MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 38259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003210	CAA	2	6	406	411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802049
2	NC_003210	TAT	2	6	440	445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802049
3	NC_003210	AAT	2	6	456	461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802049
4	NC_003210	GAA	2	6	567	572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802049
5	NC_003210	GCA	2	6	705	710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802049
6	NC_003210	GGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802049
7	NC_003210	CAA	2	6	819	824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802049
8	NC_003210	TTA	2	6	880	885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802049
9	NC_003210	ATA	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802049
10	NC_003210	GAA	2	6	909	914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802049
11	NC_003210	TGA	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802049
12	NC_003210	AAG	2	6	979	984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802049
13	NC_003210	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802049
14	NC_003210	ATT	3	9	1041	1049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802049
15	NC_003210	CCA	2	6	1137	1142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802049
16	NC_003210	AGT	2	6	1277	1282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802049
17	NC_003210	TTC	2	6	1289	1294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802049
18	NC_003210	TAA	2	6	1301	1306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802049
19	NC_003210	GCA	2	6	1326	1331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802049
20	NC_003210	TTA	2	6	1372	1377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802049
21	NC_003210	AAG	2	6	1393	1398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802049
22	NC_003210	AGA	2	6	1427	1432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802049
23	NC_003210	TGA	2	6	1532	1537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802049
24	NC_003210	TGG	2	6	1541	1546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802049
25	NC_003210	ACA	2	6	1557	1562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802049
26	NC_003210	ACT	2	6	1592	1597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802049
27	NC_003210	AAC	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802050
28	NC_003210	ATG	2	6	1979	1984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802050
29	NC_003210	ATG	2	6	2051	2056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802050
30	NC_003210	TGG	2	6	2082	2087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802050
31	NC_003210	CGT	2	6	2125	2130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802050
32	NC_003210	AGA	2	6	2136	2141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802050
33	NC_003210	CCT	2	6	2198	2203	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16802050
34	NC_003210	TGA	2	6	2451	2456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802050
35	NC_003210	CAA	2	6	2547	2552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802050
36	NC_003210	TAT	2	6	2579	2584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802050
37	NC_003210	TAA	2	6	2724	2729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802050
38	NC_003210	TTA	2	6	2732	2737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802050
39	NC_003210	TCC	2	6	2773	2778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16802050
40	NC_003210	GAA	2	6	2836	2841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802050
41	NC_003210	ATG	2	6	2869	2874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802050
42	NC_003210	TGA	2	6	2898	2903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802050
43	NC_003210	ATG	2	6	3121	3126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802051
44	NC_003210	ACA	2	6	3136	3141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802051
45	NC_003210	GAT	2	6	3216	3221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802051
46	NC_003210	TTG	2	6	3233	3238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802051
47	NC_003210	GCT	2	6	3265	3270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802051
48	NC_003210	ATT	2	6	3313	3318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802051
49	NC_003210	GGT	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802051
50	NC_003210	ATT	2	6	3430	3435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802051
51	NC_003210	CTT	2	6	3469	3474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802051
52	NC_003210	GAT	2	6	3505	3510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802051
53	NC_003210	CTA	2	6	3512	3517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802051
54	NC_003210	ACC	2	6	3526	3531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802051
55	NC_003210	TGT	2	6	3666	3671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802051
56	NC_003210	GCT	2	6	3697	3702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802051
57	NC_003210	TAA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802051
58	NC_003210	CGG	2	6	3938	3943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802051
59	NC_003210	AGC	2	6	3990	3995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802051
60	NC_003210	TCC	2	6	3997	4002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16802051
61	NC_003210	TTA	2	6	4135	4140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802051
62	NC_003210	TTA	2	6	4169	4174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802051
63	NC_003210	TGT	2	6	4236	4241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802051
64	NC_003210	TGG	2	6	4363	4368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802051
65	NC_003210	CGA	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802051
66	NC_003210	TGG	2	6	4721	4726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802052
67	NC_003210	TAT	2	6	5048	5053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802053
68	NC_003210	AGA	2	6	5063	5068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802053
69	NC_003210	CAA	2	6	5340	5345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802053
70	NC_003210	GCG	2	6	5487	5492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802053
71	NC_003210	TCA	2	6	5498	5503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802053
72	NC_003210	GTG	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802053
73	NC_003210	GAT	2	6	5667	5672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802053
74	NC_003210	GAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802053
75	NC_003210	CTT	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802053
76	NC_003210	GAT	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802053
77	NC_003210	CGA	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802053
78	NC_003210	ACA	2	6	5895	5900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802053
79	NC_003210	CAA	2	6	5938	5943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802053
80	NC_003210	AGA	2	6	6035	6040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802054
81	NC_003210	TTG	2	6	6187	6192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802054
82	NC_003210	TGA	2	6	6203	6208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802054
83	NC_003210	GTC	2	6	6319	6324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802054
84	NC_003210	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802054
85	NC_003210	GGC	3	9	6372	6380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802054
86	NC_003210	GTG	2	6	6499	6504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802054
87	NC_003210	GTA	2	6	6507	6512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802054
88	NC_003210	GAA	2	6	6522	6527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802054
89	NC_003210	AAC	2	6	6593	6598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802054
90	NC_003210	GAA	2	6	6687	6692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802054
91	NC_003210	CCA	2	6	6780	6785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802054
92	NC_003210	GAT	2	6	6807	6812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802054
93	NC_003210	ATA	2	6	6838	6843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802054
94	NC_003210	CAT	2	6	6860	6865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802054
95	NC_003210	TTA	2	6	6940	6945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802054
96	NC_003210	TAA	2	6	6962	6967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802054
97	NC_003210	TGA	2	6	6983	6988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802054
98	NC_003210	ATT	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802054
99	NC_003210	ATG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802054
100	NC_003210	GCT	2	6	7215	7220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802054
101	NC_003210	TTC	2	6	7295	7300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802054
102	NC_003210	TGG	2	6	7349	7354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802054
103	NC_003210	GAA	2	6	7458	7463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802054
104	NC_003210	TGG	2	6	7499	7504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802054
105	NC_003210	ACT	2	6	7586	7591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802054
106	NC_003210	ACC	2	6	7655	7660	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802054
107	NC_003210	AGA	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802054
108	NC_003210	AAC	2	6	7798	7803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802054
109	NC_003210	ACA	2	6	7812	7817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802054
110	NC_003210	ACT	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802054
111	NC_003210	TCG	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802054
112	NC_003210	TAA	2	6	7968	7973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802054
113	NC_003210	CAT	2	6	8123	8128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802055
114	NC_003210	TTG	2	6	8153	8158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802055
115	NC_003210	CGT	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802055
116	NC_003210	GCA	2	6	8416	8421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802055
117	NC_003210	ACT	2	6	8466	8471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802055
118	NC_003210	TAA	2	6	8481	8486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802055
119	NC_003210	TTA	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802055
120	NC_003210	CAA	2	6	8603	8608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802055
121	NC_003210	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802055
122	NC_003210	CTG	2	6	8723	8728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802055
123	NC_003210	GAT	2	6	8730	8735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
124	NC_003210	GAA	2	6	8812	8817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802055
125	NC_003210	TTA	2	6	8843	8848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802055
126	NC_003210	GAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802055
127	NC_003210	ATG	2	6	8942	8947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
128	NC_003210	TCG	2	6	8985	8990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802055
129	NC_003210	AAT	2	6	9016	9021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802055
130	NC_003210	ACT	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802055
131	NC_003210	TAT	3	9	9118	9126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802055
132	NC_003210	AGT	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
133	NC_003210	TCG	2	6	9150	9155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802055
134	NC_003210	ATT	2	6	9241	9246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802055
135	NC_003210	AAG	2	6	9284	9289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802055
136	NC_003210	TGA	2	6	9293	9298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
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138	NC_003210	TAG	2	6	9404	9409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
139	NC_003210	TGA	3	9	9441	9449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
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141	NC_003210	GAA	2	6	9472	9477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802055
142	NC_003210	AGA	2	6	9480	9485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802055
143	NC_003210	CGT	2	6	9511	9516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802055
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145	NC_003210	GGT	2	6	9652	9657	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802055
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149	NC_003210	TTC	2	6	9904	9909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802055
150	NC_003210	ACG	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802055
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152	NC_003210	GCT	2	6	10117	10122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802055
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155	NC_003210	TAG	2	6	10313	10318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
156	NC_003210	TGA	2	6	10446	10451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
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158	NC_003210	GAA	2	6	10513	10518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802055
159	NC_003210	CGA	2	6	10521	10526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802055
160	NC_003210	TGA	2	6	10548	10553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802055
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164	NC_003210	TAT	2	6	10807	10812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802056
165	NC_003210	TTA	2	6	10849	10854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802056
166	NC_003210	ACT	2	6	10865	10870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802056
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168	NC_003210	TGG	2	6	11263	11268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802056
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257	NC_003210	GAT	3	9	18378	18386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802062
258	NC_003210	TGT	2	6	18495	18500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802062
259	NC_003210	TGG	2	6	18501	18506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802062
260	NC_003210	CTT	2	6	18564	18569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802062
261	NC_003210	TTC	2	6	18688	18693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802062
262	NC_003210	GTT	2	6	18703	18708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802062
263	NC_003210	CGT	2	6	18763	18768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802062
264	NC_003210	ACA	2	6	18866	18871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802062
265	NC_003210	CTA	2	6	18873	18878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802062
266	NC_003210	TCC	2	6	18960	18965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16802062
267	NC_003210	GAT	2	6	19006	19011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802062
268	NC_003210	TTC	3	9	19114	19122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802062
269	NC_003210	TCT	2	6	19142	19147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802062
270	NC_003210	ATT	2	6	19165	19170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802062
271	NC_003210	GAA	2	6	19243	19248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802062
272	NC_003210	AGA	2	6	19260	19265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802062
273	NC_003210	AGG	2	6	19298	19303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802062
274	NC_003210	CAG	2	6	19483	19488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802063
275	NC_003210	TAA	2	6	19513	19518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802063
276	NC_003210	AGT	2	6	19539	19544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802063
277	NC_003210	TTG	2	6	19639	19644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802063
278	NC_003210	TTC	2	6	19719	19724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802063
279	NC_003210	CTA	2	6	19728	19733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802063
280	NC_003210	TGT	2	6	19868	19873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802063
281	NC_003210	ATA	2	6	19934	19939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802064
282	NC_003210	GCA	2	6	19948	19953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802064
283	NC_003210	TTG	2	6	19985	19990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802064
284	NC_003210	GTT	2	6	20005	20010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802064
285	NC_003210	ACA	2	6	20053	20058	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802064
286	NC_003210	TTA	2	6	20072	20077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802064
287	NC_003210	GCA	2	6	20179	20184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802064
288	NC_003210	GAA	2	6	20390	20395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802065
289	NC_003210	ATA	2	6	20426	20431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802065
290	NC_003210	CAA	2	6	20601	20606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802065
291	NC_003210	ATC	2	6	20623	20628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802065
292	NC_003210	GAC	2	6	20701	20706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802065
293	NC_003210	TTC	2	6	20737	20742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802065
294	NC_003210	TCG	2	6	20801	20806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802065
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298	NC_003210	ATT	2	6	21163	21168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802065
299	NC_003210	ATA	2	6	21224	21229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802065
300	NC_003210	CAG	2	6	21294	21299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802065
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382	NC_003210	ATT	2	6	27435	27440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802072
383	NC_003210	GGA	2	6	27533	27538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802073
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500	NC_003210	TGC	2	6	35082	35087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802080

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