MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 35908

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004342	GGA	2	6	242	247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212701
2	NC_004342	GAA	2	6	279	284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212701
3	NC_004342	TAT	2	6	422	427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212701
4	NC_004342	AGC	2	6	491	496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212701
5	NC_004342	TCT	2	6	762	767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
6	NC_004342	GAT	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212701
7	NC_004342	TCA	2	6	1076	1081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212701
8	NC_004342	GAA	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212701
9	NC_004342	CTT	2	6	1158	1163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
10	NC_004342	TCT	2	6	1208	1213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
11	NC_004342	CTT	2	6	1497	1502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212701
12	NC_004342	CAA	2	6	1505	1510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212701
13	NC_004342	TAC	2	6	3283	3288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212702
14	NC_004342	TAT	2	6	3306	3311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
15	NC_004342	CTG	2	6	3393	3398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212702
16	NC_004342	AAG	2	6	3408	3413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
17	NC_004342	AAC	2	6	3435	3440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212702
18	NC_004342	AGA	2	6	3490	3495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
19	NC_004342	TTC	2	6	3508	3513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
20	NC_004342	TGA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212702
21	NC_004342	TTC	2	6	3610	3615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
22	NC_004342	TCT	2	6	3623	3628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
23	NC_004342	CTT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212702
24	NC_004342	TTG	2	6	3747	3752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212702
25	NC_004342	GAA	2	6	3762	3767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
26	NC_004342	TAT	2	6	3820	3825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
27	NC_004342	ACA	2	6	3924	3929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212702
28	NC_004342	TAT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212702
29	NC_004342	AGA	2	6	4021	4026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
30	NC_004342	AGA	2	6	4063	4068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212702
31	NC_004342	GAC	2	6	4235	4240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212702
32	NC_004342	GAA	2	6	5046	5051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
33	NC_004342	TAT	2	6	5137	5142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
34	NC_004342	ATT	2	6	5203	5208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
35	NC_004342	AAG	2	6	5305	5310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
36	NC_004342	TAT	2	6	5353	5358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
37	NC_004342	GGT	2	6	5388	5393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212703
38	NC_004342	CGG	2	6	5395	5400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212703
39	NC_004342	AGA	2	6	5403	5408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
40	NC_004342	TTC	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212703
41	NC_004342	ATA	2	6	5470	5475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212703
42	NC_004342	CAA	2	6	5579	5584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212703
43	NC_004342	AAG	2	6	5585	5590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
44	NC_004342	GTT	2	6	5595	5600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212703
45	NC_004342	GGA	2	6	5646	5651	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212703
46	NC_004342	GAT	2	6	5775	5780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212703
47	NC_004342	GGC	2	6	5861	5866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212703
48	NC_004342	ATT	2	6	5875	5880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212703
49	NC_004342	TGA	2	6	5918	5923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212703
50	NC_004342	AGA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212703
51	NC_004342	ACG	2	6	6003	6008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212703
52	NC_004342	GAA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212704
53	NC_004342	TTG	2	6	6234	6239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212704
54	NC_004342	ATC	2	6	6350	6355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212704
55	NC_004342	CTT	2	6	6426	6431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212704
56	NC_004342	TTC	2	6	6546	6551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212704
57	NC_004342	AAG	2	6	6633	6638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
58	NC_004342	GTT	2	6	6908	6913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212705
59	NC_004342	GGT	2	6	6932	6937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212705
60	NC_004342	ATG	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212705
61	NC_004342	TTC	2	6	7084	7089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
62	NC_004342	TTC	2	6	7108	7113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
63	NC_004342	CCA	2	6	7149	7154	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24212705
64	NC_004342	GAC	2	6	7379	7384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212705
65	NC_004342	AAG	2	6	7587	7592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
66	NC_004342	GAA	2	6	7818	7823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
67	NC_004342	GGT	3	9	7838	7846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212705
68	NC_004342	GGT	2	6	7925	7930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212705
69	NC_004342	TTC	2	6	7968	7973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
70	NC_004342	GAA	2	6	8033	8038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
71	NC_004342	CTT	2	6	8168	8173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212705
72	NC_004342	CCT	2	6	8234	8239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212705
73	NC_004342	ATT	2	6	8302	8307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212705
74	NC_004342	AGA	2	6	8449	8454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212705
75	NC_004342	AAG	2	6	8688	8693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
76	NC_004342	AGA	2	6	8771	8776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
77	NC_004342	TTG	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212706
78	NC_004342	ATC	2	6	8865	8870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212706
79	NC_004342	CGG	2	6	8985	8990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212706
80	NC_004342	GAA	2	6	9029	9034	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
81	NC_004342	TTA	2	6	9035	9040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212706
82	NC_004342	ATG	2	6	9081	9086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212706
83	NC_004342	AAC	2	6	9096	9101	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212706
84	NC_004342	TTC	2	6	9145	9150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212706
85	NC_004342	TCC	2	6	9181	9186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212706
86	NC_004342	ATT	2	6	9299	9304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212706
87	NC_004342	AGA	2	6	9379	9384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
88	NC_004342	AGA	2	6	9802	9807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
89	NC_004342	TCC	2	6	9838	9843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	24212706
90	NC_004342	ACA	2	6	9853	9858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212706
91	NC_004342	TGA	2	6	9861	9866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212706
92	NC_004342	AGA	2	6	9945	9950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
93	NC_004342	GAA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
94	NC_004342	ATC	2	6	9983	9988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212706
95	NC_004342	AAG	2	6	10050	10055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
96	NC_004342	TTC	2	6	10114	10119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212706
97	NC_004342	GAA	2	6	10148	10153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
98	NC_004342	GGT	2	6	10226	10231	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212706
99	NC_004342	GAT	2	6	10262	10267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212706
100	NC_004342	ATA	2	6	10302	10307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212706
101	NC_004342	AAG	2	6	10374	10379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
102	NC_004342	ATC	2	6	10403	10408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212706
103	NC_004342	TCT	2	6	10474	10479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212706
104	NC_004342	TTA	2	6	10500	10505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212706
105	NC_004342	ATT	2	6	10550	10555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212706
106	NC_004342	CAT	2	6	10666	10671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212706
107	NC_004342	GAA	2	6	10683	10688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
108	NC_004342	GTG	2	6	10695	10700	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212706
109	NC_004342	AAG	2	6	10755	10760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
110	NC_004342	GAA	2	6	10784	10789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
111	NC_004342	GAA	2	6	10814	10819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212706
112	NC_004342	GGC	2	6	10838	10843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212706
113	NC_004342	ATT	2	6	10922	10927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212706
114	NC_004342	CAA	2	6	10937	10942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212706
115	NC_004342	CTG	2	6	10992	10997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212706
116	NC_004342	GCT	2	6	11175	11180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212707
117	NC_004342	GAA	2	6	11262	11267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212707
118	NC_004342	CAT	2	6	11351	11356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212707
119	NC_004342	GTT	2	6	11371	11376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212707
120	NC_004342	GAG	2	6	11398	11403	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212707
121	NC_004342	GAA	2	6	11550	11555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212707
122	NC_004342	AGG	2	6	11695	11700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212707
123	NC_004342	GAA	2	6	11793	11798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212707
124	NC_004342	ACA	2	6	11831	11836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212707
125	NC_004342	GAT	2	6	11846	11851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212707
126	NC_004342	GAA	2	6	11865	11870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212707
127	NC_004342	ATT	2	6	11948	11953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212707
128	NC_004342	ACT	2	6	12036	12041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212707
129	NC_004342	CGA	3	9	12218	12226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294827554
130	NC_004342	TTG	2	6	12694	12699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212709
131	NC_004342	GAA	2	6	12721	12726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212709
132	NC_004342	AAG	2	6	12734	12739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212709
133	NC_004342	AAG	2	6	12938	12943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212709
134	NC_004342	GAT	2	6	13000	13005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212709
135	NC_004342	CGA	2	6	13019	13024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212709
136	NC_004342	ATT	2	6	13145	13150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212709
137	NC_004342	ACG	2	6	13151	13156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212709
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139	NC_004342	CTT	2	6	13198	13203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212709
140	NC_004342	CGA	2	6	13266	13271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212709
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146	NC_004342	GGA	2	6	14255	14260	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294827555
147	NC_004342	TGA	2	6	14303	14308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294827555
148	NC_004342	ATT	2	6	14372	14377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294827555
149	NC_004342	ACG	2	6	14428	14433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294827555
150	NC_004342	AAT	2	6	14448	14453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294827555
151	NC_004342	ATC	2	6	14530	14535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294827555
152	NC_004342	TTG	2	6	14550	14555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294827555
153	NC_004342	AGT	2	6	14595	14600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294827555
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155	NC_004342	ACC	2	6	15201	15206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	24212711
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162	NC_004342	TTG	2	6	15680	15685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212711
163	NC_004342	ATT	2	6	15715	15720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212711
164	NC_004342	TTC	2	6	15922	15927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827556
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172	NC_004342	CTT	2	6	16687	16692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827556
173	NC_004342	TAT	2	6	16729	16734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294827556
174	NC_004342	CGT	2	6	16741	16746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294827556
175	NC_004342	TTA	2	6	17079	17084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294827556
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184	NC_004342	CTT	2	6	18423	18428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212714
185	NC_004342	TTC	2	6	18499	18504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212714
186	NC_004342	AAT	2	6	18535	18540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212714
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