MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 chromosome

Total Repeats: 1760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002973	ACCAA	2	10	2172	2181	60 %	0 %	0 %	40 %	46906226
2	NC_002973	TTAAA	2	10	2565	2574	60 %	40 %	0 %	0 %	46906226
3	NC_002973	TTTAT	2	10	4206	4215	20 %	80 %	0 %	0 %	46906227
4	NC_002973	TCATT	2	10	6862	6871	20 %	60 %	0 %	20 %	46906230
5	NC_002973	GGACG	2	10	12007	12016	20 %	0 %	60 %	20 %	46906232
6	NC_002973	TTTTA	2	10	12427	12436	20 %	80 %	0 %	0 %	46906233
7	NC_002973	GTATG	2	10	13370	13379	20 %	40 %	40 %	0 %	46906235
8	NC_002973	AAAGA	2	10	14385	14394	80 %	0 %	20 %	0 %	46906236
9	NC_002973	ATGAA	2	10	19331	19340	60 %	20 %	20 %	0 %	46906239
10	NC_002973	GAATG	2	10	21073	21082	40 %	20 %	40 %	0 %	46906240
11	NC_002973	TAATT	2	10	22450	22459	40 %	60 %	0 %	0 %	46906243
12	NC_002973	ATTAA	2	10	23967	23976	60 %	40 %	0 %	0 %	46906244
13	NC_002973	AAATC	2	10	24428	24437	60 %	20 %	0 %	20 %	46906244
14	NC_002973	ATTTT	2	10	25205	25214	20 %	80 %	0 %	0 %	46906245
15	NC_002973	GGATT	2	10	25550	25559	20 %	40 %	40 %	0 %	46906245
16	NC_002973	ATGGA	2	10	30908	30917	40 %	20 %	40 %	0 %	46906252
17	NC_002973	AATAA	2	10	33746	33755	80 %	20 %	0 %	0 %	46906254
18	NC_002973	GGTTT	2	10	34291	34300	0 %	60 %	40 %	0 %	46906255
19	NC_002973	CATAT	2	10	34623	34632	40 %	40 %	0 %	20 %	46906255
20	NC_002973	CCATA	2	10	35591	35600	40 %	20 %	0 %	40 %	46906256
21	NC_002973	GAAAA	2	10	36436	36445	80 %	0 %	20 %	0 %	46906257
22	NC_002973	AGATA	2	10	36693	36702	60 %	20 %	20 %	0 %	46906257
23	NC_002973	AATTG	2	10	37004	37013	40 %	40 %	20 %	0 %	46906258
24	NC_002973	TAAAA	2	10	37256	37265	80 %	20 %	0 %	0 %	46906258
25	NC_002973	GAAAA	2	10	39247	39256	80 %	0 %	20 %	0 %	46906261
26	NC_002973	TGAAA	2	10	40402	40411	60 %	20 %	20 %	0 %	46906262
27	NC_002973	GAATG	2	10	42273	42282	40 %	20 %	40 %	0 %	46906264
28	NC_002973	AAATT	2	10	42400	42409	60 %	40 %	0 %	0 %	46906264
29	NC_002973	ATTTT	2	10	43006	43015	20 %	80 %	0 %	0 %	46906264
30	NC_002973	AAAAC	2	10	46633	46642	80 %	0 %	0 %	20 %	46906266
31	NC_002973	TTATT	2	10	48119	48128	20 %	80 %	0 %	0 %	46906268
32	NC_002973	GAAAA	2	10	49332	49341	80 %	0 %	20 %	0 %	46906268
33	NC_002973	ATAAA	2	10	50157	50166	80 %	20 %	0 %	0 %	46906269
34	NC_002973	ATTTT	2	10	51961	51970	20 %	80 %	0 %	0 %	46906271
35	NC_002973	GACAT	2	10	53174	53183	40 %	20 %	20 %	20 %	46906272
36	NC_002973	ATTTT	2	10	53544	53553	20 %	80 %	0 %	0 %	46906273
37	NC_002973	AAATG	2	10	54673	54682	60 %	20 %	20 %	0 %	46906274
38	NC_002973	GTAGA	2	10	55759	55768	40 %	20 %	40 %	0 %	46906275
39	NC_002973	TTACT	2	10	56741	56750	20 %	60 %	0 %	20 %	46906277
40	NC_002973	CAAAA	2	10	57248	57257	80 %	0 %	0 %	20 %	46906278
41	NC_002973	GAAAT	2	10	57398	57407	60 %	20 %	20 %	0 %	46906278
42	NC_002973	CTTAG	2	10	57497	57506	20 %	40 %	20 %	20 %	46906278
43	NC_002973	TGCTA	2	10	58922	58931	20 %	40 %	20 %	20 %	46906281
44	NC_002973	TTTTA	2	10	59090	59099	20 %	80 %	0 %	0 %	46906281
45	NC_002973	AGTTA	2	10	60406	60415	40 %	40 %	20 %	0 %	46906282
46	NC_002973	AGTCT	2	10	61871	61880	20 %	40 %	20 %	20 %	46906283
47	NC_002973	TTTTA	2	10	64867	64876	20 %	80 %	0 %	0 %	46906286
48	NC_002973	AAACG	2	10	69236	69245	60 %	0 %	20 %	20 %	46906290
49	NC_002973	CAAAA	2	10	70736	70745	80 %	0 %	0 %	20 %	46906291
50	NC_002973	AACAA	2	10	72155	72164	80 %	0 %	0 %	20 %	46906293
51	NC_002973	GAGAG	2	10	77211	77220	40 %	0 %	60 %	0 %	46906295
52	NC_002973	GCAAA	2	10	78393	78402	60 %	0 %	20 %	20 %	46906298
53	NC_002973	CAATA	2	10	78458	78467	60 %	20 %	0 %	20 %	46906298
54	NC_002973	GCCTT	2	10	79261	79270	0 %	40 %	20 %	40 %	46906299
55	NC_002973	CAAAA	2	10	79638	79647	80 %	0 %	0 %	20 %	46906299
56	NC_002973	TAATT	2	10	81841	81850	40 %	60 %	0 %	0 %	46906303
57	NC_002973	GCCTT	2	10	83038	83047	0 %	40 %	20 %	40 %	46906304
58	NC_002973	CAAAA	2	10	83415	83424	80 %	0 %	0 %	20 %	46906304
59	NC_002973	AATTA	2	10	84357	84366	60 %	40 %	0 %	0 %	46906305
60	NC_002973	ATAAA	2	10	85609	85618	80 %	20 %	0 %	0 %	46906306
61	NC_002973	GAAAT	2	10	85935	85944	60 %	20 %	20 %	0 %	46906307
62	NC_002973	GCTTT	2	10	86733	86742	0 %	60 %	20 %	20 %	46906309
63	NC_002973	TTATA	2	10	88578	88587	40 %	60 %	0 %	0 %	46906312
64	NC_002973	TATTT	2	10	88673	88682	20 %	80 %	0 %	0 %	46906313
65	NC_002973	GCTTG	2	10	90654	90663	0 %	40 %	40 %	20 %	46906315
66	NC_002973	GCGCT	2	10	92708	92717	0 %	20 %	40 %	40 %	46906317
67	NC_002973	ATTTG	2	10	94684	94693	20 %	60 %	20 %	0 %	46906318
68	NC_002973	TAAAA	2	10	95928	95937	80 %	20 %	0 %	0 %	46906320
69	NC_002973	TTTGT	2	10	97033	97042	0 %	80 %	20 %	0 %	46906323
70	NC_002973	TTTCT	2	10	97771	97780	0 %	80 %	0 %	20 %	46906323
71	NC_002973	CTAAA	2	10	100132	100141	60 %	20 %	0 %	20 %	46906325
72	NC_002973	GAAAA	2	10	101475	101484	80 %	0 %	20 %	0 %	46906325
73	NC_002973	TGAAA	2	10	101717	101726	60 %	20 %	20 %	0 %	46906325
74	NC_002973	AAATT	2	10	102061	102070	60 %	40 %	0 %	0 %	46906325
75	NC_002973	AGCGG	2	10	102645	102654	20 %	0 %	60 %	20 %	46906325
76	NC_002973	GGAAA	2	10	103824	103833	60 %	0 %	40 %	0 %	46906325
77	NC_002973	CGAAA	2	10	105140	105149	60 %	0 %	20 %	20 %	46906326
78	NC_002973	AAAAG	2	10	105453	105462	80 %	0 %	20 %	0 %	46906326
79	NC_002973	TGCAT	2	10	109113	109122	20 %	40 %	20 %	20 %	46906329
80	NC_002973	TTACT	2	10	109359	109368	20 %	60 %	0 %	20 %	46906329
81	NC_002973	GTTTT	2	10	110957	110966	0 %	80 %	20 %	0 %	46906331
82	NC_002973	TGGCT	2	10	111108	111117	0 %	40 %	40 %	20 %	46906331
83	NC_002973	AGCGG	2	10	112557	112566	20 %	0 %	60 %	20 %	46906332
84	NC_002973	AAAAG	2	10	122656	122665	80 %	0 %	20 %	0 %	46906345
85	NC_002973	ACGGT	2	10	124200	124209	20 %	20 %	40 %	20 %	46906346
86	NC_002973	GAAAT	2	10	125439	125448	60 %	20 %	20 %	0 %	46906347
87	NC_002973	GAATT	2	10	126080	126089	40 %	40 %	20 %	0 %	46906347
88	NC_002973	CTTTA	2	10	130284	130293	20 %	60 %	0 %	20 %	46906350
89	NC_002973	CTCGA	2	10	131635	131644	20 %	20 %	20 %	40 %	46906352
90	NC_002973	TTCCA	2	10	131969	131978	20 %	40 %	0 %	40 %	46906352
91	NC_002973	TTTTA	2	10	133167	133176	20 %	80 %	0 %	0 %	46906354
92	NC_002973	AAAAG	2	10	133436	133445	80 %	0 %	20 %	0 %	46906355
93	NC_002973	TTAGT	2	10	135596	135605	20 %	60 %	20 %	0 %	46906359
94	NC_002973	TGAAC	2	10	136278	136287	40 %	20 %	20 %	20 %	46906361
95	NC_002973	AGATG	2	10	136320	136329	40 %	20 %	40 %	0 %	46906361
96	NC_002973	TTTAT	2	10	138596	138605	20 %	80 %	0 %	0 %	46906362
97	NC_002973	AAGTG	2	10	140618	140627	40 %	20 %	40 %	0 %	46906365
98	NC_002973	AGTCT	2	10	140898	140907	20 %	40 %	20 %	20 %	46906365
99	NC_002973	TGTAA	2	10	141978	141987	40 %	40 %	20 %	0 %	46906367
100	NC_002973	AATTT	2	10	142360	142369	40 %	60 %	0 %	0 %	46906368
101	NC_002973	TTGTT	2	10	144726	144735	0 %	80 %	20 %	0 %	46906370
102	NC_002973	ATTTT	2	10	146528	146537	20 %	80 %	0 %	0 %	46906372
103	NC_002973	AAAAT	2	10	148030	148039	80 %	20 %	0 %	0 %	46906372
104	NC_002973	AACTT	2	10	149339	149348	40 %	40 %	0 %	20 %	46906375
105	NC_002973	ACAAA	2	10	149441	149450	80 %	0 %	0 %	20 %	46906375
106	NC_002973	ACTTG	2	10	150235	150244	20 %	40 %	20 %	20 %	46906375
107	NC_002973	CCACA	2	10	150576	150585	40 %	0 %	0 %	60 %	46906375
108	NC_002973	TTGGT	2	10	151031	151040	0 %	60 %	40 %	0 %	46906376
109	NC_002973	TGTTT	2	10	151374	151383	0 %	80 %	20 %	0 %	46906376
110	NC_002973	TAACG	2	10	155858	155867	40 %	20 %	20 %	20 %	46906382
111	NC_002973	ATCCG	2	10	158523	158532	20 %	20 %	20 %	40 %	46906388
112	NC_002973	ACGGC	2	10	159144	159153	20 %	0 %	40 %	40 %	46906388
113	NC_002973	TTTAA	2	10	159216	159225	40 %	60 %	0 %	0 %	46906388
114	NC_002973	AATTT	2	10	159402	159411	40 %	60 %	0 %	0 %	46906388
115	NC_002973	AAACG	2	10	160552	160561	60 %	0 %	20 %	20 %	46906389
116	NC_002973	AATAA	2	10	160675	160684	80 %	20 %	0 %	0 %	46906389
117	NC_002973	GAATA	2	10	162636	162645	60 %	20 %	20 %	0 %	46906392
118	NC_002973	TTACT	2	10	163834	163843	20 %	60 %	0 %	20 %	46906393
119	NC_002973	AGATG	2	10	163882	163891	40 %	20 %	40 %	0 %	46906393
120	NC_002973	GCCAA	2	10	166862	166871	40 %	0 %	20 %	40 %	46906395
121	NC_002973	TCTAA	2	10	168883	168892	40 %	40 %	0 %	20 %	46906396
122	NC_002973	AAACA	2	10	169495	169504	80 %	0 %	0 %	20 %	46906396
123	NC_002973	GGAAT	2	10	172016	172025	40 %	20 %	40 %	0 %	46906398
124	NC_002973	AAGAT	2	10	172437	172446	60 %	20 %	20 %	0 %	46906398
125	NC_002973	GAATT	2	10	172808	172817	40 %	40 %	20 %	0 %	46906399
126	NC_002973	AAATA	2	10	175860	175869	80 %	20 %	0 %	0 %	46906403
127	NC_002973	ACTTT	2	10	179523	179532	20 %	60 %	0 %	20 %	46906407
128	NC_002973	AAAAG	2	10	180952	180961	80 %	0 %	20 %	0 %	46906408
129	NC_002973	ATGAA	2	10	182726	182735	60 %	20 %	20 %	0 %	46906409
130	NC_002973	TTTAC	2	10	185753	185762	20 %	60 %	0 %	20 %	46906412
131	NC_002973	AGTGA	2	10	188338	188347	40 %	20 %	40 %	0 %	46906414
132	NC_002973	TTGTT	2	10	189090	189099	0 %	80 %	20 %	0 %	46906414
133	NC_002973	TGGAA	2	10	190576	190585	40 %	20 %	40 %	0 %	46906414
134	NC_002973	TCAGT	2	10	191060	191069	20 %	40 %	20 %	20 %	46906415
135	NC_002973	TACAT	2	10	191809	191818	40 %	40 %	0 %	20 %	46906415
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137	NC_002973	ATCAA	2	10	194872	194881	60 %	20 %	0 %	20 %	46906416
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