MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 69179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_004342	TGTT	2	8	230883	230890	0 %	75 %	25 %	0 %	294827598
4003	NC_004342	T	6	6	230900	230905	0 %	100 %	0 %	0 %	294827598
4004	NC_004342	GTT	2	6	230967	230972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294827598
4005	NC_004342	CCAG	2	8	230986	230993	25 %	0 %	25 %	50 %	294827598
4006	NC_004342	TG	3	6	231056	231061	0 %	50 %	50 %	0 %	294827598
4007	NC_004342	CTT	2	6	231111	231116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827598
4008	NC_004342	AC	3	6	231216	231221	50 %	0 %	0 %	50 %	294827598
4009	NC_004342	T	6	6	231253	231258	0 %	100 %	0 %	0 %	294827598
4010	NC_004342	AGG	2	6	231346	231351	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294827598
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4012	NC_004342	TGAG	2	8	231437	231444	25 %	25 %	50 %	0 %	294827598
4013	NC_004342	TCT	2	6	231455	231460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827598
4014	NC_004342	T	8	8	231473	231480	0 %	100 %	0 %	0 %	294827598
4015	NC_004342	TTC	2	6	231496	231501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827598
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4031	NC_004342	GTC	2	6	232067	232072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212935
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4035	NC_004342	TAG	2	6	232281	232286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212935
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4053	NC_004342	CA	3	6	234208	234213	50 %	0 %	0 %	50 %	24212937
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4092	NC_004342	T	6	6	235956	235961	0 %	100 %	0 %	0 %	294827599
4093	NC_004342	TC	3	6	235984	235989	0 %	50 %	0 %	50 %	294827599
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4096	NC_004342	CTTT	2	8	236207	236214	0 %	75 %	0 %	25 %	24212941
4097	NC_004342	T	7	7	236251	236257	0 %	100 %	0 %	0 %	24212941
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4108	NC_004342	ATC	2	6	236968	236973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294827600
4109	NC_004342	CA	4	8	237089	237096	50 %	0 %	0 %	50 %	294827600
4110	NC_004342	T	6	6	237151	237156	0 %	100 %	0 %	0 %	294827600
4111	NC_004342	TGA	2	6	237361	237366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294827600
4112	NC_004342	TTCA	2	8	237382	237389	25 %	50 %	0 %	25 %	294827600
4113	NC_004342	GATG	2	8	237416	237423	25 %	25 %	50 %	0 %	294827600
4114	NC_004342	ACA	2	6	237441	237446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294827600
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4116	NC_004342	A	6	6	237624	237629	100 %	0 %	0 %	0 %	294827600
4117	NC_004342	ACGG	2	8	237666	237673	25 %	0 %	50 %	25 %	294827600
4118	NC_004342	TCCT	2	8	237689	237696	0 %	50 %	0 %	50 %	294827600
4119	NC_004342	GA	3	6	237719	237724	50 %	0 %	50 %	0 %	294827600
4120	NC_004342	CTT	2	6	237826	237831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827600
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4122	NC_004342	CGAT	2	8	237980	237987	25 %	25 %	25 %	25 %	24212943
4123	NC_004342	TTCT	2	8	238030	238037	0 %	75 %	0 %	25 %	24212943
4124	NC_004342	ATG	2	6	238129	238134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212943
4125	NC_004342	CAT	2	6	238149	238154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212943
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4127	NC_004342	TTC	2	6	238419	238424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212943
4128	NC_004342	AGAA	2	8	238587	238594	75 %	0 %	25 %	0 %	24212943
4129	NC_004342	GAG	2	6	238628	238633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	24212943
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4132	NC_004342	TTC	2	6	238694	238699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212943
4133	NC_004342	TTC	2	6	238776	238781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212943
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4135	NC_004342	TGTT	2	8	238826	238833	0 %	75 %	25 %	0 %	24212943
4136	NC_004342	CGG	2	6	239001	239006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212943
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4152	NC_004342	A	6	6	239777	239782	100 %	0 %	0 %	0 %	24212944
4153	NC_004342	GCT	2	6	239927	239932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212944
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4159	NC_004342	A	7	7	241678	241684	100 %	0 %	0 %	0 %	24212947
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4236	NC_004342	AGA	2	6	245507	245512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212951
4237	NC_004342	GAAT	2	8	245587	245594	50 %	25 %	25 %	0 %	24212951
4238	NC_004342	AAG	2	6	245625	245630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212951
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4241	NC_004342	A	6	6	245670	245675	100 %	0 %	0 %	0 %	24212951
4242	NC_004342	AAC	2	6	245798	245803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212951
4243	NC_004342	GAT	2	6	245856	245861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212951
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4246	NC_004342	ATT	2	6	246004	246009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212951
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4252	NC_004342	A	6	6	246316	246321	100 %	0 %	0 %	0 %	24212951
4253	NC_004342	TGA	2	6	246349	246354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	24212951
4254	NC_004342	CTTC	2	8	246402	246409	0 %	50 %	0 %	50 %	24212951
4255	NC_004342	ATC	2	6	246420	246425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212951
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4371	NC_004342	AGA	2	6	254025	254030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294827603
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