MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes EGD-e chromosome

Total Repeats: 58890

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_003210	TGT	2	6	255579	255584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802280
5002	NC_003210	GAT	2	6	255658	255663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802280
5003	NC_003210	GAT	2	6	255669	255674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802280
5004	NC_003210	TGT	2	6	255675	255680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802280
5005	NC_003210	AGA	2	6	255681	255686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802280
5006	NC_003210	TTA	2	6	255698	255703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802280
5007	NC_003210	CAG	2	6	255746	255751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802280
5008	NC_003210	GAA	2	6	255752	255757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802280
5009	NC_003210	T	7	7	255816	255822	0 %	100 %	0 %	0 %	16802281
5010	NC_003210	TCAT	2	8	255897	255904	25 %	50 %	0 %	25 %	16802281
5011	NC_003210	T	6	6	255916	255921	0 %	100 %	0 %	0 %	16802281
5012	NC_003210	GTT	2	6	255933	255938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802281
5013	NC_003210	TTG	2	6	255948	255953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802281
5014	NC_003210	TG	3	6	255952	255957	0 %	50 %	50 %	0 %	16802281
5015	NC_003210	AAG	2	6	255960	255965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802281
5016	NC_003210	GAAA	2	8	255968	255975	75 %	0 %	25 %	0 %	16802281
5017	NC_003210	ATG	2	6	256110	256115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802281
5018	NC_003210	ATT	2	6	256142	256147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802281
5019	NC_003210	ATT	2	6	256153	256158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802281
5020	NC_003210	AGTAAA	2	12	256195	256206	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	16802281
5021	NC_003210	TGA	2	6	256224	256229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802281
5022	NC_003210	CGC	2	6	256281	256286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16802281
5023	NC_003210	TAT	2	6	256412	256417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802281
5024	NC_003210	ATG	2	6	256513	256518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802282
5025	NC_003210	TTA	2	6	256546	256551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802282
5026	NC_003210	TGG	2	6	256553	256558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802282
5027	NC_003210	T	6	6	256670	256675	0 %	100 %	0 %	0 %	16802282
5028	NC_003210	CTA	2	6	256780	256785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802282
5029	NC_003210	GAA	2	6	256920	256925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802282
5030	NC_003210	AAT	2	6	256960	256965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16802282
5031	NC_003210	TATT	2	8	257073	257080	25 %	75 %	0 %	0 %	16802283
5032	NC_003210	ATG	2	6	257092	257097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802283
5033	NC_003210	GAA	2	6	257154	257159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802283
5034	NC_003210	TCAA	2	8	257252	257259	50 %	25 %	0 %	25 %	16802283
5035	NC_003210	AGA	3	9	257321	257329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802283
5036	NC_003210	GTC	2	6	257392	257397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802283
5037	NC_003210	AAG	2	6	257425	257430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802283
5038	NC_003210	A	6	6	257553	257558	100 %	0 %	0 %	0 %	16802283
5039	NC_003210	GAT	2	6	257595	257600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802283
5040	NC_003210	TTC	2	6	257623	257628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802283
5041	NC_003210	CCA	2	6	257694	257699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16802283
5042	NC_003210	ATT	2	6	257766	257771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802283
5043	NC_003210	ATT	2	6	257816	257821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802283
5044	NC_003210	TTGG	2	8	257839	257846	0 %	50 %	50 %	0 %	16802283
5045	NC_003210	GAA	3	9	257859	257867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802283
5046	NC_003210	AGA	2	6	257879	257884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802283
5047	NC_003210	GTT	2	6	257930	257935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802283
5048	NC_003210	A	6	6	257976	257981	100 %	0 %	0 %	0 %	16802283
5049	NC_003210	ATG	2	6	257992	257997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802283
5050	NC_003210	TAG	2	6	257998	258003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802283
5051	NC_003210	CTTT	2	8	258006	258013	0 %	75 %	0 %	25 %	16802283
5052	NC_003210	CTG	2	6	258043	258048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802283
5053	NC_003210	TGA	2	6	258176	258181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802283
5054	NC_003210	AGA	2	6	258182	258187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802283
5055	NC_003210	A	6	6	258237	258242	100 %	0 %	0 %	0 %	16802283
5056	NC_003210	AAAGGT	2	12	258321	258332	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	16802283
5057	NC_003210	TCGTA	2	10	258347	258356	20 %	40 %	20 %	20 %	16802283
5058	NC_003210	TAAT	2	8	258452	258459	50 %	50 %	0 %	0 %	16802283
5059	NC_003210	AGA	2	6	258873	258878	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802284
5060	NC_003210	CAA	2	6	258884	258889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802284
5061	NC_003210	CGA	2	6	258908	258913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802284
5062	NC_003210	T	6	6	258919	258924	0 %	100 %	0 %	0 %	16802284
5063	NC_003210	T	6	6	258930	258935	0 %	100 %	0 %	0 %	16802284
5064	NC_003210	TGG	2	6	258961	258966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16802284
5065	NC_003210	T	7	7	258982	258988	0 %	100 %	0 %	0 %	16802284
5066	NC_003210	TTTG	2	8	259005	259012	0 %	75 %	25 %	0 %	16802284
5067	NC_003210	TAT	2	6	259019	259024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802284
5068	NC_003210	CAG	2	6	259127	259132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802284
5069	NC_003210	GAT	2	6	259141	259146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802284
5070	NC_003210	CGG	2	6	259235	259240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802284
5071	NC_003210	CCT	2	6	259318	259323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16802284
5072	NC_003210	GTT	2	6	259354	259359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802284
5073	NC_003210	TAG	2	6	259439	259444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802284
5074	NC_003210	GA	3	6	259508	259513	50 %	0 %	50 %	0 %	16802285
5075	NC_003210	GTGAA	2	10	259541	259550	40 %	20 %	40 %	0 %	16802285
5076	NC_003210	ATT	2	6	259609	259614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802285
5077	NC_003210	ATG	2	6	259655	259660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802285
5078	NC_003210	GAT	2	6	259690	259695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802285
5079	NC_003210	TGA	2	6	259770	259775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802285
5080	NC_003210	A	6	6	259915	259920	100 %	0 %	0 %	0 %	16802285
5081	NC_003210	CT	3	6	259939	259944	0 %	50 %	0 %	50 %	16802285
5082	NC_003210	GCA	2	6	259965	259970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802285
5083	NC_003210	A	6	6	260116	260121	100 %	0 %	0 %	0 %	16802285
5084	NC_003210	ACT	2	6	260231	260236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802285
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5086	NC_003210	TTA	2	6	260297	260302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802285
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5088	NC_003210	TTC	2	6	260347	260352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802285
5089	NC_003210	ATG	2	6	260390	260395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802285
5090	NC_003210	AGA	2	6	260403	260408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802285
5091	NC_003210	ATC	2	6	260456	260461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802285
5092	NC_003210	GAA	2	6	260491	260496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802285
5093	NC_003210	AAC	2	6	260519	260524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802285
5094	NC_003210	GAT	2	6	260551	260556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802285
5095	NC_003210	GAT	3	9	260560	260568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802285
5096	NC_003210	TAC	2	6	260589	260594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802285
5097	NC_003210	GAAA	2	8	260634	260641	75 %	0 %	25 %	0 %	16802285
5098	NC_003210	ATG	2	6	260677	260682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802285
5099	NC_003210	GTTT	2	8	260684	260691	0 %	75 %	25 %	0 %	16802285
5100	NC_003210	GAA	2	6	260767	260772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802285
5101	NC_003210	TGA	2	6	260811	260816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802285
5102	NC_003210	A	7	7	260837	260843	100 %	0 %	0 %	0 %	16802285
5103	NC_003210	TAT	2	6	260844	260849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802285
5104	NC_003210	AAC	2	6	260918	260923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16802286
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5106	NC_003210	GAA	3	9	261103	261111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802286
5107	NC_003210	ATGG	2	8	261255	261262	25 %	25 %	50 %	0 %	16802286
5108	NC_003210	TAG	2	6	261278	261283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802286
5109	NC_003210	AT	3	6	261390	261395	50 %	50 %	0 %	0 %	16802287
5110	NC_003210	AAG	2	6	261400	261405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802287
5111	NC_003210	A	6	6	261484	261489	100 %	0 %	0 %	0 %	16802287
5112	NC_003210	AGT	2	6	261497	261502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802287
5113	NC_003210	GC	3	6	261508	261513	0 %	0 %	50 %	50 %	16802287
5114	NC_003210	TGA	2	6	261560	261565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802287
5115	NC_003210	GCT	3	9	261573	261581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802287
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5118	NC_003210	CGG	2	6	261661	261666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16802287
5119	NC_003210	ATT	3	9	261687	261695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802287
5120	NC_003210	CGC	2	6	261702	261707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16802287
5121	NC_003210	GAA	2	6	261801	261806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802287
5122	NC_003210	GTA	2	6	261850	261855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802287
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5124	NC_003210	TTA	2	6	262014	262019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16802287
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5249	NC_003210	TA	3	6	268218	268223	50 %	50 %	0 %	0 %	16802299
5250	NC_003210	TTTA	2	8	268257	268264	25 %	75 %	0 %	0 %	16802299
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5370	NC_003210	CCG	2	6	274646	274651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16802304
5371	NC_003210	AAAC	2	8	274663	274670	75 %	0 %	0 %	25 %	16802304
5372	NC_003210	GATT	2	8	274685	274692	25 %	50 %	25 %	0 %	16802304
5373	NC_003210	GTA	2	6	274722	274727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802304
5374	NC_003210	AGA	3	9	274769	274777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802304
5375	NC_003210	GAT	2	6	274899	274904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802304
5376	NC_003210	TTG	2	6	274975	274980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802304
5377	NC_003210	TGC	2	6	275018	275023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802304
5378	NC_003210	TCG	2	6	275081	275086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802304
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5381	NC_003210	GTT	2	6	275211	275216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16802304
5382	NC_003210	ATC	2	6	275328	275333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16802304
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5395	NC_003210	TGA	2	6	276137	276142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802304
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5400	NC_003210	TGGT	2	8	276313	276320	0 %	50 %	50 %	0 %	16802304
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5403	NC_003210	GAT	3	9	276477	276485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802304
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5490	NC_003210	GTTG	2	8	281753	281760	0 %	50 %	50 %	0 %	16802307
5491	NC_003210	GAT	2	6	281804	281809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16802307
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5493	NC_003210	TTC	2	6	281897	281902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16802307
5494	NC_003210	AAG	2	6	281928	281933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802307
5495	NC_003210	CGA	3	9	281938	281946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16802307
5496	NC_003210	ATTTC	2	10	281970	281979	20 %	60 %	0 %	20 %	16802307
5497	NC_003210	GTC	2	6	282076	282081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16802307
5498	NC_003210	AGA	3	9	282199	282207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802307
5499	NC_003210	AAG	2	6	282267	282272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16802307
5500	NC_003210	ATTC	2	8	282426	282433	25 %	50 %	0 %	25 %	16802307

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