50 %	0 %	0 %	42518107
570	NC_005362	TAA	2	6	27486	27491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518107
571	NC_005362	A	8	8	27524	27531	100 %	0 %	0 %	0 %	42518107
572	NC_005362	TAAAA	2	10	27532	27541	80 %	20 %	0 %	0 %	42518107
573	NC_005362	ATT	2	6	27542	27547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518107
574	NC_005362	TAG	2	6	27561	27566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518107
575	NC_005362	TAT	2	6	27567	27572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518107
576	NC_005362	T	7	7	27588	27594	0 %	100 %	0 %	0 %	42518107
577	NC_005362	TTA	2	6	27607	27612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518107
578	NC_005362	ATT	2	6	27663	27668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518107
579	NC_005362	ATGTT	2	10	27672	27681	20 %	60 %	20 %	0 %	42518107
580	NC_005362	AGAA	2	8	27700	27707	75 %	0 %	25 %	0 %	42518107
581	NC_005362	CAT	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518107
582	NC_005362	GTA	2	6	27767	27772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518107
583	NC_005362	AACTA	2	10	27787	27796	60 %	20 %	0 %	20 %	42518107
584	NC_005362	TGT	2	6	27808	27813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518107
585	NC_005362	ATT	2	6	27889	27894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518107
586	NC_005362	ATT	2	6	28308	28313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518108
587	NC_005362	GTA	2	6	28353	28358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518108
588	NC_005362	TAA	2	6	28391	28396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518108
589	NC_005362	GTCC	2	8	28454	28461	0 %	25 %	25 %	50 %	42518108
590	NC_005362	GAC	2	6	28469	28474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518108
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592	NC_005362	AT	3	6	28537	28542	50 %	50 %	0 %	0 %	42518108
593	NC_005362	AAT	2	6	28581	28586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518108
594	NC_005362	TAA	2	6	28607	28612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518108
595	NC_005362	AAAC	2	8	28635	28642	75 %	0 %	0 %	25 %	42518108
596	NC_005362	CTTT	2	8	28697	28704	0 %	75 %	0 %	25 %	42518108
597	NC_005362	GAA	2	6	28835	28840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518108
598	NC_005362	ATG	2	6	28888	28893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518108
599	NC_005362	AGCCC	2	10	28932	28941	20 %	0 %	20 %	60 %	42518108
600	NC_005362	AATT	2	8	29143	29150	50 %	50 %	0 %	0 %	42518109
601	NC_005362	TGA	2	6	29159	29164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518109
602	NC_005362	TGC	2	6	29180	29185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518109
603	NC_005362	TGCA	2	8	29203	29210	25 %	25 %	25 %	25 %	42518109
604	NC_005362	CT	3	6	29233	29238	0 %	50 %	0 %	50 %	42518109
605	NC_005362	GAA	2	6	29316	29321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518109
606	NC_005362	TTA	2	6	29347	29352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518109
607	NC_005362	ATGA	2	8	29391	29398	50 %	25 %	25 %	0 %	42518109
608	NC_005362	TCA	2	6	29423	29428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518109
609	NC_005362	A	6	6	29466	29471	100 %	0 %	0 %	0 %	42518109
610	NC_005362	ACT	2	6	29551	29556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518109
611	NC_005362	TTGAT	2	10	29557	29566	20 %	60 %	20 %	0 %	42518109
612	NC_005362	GAA	2	6	29577	29582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518109
613	NC_005362	ATT	2	6	29587	29592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518109
614	NC_005362	ATT	2	6	29617	29622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518109
615	NC_005362	GGAT	2	8	29669	29676	25 %	25 %	50 %	0 %	42518109
616	NC_005362	TCACCG	2	12	29732	29743	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	42518109
617	NC_005362	ATA	2	6	29749	29754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518109
618	NC_005362	AAG	2	6	29823	29828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518109
619	NC_005362	TATT	2	8	29869	29876	25 %	75 %	0 %	0 %	42518110
620	NC_005362	ACCA	2	8	29887	29894	50 %	0 %	0 %	50 %	42518110
621	NC_005362	GCC	2	6	29899	29904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42518110
622	NC_005362	TTC	2	6	29905	29910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518110
623	NC_005362	TTTC	2	8	29982	29989	0 %	75 %	0 %	25 %	42518110
624	NC_005362	ATC	2	6	30064	30069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518110
625	NC_005362	TCT	2	6	30079	30084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518110
626	NC_005362	CTT	2	6	30088	30093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518110
627	NC_005362	TTG	2	6	30134	30139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518110
628	NC_005362	TTC	2	6	30265	30270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518110
629	NC_005362	AGT	2	6	30335	30340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518110
630	NC_005362	AGC	2	6	30415	30420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518110
631	NC_005362	AG	3	6	30445	30450	50 %	0 %	50 %	0 %	42518110
632	NC_005362	TCG	2	6	30479	30484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518110
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761	NC_005362	TA	3	6	38257	38262	50 %	50 %	0 %	0 %	42518115
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