MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100

Total Repeats: 979

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003383	CTT	2	6	151	156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450287
2	NC_003383	CTT	2	6	261	266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450287
3	NC_003383	TCG	2	6	290	295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450287
4	NC_003383	TAA	2	6	520	525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450287
5	NC_003383	TTG	2	6	656	661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450288
6	NC_003383	TTG	2	6	669	674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450288
7	NC_003383	CAT	2	6	807	812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450288
8	NC_003383	ATC	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450289
9	NC_003383	TTC	2	6	868	873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450289
10	NC_003383	TCT	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450289
11	NC_003383	CTT	2	6	1023	1028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450289
12	NC_003383	TGT	2	6	1197	1202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450289
13	NC_003383	GAC	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450289
14	NC_003383	TAC	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450289
15	NC_003383	TTC	2	6	1726	1731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450289
16	NC_003383	AAT	2	6	1843	1848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450289
17	NC_003383	TTC	2	6	1849	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450289
18	NC_003383	AGG	2	6	1870	1875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18450289
19	NC_003383	ATA	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450289
20	NC_003383	GTA	2	6	2013	2018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450289
21	NC_003383	CCA	2	6	2222	2227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450290
22	NC_003383	GAT	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450290
23	NC_003383	TTC	2	6	2292	2297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
24	NC_003383	TGT	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450290
25	NC_003383	CCA	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450290
26	NC_003383	GAA	2	6	2376	2381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450290
27	NC_003383	TTA	2	6	2451	2456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450290
28	NC_003383	CCT	2	6	2540	2545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18450290
29	NC_003383	AAT	2	6	2577	2582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450290
30	NC_003383	TTC	2	6	2689	2694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
31	NC_003383	GCT	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450290
32	NC_003383	AAG	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450290
33	NC_003383	AAG	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450290
34	NC_003383	GAA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450290
35	NC_003383	TAG	2	6	2915	2920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450290
36	NC_003383	TGC	2	6	2941	2946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450290
37	NC_003383	TTC	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
38	NC_003383	TCA	2	6	3014	3019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450290
39	NC_003383	ACC	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450290
40	NC_003383	TTC	2	6	3070	3075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
41	NC_003383	GCA	2	6	3111	3116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450290
42	NC_003383	TTC	2	6	3205	3210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
43	NC_003383	TCT	2	6	3218	3223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
44	NC_003383	CTT	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
45	NC_003383	CTA	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450290
46	NC_003383	TCA	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450290
47	NC_003383	CAT	2	6	3609	3614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450290
48	NC_003383	TTC	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
49	NC_003383	ATT	2	6	3721	3726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450290
50	NC_003383	TGT	2	6	3779	3784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450290
51	NC_003383	TAT	2	6	3798	3803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450290
52	NC_003383	TAG	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450290
53	NC_003383	GAT	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450290
54	NC_003383	AGC	2	6	4247	4252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450290
55	NC_003383	TCA	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450290
56	NC_003383	CTG	2	6	4280	4285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450290
57	NC_003383	TTC	2	6	4390	4395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
58	NC_003383	CTT	2	6	4413	4418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450291
59	NC_003383	CTT	2	6	4427	4432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450291
60	NC_003383	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450291
61	NC_003383	AAT	2	6	4579	4584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450291
62	NC_003383	CCA	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450291
63	NC_003383	AAG	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450291
64	NC_003383	ATC	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450292
65	NC_003383	ATT	2	6	5057	5062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450292
66	NC_003383	TAC	2	6	5088	5093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450292
67	NC_003383	GTG	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450292
68	NC_003383	GAA	3	9	5250	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450292
69	NC_003383	GCT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450293
70	NC_003383	AGT	2	6	5508	5513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450293
71	NC_003383	TTA	2	6	5687	5692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450293
72	NC_003383	AAT	2	6	5694	5699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450293
73	NC_003383	ATC	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450293
74	NC_003383	CTT	2	6	5781	5786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450293
75	NC_003383	TCT	2	6	5816	5821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450293
76	NC_003383	CTT	2	6	5838	5843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450293
77	NC_003383	AAT	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450293
78	NC_003383	TCT	2	6	5864	5869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450293
79	NC_003383	ATC	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450294
80	NC_003383	TCT	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450294
81	NC_003383	TGG	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450294
82	NC_003383	TTC	2	6	6333	6338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450294
83	NC_003383	TTG	2	6	6375	6380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450294
84	NC_003383	TTG	2	6	6509	6514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450294
85	NC_003383	TAT	2	6	6629	6634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450294
86	NC_003383	ATA	2	6	6640	6645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450294
87	NC_003383	TGG	2	6	6694	6699	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450294
88	NC_003383	TTC	2	6	6758	6763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450294
89	NC_003383	GTT	2	6	7195	7200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450295
90	NC_003383	CTG	2	6	7349	7354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450295
91	NC_003383	ATG	2	6	7364	7369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450295
92	NC_003383	CTT	2	6	7411	7416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450295
93	NC_003383	GCT	2	6	7435	7440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450295
94	NC_003383	CTT	2	6	7507	7512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450295
95	NC_003383	TCT	2	6	7560	7565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450295
96	NC_003383	GAT	2	6	7567	7572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450295
97	NC_003383	AAT	2	6	7582	7587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450295
98	NC_003383	GTG	2	6	7738	7743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450295
99	NC_003383	AAG	2	6	7745	7750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450295
100	NC_003383	ATC	2	6	7766	7771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450295
101	NC_003383	TAC	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450295
102	NC_003383	GCT	2	6	7989	7994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450295
103	NC_003383	CTT	2	6	8020	8025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450295
104	NC_003383	TTG	2	6	8060	8065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450295
105	NC_003383	CTT	2	6	8323	8328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450295
106	NC_003383	TCA	2	6	8376	8381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450295
107	NC_003383	TTC	2	6	8415	8420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450295
108	NC_003383	TCG	2	6	8455	8460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450295
109	NC_003383	CGG	2	6	8473	8478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18450295
110	NC_003383	TAC	2	6	8505	8510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450296
111	NC_003383	CTT	2	6	8537	8542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450296
112	NC_003383	CTT	3	9	8579	8587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450296
113	NC_003383	TAA	2	6	8600	8605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450296
114	NC_003383	GAA	2	6	8628	8633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450296
115	NC_003383	CTT	2	6	8636	8641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450296
116	NC_003383	AAG	2	6	8659	8664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450296
117	NC_003383	GTT	2	6	8667	8672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450296
118	NC_003383	ATT	2	6	8709	8714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450296
119	NC_003383	GAT	2	6	8817	8822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450296
120	NC_003383	TCA	2	6	8873	8878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450296
121	NC_003383	TCC	2	6	8931	8936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18450297
122	NC_003383	GTT	2	6	8959	8964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450297
123	NC_003383	CTT	2	6	9016	9021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450297
124	NC_003383	GAT	2	6	9034	9039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450297
125	NC_003383	TTC	2	6	9044	9049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450297
126	NC_003383	GCG	2	6	9054	9059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	18450297
127	NC_003383	CAG	2	6	9659	9664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450298
128	NC_003383	ATT	2	6	9671	9676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450298
129	NC_003383	CTA	2	6	9688	9693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450298
130	NC_003383	ACG	2	6	9764	9769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450298
131	NC_003383	ACT	2	6	9799	9804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450298
132	NC_003383	ATT	2	6	9891	9896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450298
133	NC_003383	AGC	2	6	9964	9969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450298
134	NC_003383	TGA	2	6	10003	10008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450298
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138	NC_003383	TCT	2	6	10540	10545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450299
139	NC_003383	TTA	2	6	10627	10632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450299
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141	NC_003383	ATT	2	6	10749	10754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450299
142	NC_003383	ATT	2	6	10773	10778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450299
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155	NC_003383	AAT	2	6	11369	11374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450300
156	NC_003383	TAG	2	6	11449	11454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450300
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161	NC_003383	TCT	2	6	11640	11645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450301
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163	NC_003383	TCT	2	6	11682	11687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450301
164	NC_003383	ACC	2	6	11729	11734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450301
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252	NC_003383	AAC	2	6	19285	19290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450304
253	NC_003383	ATT	2	6	19471	19476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450304
254	NC_003383	ATC	2	6	19834	19839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450304
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256	NC_003383	CAA	2	6	19890	19895	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450304
257	NC_003383	ATC	2	6	20167	20172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450304
258	NC_003383	CCA	2	6	20211	20216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450305
259	NC_003383	TTC	2	6	20238	20243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450305
260	NC_003383	TAT	2	6	20249	20254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450305
261	NC_003383	ATC	2	6	20289	20294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450305
262	NC_003383	TCT	2	6	20335	20340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450305
263	NC_003383	TTC	2	6	20346	20351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450305
264	NC_003383	GTT	3	9	20381	20389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450305
265	NC_003383	TCA	2	6	20482	20487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450305
266	NC_003383	ATT	2	6	20493	20498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450305
267	NC_003383	GTC	2	6	20505	20510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450305
268	NC_003383	TTG	2	6	20523	20528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450305
269	NC_003383	TAA	2	6	20567	20572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450305
270	NC_003383	TCA	2	6	20729	20734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450305
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272	NC_003383	GGT	2	6	20842	20847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450306
273	NC_003383	TCT	2	6	21045	21050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450306
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280	NC_003383	TTC	2	6	21674	21679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450306
281	NC_003383	TTC	2	6	21713	21718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450306
282	NC_003383	ACT	2	6	21816	21821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450306
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284	NC_003383	ATT	2	6	22339	22344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450307
285	NC_003383	GCC	2	6	22493	22498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18450307
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287	NC_003383	AGT	2	6	22767	22772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450307
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291	NC_003383	TTG	2	6	23125	23130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450308
292	NC_003383	ATC	3	9	23146	23154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450308
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294	NC_003383	AAT	2	6	23428	23433	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450309
295	NC_003383	CAA	3	9	23473	23481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450309
296	NC_003383	GTT	2	6	23505	23510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450309
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381	NC_003383	TGT	2	6	29145	29150	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450314
382	NC_003383	ACC	2	6	29151	29156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450314
383	NC_003383	AGT	2	6	29157	29162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450314
384	NC_003383	TCC	2	6	29185	29190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18450314
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