MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria innocua Clip11262 plasmid pLI100

Total Repeats: 1597

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_003383	GTT	2	6	73652	73657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450354
1502	NC_003383	AAGC	2	8	73808	73815	50 %	0 %	25 %	25 %	18450354
1503	NC_003383	A	7	7	73876	73882	100 %	0 %	0 %	0 %	18450354
1504	NC_003383	TTTA	2	8	73890	73897	25 %	75 %	0 %	0 %	18450354
1505	NC_003383	AAC	2	6	73998	74003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450354
1506	NC_003383	CTT	2	6	74149	74154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450354
1507	NC_003383	A	6	6	74165	74170	100 %	0 %	0 %	0 %	18450354
1508	NC_003383	GAA	2	6	74171	74176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450354
1509	NC_003383	TTC	2	6	74194	74199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450354
1510	NC_003383	AT	3	6	74230	74235	50 %	50 %	0 %	0 %	18450354
1511	NC_003383	GAA	2	6	74291	74296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450354
1512	NC_003383	T	6	6	74305	74310	0 %	100 %	0 %	0 %	18450354
1513	NC_003383	T	6	6	74335	74340	0 %	100 %	0 %	0 %	18450354
1514	NC_003383	TAT	2	6	74917	74922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450355
1515	NC_003383	TCAC	2	8	74956	74963	25 %	25 %	0 %	50 %	18450355
1516	NC_003383	CAA	2	6	74987	74992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	18450355
1517	NC_003383	TTTC	2	8	75047	75054	0 %	75 %	0 %	25 %	18450355
1518	NC_003383	TTC	2	6	75144	75149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450355
1519	NC_003383	CAT	2	6	75182	75187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450355
1520	NC_003383	A	6	6	75188	75193	100 %	0 %	0 %	0 %	18450355
1521	NC_003383	ACTC	2	8	75269	75276	25 %	25 %	0 %	50 %	18450355
1522	NC_003383	TCT	2	6	75340	75345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450355
1523	NC_003383	TCA	2	6	75368	75373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450355
1524	NC_003383	ATC	2	6	75378	75383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450355
1525	NC_003383	CTT	2	6	75410	75415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450355
1526	NC_003383	CAGC	2	8	75501	75508	25 %	0 %	25 %	50 %	18450355
1527	NC_003383	TCA	2	6	75580	75585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450355
1528	NC_003383	TCT	2	6	75697	75702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450355
1529	NC_003383	T	7	7	75718	75724	0 %	100 %	0 %	0 %	18450355
1530	NC_003383	AGC	2	6	75727	75732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450355
1531	NC_003383	CTT	2	6	75806	75811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450355
1532	NC_003383	TCT	2	6	75892	75897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450355
1533	NC_003383	TTA	2	6	75922	75927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450356
1534	NC_003383	CGA	2	6	76033	76038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450356
1535	NC_003383	T	6	6	76297	76302	0 %	100 %	0 %	0 %	18450357
1536	NC_003383	TAT	2	6	76308	76313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450357
1537	NC_003383	TGTT	2	8	76330	76337	0 %	75 %	25 %	0 %	18450357
1538	NC_003383	T	6	6	76441	76446	0 %	100 %	0 %	0 %	18450357
1539	NC_003383	AT	3	6	76469	76474	50 %	50 %	0 %	0 %	18450357
1540	NC_003383	ATTTT	2	10	76502	76511	20 %	80 %	0 %	0 %	18450357
1541	NC_003383	GAT	2	6	76641	76646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450357
1542	NC_003383	ATAA	2	8	76704	76711	75 %	25 %	0 %	0 %	18450357
1543	NC_003383	CGC	2	6	76715	76720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	18450357
1544	NC_003383	A	6	6	76777	76782	100 %	0 %	0 %	0 %	18450357
1545	NC_003383	T	6	6	76786	76791	0 %	100 %	0 %	0 %	18450357
1546	NC_003383	TAC	2	6	76798	76803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450357
1547	NC_003383	GAA	2	6	77853	77858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450358
1548	NC_003383	AAG	2	6	77895	77900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450358
1549	NC_003383	CTT	2	6	77968	77973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450358
1550	NC_003383	CGA	2	6	77991	77996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450358
1551	NC_003383	TTC	2	6	78002	78007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450358
1552	NC_003383	TTC	2	6	78009	78014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450358
1553	NC_003383	AAAG	2	8	78023	78030	75 %	0 %	25 %	0 %	18450358
1554	NC_003383	GAA	2	6	78148	78153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450358
1555	NC_003383	GCTC	2	8	78186	78193	0 %	25 %	25 %	50 %	18450358
1556	NC_003383	GA	3	6	78256	78261	50 %	0 %	50 %	0 %	18450358
1557	NC_003383	T	7	7	78296	78302	0 %	100 %	0 %	0 %	18450358
1558	NC_003383	AGA	2	6	78386	78391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	18450358
1559	NC_003383	AAT	2	6	78569	78574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	18450358
1560	NC_003383	TTG	2	6	78584	78589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450358
1561	NC_003383	T	7	7	78751	78757	0 %	100 %	0 %	0 %	18450359
1562	NC_003383	TCT	3	9	78770	78778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450359
1563	NC_003383	GA	3	6	78888	78893	50 %	0 %	50 %	0 %	18450359
1564	NC_003383	AGC	2	6	78913	78918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450359
1565	NC_003383	TCA	2	6	78968	78973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	18450359
1566	NC_003383	T	6	6	78976	78981	0 %	100 %	0 %	0 %	18450359
1567	NC_003383	A	6	6	80407	80412	100 %	0 %	0 %	0 %	18450360
1568	NC_003383	TTTA	2	8	80413	80420	25 %	75 %	0 %	0 %	18450360
1569	NC_003383	GT	3	6	80440	80445	0 %	50 %	50 %	0 %	18450360
1570	NC_003383	TTA	2	6	80502	80507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450360
1571	NC_003383	GTA	2	6	80514	80519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450360
1572	NC_003383	A	6	6	80628	80633	100 %	0 %	0 %	0 %	18450360
1573	NC_003383	ATT	2	6	80658	80663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450360
1574	NC_003383	T	6	6	80699	80704	0 %	100 %	0 %	0 %	18450360
1575	NC_003383	T	6	6	80745	80750	0 %	100 %	0 %	0 %	18450360
1576	NC_003383	ATT	2	6	80757	80762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450360
1577	NC_003383	CAAA	2	8	80820	80827	75 %	0 %	0 %	25 %	18450360
1578	NC_003383	TGA	2	6	80861	80866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450360
1579	NC_003383	TTG	2	6	80880	80885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450360
1580	NC_003383	T	6	6	80931	80936	0 %	100 %	0 %	0 %	18450360
1581	NC_003383	CTT	2	6	80952	80957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450360
1582	NC_003383	TTTA	2	8	80983	80990	25 %	75 %	0 %	0 %	18450360
1583	NC_003383	CTT	2	6	81080	81085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	18450360
1584	NC_003383	T	6	6	81138	81143	0 %	100 %	0 %	0 %	18450360
1585	NC_003383	AGC	2	6	81172	81177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450360
1586	NC_003383	AGAA	2	8	81184	81191	75 %	0 %	25 %	0 %	18450360
1587	NC_003383	AGC	2	6	81245	81250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	18450360
1588	NC_003383	ATT	2	6	81312	81317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450360
1589	NC_003383	GTT	2	6	81331	81336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450360
1590	NC_003383	TGC	2	6	81341	81346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450360
1591	NC_003383	AAGT	2	8	81353	81360	50 %	25 %	25 %	0 %	18450360
1592	NC_003383	GTC	2	6	81364	81369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	18450360
1593	NC_003383	ATG	2	6	81396	81401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450360
1594	NC_003383	TGA	2	6	81496	81501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	18450360
1595	NC_003383	GCTT	2	8	81530	81537	0 %	50 %	25 %	25 %	18450360
1596	NC_003383	ATT	2	6	81661	81666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	18450361
1597	NC_003383	GTT	2	6	81702	81707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	18450361

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.