MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 5915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004343	ATT	2	6	179423	179428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217243
3002	NC_004343	TTGATT	2	12	179429	179440	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	24217243
3003	NC_004343	ATG	2	6	179598	179603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217244
3004	NC_004343	TGA	3	9	179605	179613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217244
3005	NC_004343	GAT	2	6	179681	179686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217244
3006	NC_004343	GTT	2	6	181604	181609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217247
3007	NC_004343	CTA	2	6	181662	181667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217247
3008	NC_004343	GAA	2	6	181684	181689	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217247
3009	NC_004343	TAA	2	6	181701	181706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24217247
3010	NC_004343	ATTT	2	8	181729	181736	25 %	75 %	0 %	0 %	24217247
3011	NC_004343	AGA	2	6	181767	181772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217247
3012	NC_004343	T	7	7	181780	181786	0 %	100 %	0 %	0 %	24217247
3013	NC_004343	ATC	2	6	181808	181813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217247
3014	NC_004343	CGTT	2	8	181899	181906	0 %	50 %	25 %	25 %	24217247
3015	NC_004343	A	6	6	181939	181944	100 %	0 %	0 %	0 %	24217247
3016	NC_004343	AAGGAA	2	12	181973	181984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217247
3017	NC_004343	CAAA	2	8	182028	182035	75 %	0 %	0 %	25 %	24217247
3018	NC_004343	T	6	6	182132	182137	0 %	100 %	0 %	0 %	24217247
3019	NC_004343	T	7	7	182244	182250	0 %	100 %	0 %	0 %	24217248
3020	NC_004343	GAT	2	6	182269	182274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217248
3021	NC_004343	GAA	2	6	182324	182329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217248
3022	NC_004343	T	6	6	182370	182375	0 %	100 %	0 %	0 %	24217248
3023	NC_004343	TTTC	2	8	182390	182397	0 %	75 %	0 %	25 %	24217248
3024	NC_004343	A	7	7	182417	182423	100 %	0 %	0 %	0 %	24217248
3025	NC_004343	TTA	2	6	182424	182429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217248
3026	NC_004343	TCT	2	6	182464	182469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217248
3027	NC_004343	AGG	2	6	182518	182523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217248
3028	NC_004343	CTT	2	6	182549	182554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217248
3029	NC_004343	CTT	2	6	182633	182638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217248
3030	NC_004343	AGG	2	6	182644	182649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217248
3031	NC_004343	T	6	6	182671	182676	0 %	100 %	0 %	0 %	24217248
3032	NC_004343	TGGA	2	8	182734	182741	25 %	25 %	50 %	0 %	24217248
3033	NC_004343	GAA	2	6	182762	182767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217248
3034	NC_004343	A	6	6	182783	182788	100 %	0 %	0 %	0 %	24217248
3035	NC_004343	AC	3	6	182822	182827	50 %	0 %	0 %	50 %	24217248
3036	NC_004343	CTT	2	6	182831	182836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217248
3037	NC_004343	GAA	2	6	182915	182920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217248
3038	NC_004343	T	7	7	182964	182970	0 %	100 %	0 %	0 %	24217248
3039	NC_004343	TTA	2	6	182981	182986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217248
3040	NC_004343	A	8	8	183010	183017	100 %	0 %	0 %	0 %	24217248
3041	NC_004343	GTT	2	6	183095	183100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217248
3042	NC_004343	TCT	2	6	183173	183178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217248
3043	NC_004343	GA	3	6	183189	183194	50 %	0 %	50 %	0 %	24217248
3044	NC_004343	TC	3	6	183233	183238	0 %	50 %	0 %	50 %	24217248
3045	NC_004343	T	8	8	183242	183249	0 %	100 %	0 %	0 %	24217248
3046	NC_004343	TCGG	2	8	183263	183270	0 %	25 %	50 %	25 %	24217248
3047	NC_004343	ATC	2	6	183301	183306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217248
3048	NC_004343	ACG	2	6	183578	183583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217250
3049	NC_004343	ATTT	2	8	183599	183606	25 %	75 %	0 %	0 %	24217250
3050	NC_004343	TC	3	6	183634	183639	0 %	50 %	0 %	50 %	24217250
3051	NC_004343	A	7	7	183726	183732	100 %	0 %	0 %	0 %	24217250
3052	NC_004343	TCT	2	6	183733	183738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217250
3053	NC_004343	CCA	2	6	183742	183747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24217250
3054	NC_004343	TCC	2	6	183751	183756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217250
3055	NC_004343	GCC	3	9	183802	183810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24217250
3056	NC_004343	CCCG	2	8	183898	183905	0 %	0 %	25 %	75 %	24217250
3057	NC_004343	A	6	6	183955	183960	100 %	0 %	0 %	0 %	24217250
3058	NC_004343	T	8	8	183981	183988	0 %	100 %	0 %	0 %	24217250
3059	NC_004343	T	6	6	184073	184078	0 %	100 %	0 %	0 %	24217250
3060	NC_004343	CAA	2	6	184089	184094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24217250
3061	NC_004343	CCA	2	6	185016	185021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24217252
3062	NC_004343	TAA	2	6	185022	185027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24217252
3063	NC_004343	ATTG	2	8	185062	185069	25 %	50 %	25 %	0 %	24217252
3064	NC_004343	A	7	7	185088	185094	100 %	0 %	0 %	0 %	24217252
3065	NC_004343	ATTTA	2	10	185180	185189	40 %	60 %	0 %	0 %	24217252
3066	NC_004343	TCCTG	2	10	185208	185217	0 %	40 %	20 %	40 %	24217252
3067	NC_004343	TCC	2	6	185291	185296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217252
3068	NC_004343	TGA	2	6	185328	185333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217252
3069	NC_004343	CTTC	2	8	185340	185347	0 %	50 %	0 %	50 %	24217252
3070	NC_004343	CTC	2	6	185446	185451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217252
3071	NC_004343	CT	3	6	185495	185500	0 %	50 %	0 %	50 %	24217252
3072	NC_004343	TTTG	2	8	185504	185511	0 %	75 %	25 %	0 %	24217252
3073	NC_004343	ATA	2	6	185538	185543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24217252
3074	NC_004343	A	6	6	185574	185579	100 %	0 %	0 %	0 %	24217252
3075	NC_004343	ACA	2	6	185652	185657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24217252
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3078	NC_004343	ATC	2	6	185807	185812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217252
3079	NC_004343	ACT	2	6	185832	185837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217252
3080	NC_004343	A	8	8	185876	185883	100 %	0 %	0 %	0 %	24217252
3081	NC_004343	TA	3	6	185899	185904	50 %	50 %	0 %	0 %	24217252
3082	NC_004343	ATTC	2	8	185935	185942	25 %	50 %	0 %	25 %	24217252
3083	NC_004343	TTA	2	6	186069	186074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217252
3084	NC_004343	TTA	2	6	186180	186185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217252
3085	NC_004343	AGT	2	6	186329	186334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217252
3086	NC_004343	ACCGC	2	10	186390	186399	20 %	0 %	20 %	60 %	24217252
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3088	NC_004343	AGT	2	6	186485	186490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217252
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3090	NC_004343	AATTA	2	10	186530	186539	60 %	40 %	0 %	0 %	24217252
3091	NC_004343	CTC	2	6	186544	186549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217252
3092	NC_004343	CTA	2	6	186627	186632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217252
3093	NC_004343	A	6	6	186735	186740	100 %	0 %	0 %	0 %	24217252
3094	NC_004343	TAC	2	6	186743	186748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217252
3095	NC_004343	GCA	2	6	186780	186785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24217252
3096	NC_004343	TCT	2	6	186854	186859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217252
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3098	NC_004343	A	6	6	187030	187035	100 %	0 %	0 %	0 %	24217252
3099	NC_004343	A	7	7	187069	187075	100 %	0 %	0 %	0 %	24217252
3100	NC_004343	TAA	2	6	187166	187171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294653556
3101	NC_004343	A	6	6	187244	187249	100 %	0 %	0 %	0 %	294653556
3102	NC_004343	TTTG	2	8	187298	187305	0 %	75 %	25 %	0 %	294653556
3103	NC_004343	AAG	2	6	187350	187355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653556
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3107	NC_004343	CGG	2	6	187713	187718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294653556
3108	NC_004343	TGT	2	6	187721	187726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294653556
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3110	NC_004343	A	6	6	187887	187892	100 %	0 %	0 %	0 %	24217255
3111	NC_004343	AGT	2	6	187896	187901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217255
3112	NC_004343	AGTGTA	2	12	187927	187938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217255
3113	NC_004343	TTG	2	6	187980	187985	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217255
3114	NC_004343	GTA	2	6	188000	188005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217255
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3116	NC_004343	TAT	2	6	188040	188045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217255
3117	NC_004343	TCA	2	6	188081	188086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217255
3118	NC_004343	AGT	2	6	188209	188214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217255
3119	NC_004343	AAG	2	6	188232	188237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217255
3120	NC_004343	TAA	2	6	188305	188310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24217255
3121	NC_004343	T	6	6	188326	188331	0 %	100 %	0 %	0 %	24217255
3122	NC_004343	GTC	2	6	188332	188337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217255
3123	NC_004343	TGT	2	6	188380	188385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217255
3124	NC_004343	GAT	2	6	188883	188888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294653555
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3126	NC_004343	T	6	6	188924	188929	0 %	100 %	0 %	0 %	294653555
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