MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome II

Total Repeats: 5915

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004343	GAAG	2	8	333961	333968	50 %	0 %	50 %	0 %	24217403
5502	NC_004343	A	6	6	333984	333989	100 %	0 %	0 %	0 %	24217403
5503	NC_004343	AGA	2	6	334008	334013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217403
5504	NC_004343	TCAA	2	8	334078	334085	50 %	25 %	0 %	25 %	24217403
5505	NC_004343	TCTT	2	8	334144	334151	0 %	75 %	0 %	25 %	24217403
5506	NC_004343	GAA	2	6	334180	334185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217403
5507	NC_004343	ATT	2	6	334355	334360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217404
5508	NC_004343	T	7	7	334359	334365	0 %	100 %	0 %	0 %	24217404
5509	NC_004343	GGA	2	6	334377	334382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24217404
5510	NC_004343	TTAAT	2	10	334459	334468	40 %	60 %	0 %	0 %	24217404
5511	NC_004343	T	7	7	334546	334552	0 %	100 %	0 %	0 %	24217404
5512	NC_004343	GCC	2	6	334572	334577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	24217404
5513	NC_004343	T	7	7	334732	334738	0 %	100 %	0 %	0 %	24217404
5514	NC_004343	TAT	2	6	334743	334748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217404
5515	NC_004343	A	6	6	334749	334754	100 %	0 %	0 %	0 %	24217404
5516	NC_004343	T	8	8	335317	335324	0 %	100 %	0 %	0 %	294653517
5517	NC_004343	AT	3	6	335358	335363	50 %	50 %	0 %	0 %	294653517
5518	NC_004343	GAT	2	6	335440	335445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294653517
5519	NC_004343	T	6	6	335449	335454	0 %	100 %	0 %	0 %	294653517
5520	NC_004343	T	6	6	335461	335466	0 %	100 %	0 %	0 %	294653517
5521	NC_004343	ACC	2	6	335500	335505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294653517
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5524	NC_004343	GTA	2	6	335635	335640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294653517
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5531	NC_004343	TAAA	2	8	335940	335947	75 %	25 %	0 %	0 %	294653517
5532	NC_004343	GTT	2	6	335976	335981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294653517
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5537	NC_004343	T	7	7	336117	336123	0 %	100 %	0 %	0 %	294653517
5538	NC_004343	TAA	2	6	336262	336267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294653517
5539	NC_004343	GAGT	2	8	336310	336317	25 %	25 %	50 %	0 %	294653517
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5541	NC_004343	TTTC	2	8	336349	336356	0 %	75 %	0 %	25 %	294653517
5542	NC_004343	CTT	2	6	336381	336386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294653517
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5544	NC_004343	TTG	2	6	336478	336483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294653517
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5551	NC_004343	CTGAAA	2	12	337070	337081	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294653516
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5553	NC_004343	TGAT	2	8	337138	337145	25 %	50 %	25 %	0 %	294653516
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5556	NC_004343	CTT	2	6	338182	338187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217409
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5558	NC_004343	T	8	8	338310	338317	0 %	100 %	0 %	0 %	24217409
5559	NC_004343	GAT	2	6	338360	338365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217409
5560	NC_004343	TCTT	2	8	338366	338373	0 %	75 %	0 %	25 %	24217409
5561	NC_004343	GAT	2	6	338380	338385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217409
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5563	NC_004343	CTG	2	6	339780	339785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217411
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5565	NC_004343	TGA	2	6	339920	339925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217411
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5589	NC_004343	CTT	2	6	341638	341643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217414
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5594	NC_004343	AAAG	2	8	341733	341740	75 %	0 %	25 %	0 %	24217414
5595	NC_004343	TCT	3	9	341757	341765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217414
5596	NC_004343	GAATA	2	10	341771	341780	60 %	20 %	20 %	0 %	24217414
5597	NC_004343	CTA	2	6	341908	341913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24217414
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5599	NC_004343	TTC	2	6	342002	342007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217414
5600	NC_004343	TTC	2	6	342011	342016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217414
5601	NC_004343	AAAGGT	2	12	342032	342043	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	24217414
5602	NC_004343	GAT	2	6	342064	342069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217414
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5604	NC_004343	GAT	2	6	342290	342295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217414
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5607	NC_004343	GA	3	6	342406	342411	50 %	0 %	50 %	0 %	24217415
5608	NC_004343	T	7	7	342452	342458	0 %	100 %	0 %	0 %	24217415
5609	NC_004343	GAA	2	6	342473	342478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24217415
5610	NC_004343	TCCTT	2	10	342494	342503	0 %	60 %	0 %	40 %	24217415
5611	NC_004343	T	6	6	342502	342507	0 %	100 %	0 %	0 %	24217415
5612	NC_004343	AATA	2	8	342576	342583	75 %	25 %	0 %	0 %	24217415
5613	NC_004343	CATC	2	8	342639	342646	25 %	25 %	0 %	50 %	24217415
5614	NC_004343	TTG	2	6	342676	342681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24217415
5615	NC_004343	GTC	2	6	342694	342699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24217415
5616	NC_004343	TTCT	2	8	342714	342721	0 %	75 %	0 %	25 %	24217415
5617	NC_004343	AGT	2	6	342757	342762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24217415
5618	NC_004343	T	6	6	342768	342773	0 %	100 %	0 %	0 %	24217415
5619	NC_004343	T	7	7	342809	342815	0 %	100 %	0 %	0 %	24217415
5620	NC_004343	TCTTTT	2	12	342833	342844	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	24217415
5621	NC_004343	TCT	2	6	342872	342877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24217415
5622	NC_004343	TAT	2	6	342927	342932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24217415
5623	NC_004343	TTGAT	2	10	342938	342947	20 %	60 %	20 %	0 %	24217415
5624	NC_004343	A	7	7	343003	343009	100 %	0 %	0 %	0 %	24217415
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