MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii NCC 533

Total Repeats: 40435

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005362	ATT	2	6	220284	220289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518273
4502	NC_005362	GTT	2	6	220304	220309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518273
4503	NC_005362	T	7	7	220308	220314	0 %	100 %	0 %	0 %	42518273
4504	NC_005362	TAG	2	6	220435	220440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518273
4505	NC_005362	T	6	6	220485	220490	0 %	100 %	0 %	0 %	42518273
4506	NC_005362	TTG	2	6	220530	220535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518273
4507	NC_005362	TGT	2	6	220539	220544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518273
4508	NC_005362	GCA	2	6	220549	220554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518273
4509	NC_005362	T	6	6	220584	220589	0 %	100 %	0 %	0 %	42518273
4510	NC_005362	T	6	6	220738	220743	0 %	100 %	0 %	0 %	42518274
4511	NC_005362	T	6	6	220775	220780	0 %	100 %	0 %	0 %	42518274
4512	NC_005362	TCA	2	6	220833	220838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518274
4513	NC_005362	T	6	6	220865	220870	0 %	100 %	0 %	0 %	42518274
4514	NC_005362	CTT	2	6	220954	220959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518274
4515	NC_005362	TTGAT	2	10	220963	220972	20 %	60 %	20 %	0 %	42518274
4516	NC_005362	TCA	2	6	221001	221006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518274
4517	NC_005362	CCAA	2	8	221039	221046	50 %	0 %	0 %	50 %	42518274
4518	NC_005362	GTA	2	6	221217	221222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518274
4519	NC_005362	CTG	2	6	221260	221265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518274
4520	NC_005362	TCT	2	6	221289	221294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518274
4521	NC_005362	ATC	2	6	221300	221305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518274
4522	NC_005362	CAG	2	6	221431	221436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518274
4523	NC_005362	AGCT	2	8	221501	221508	25 %	25 %	25 %	25 %	42518274
4524	NC_005362	ACT	2	6	221511	221516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518274
4525	NC_005362	TGCT	2	8	221521	221528	0 %	50 %	25 %	25 %	42518274
4526	NC_005362	CCG	2	6	221583	221588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42518274
4527	NC_005362	GA	3	6	221763	221768	50 %	0 %	50 %	0 %	42518274
4528	NC_005362	TCA	2	6	221802	221807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518274
4529	NC_005362	CTT	2	6	221833	221838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518274
4530	NC_005362	ATC	2	6	221852	221857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518274
4531	NC_005362	AT	3	6	221922	221927	50 %	50 %	0 %	0 %	42518274
4532	NC_005362	TCT	2	6	221934	221939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518274
4533	NC_005362	GTG	2	6	221945	221950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	42518274
4534	NC_005362	CAG	2	6	222070	222075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518274
4535	NC_005362	TTAG	2	8	222114	222121	25 %	50 %	25 %	0 %	42518274
4536	NC_005362	ACC	2	6	222161	222166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518274
4537	NC_005362	GCA	2	6	222180	222185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518274
4538	NC_005362	AGT	2	6	222220	222225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518274
4539	NC_005362	T	6	6	222225	222230	0 %	100 %	0 %	0 %	42518274
4540	NC_005362	TTG	2	6	222358	222363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518275
4541	NC_005362	T	6	6	222428	222433	0 %	100 %	0 %	0 %	42518275
4542	NC_005362	ATC	2	6	222458	222463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518275
4543	NC_005362	TAG	2	6	222469	222474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518275
4544	NC_005362	ATG	2	6	222518	222523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518275
4545	NC_005362	TAGA	2	8	222534	222541	50 %	25 %	25 %	0 %	42518275
4546	NC_005362	AT	3	6	222550	222555	50 %	50 %	0 %	0 %	42518275
4547	NC_005362	ATGT	2	8	222592	222599	25 %	50 %	25 %	0 %	42518275
4548	NC_005362	GAC	2	6	222634	222639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518275
4549	NC_005362	ATTTTA	2	12	222664	222675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518275
4550	NC_005362	TAG	2	6	222749	222754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518275
4551	NC_005362	GAATTG	2	12	222802	222813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518275
4552	NC_005362	CTT	2	6	222884	222889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518275
4553	NC_005362	TTC	2	6	222914	222919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518275
4554	NC_005362	T	6	6	222928	222933	0 %	100 %	0 %	0 %	42518275
4555	NC_005362	T	6	6	222979	222984	0 %	100 %	0 %	0 %	42518275
4556	NC_005362	ATT	2	6	223026	223031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518275
4557	NC_005362	T	7	7	223041	223047	0 %	100 %	0 %	0 %	42518276
4558	NC_005362	CTA	2	6	223056	223061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518276
4559	NC_005362	CTT	2	6	223155	223160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518276
4560	NC_005362	TGCT	2	8	223210	223217	0 %	50 %	25 %	25 %	42518276
4561	NC_005362	TAA	2	6	223218	223223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518276
4562	NC_005362	TCA	2	6	223226	223231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518276
4563	NC_005362	T	6	6	223249	223254	0 %	100 %	0 %	0 %	42518276
4564	NC_005362	AGC	2	6	223255	223260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518276
4565	NC_005362	TTGC	2	8	223266	223273	0 %	50 %	25 %	25 %	42518276
4566	NC_005362	AGC	3	9	223276	223284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42518276
4567	NC_005362	ATA	2	6	223304	223309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518276
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4569	NC_005362	TGC	2	6	223483	223488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518277
4570	NC_005362	CAAT	2	8	223493	223500	50 %	25 %	0 %	25 %	42518277
4571	NC_005362	ATA	2	6	223553	223558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518277
4572	NC_005362	ATG	2	6	223576	223581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518277
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4574	NC_005362	TGA	2	6	223646	223651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518277
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4577	NC_005362	TAA	2	6	223774	223779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518278
4578	NC_005362	TCA	2	6	223800	223805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518278
4579	NC_005362	TGC	2	6	223901	223906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518278
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4582	NC_005362	ATA	2	6	224022	224027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518278
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4585	NC_005362	AAGT	2	8	224399	224406	50 %	25 %	25 %	0 %	42518279
4586	NC_005362	AAG	2	6	224432	224437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518279
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4588	NC_005362	TAA	2	6	224613	224618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518279
4589	NC_005362	GTT	2	6	224620	224625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518279
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4593	NC_005362	AGA	2	6	224772	224777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518279
4594	NC_005362	CAC	2	6	224805	224810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518279
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4596	NC_005362	AGT	2	6	224881	224886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518279
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4598	NC_005362	ATA	2	6	225014	225019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42518279
4599	NC_005362	CAA	2	6	225048	225053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518279
4600	NC_005362	GCG	2	6	225059	225064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42518279
4601	NC_005362	CCA	2	6	225077	225082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518279
4602	NC_005362	CTG	2	6	225330	225335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42518279
4603	NC_005362	AGT	3	9	225358	225366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518279
4604	NC_005362	GAA	2	6	225379	225384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518279
4605	NC_005362	GGAATA	2	12	225425	225436	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42518279
4606	NC_005362	AACA	2	8	225562	225569	75 %	0 %	0 %	25 %	42518279
4607	NC_005362	GCTC	2	8	225591	225598	0 %	25 %	25 %	50 %	42518279
4608	NC_005362	TCA	2	6	225850	225855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518280
4609	NC_005362	AAG	2	6	226088	226093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42518280
4610	NC_005362	T	6	6	226128	226133	0 %	100 %	0 %	0 %	42518280
4611	NC_005362	TCT	2	6	226138	226143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42518280
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4613	NC_005362	CAT	2	6	226229	226234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518280
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4615	NC_005362	TTG	2	6	226311	226316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42518280
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4617	NC_005362	CAT	3	9	226343	226351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518280
4618	NC_005362	TGGTG	2	10	226394	226403	0 %	40 %	60 %	0 %	42518280
4619	NC_005362	ATC	2	6	226419	226424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42518280
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4621	NC_005362	CAA	2	6	226568	226573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42518280
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4623	NC_005362	AATTC	2	10	226693	226702	40 %	40 %	0 %	20 %	42518280
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4996	NC_005362	TTTG	2	8	244783	244790	0 %	75 %	25 %	0 %	42518298
4997	NC_005362	AGT	2	6	244795	244800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42518298
4998	NC_005362	ATCA	2	8	244863	244870	50 %	25 %	0 %	25 %	42518298
4999	NC_005362	CCA	2	6	244985	244990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	42518298
5000	NC_005362	TTA	2	6	245060	245065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42518298

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