MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 5915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004343	AGAA	2	8	53431	53438	75 %	0 %	25 %	0 %	294653578
1002	NC_004343	GTG	2	6	53497	53502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294653578
1003	NC_004343	CAA	2	6	53505	53510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294653578
1004	NC_004343	TCC	2	6	53527	53532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294653578
1005	NC_004343	T	6	6	53697	53702	0 %	100 %	0 %	0 %	294653578
1006	NC_004343	T	6	6	53706	53711	0 %	100 %	0 %	0 %	294653578
1007	NC_004343	TTC	2	6	53725	53730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653578
1008	NC_004343	T	7	7	53846	53852	0 %	100 %	0 %	0 %	294653578
1009	NC_004343	T	6	6	53884	53889	0 %	100 %	0 %	0 %	294653578
1010	NC_004343	AAG	2	6	54005	54010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653577
1011	NC_004343	AGA	3	9	54030	54038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653577
1012	NC_004343	A	6	6	54043	54048	100 %	0 %	0 %	0 %	294653577
1013	NC_004343	A	6	6	54091	54096	100 %	0 %	0 %	0 %	294653577
1014	NC_004343	GAA	2	6	54136	54141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653577
1015	NC_004343	GAA	2	6	54164	54169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653577
1016	NC_004343	TGGAT	2	10	54234	54243	20 %	40 %	40 %	0 %	294653577
1017	NC_004343	ATT	2	6	54259	54264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294653577
1018	NC_004343	GAATTA	2	12	54322	54333	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294653577
1019	NC_004343	T	6	6	54355	54360	0 %	100 %	0 %	0 %	294653577
1020	NC_004343	TAGGGG	2	12	54474	54485	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	294653577
1021	NC_004343	TGA	2	6	54494	54499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294653577
1022	NC_004343	CGA	2	6	54510	54515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294653577
1023	NC_004343	AAG	2	6	54516	54521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653577
1024	NC_004343	ATT	2	6	54566	54571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294653577
1025	NC_004343	TGA	2	6	54630	54635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294653577
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1030	NC_004343	GA	3	6	54843	54848	50 %	0 %	50 %	0 %	294653577
1031	NC_004343	CTT	2	6	54854	54859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653577
1032	NC_004343	A	6	6	54881	54886	100 %	0 %	0 %	0 %	294653577
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1035	NC_004343	AAG	2	6	55006	55011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217127
1036	NC_004343	TTCT	2	8	55045	55052	0 %	75 %	0 %	25 %	24217127
1037	NC_004343	A	6	6	55068	55073	100 %	0 %	0 %	0 %	24217127
1038	NC_004343	A	6	6	55098	55103	100 %	0 %	0 %	0 %	24217127
1039	NC_004343	CTTA	2	8	55109	55116	25 %	50 %	0 %	25 %	24217127
1040	NC_004343	A	6	6	55129	55134	100 %	0 %	0 %	0 %	24217127
1041	NC_004343	GAA	2	6	55161	55166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217127
1042	NC_004343	A	6	6	55165	55170	100 %	0 %	0 %	0 %	24217127
1043	NC_004343	GAA	2	6	55257	55262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217127
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1049	NC_004343	CTT	2	6	55926	55931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217129
1050	NC_004343	T	6	6	55930	55935	0 %	100 %	0 %	0 %	24217129
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1053	NC_004343	ATG	2	6	56036	56041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217129
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1056	NC_004343	T	6	6	56166	56171	0 %	100 %	0 %	0 %	24217129
1057	NC_004343	TTTAT	2	10	56188	56197	20 %	80 %	0 %	0 %	24217129
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1059	NC_004343	AAT	2	6	56390	56395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24217129
1060	NC_004343	T	6	6	56479	56484	0 %	100 %	0 %	0 %	24217129
1061	NC_004343	A	8	8	56527	56534	100 %	0 %	0 %	0 %	24217129
1062	NC_004343	GAA	2	6	57330	57335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217130
1063	NC_004343	GAA	2	6	57423	57428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217130
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1065	NC_004343	A	7	7	57587	57593	100 %	0 %	0 %	0 %	24217130
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1084	NC_004343	TTGG	2	8	60533	60540	0 %	50 %	50 %	0 %	294653576
1085	NC_004343	A	6	6	61343	61348	100 %	0 %	0 %	0 %	294653575
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1089	NC_004343	AAGA	2	8	61430	61437	75 %	0 %	25 %	0 %	294653575
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1091	NC_004343	A	6	6	61558	61563	100 %	0 %	0 %	0 %	294653575
1092	NC_004343	GT	3	6	61604	61609	0 %	50 %	50 %	0 %	294653575
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1099	NC_004343	GGAAA	2	10	62051	62060	60 %	0 %	40 %	0 %	294653574
1100	NC_004343	T	6	6	62110	62115	0 %	100 %	0 %	0 %	294653574
1101	NC_004343	GAA	2	6	62121	62126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653574
1102	NC_004343	CGA	2	6	62145	62150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294653574
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1104	NC_004343	GGA	2	6	62225	62230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294653574
1105	NC_004343	AAAG	2	8	62408	62415	75 %	0 %	25 %	0 %	294653574
1106	NC_004343	ACGAA	2	10	62474	62483	60 %	0 %	20 %	20 %	294653574
1107	NC_004343	A	7	7	62482	62488	100 %	0 %	0 %	0 %	294653574
1108	NC_004343	GAA	2	6	62493	62498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653574
1109	NC_004343	CTGG	2	8	62545	62552	0 %	25 %	50 %	25 %	294653574
1110	NC_004343	CGGG	2	8	62582	62589	0 %	0 %	75 %	25 %	294653574
1111	NC_004343	ACC	2	6	62623	62628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294653574
1112	NC_004343	CGA	2	6	62655	62660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294653574
1113	NC_004343	TAT	2	6	62676	62681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294653574
1114	NC_004343	AGA	2	6	62719	62724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294653574
1115	NC_004343	GA	3	6	62785	62790	50 %	0 %	50 %	0 %	294653574
1116	NC_004343	T	6	6	62810	62815	0 %	100 %	0 %	0 %	294653574
1117	NC_004343	TCT	2	6	62912	62917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653574
1118	NC_004343	GGA	2	6	63081	63086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217135
1119	NC_004343	TCC	2	6	63092	63097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217135
1120	NC_004343	AGAA	2	8	63173	63180	75 %	0 %	25 %	0 %	24217135
1121	NC_004343	TTC	2	6	63206	63211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217135
1122	NC_004343	TTC	2	6	63230	63235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217135
1123	NC_004343	ATC	2	6	63297	63302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217135
1124	NC_004343	ACTTT	2	10	63619	63628	20 %	60 %	0 %	20 %	24217135
1125	NC_004343	TTC	2	6	63647	63652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217135
1126	NC_004343	CTC	2	6	63679	63684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24217135
1127	NC_004343	TCA	2	6	63697	63702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217135
1128	NC_004343	CTT	3	9	63877	63885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217135
1129	NC_004343	CT	3	6	63903	63908	0 %	50 %	0 %	50 %	24217135
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