MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Lai str. 56601 chromosome I

Total Repeats: 69179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004342	TCG	2	6	29037	29042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	24212726
502	NC_004342	TTA	2	6	29152	29157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212727
503	NC_004342	CATA	2	8	29167	29174	50 %	25 %	0 %	25 %	24212727
504	NC_004342	TAA	2	6	29236	29241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212727
505	NC_004342	AGAT	2	8	29282	29289	50 %	25 %	25 %	0 %	24212727
506	NC_004342	A	6	6	29321	29326	100 %	0 %	0 %	0 %	24212727
507	NC_004342	A	6	6	29328	29333	100 %	0 %	0 %	0 %	24212727
508	NC_004342	ATTA	2	8	29396	29403	50 %	50 %	0 %	0 %	24212727
509	NC_004342	T	6	6	29431	29436	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
510	NC_004342	ATTC	2	8	29490	29497	25 %	50 %	0 %	25 %	24212727
511	NC_004342	AAC	2	6	29524	29529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212727
512	NC_004342	ATTT	2	8	29538	29545	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
513	NC_004342	GAAAA	2	10	29596	29605	80 %	0 %	20 %	0 %	24212727
514	NC_004342	AAAC	2	8	29613	29620	75 %	0 %	0 %	25 %	24212727
515	NC_004342	AAG	2	6	29698	29703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212727
516	NC_004342	AT	4	8	29721	29728	50 %	50 %	0 %	0 %	24212727
517	NC_004342	TGT	2	6	29851	29856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212727
518	NC_004342	ATTT	2	8	29892	29899	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
519	NC_004342	GAA	2	6	29911	29916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212727
520	NC_004342	TAT	2	6	29925	29930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212727
521	NC_004342	T	7	7	29952	29958	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
522	NC_004342	T	8	8	29969	29976	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
523	NC_004342	CTT	2	6	29977	29982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212727
524	NC_004342	AAATCC	2	12	30008	30019	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	24212727
525	NC_004342	T	8	8	30037	30044	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
526	NC_004342	TTC	2	6	30056	30061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212727
527	NC_004342	CTT	2	6	30079	30084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212727
528	NC_004342	TAT	2	6	30087	30092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212727
529	NC_004342	T	6	6	30092	30097	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
530	NC_004342	ATT	2	6	30103	30108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212727
531	NC_004342	TC	3	6	30109	30114	0 %	50 %	0 %	50 %	24212727
532	NC_004342	CTT	2	6	30139	30144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212727
533	NC_004342	T	7	7	30143	30149	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
534	NC_004342	T	7	7	30154	30160	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
535	NC_004342	T	6	6	30171	30176	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
536	NC_004342	TATTT	2	10	30257	30266	20 %	80 %	0 %	0 %	24212727
537	NC_004342	T	7	7	30264	30270	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
538	NC_004342	A	6	6	30287	30292	100 %	0 %	0 %	0 %	24212727
539	NC_004342	TGG	2	6	30316	30321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	24212727
540	NC_004342	TGTA	2	8	30329	30336	25 %	50 %	25 %	0 %	24212727
541	NC_004342	T	6	6	30340	30345	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
542	NC_004342	T	7	7	30398	30404	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
543	NC_004342	TTTA	2	8	30412	30419	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
544	NC_004342	T	6	6	30420	30425	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
545	NC_004342	TAAA	2	8	30490	30497	75 %	25 %	0 %	0 %	24212727
546	NC_004342	AGAA	2	8	30511	30518	75 %	0 %	25 %	0 %	24212727
547	NC_004342	TTA	2	6	30547	30552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	24212727
548	NC_004342	TAGA	2	8	30559	30566	50 %	25 %	25 %	0 %	24212727
549	NC_004342	CTT	2	6	30625	30630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212727
550	NC_004342	GAA	2	6	30714	30719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212727
551	NC_004342	AT	3	6	30752	30757	50 %	50 %	0 %	0 %	24212727
552	NC_004342	ACG	2	6	30790	30795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212727
553	NC_004342	AGC	2	6	30800	30805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212727
554	NC_004342	CGATC	2	10	30865	30874	20 %	20 %	20 %	40 %	24212727
555	NC_004342	A	6	6	30887	30892	100 %	0 %	0 %	0 %	24212727
556	NC_004342	T	6	6	30893	30898	0 %	100 %	0 %	0 %	24212727
557	NC_004342	AGA	2	6	30978	30983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212727
558	NC_004342	CAT	2	6	31074	31079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	24212727
559	NC_004342	AAAG	2	8	31143	31150	75 %	0 %	25 %	0 %	24212727
560	NC_004342	AATC	2	8	31195	31202	50 %	25 %	0 %	25 %	24212727
561	NC_004342	GAA	2	6	31308	31313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212727
562	NC_004342	ATTT	2	8	31335	31342	25 %	75 %	0 %	0 %	24212727
563	NC_004342	TTC	2	6	31361	31366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212727
564	NC_004342	T	6	6	32047	32052	0 %	100 %	0 %	0 %	24212729
565	NC_004342	ATA	2	6	32053	32058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	24212729
566	NC_004342	T	7	7	32079	32085	0 %	100 %	0 %	0 %	24212729
567	NC_004342	T	6	6	32153	32158	0 %	100 %	0 %	0 %	24212729
568	NC_004342	A	6	6	32214	32219	100 %	0 %	0 %	0 %	24212729
569	NC_004342	GAA	2	6	32288	32293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	24212729
570	NC_004342	CGA	2	6	32322	32327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	24212729
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572	NC_004342	TCT	2	6	32458	32463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212729
573	NC_004342	T	6	6	32495	32500	0 %	100 %	0 %	0 %	24212729
574	NC_004342	A	6	6	32509	32514	100 %	0 %	0 %	0 %	24212729
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577	NC_004342	A	7	7	32588	32594	100 %	0 %	0 %	0 %	24212729
578	NC_004342	T	8	8	32622	32629	0 %	100 %	0 %	0 %	294827559
579	NC_004342	TG	3	6	32633	32638	0 %	50 %	50 %	0 %	294827559
580	NC_004342	GCA	2	6	32650	32655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294827559
581	NC_004342	GA	3	6	32668	32673	50 %	0 %	50 %	0 %	294827559
582	NC_004342	GGA	2	6	32717	32722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294827559
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590	NC_004342	CAT	2	6	32987	32992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294827559
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594	NC_004342	T	6	6	33280	33285	0 %	100 %	0 %	0 %	294827559
595	NC_004342	TTC	2	6	33330	33335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827559
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598	NC_004342	GAAAA	2	10	33464	33473	80 %	0 %	20 %	0 %	294827559
599	NC_004342	GAA	2	6	33539	33544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294827559
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601	NC_004342	AGG	2	6	33592	33597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294827559
602	NC_004342	TAA	2	6	33598	33603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294827559
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604	NC_004342	TTC	2	6	33697	33702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294827559
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609	NC_004342	TTCT	2	8	34113	34120	0 %	75 %	0 %	25 %	24212731
610	NC_004342	A	6	6	34147	34152	100 %	0 %	0 %	0 %	24212731
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614	NC_004342	CGG	2	6	34296	34301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	24212731
615	NC_004342	GTTTG	2	10	34333	34342	0 %	60 %	40 %	0 %	24212731
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621	NC_004342	T	6	6	34757	34762	0 %	100 %	0 %	0 %	24212732
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629	NC_004342	GAAA	2	8	35155	35162	75 %	0 %	25 %	0 %	24212733
630	NC_004342	GCTG	2	8	35217	35224	0 %	25 %	50 %	25 %	24212733
631	NC_004342	CAA	2	6	35284	35289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	24212733
632	NC_004342	TTC	2	6	35312	35317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	24212733
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634	NC_004342	TTG	2	6	35387	35392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	24212733
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