MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 58890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003210	AGA	2	6	47637	47642	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802090
1002	NC_003210	TAA	2	6	47660	47665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802090
1003	NC_003210	A	6	6	47672	47677	100 %	0 %	0 %	0 %	16802090
1004	NC_003210	TTC	2	6	47695	47700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802090
1005	NC_003210	TGG	2	6	47709	47714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802090
1006	NC_003210	CTT	2	6	47865	47870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802090
1007	NC_003210	TAG	2	6	47906	47911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802090
1008	NC_003210	ATT	2	6	47920	47925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802090
1009	NC_003210	GTT	2	6	47947	47952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802090
1010	NC_003210	TTA	2	6	47957	47962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802090
1011	NC_003210	AAT	2	6	47990	47995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802090
1012	NC_003210	TGA	2	6	48072	48077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802091
1013	NC_003210	TAT	2	6	48189	48194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802091
1014	NC_003210	TGA	2	6	48196	48201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802091
1015	NC_003210	ATG	2	6	48218	48223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802091
1016	NC_003210	T	7	7	48238	48244	0 %	100 %	0 %	0 %	16802091
1017	NC_003210	GA	3	6	48256	48261	50 %	0 %	50 %	0 %	16802091
1018	NC_003210	ATT	2	6	48396	48401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802091
1019	NC_003210	GAA	2	6	48419	48424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802091
1020	NC_003210	A	6	6	48452	48457	100 %	0 %	0 %	0 %	16802091
1021	NC_003210	AAATG	2	10	48490	48499	60 %	20 %	20 %	0 %	16802091
1022	NC_003210	T	6	6	48517	48522	0 %	100 %	0 %	0 %	16802091
1023	NC_003210	CAG	2	6	48561	48566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802091
1024	NC_003210	CCAG	2	8	48604	48611	25 %	0 %	25 %	50 %	16802091
1025	NC_003210	CAT	2	6	48653	48658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802091
1026	NC_003210	TGAA	2	8	48741	48748	50 %	25 %	25 %	0 %	16802091
1027	NC_003210	GAAC	2	8	48773	48780	50 %	0 %	25 %	25 %	16802091
1028	NC_003210	TTTA	2	8	48814	48821	25 %	75 %	0 %	0 %	16802091
1029	NC_003210	CAA	2	6	48950	48955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802091
1030	NC_003210	AT	6	12	48966	48977	50 %	50 %	0 %	0 %	16802091
1031	NC_003210	A	6	6	48981	48986	100 %	0 %	0 %	0 %	16802091
1032	NC_003210	ATG	2	6	49119	49124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802091
1033	NC_003210	AAG	2	6	49198	49203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802091
1034	NC_003210	GTAGA	2	10	49576	49585	40 %	20 %	40 %	0 %	16802092
1035	NC_003210	CAT	2	6	49611	49616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802092
1036	NC_003210	GAA	2	6	49630	49635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802092
1037	NC_003210	A	6	6	49642	49647	100 %	0 %	0 %	0 %	16802092
1038	NC_003210	TGT	2	6	49650	49655	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802092
1039	NC_003210	ATC	2	6	49696	49701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802092
1040	NC_003210	TGA	2	6	49836	49841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802092
1041	NC_003210	AGA	2	6	49866	49871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802092
1042	NC_003210	ATG	2	6	49934	49939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802093
1043	NC_003210	GTA	2	6	49946	49951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802093
1044	NC_003210	CAA	2	6	50051	50056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802093
1045	NC_003210	TTA	2	6	50076	50081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802093
1046	NC_003210	TGT	2	6	50086	50091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802093
1047	NC_003210	GAA	2	6	50128	50133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802093
1048	NC_003210	GGCG	2	8	50143	50150	0 %	0 %	75 %	25 %	16802093
1049	NC_003210	ACG	2	6	50187	50192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802093
1050	NC_003210	AG	3	6	50224	50229	50 %	0 %	50 %	0 %	16802093
1051	NC_003210	TGGCGG	2	12	50260	50271	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	16802093
1052	NC_003210	AAC	2	6	50294	50299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802093
1053	NC_003210	AAT	2	6	50300	50305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802093
1054	NC_003210	CAA	2	6	50372	50377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802093
1055	NC_003210	TCAAAA	2	12	50380	50391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	16802093
1056	NC_003210	TAA	2	6	50404	50409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802093
1057	NC_003210	TGA	2	6	50449	50454	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802093
1058	NC_003210	GGA	2	6	50520	50525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802094
1059	NC_003210	A	6	6	50547	50552	100 %	0 %	0 %	0 %	16802094
1060	NC_003210	TTACT	2	10	50558	50567	20 %	60 %	0 %	20 %	16802094
1061	NC_003210	CTT	2	6	50607	50612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802094
1062	NC_003210	A	6	6	50613	50618	100 %	0 %	0 %	0 %	16802094
1063	NC_003210	TCG	2	6	50648	50653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802094
1064	NC_003210	TAC	2	6	50725	50730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802094
1065	NC_003210	GAA	2	6	50742	50747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802094
1066	NC_003210	AAAT	2	8	50748	50755	75 %	25 %	0 %	0 %	16802094
1067	NC_003210	A	6	6	50913	50918	100 %	0 %	0 %	0 %	16802095
1068	NC_003210	TAT	2	6	50941	50946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802095
1069	NC_003210	TAG	2	6	50947	50952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802095
1070	NC_003210	ATG	2	6	50977	50982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802095
1071	NC_003210	CAT	2	6	50992	50997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802095
1072	NC_003210	ATA	2	6	51001	51006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802095
1073	NC_003210	CAA	2	6	51008	51013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802095
1074	NC_003210	ACT	2	6	51018	51023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802095
1075	NC_003210	TAA	2	6	51038	51043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802095
1076	NC_003210	TCA	2	6	51051	51056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802095
1077	NC_003210	GAAAT	2	10	51216	51225	60 %	20 %	20 %	0 %	16802095
1078	NC_003210	AAC	2	6	51244	51249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802095
1079	NC_003210	TGA	2	6	51254	51259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802095
1080	NC_003210	CTTAG	2	10	51315	51324	20 %	40 %	20 %	20 %	16802095
1081	NC_003210	AAG	2	6	51343	51348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802095
1082	NC_003210	TTA	2	6	51422	51427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802095
1083	NC_003210	ATA	2	6	51448	51453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802095
1084	NC_003210	TTC	2	6	51493	51498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802095
1085	NC_003210	TAA	2	6	51516	51521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802095
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1089	NC_003210	TAAT	2	8	51899	51906	50 %	50 %	0 %	0 %	16802096
1090	NC_003210	ACAGTG	2	12	51964	51975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16802096
1091	NC_003210	TAA	2	6	52101	52106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802096
1092	NC_003210	GAA	2	6	52195	52200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802096
1093	NC_003210	GAT	2	6	52227	52232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802096
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1095	NC_003210	AGG	2	6	52357	52362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802096
1096	NC_003210	AGA	2	6	52420	52425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802097
1097	NC_003210	TTC	2	6	52447	52452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802097
1098	NC_003210	GCTT	2	8	52463	52470	0 %	50 %	25 %	25 %	16802097
1099	NC_003210	A	7	7	52515	52521	100 %	0 %	0 %	0 %	16802097
1100	NC_003210	ATAA	2	8	52527	52534	75 %	25 %	0 %	0 %	16802097
1101	NC_003210	AACA	2	8	52692	52699	75 %	0 %	0 %	25 %	16802098
1102	NC_003210	T	6	6	52703	52708	0 %	100 %	0 %	0 %	16802098
1103	NC_003210	TGCTA	2	10	52740	52749	20 %	40 %	20 %	20 %	16802098
1104	NC_003210	TTTA	2	8	52758	52765	25 %	75 %	0 %	0 %	16802098
1105	NC_003210	GAT	2	6	52785	52790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802098
1106	NC_003210	ATTG	2	8	52797	52804	25 %	50 %	25 %	0 %	16802098
1107	NC_003210	AAAAAT	2	12	52828	52839	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	16802098
1108	NC_003210	GTA	2	6	52840	52845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802098
1109	NC_003210	TTA	2	6	52871	52876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802098
1110	NC_003210	TACT	2	8	52880	52887	25 %	50 %	0 %	25 %	16802098
1111	NC_003210	TAG	2	6	52901	52906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802098
1112	NC_003210	TTTTA	2	10	52908	52917	20 %	80 %	0 %	0 %	16802098
1113	NC_003210	ATG	2	6	52940	52945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802098
1114	NC_003210	TTG	2	6	53002	53007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802098
1115	NC_003210	TCT	2	6	53019	53024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802098
1116	NC_003210	ATTG	2	8	53031	53038	25 %	50 %	25 %	0 %	16802098
1117	NC_003210	TTG	2	6	53060	53065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802098
1118	NC_003210	TAT	2	6	53085	53090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802098
1119	NC_003210	T	6	6	53090	53095	0 %	100 %	0 %	0 %	16802098
1120	NC_003210	GTT	2	6	53233	53238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802098
1121	NC_003210	CAAC	2	8	53249	53256	50 %	0 %	0 %	50 %	16802098
1122	NC_003210	TAC	2	6	53310	53315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802098
1123	NC_003210	TTG	2	6	53381	53386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802098
1124	NC_003210	AT	3	6	53388	53393	50 %	50 %	0 %	0 %	16802098
1125	NC_003210	ATA	2	6	53396	53401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802098
1126	NC_003210	ATA	2	6	53435	53440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802098
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1128	NC_003210	AAC	2	6	53470	53475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802098
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