MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004343	TC	3	6	414	419	0 %	50 %	0 %	50 %	24217062
2	NC_004343	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	294653594
3	NC_004343	AG	3	6	3319	3324	50 %	0 %	50 %	0 %	294653594
4	NC_004343	TC	3	6	4332	4337	0 %	50 %	0 %	50 %	24217066
5	NC_004343	TC	3	6	5788	5793	0 %	50 %	0 %	50 %	294653593
6	NC_004343	TC	3	6	6724	6729	0 %	50 %	0 %	50 %	24217071
7	NC_004343	TA	3	6	7027	7032	50 %	50 %	0 %	0 %	24217071
8	NC_004343	AT	4	8	7110	7117	50 %	50 %	0 %	0 %	24217071
9	NC_004343	AG	3	6	7216	7221	50 %	0 %	50 %	0 %	24217071
10	NC_004343	AT	3	6	10010	10015	50 %	50 %	0 %	0 %	24217074
11	NC_004343	CT	3	6	10130	10135	0 %	50 %	0 %	50 %	24217074
12	NC_004343	CT	3	6	10298	10303	0 %	50 %	0 %	50 %	24217074
13	NC_004343	AC	3	6	11450	11455	50 %	0 %	0 %	50 %	24217075
14	NC_004343	TA	3	6	11630	11635	50 %	50 %	0 %	0 %	24217075
15	NC_004343	TA	3	6	11949	11954	50 %	50 %	0 %	0 %	24217075
16	NC_004343	TA	4	8	12444	12451	50 %	50 %	0 %	0 %	24217076
17	NC_004343	GA	3	6	12746	12751	50 %	0 %	50 %	0 %	24217076
18	NC_004343	AG	3	6	13370	13375	50 %	0 %	50 %	0 %	294653591
19	NC_004343	AG	3	6	13637	13642	50 %	0 %	50 %	0 %	294653591
20	NC_004343	GA	3	6	13741	13746	50 %	0 %	50 %	0 %	294653591
21	NC_004343	TA	3	6	14002	14007	50 %	50 %	0 %	0 %	24217078
22	NC_004343	GA	3	6	14332	14337	50 %	0 %	50 %	0 %	24217078
23	NC_004343	GA	3	6	14928	14933	50 %	0 %	50 %	0 %	24217078
24	NC_004343	CT	3	6	14995	15000	0 %	50 %	0 %	50 %	24217078
25	NC_004343	TC	3	6	15800	15805	0 %	50 %	0 %	50 %	24217079
26	NC_004343	GT	3	6	15957	15962	0 %	50 %	50 %	0 %	24217079
27	NC_004343	TA	3	6	16401	16406	50 %	50 %	0 %	0 %	24217081
28	NC_004343	CT	3	6	16680	16685	0 %	50 %	0 %	50 %	24217081
29	NC_004343	GT	3	6	16702	16707	0 %	50 %	50 %	0 %	24217081
30	NC_004343	AT	3	6	17040	17045	50 %	50 %	0 %	0 %	24217081
31	NC_004343	AT	3	6	19427	19432	50 %	50 %	0 %	0 %	294653590
32	NC_004343	AT	3	6	22832	22837	50 %	50 %	0 %	0 %	24217087
33	NC_004343	CG	3	6	23036	23041	0 %	0 %	50 %	50 %	24217087
34	NC_004343	TA	3	6	26000	26005	50 %	50 %	0 %	0 %	24217091
35	NC_004343	TC	3	6	26565	26570	0 %	50 %	0 %	50 %	294653589
36	NC_004343	CA	3	6	26810	26815	50 %	0 %	0 %	50 %	294653589
37	NC_004343	CG	3	6	28213	28218	0 %	0 %	50 %	50 %	24217096
38	NC_004343	TC	3	6	28328	28333	0 %	50 %	0 %	50 %	24217096
39	NC_004343	TC	3	6	29545	29550	0 %	50 %	0 %	50 %	24217097
40	NC_004343	TA	3	6	29593	29598	50 %	50 %	0 %	0 %	24217097
41	NC_004343	AT	3	6	29909	29914	50 %	50 %	0 %	0 %	294653588
42	NC_004343	GA	3	6	30857	30862	50 %	0 %	50 %	0 %	24217100
43	NC_004343	AT	3	6	30996	31001	50 %	50 %	0 %	0 %	24217100
44	NC_004343	AG	3	6	31111	31116	50 %	0 %	50 %	0 %	24217100
45	NC_004343	TC	3	6	33343	33348	0 %	50 %	0 %	50 %	24217104
46	NC_004343	AG	3	6	36465	36470	50 %	0 %	50 %	0 %	294653584
47	NC_004343	AT	3	6	36881	36886	50 %	50 %	0 %	0 %	294653584
48	NC_004343	AG	3	6	36901	36906	50 %	0 %	50 %	0 %	294653584
49	NC_004343	CT	3	6	38209	38214	0 %	50 %	0 %	50 %	294653583
50	NC_004343	AT	3	6	38949	38954	50 %	50 %	0 %	0 %	294653583
51	NC_004343	AT	3	6	42103	42108	50 %	50 %	0 %	0 %	24217113
52	NC_004343	TC	3	6	42618	42623	0 %	50 %	0 %	50 %	24217113
53	NC_004343	TA	3	6	43605	43610	50 %	50 %	0 %	0 %	294653581
54	NC_004343	AT	3	6	43805	43810	50 %	50 %	0 %	0 %	294653581
55	NC_004343	TC	3	6	44331	44336	0 %	50 %	0 %	50 %	294653581
56	NC_004343	CG	3	6	45411	45416	0 %	0 %	50 %	50 %	294653580
57	NC_004343	AT	3	6	45886	45891	50 %	50 %	0 %	0 %	294653579
58	NC_004343	AG	3	6	46193	46198	50 %	0 %	50 %	0 %	294653579
59	NC_004343	GT	3	6	46487	46492	0 %	50 %	50 %	0 %	24217118
60	NC_004343	TA	3	6	46877	46882	50 %	50 %	0 %	0 %	24217118
61	NC_004343	GA	3	6	47117	47122	50 %	0 %	50 %	0 %	24217118
62	NC_004343	AT	3	6	47890	47895	50 %	50 %	0 %	0 %	24217119
63	NC_004343	AG	3	6	49207	49212	50 %	0 %	50 %	0 %	24217119
64	NC_004343	TC	3	6	49494	49499	0 %	50 %	0 %	50 %	24217119
65	NC_004343	CT	3	6	49790	49795	0 %	50 %	0 %	50 %	24217120
66	NC_004343	GC	3	6	49917	49922	0 %	0 %	50 %	50 %	24217120
67	NC_004343	AT	3	6	50113	50118	50 %	50 %	0 %	0 %	24217120
68	NC_004343	TG	3	6	50637	50642	0 %	50 %	50 %	0 %	24217121
69	NC_004343	TA	3	6	51767	51772	50 %	50 %	0 %	0 %	24217122
70	NC_004343	TA	3	6	51800	51805	50 %	50 %	0 %	0 %	24217122
71	NC_004343	TA	3	6	52307	52312	50 %	50 %	0 %	0 %	24217122
72	NC_004343	GA	3	6	52941	52946	50 %	0 %	50 %	0 %	294653578
73	NC_004343	GA	3	6	54843	54848	50 %	0 %	50 %	0 %	294653577
74	NC_004343	GA	3	6	59270	59275	50 %	0 %	50 %	0 %	24217131
75	NC_004343	AG	3	6	61365	61370	50 %	0 %	50 %	0 %	294653575
76	NC_004343	CT	3	6	61386	61391	0 %	50 %	0 %	50 %	294653575
77	NC_004343	GT	3	6	61604	61609	0 %	50 %	50 %	0 %	294653575
78	NC_004343	GA	3	6	62785	62790	50 %	0 %	50 %	0 %	294653574
79	NC_004343	CT	3	6	63903	63908	0 %	50 %	0 %	50 %	24217135
80	NC_004343	CA	3	6	64304	64309	50 %	0 %	0 %	50 %	24217135
81	NC_004343	AT	3	6	64525	64530	50 %	50 %	0 %	0 %	24217135
82	NC_004343	TC	3	6	65147	65152	0 %	50 %	0 %	50 %	24217137
83	NC_004343	GA	3	6	65647	65652	50 %	0 %	50 %	0 %	24217137
84	NC_004343	GA	3	6	67642	67647	50 %	0 %	50 %	0 %	24217138
85	NC_004343	TA	3	6	67648	67653	50 %	50 %	0 %	0 %	24217138
86	NC_004343	AC	3	6	70241	70246	50 %	0 %	0 %	50 %	24217140
87	NC_004343	AT	3	6	71042	71047	50 %	50 %	0 %	0 %	294653573
88	NC_004343	AT	4	8	71443	71450	50 %	50 %	0 %	0 %	294653573
89	NC_004343	AT	3	6	72001	72006	50 %	50 %	0 %	0 %	294653573
90	NC_004343	GT	3	6	72979	72984	0 %	50 %	50 %	0 %	24217143
91	NC_004343	TC	3	6	74662	74667	0 %	50 %	0 %	50 %	24217145
92	NC_004343	TA	3	6	74871	74876	50 %	50 %	0 %	0 %	24217145
93	NC_004343	TA	3	6	76248	76253	50 %	50 %	0 %	0 %	24217147
94	NC_004343	GT	3	6	76396	76401	0 %	50 %	50 %	0 %	24217147
95	NC_004343	AC	3	6	78410	78415	50 %	0 %	0 %	50 %	24217149
96	NC_004343	TC	3	6	78423	78428	0 %	50 %	0 %	50 %	24217149
97	NC_004343	TA	3	6	78567	78572	50 %	50 %	0 %	0 %	24217149
98	NC_004343	GA	3	6	79780	79785	50 %	0 %	50 %	0 %	24217150
99	NC_004343	GA	3	6	80594	80599	50 %	0 %	50 %	0 %	24217150
100	NC_004343	GA	3	6	82073	82078	50 %	0 %	50 %	0 %	24217153
101	NC_004343	AT	3	6	85413	85418	50 %	50 %	0 %	0 %	24217155
102	NC_004343	CT	3	6	86356	86361	0 %	50 %	0 %	50 %	24217155
103	NC_004343	AT	3	6	86550	86555	50 %	50 %	0 %	0 %	24217155
104	NC_004343	AT	3	6	86776	86781	50 %	50 %	0 %	0 %	24217155
105	NC_004343	GT	3	6	89527	89532	0 %	50 %	50 %	0 %	294653572
106	NC_004343	AG	3	6	93379	93384	50 %	0 %	50 %	0 %	24217165
107	NC_004343	TC	3	6	95659	95664	0 %	50 %	0 %	50 %	24217167
108	NC_004343	TC	3	6	96218	96223	0 %	50 %	0 %	50 %	24217167
109	NC_004343	TA	3	6	97092	97097	50 %	50 %	0 %	0 %	24217168
110	NC_004343	GA	3	6	97480	97485	50 %	0 %	50 %	0 %	24217169
111	NC_004343	GC	3	6	97693	97698	0 %	0 %	50 %	50 %	24217169
112	NC_004343	AT	3	6	98243	98248	50 %	50 %	0 %	0 %	24217169
113	NC_004343	AG	3	6	99090	99095	50 %	0 %	50 %	0 %	24217169
114	NC_004343	GA	3	6	99320	99325	50 %	0 %	50 %	0 %	24217169
115	NC_004343	AT	3	6	99380	99385	50 %	50 %	0 %	0 %	24217169
116	NC_004343	AT	3	6	100405	100410	50 %	50 %	0 %	0 %	24217169
117	NC_004343	TA	3	6	100551	100556	50 %	50 %	0 %	0 %	24217169
118	NC_004343	AT	3	6	104054	104059	50 %	50 %	0 %	0 %	24217172
119	NC_004343	GA	3	6	105849	105854	50 %	0 %	50 %	0 %	24217173
120	NC_004343	GA	3	6	106499	106504	50 %	0 %	50 %	0 %	24217174
121	NC_004343	TA	3	6	107938	107943	50 %	50 %	0 %	0 %	294653570
122	NC_004343	TA	3	6	111991	111996	50 %	50 %	0 %	0 %	24217179
123	NC_004343	AT	3	6	112075	112080	50 %	50 %	0 %	0 %	24217179
124	NC_004343	TA	3	6	112133	112138	50 %	50 %	0 %	0 %	24217179
125	NC_004343	AT	3	6	113556	113561	50 %	50 %	0 %	0 %	24217179
126	NC_004343	AC	3	6	115928	115933	50 %	0 %	0 %	50 %	24217181
127	NC_004343	CA	3	6	117673	117678	50 %	0 %	0 %	50 %	24217183
128	NC_004343	AT	3	6	117715	117720	50 %	50 %	0 %	0 %	24217183
129	NC_004343	GA	3	6	119087	119092	50 %	0 %	50 %	0 %	24217185
130	NC_004343	AT	3	6	120506	120511	50 %	50 %	0 %	0 %	24217187
131	NC_004343	CT	3	6	123466	123471	0 %	50 %	0 %	50 %	24217191
132	NC_004343	AG	3	6	124252	124257	50 %	0 %	50 %	0 %	24217191
133	NC_004343	GT	3	6	125076	125081	0 %	50 %	50 %	0 %	24217192
134	NC_004343	GA	3	6	125099	125104	50 %	0 %	50 %	0 %	24217192
135	NC_004343	AT	3	6	127406	127411	50 %	50 %	0 %	0 %	294653566
136	NC_004343	AT	3	6	128043	128048	50 %	50 %	0 %	0 %	294653566
137	NC_004343	AG	3	6	128146	128151	50 %	0 %	50 %	0 %	294653566
138	NC_004343	TA	3	6	129528	129533	50 %	50 %	0 %	0 %	294653565
139	NC_004343	TG	3	6	130920	130925	0 %	50 %	50 %	0 %	24217197
140	NC_004343	AT	3	6	131306	131311	50 %	50 %	0 %	0 %	24217198
141	NC_004343	TA	3	6	134608	134613	50 %	50 %	0 %	0 %	294653564
142	NC_004343	TC	3	6	138346	138351	0 %	50 %	0 %	50 %	24217204
143	NC_004343	CT	3	6	138980	138985	0 %	50 %	0 %	50 %	24217204
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.