MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis Il1403 chromosome

Total Repeats: 45565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002662	AT	3	6	23721	23726	50 %	50 %	0 %	0 %	15672000
502	NC_002662	TGG	2	6	23743	23748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672000
503	NC_002662	CAGATA	2	12	23751	23762	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	15672000
504	NC_002662	ATG	2	6	23766	23771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672000
505	NC_002662	GAT	2	6	23831	23836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672000
506	NC_002662	ATT	2	6	23949	23954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672001
507	NC_002662	GGT	2	6	23965	23970	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672001
508	NC_002662	AAG	2	6	24011	24016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672001
509	NC_002662	GAA	2	6	24079	24084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672001
510	NC_002662	CAA	2	6	24104	24109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672001
511	NC_002662	A	7	7	24158	24164	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
512	NC_002662	T	6	6	24187	24192	0 %	100 %	0 %	0 %	15672001
513	NC_002662	TCA	3	9	24237	24245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672001
514	NC_002662	TTG	2	6	24254	24259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672001
515	NC_002662	ATT	2	6	24357	24362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672001
516	NC_002662	AGA	2	6	24375	24380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672001
517	NC_002662	TAT	2	6	24397	24402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672001
518	NC_002662	CAA	2	6	24410	24415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672001
519	NC_002662	ATT	2	6	24428	24433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672001
520	NC_002662	A	7	7	24471	24477	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
521	NC_002662	CAAT	2	8	24496	24503	50 %	25 %	0 %	25 %	15672001
522	NC_002662	TAAT	2	8	24542	24549	50 %	50 %	0 %	0 %	15672001
523	NC_002662	A	6	6	24551	24556	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
524	NC_002662	TTG	2	6	24572	24577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672001
525	NC_002662	A	6	6	24581	24586	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
526	NC_002662	ATC	2	6	24588	24593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672001
527	NC_002662	A	6	6	24595	24600	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
528	NC_002662	CAAA	2	8	24610	24617	75 %	0 %	0 %	25 %	15672001
529	NC_002662	ACA	2	6	24624	24629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672001
530	NC_002662	T	6	6	24646	24651	0 %	100 %	0 %	0 %	15672001
531	NC_002662	AAGT	2	8	24671	24678	50 %	25 %	25 %	0 %	15672001
532	NC_002662	A	6	6	24682	24687	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
533	NC_002662	CAA	2	6	24721	24726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672001
534	NC_002662	ATTTT	2	10	24750	24759	20 %	80 %	0 %	0 %	15672001
535	NC_002662	A	6	6	24788	24793	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
536	NC_002662	GAAATT	2	12	24883	24894	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	15672001
537	NC_002662	TCA	2	6	24933	24938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672001
538	NC_002662	A	6	6	24940	24945	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
539	NC_002662	T	6	6	24955	24960	0 %	100 %	0 %	0 %	15672001
540	NC_002662	GA	3	6	24989	24994	50 %	0 %	50 %	0 %	15672001
541	NC_002662	A	6	6	25015	25020	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
542	NC_002662	AGA	2	6	25084	25089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672001
543	NC_002662	A	7	7	25137	25143	100 %	0 %	0 %	0 %	15672001
544	NC_002662	AGA	3	9	25177	25185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672002
545	NC_002662	A	6	6	25240	25245	100 %	0 %	0 %	0 %	15672002
546	NC_002662	TTC	2	6	25263	25268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672002
547	NC_002662	ATTG	2	8	25307	25314	25 %	50 %	25 %	0 %	15672002
548	NC_002662	CGG	2	6	25354	25359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15672002
549	NC_002662	CAG	2	6	25404	25409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672002
550	NC_002662	TTG	2	6	25431	25436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672002
551	NC_002662	CTT	2	6	25520	25525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672002
552	NC_002662	TTG	2	6	25545	25550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672002
553	NC_002662	ATT	2	6	25563	25568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672002
554	NC_002662	TGT	2	6	25594	25599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672002
555	NC_002662	TTTGG	2	10	25604	25613	0 %	60 %	40 %	0 %	15672002
556	NC_002662	GAA	2	6	25619	25624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672002
557	NC_002662	AAT	2	6	25677	25682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672002
558	NC_002662	AAC	2	6	25893	25898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672003
559	NC_002662	AAC	2	6	25900	25905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672003
560	NC_002662	A	6	6	25925	25930	100 %	0 %	0 %	0 %	15672003
561	NC_002662	TTG	4	12	25957	25968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672003
562	NC_002662	TCT	2	6	25981	25986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672003
563	NC_002662	AGT	2	6	25989	25994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
564	NC_002662	AATC	2	8	25995	26002	50 %	25 %	0 %	25 %	15672003
565	NC_002662	TGA	2	6	26032	26037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
566	NC_002662	GTAAAA	2	12	26124	26135	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	15672003
567	NC_002662	AAT	2	6	26142	26147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15672003
568	NC_002662	TAG	2	6	26168	26173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
569	NC_002662	TAT	2	6	26198	26203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15672003
570	NC_002662	ATG	2	6	26251	26256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
571	NC_002662	GTT	2	6	26268	26273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672003
572	NC_002662	TCA	2	6	26280	26285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672003
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574	NC_002662	CAT	2	6	26315	26320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15672003
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576	NC_002662	TCT	2	6	26344	26349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672003
577	NC_002662	ATG	2	6	26355	26360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
578	NC_002662	GGC	2	6	26385	26390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15672003
579	NC_002662	ACA	2	6	26429	26434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15672003
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581	NC_002662	A	6	6	26532	26537	100 %	0 %	0 %	0 %	15672003
582	NC_002662	CAG	2	6	26563	26568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672003
583	NC_002662	TTC	2	6	26572	26577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15672003
584	NC_002662	CAGGTA	2	12	26590	26601	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15672003
585	NC_002662	TTGC	2	8	26607	26614	0 %	50 %	25 %	25 %	15672003
586	NC_002662	TGTCGG	2	12	26684	26695	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	15672003
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588	NC_002662	TGA	2	6	26759	26764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
589	NC_002662	GTC	2	6	26779	26784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672003
590	NC_002662	TGG	3	9	26801	26809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672003
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592	NC_002662	GAT	2	6	26868	26873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
593	NC_002662	TGC	2	6	26894	26899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672003
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596	NC_002662	TTG	2	6	27121	27126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672003
597	NC_002662	GC	3	6	27129	27134	0 %	0 %	50 %	50 %	15672003
598	NC_002662	A	6	6	27141	27146	100 %	0 %	0 %	0 %	15672003
599	NC_002662	TGC	2	6	27155	27160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672003
600	NC_002662	TGA	2	6	27167	27172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
601	NC_002662	AAGA	2	8	27204	27211	75 %	0 %	25 %	0 %	15672003
602	NC_002662	TCAA	2	8	27218	27225	50 %	25 %	0 %	25 %	15672003
603	NC_002662	TTG	2	6	27271	27276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672003
604	NC_002662	GTT	2	6	27318	27323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672003
605	NC_002662	GGT	2	6	27339	27344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15672003
606	NC_002662	TGCT	2	8	27349	27356	0 %	50 %	25 %	25 %	15672003
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608	NC_002662	CAAC	2	8	27378	27385	50 %	0 %	0 %	50 %	15672003
609	NC_002662	GAC	2	6	27427	27432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672003
610	NC_002662	GAA	2	6	27438	27443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672003
611	NC_002662	AC	3	6	27495	27500	50 %	0 %	0 %	50 %	15672003
612	NC_002662	TGGTA	2	10	27545	27554	20 %	40 %	40 %	0 %	15672003
613	NC_002662	TATT	2	8	27577	27584	25 %	75 %	0 %	0 %	15672003
614	NC_002662	CTG	2	6	27625	27630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672003
615	NC_002662	TGAT	2	8	27634	27641	25 %	50 %	25 %	0 %	15672003
616	NC_002662	CGT	2	6	27651	27656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15672003
617	NC_002662	AAG	2	6	27685	27690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672003
618	NC_002662	AC	3	6	27699	27704	50 %	0 %	0 %	50 %	15672003
619	NC_002662	TGA	2	6	27800	27805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
620	NC_002662	AGC	2	6	27806	27811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672003
621	NC_002662	GCA	2	6	27813	27818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15672003
622	NC_002662	GAA	2	6	27843	27848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672003
623	NC_002662	TC	3	6	27849	27854	0 %	50 %	0 %	50 %	15672003
624	NC_002662	TGA	2	6	27875	27880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
625	NC_002662	TGA	2	6	27908	27913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672003
626	NC_002662	A	6	6	27913	27918	100 %	0 %	0 %	0 %	15672003
627	NC_002662	AGA	2	6	27932	27937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672003
628	NC_002662	AGA	2	6	27953	27958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15672003
629	NC_002662	ATG	2	6	30994	30999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672004
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631	NC_002662	T	6	6	31101	31106	0 %	100 %	0 %	0 %	15672004
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759	NC_002662	AT	3	6	38891	38896	50 %	50 %	0 %	0 %	15672011
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763	NC_002662	T	6	6	39065	39070	0 %	100 %	0 %	0 %	15672011
764	NC_002662	TGA	2	6	39118	39123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15672011
765	NC_002662	TTTCTT	2	12	39124	39135	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15672011
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767	NC_002662	T	6	6	39185	39190	0 %	100 %	0 %	0 %	15672011
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771	NC_002662	GTT	2	6	39456	39461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672012
772	NC_002662	GTT	2	6	39535	39540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15672012
773	NC_002662	GT	3	6	39687	39692	0 %	50 %	50 %	0 %	15672012
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