MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100

Total Repeats: 1597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003383	CTT	2	6	151	156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450287
2	NC_003383	TTTC	2	8	215	222	0 %	75 %	0 %	25 %	18450287
3	NC_003383	AAGT	2	8	247	254	50 %	25 %	25 %	0 %	18450287
4	NC_003383	CTT	2	6	261	266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450287
5	NC_003383	TCG	2	6	290	295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450287
6	NC_003383	T	7	7	322	328	0 %	100 %	0 %	0 %	18450287
7	NC_003383	AACA	2	8	398	405	75 %	0 %	0 %	25 %	18450287
8	NC_003383	CGAT	2	8	416	423	25 %	25 %	25 %	25 %	18450287
9	NC_003383	TAA	2	6	520	525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450287
10	NC_003383	TTG	2	6	656	661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450288
11	NC_003383	TTG	2	6	669	674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450288
12	NC_003383	TTTC	2	8	746	753	0 %	75 %	0 %	25 %	18450288
13	NC_003383	AATTC	2	10	764	773	40 %	40 %	0 %	20 %	18450288
14	NC_003383	CAT	2	6	807	812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450288
15	NC_003383	ATC	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450289
16	NC_003383	TTC	2	6	868	873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450289
17	NC_003383	TCT	2	6	875	880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450289
18	NC_003383	CAAA	2	8	986	993	75 %	0 %	0 %	25 %	18450289
19	NC_003383	CTT	2	6	1023	1028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450289
20	NC_003383	AT	3	6	1034	1039	50 %	50 %	0 %	0 %	18450289
21	NC_003383	GATG	2	8	1146	1153	25 %	25 %	50 %	0 %	18450289
22	NC_003383	TGT	2	6	1197	1202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450289
23	NC_003383	AT	3	6	1246	1251	50 %	50 %	0 %	0 %	18450289
24	NC_003383	TTTG	2	8	1340	1347	0 %	75 %	25 %	0 %	18450289
25	NC_003383	GAC	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450289
26	NC_003383	TG	3	6	1427	1432	0 %	50 %	50 %	0 %	18450289
27	NC_003383	TAC	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450289
28	NC_003383	TTTC	2	8	1656	1663	0 %	75 %	0 %	25 %	18450289
29	NC_003383	TTC	2	6	1726	1731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450289
30	NC_003383	T	6	6	1783	1788	0 %	100 %	0 %	0 %	18450289
31	NC_003383	AAT	2	6	1843	1848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450289
32	NC_003383	TTC	2	6	1849	1854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450289
33	NC_003383	AGG	2	6	1870	1875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	18450289
34	NC_003383	TC	4	8	1888	1895	0 %	50 %	0 %	50 %	18450289
35	NC_003383	ATA	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450289
36	NC_003383	TCAT	2	8	2000	2007	25 %	50 %	0 %	25 %	18450289
37	NC_003383	GTA	2	6	2013	2018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450289
38	NC_003383	ACCA	2	8	2174	2181	50 %	0 %	0 %	50 %	18450290
39	NC_003383	CA	3	6	2200	2205	50 %	0 %	0 %	50 %	18450290
40	NC_003383	CCA	2	6	2222	2227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450290
41	NC_003383	GAT	2	6	2268	2273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450290
42	NC_003383	TTC	2	6	2292	2297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
43	NC_003383	TGT	2	6	2317	2322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450290
44	NC_003383	CCA	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450290
45	NC_003383	GAA	2	6	2376	2381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450290
46	NC_003383	CCCA	2	8	2407	2414	25 %	0 %	0 %	75 %	18450290
47	NC_003383	TTA	2	6	2451	2456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450290
48	NC_003383	GC	3	6	2482	2487	0 %	0 %	50 %	50 %	18450290
49	NC_003383	TCTT	2	8	2495	2502	0 %	75 %	0 %	25 %	18450290
50	NC_003383	AT	3	6	2534	2539	50 %	50 %	0 %	0 %	18450290
51	NC_003383	CCT	2	6	2540	2545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	18450290
52	NC_003383	AAT	2	6	2577	2582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450290
53	NC_003383	TTC	2	6	2689	2694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
54	NC_003383	GCT	2	6	2714	2719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450290
55	NC_003383	T	7	7	2731	2737	0 %	100 %	0 %	0 %	18450290
56	NC_003383	AAG	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450290
57	NC_003383	AAG	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450290
58	NC_003383	T	6	6	2847	2852	0 %	100 %	0 %	0 %	18450290
59	NC_003383	GAA	2	6	2874	2879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450290
60	NC_003383	CGAT	2	8	2891	2898	25 %	25 %	25 %	25 %	18450290
61	NC_003383	TAG	2	6	2915	2920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450290
62	NC_003383	TGC	2	6	2941	2946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450290
63	NC_003383	TTC	2	6	2953	2958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
64	NC_003383	TCA	2	6	3014	3019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450290
65	NC_003383	ACC	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450290
66	NC_003383	AT	3	6	3060	3065	50 %	50 %	0 %	0 %	18450290
67	NC_003383	TTC	2	6	3070	3075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
68	NC_003383	GCA	2	6	3111	3116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450290
69	NC_003383	TTC	2	6	3205	3210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
70	NC_003383	TCT	2	6	3218	3223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
71	NC_003383	GTTT	2	8	3253	3260	0 %	75 %	25 %	0 %	18450290
72	NC_003383	AAAT	2	8	3268	3275	75 %	25 %	0 %	0 %	18450290
73	NC_003383	A	7	7	3307	3313	100 %	0 %	0 %	0 %	18450290
74	NC_003383	CTT	2	6	3339	3344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
75	NC_003383	CTA	2	6	3345	3350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450290
76	NC_003383	TCGG	2	8	3427	3434	0 %	25 %	50 %	25 %	18450290
77	NC_003383	CTTT	2	8	3439	3446	0 %	75 %	0 %	25 %	18450290
78	NC_003383	TCTTG	2	10	3476	3485	0 %	60 %	20 %	20 %	18450290
79	NC_003383	TCA	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450290
80	NC_003383	TTTC	2	8	3560	3567	0 %	75 %	0 %	25 %	18450290
81	NC_003383	CAT	2	6	3609	3614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450290
82	NC_003383	TTC	2	6	3615	3620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
83	NC_003383	CT	3	6	3704	3709	0 %	50 %	0 %	50 %	18450290
84	NC_003383	T	6	6	3709	3714	0 %	100 %	0 %	0 %	18450290
85	NC_003383	ATT	2	6	3721	3726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450290
86	NC_003383	TGT	2	6	3779	3784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450290
87	NC_003383	TAT	2	6	3798	3803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450290
88	NC_003383	TAG	2	6	3838	3843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450290
89	NC_003383	GAT	2	6	3880	3885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450290
90	NC_003383	A	6	6	3916	3921	100 %	0 %	0 %	0 %	18450290
91	NC_003383	AT	3	6	4104	4109	50 %	50 %	0 %	0 %	18450290
92	NC_003383	CTTT	2	8	4120	4127	0 %	75 %	0 %	25 %	18450290
93	NC_003383	AGC	2	6	4247	4252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450290
94	NC_003383	TCA	2	6	4256	4261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450290
95	NC_003383	CTG	2	6	4280	4285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450290
96	NC_003383	T	7	7	4371	4377	0 %	100 %	0 %	0 %	18450290
97	NC_003383	T	6	6	4379	4384	0 %	100 %	0 %	0 %	18450290
98	NC_003383	TTC	2	6	4390	4395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450290
99	NC_003383	CTT	2	6	4413	4418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450291
100	NC_003383	CTT	2	6	4427	4432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450291
101	NC_003383	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450291
102	NC_003383	A	7	7	4534	4540	100 %	0 %	0 %	0 %	18450291
103	NC_003383	AAT	2	6	4579	4584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450291
104	NC_003383	CCA	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	18450291
105	NC_003383	GCTT	2	8	4663	4670	0 %	50 %	25 %	25 %	18450291
106	NC_003383	ACTA	2	8	4735	4742	50 %	25 %	0 %	25 %	18450291
107	NC_003383	AAG	2	6	4751	4756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450291
108	NC_003383	CGATC	2	10	4761	4770	20 %	20 %	20 %	40 %	18450291
109	NC_003383	AT	3	6	4773	4778	50 %	50 %	0 %	0 %	18450291
110	NC_003383	A	7	7	5018	5024	100 %	0 %	0 %	0 %	18450292
111	NC_003383	ATC	2	6	5041	5046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450292
112	NC_003383	ATT	2	6	5057	5062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450292
113	NC_003383	TAC	2	6	5088	5093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450292
114	NC_003383	GTG	2	6	5098	5103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450292
115	NC_003383	ACTT	2	8	5142	5149	25 %	50 %	0 %	25 %	18450292
116	NC_003383	GAA	3	9	5250	5258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450292
117	NC_003383	A	6	6	5311	5316	100 %	0 %	0 %	0 %	18450292
118	NC_003383	T	6	6	5373	5378	0 %	100 %	0 %	0 %	18450293
119	NC_003383	GCT	2	6	5414	5419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450293
120	NC_003383	T	6	6	5475	5480	0 %	100 %	0 %	0 %	18450293
121	NC_003383	AGT	2	6	5508	5513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450293
122	NC_003383	AC	3	6	5533	5538	50 %	0 %	0 %	50 %	18450293
123	NC_003383	T	6	6	5586	5591	0 %	100 %	0 %	0 %	18450293
124	NC_003383	ACTTC	2	10	5645	5654	20 %	40 %	0 %	40 %	18450293
125	NC_003383	TTA	2	6	5687	5692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450293
126	NC_003383	AAT	2	6	5694	5699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450293
127	NC_003383	ATC	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450293
128	NC_003383	CTT	2	6	5781	5786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450293
129	NC_003383	TCT	2	6	5816	5821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450293
130	NC_003383	CTT	2	6	5838	5843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450293
131	NC_003383	AAT	2	6	5849	5854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450293
132	NC_003383	TCT	2	6	5864	5869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450293
133	NC_003383	ATC	2	6	6006	6011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450294
134	NC_003383	T	6	6	6019	6024	0 %	100 %	0 %	0 %	18450294
135	NC_003383	TTTTG	2	10	6091	6100	0 %	80 %	20 %	0 %	18450294
136	NC_003383	TCT	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450294
137	NC_003383	TGG	2	6	6180	6185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	18450294
138	NC_003383	TTCT	2	8	6318	6325	0 %	75 %	0 %	25 %	18450294
139	NC_003383	TTC	2	6	6333	6338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450294
140	NC_003383	TTG	2	6	6375	6380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450294
141	NC_003383	TTG	2	6	6509	6514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450294
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275	NC_003383	AAT	2	6	11815	11820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450301
276	NC_003383	CTG	2	6	11857	11862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450301
277	NC_003383	T	7	7	11884	11890	0 %	100 %	0 %	0 %	18450301
278	NC_003383	T	6	6	11904	11909	0 %	100 %	0 %	0 %	18450301
279	NC_003383	AAC	2	6	11924	11929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450301
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281	NC_003383	TCT	2	6	11976	11981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450301
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285	NC_003383	T	6	6	12111	12116	0 %	100 %	0 %	0 %	18450301
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289	NC_003383	GTT	2	6	12273	12278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450301
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301	NC_003383	T	6	6	13397	13402	0 %	100 %	0 %	0 %	18450302
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310	NC_003383	A	6	6	13629	13634	100 %	0 %	0 %	0 %	18450302
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315	NC_003383	AT	3	6	14968	14973	50 %	50 %	0 %	0 %	18450303
316	NC_003383	TTTCT	2	10	15010	15019	0 %	80 %	0 %	20 %	18450303
317	NC_003383	AATA	2	8	15029	15036	75 %	25 %	0 %	0 %	18450303
318	NC_003383	TG	3	6	15072	15077	0 %	50 %	50 %	0 %	18450303
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328	NC_003383	TA	3	6	15880	15885	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
329	NC_003383	ATA	2	6	15940	15945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450304
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390	NC_003383	TTC	2	6	18721	18726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450304
391	NC_003383	CAT	2	6	18768	18773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450304
392	NC_003383	CAT	2	6	18814	18819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450304
393	NC_003383	CAT	2	6	18849	18854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450304
394	NC_003383	CGTT	2	8	18886	18893	0 %	50 %	25 %	25 %	18450304
395	NC_003383	TGC	2	6	18910	18915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450304
396	NC_003383	TCA	2	6	18917	18922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450304
397	NC_003383	GAA	2	6	18991	18996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450304
398	NC_003383	TCA	2	6	19016	19021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450304
399	NC_003383	TGA	2	6	19027	19032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450304
400	NC_003383	T	8	8	19058	19065	0 %	100 %	0 %	0 %	18450304
401	NC_003383	AT	3	6	19078	19083	50 %	50 %	0 %	0 %	18450304
402	NC_003383	CTT	2	6	19161	19166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450304
403	NC_003383	TCA	2	6	19202	19207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450304
404	NC_003383	ATA	2	6	19211	19216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450304
405	NC_003383	CTT	2	6	19236	19241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450304
406	NC_003383	AAC	2	6	19285	19290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450304
407	NC_003383	GGTT	2	8	19300	19307	0 %	50 %	50 %	0 %	18450304
408	NC_003383	ATT	2	6	19471	19476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450304
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410	NC_003383	CT	3	6	19678	19683	0 %	50 %	0 %	50 %	18450304
411	NC_003383	T	6	6	19687	19692	0 %	100 %	0 %	0 %	18450304
412	NC_003383	T	6	6	19696	19701	0 %	100 %	0 %	0 %	18450304
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