MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes serotype 4b str. F2365 chromosome

Total Repeats: 57604

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57502	NC_002973	ACTTTT	2	12	2901002	2901013	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46909039
57503	NC_002973	CAT	2	6	2901027	2901032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46909039
57504	NC_002973	TCA	2	6	2901064	2901069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46909039
57505	NC_002973	CAA	2	6	2901087	2901092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46909039
57506	NC_002973	A	8	8	2901123	2901130	100 %	0 %	0 %	0 %	46909039
57507	NC_002973	TCT	2	6	2901149	2901154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46909039
57508	NC_002973	AT	3	6	2901188	2901193	50 %	50 %	0 %	0 %	46909039
57509	NC_002973	CAA	2	6	2901225	2901230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46909039
57510	NC_002973	T	6	6	2901257	2901262	0 %	100 %	0 %	0 %	46909039
57511	NC_002973	AGA	3	9	2901263	2901271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46909039
57512	NC_002973	TCA	2	6	2901276	2901281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46909039
57513	NC_002973	TGA	2	6	2901350	2901355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46909039
57514	NC_002973	CAC	2	6	2901377	2901382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46909039
57515	NC_002973	CCA	2	6	2901385	2901390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46909039
57516	NC_002973	TTA	2	6	2901400	2901405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46909039
57517	NC_002973	A	8	8	2901495	2901502	100 %	0 %	0 %	0 %	46909039
57518	NC_002973	A	6	6	2901538	2901543	100 %	0 %	0 %	0 %	46909039
57519	NC_002973	GCA	2	6	2901549	2901554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46909039
57520	NC_002973	ATT	2	6	2901594	2901599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46909039
57521	NC_002973	ACTT	2	8	2901624	2901631	25 %	50 %	0 %	25 %	46909039
57522	NC_002973	A	7	7	2901645	2901651	100 %	0 %	0 %	0 %	46909039
57523	NC_002973	A	6	6	2901684	2901689	100 %	0 %	0 %	0 %	46909039
57524	NC_002973	AAC	2	6	2901751	2901756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46909040
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57526	NC_002973	CA	3	6	2901811	2901816	50 %	0 %	0 %	50 %	46909040
57527	NC_002973	ATGT	2	8	2901834	2901841	25 %	50 %	25 %	0 %	46909040
57528	NC_002973	ATA	2	6	2901920	2901925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46909040
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57530	NC_002973	GCT	2	6	2902039	2902044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46909040
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57532	NC_002973	CCA	2	6	2902076	2902081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46909040
57533	NC_002973	ACTT	2	8	2902128	2902135	25 %	50 %	0 %	25 %	46909040
57534	NC_002973	ATC	2	6	2902139	2902144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46909040
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57536	NC_002973	AAT	2	6	2902351	2902356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46909041
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57538	NC_002973	GC	3	6	2902394	2902399	0 %	0 %	50 %	50 %	46909041
57539	NC_002973	AAT	2	6	2902486	2902491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46909041
57540	NC_002973	GTT	2	6	2902508	2902513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46909041
57541	NC_002973	TTA	2	6	2902514	2902519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46909041
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57543	NC_002973	CTT	2	6	2902626	2902631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46909041
57544	NC_002973	AATC	2	8	2902683	2902690	50 %	25 %	0 %	25 %	46909041
57545	NC_002973	TCT	2	6	2902706	2902711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46909041
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57550	NC_002973	CTTT	2	8	2902878	2902885	0 %	75 %	0 %	25 %	46909041
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57552	NC_002973	T	6	6	2902896	2902901	0 %	100 %	0 %	0 %	46909042
57553	NC_002973	GCT	2	6	2902918	2902923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46909042
57554	NC_002973	T	6	6	2902923	2902928	0 %	100 %	0 %	0 %	46909042
57555	NC_002973	AGC	3	9	2902953	2902961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46909042
57556	NC_002973	CCT	2	6	2902967	2902972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46909042
57557	NC_002973	GTTT	2	8	2902979	2902986	0 %	75 %	25 %	0 %	46909042
57558	NC_002973	ATT	2	6	2902995	2903000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46909042
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57560	NC_002973	CAT	2	6	2903148	2903153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46909042
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57564	NC_002973	GAAT	2	8	2903241	2903248	50 %	25 %	25 %	0 %	46909042
57565	NC_002973	CTG	2	6	2903261	2903266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46909042
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57569	NC_002973	CAT	2	6	2903331	2903336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46909042
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57579	NC_002973	GATT	2	8	2903910	2903917	25 %	50 %	25 %	0 %	46909043
57580	NC_002973	GACA	2	8	2903970	2903977	50 %	0 %	25 %	25 %	46909043
57581	NC_002973	T	7	7	2903988	2903994	0 %	100 %	0 %	0 %	46909043
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57589	NC_002973	ATTA	2	8	2904361	2904368	50 %	50 %	0 %	0 %	46909044
57590	NC_002973	ATT	2	6	2904529	2904534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46909045
57591	NC_002973	AT	3	6	2904546	2904551	50 %	50 %	0 %	0 %	46909045
57592	NC_002973	TC	3	6	2904555	2904560	0 %	50 %	0 %	50 %	46909045
57593	NC_002973	CTA	2	6	2904598	2904603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46909045
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.