MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 58890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003210	AGT	2	6	24499	24504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802068
502	NC_003210	A	6	6	24539	24544	100 %	0 %	0 %	0 %	16802068
503	NC_003210	TGA	2	6	24598	24603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802068
504	NC_003210	AAC	2	6	24623	24628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802068
505	NC_003210	AG	3	6	24745	24750	50 %	0 %	50 %	0 %	16802068
506	NC_003210	AAT	2	6	24782	24787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802068
507	NC_003210	AT	3	6	24871	24876	50 %	50 %	0 %	0 %	16802068
508	NC_003210	ATTGAA	2	12	24908	24919	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16802068
509	NC_003210	A	6	6	24923	24928	100 %	0 %	0 %	0 %	16802068
510	NC_003210	ATTAT	2	10	24954	24963	40 %	60 %	0 %	0 %	16802069
511	NC_003210	GCA	2	6	24965	24970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802069
512	NC_003210	AAC	2	6	25024	25029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802069
513	NC_003210	GAA	2	6	25055	25060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802069
514	NC_003210	TTG	2	6	25137	25142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802069
515	NC_003210	AGG	2	6	25257	25262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802069
516	NC_003210	ATA	2	6	25281	25286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802069
517	NC_003210	TGA	2	6	25327	25332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802069
518	NC_003210	GGA	2	6	25336	25341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802069
519	NC_003210	CAA	2	6	25412	25417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802070
520	NC_003210	TTG	2	6	25454	25459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802070
521	NC_003210	ATG	2	6	25460	25465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802070
522	NC_003210	A	6	6	25473	25478	100 %	0 %	0 %	0 %	16802070
523	NC_003210	CTG	2	6	25514	25519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802070
524	NC_003210	GCA	2	6	25552	25557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802070
525	NC_003210	AAT	2	6	25558	25563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802070
526	NC_003210	AAT	2	6	25567	25572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802070
527	NC_003210	GCA	2	6	25587	25592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802070
528	NC_003210	A	7	7	25707	25713	100 %	0 %	0 %	0 %	16802070
529	NC_003210	ATT	2	6	25751	25756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802070
530	NC_003210	A	7	7	25830	25836	100 %	0 %	0 %	0 %	16802070
531	NC_003210	GTTA	2	8	25891	25898	25 %	50 %	25 %	0 %	16802071
532	NC_003210	TAA	2	6	25959	25964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802071
533	NC_003210	CGG	2	6	26059	26064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802071
534	NC_003210	TCG	2	6	26097	26102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802071
535	NC_003210	TCAGG	2	10	26123	26132	20 %	20 %	40 %	20 %	16802071
536	NC_003210	CAG	2	6	26262	26267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802071
537	NC_003210	CG	4	8	26310	26317	0 %	0 %	50 %	50 %	16802071
538	NC_003210	TGG	2	6	26413	26418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802071
539	NC_003210	TTC	2	6	26421	26426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802071
540	NC_003210	AGT	2	6	26428	26433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802071
541	NC_003210	CAA	2	6	26463	26468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802071
542	NC_003210	TCG	2	6	26475	26480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802071
543	NC_003210	AGC	3	9	26503	26511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802071
544	NC_003210	ATC	2	6	26564	26569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802071
545	NC_003210	CAAA	2	8	26575	26582	75 %	0 %	0 %	25 %	16802071
546	NC_003210	GAG	2	6	26633	26638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802071
547	NC_003210	AGC	2	6	26705	26710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802072
548	NC_003210	GTTG	2	8	26719	26726	0 %	50 %	50 %	0 %	16802072
549	NC_003210	GCCA	2	8	26730	26737	25 %	0 %	25 %	50 %	16802072
550	NC_003210	ATG	2	6	26760	26765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802072
551	NC_003210	TGA	3	9	26819	26827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802072
552	NC_003210	ATG	2	6	26838	26843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802072
553	NC_003210	GGT	2	6	26883	26888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802072
554	NC_003210	AAAG	2	8	26927	26934	75 %	0 %	25 %	0 %	16802072
555	NC_003210	AAG	2	6	26941	26946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802072
556	NC_003210	CGA	2	6	27022	27027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802072
557	NC_003210	AT	3	6	27047	27052	50 %	50 %	0 %	0 %	16802072
558	NC_003210	TTTAC	2	10	27123	27132	20 %	60 %	0 %	20 %	16802072
559	NC_003210	GTC	2	6	27228	27233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802072
560	NC_003210	A	7	7	27387	27393	100 %	0 %	0 %	0 %	16802072
561	NC_003210	TTA	2	6	27414	27419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802072
562	NC_003210	ATT	2	6	27435	27440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802072
563	NC_003210	T	6	6	27507	27512	0 %	100 %	0 %	0 %	16802073
564	NC_003210	GGA	2	6	27533	27538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802073
565	NC_003210	A	6	6	27544	27549	100 %	0 %	0 %	0 %	16802073
566	NC_003210	TCA	2	6	27566	27571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802073
567	NC_003210	AGC	2	6	27572	27577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802073
568	NC_003210	TGG	2	6	27583	27588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802073
569	NC_003210	ACG	2	6	27604	27609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802073
570	NC_003210	ATT	2	6	27612	27617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802073
571	NC_003210	AGG	2	6	27674	27679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802073
572	NC_003210	TTA	2	6	27697	27702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802073
573	NC_003210	CTG	2	6	27709	27714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802073
574	NC_003210	TTA	2	6	27719	27724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802073
575	NC_003210	AT	3	6	27784	27789	50 %	50 %	0 %	0 %	16802073
576	NC_003210	TTG	2	6	27871	27876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802073
577	NC_003210	CAG	2	6	27901	27906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802073
578	NC_003210	TTG	2	6	27930	27935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802073
579	NC_003210	CAA	2	6	28056	28061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802073
580	NC_003210	ACC	2	6	28106	28111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802073
581	NC_003210	TGG	2	6	28136	28141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802073
582	NC_003210	TAA	2	6	28197	28202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802073
583	NC_003210	ATG	2	6	28251	28256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802074
584	NC_003210	AAG	2	6	28264	28269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802074
585	NC_003210	TAC	2	6	28283	28288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802074
586	NC_003210	GTTA	2	8	28365	28372	25 %	50 %	25 %	0 %	16802074
587	NC_003210	TGT	2	6	28388	28393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802074
588	NC_003210	GTCC	2	8	28434	28441	0 %	25 %	25 %	50 %	16802074
589	NC_003210	AGA	2	6	28469	28474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802074
590	NC_003210	TGAT	2	8	28486	28493	25 %	50 %	25 %	0 %	16802074
591	NC_003210	ATT	2	6	28586	28591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802074
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593	NC_003210	TGA	2	6	28634	28639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802074
594	NC_003210	TAG	2	6	28642	28647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802074
595	NC_003210	TGG	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802074
596	NC_003210	GAA	2	6	28737	28742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802074
597	NC_003210	AT	3	6	28763	28768	50 %	50 %	0 %	0 %	16802074
598	NC_003210	ATT	2	6	28791	28796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802074
599	NC_003210	GGA	2	6	28806	28811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16802074
600	NC_003210	AGC	2	6	28853	28858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802074
601	NC_003210	CGG	2	6	29141	29146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802075
602	NC_003210	GAAA	2	8	29225	29232	75 %	0 %	25 %	0 %	16802075
603	NC_003210	GTG	2	6	29269	29274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802075
604	NC_003210	AGT	2	6	29285	29290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802075
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606	NC_003210	TTGG	2	8	29497	29504	0 %	50 %	50 %	0 %	16802075
607	NC_003210	GTAC	2	8	29521	29528	25 %	25 %	25 %	25 %	16802075
608	NC_003210	CTT	2	6	29564	29569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802075
609	NC_003210	A	6	6	29598	29603	100 %	0 %	0 %	0 %	16802075
610	NC_003210	CGG	2	6	29606	29611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802075
611	NC_003210	GGT	2	6	29637	29642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802075
612	NC_003210	CAG	2	6	29674	29679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802075
613	NC_003210	TCT	2	6	29775	29780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802075
614	NC_003210	ATT	2	6	29885	29890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802075
615	NC_003210	ATT	2	6	29948	29953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802075
616	NC_003210	GGT	2	6	30012	30017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802075
617	NC_003210	CAA	2	6	30074	30079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802075
618	NC_003210	A	7	7	30180	30186	100 %	0 %	0 %	0 %	16802075
619	NC_003210	ATTT	2	8	30209	30216	25 %	75 %	0 %	0 %	16802075
620	NC_003210	A	6	6	30270	30275	100 %	0 %	0 %	0 %	16802075
621	NC_003210	TGG	2	6	30299	30304	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802075
622	NC_003210	TGG	2	6	30308	30313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802075
623	NC_003210	AT	3	6	30344	30349	50 %	50 %	0 %	0 %	16802075
624	NC_003210	CTT	2	6	30383	30388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802075
625	NC_003210	TGG	2	6	30420	30425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802075
626	NC_003210	GTA	2	6	30477	30482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802075
627	NC_003210	GTA	3	9	30504	30512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802075
628	NC_003210	AGT	2	6	30572	30577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802075
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630	NC_003210	AAC	2	6	30698	30703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802075
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