MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Leifsonia xyli subsp. cynodontis DSM 46306

Total Repeats: 71631

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022438	GCC	2	6	22164	22169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628306
502	NC_022438	CGG	2	6	22190	22195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628306
503	NC_022438	CGGC	2	8	22248	22255	0 %	0 %	50 %	50 %	545628306
504	NC_022438	CCA	2	6	22333	22338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628306
505	NC_022438	CATC	2	8	22342	22349	25 %	25 %	0 %	50 %	545628306
506	NC_022438	CGG	2	6	22387	22392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628306
507	NC_022438	CGC	2	6	22432	22437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628306
508	NC_022438	CGG	2	6	22442	22447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628306
509	NC_022438	GTGC	2	8	22497	22504	0 %	25 %	50 %	25 %	545628306
510	NC_022438	CGG	2	6	22561	22566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628306
511	NC_022438	GAG	2	6	22587	22592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628306
512	NC_022438	CG	3	6	22601	22606	0 %	0 %	50 %	50 %	545628306
513	NC_022438	ATC	2	6	22650	22655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628306
514	NC_022438	ACG	2	6	22683	22688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628306
515	NC_022438	TGA	2	6	22771	22776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628306
516	NC_022438	TCG	2	6	22888	22893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628306
517	NC_022438	CGC	2	6	22907	22912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628306
518	NC_022438	CCT	2	6	22921	22926	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628306
519	NC_022438	ACG	2	6	22945	22950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628306
520	NC_022438	GAG	2	6	22973	22978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628306
521	NC_022438	CAC	2	6	23038	23043	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628306
522	NC_022438	GGC	2	6	23083	23088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_022438	CGG	2	6	23115	23120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_022438	GAC	2	6	23181	23186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628307
525	NC_022438	CCGGT	2	10	23197	23206	0 %	20 %	40 %	40 %	545628307
526	NC_022438	CCG	2	6	23227	23232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628307
527	NC_022438	CGAC	2	8	23251	23258	25 %	0 %	25 %	50 %	545628307
528	NC_022438	AGA	2	6	23272	23277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545628307
529	NC_022438	AGT	2	6	23293	23298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628307
530	NC_022438	GCT	2	6	23306	23311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628307
531	NC_022438	GC	3	6	23371	23376	0 %	0 %	50 %	50 %	545628307
532	NC_022438	CCGG	2	8	23394	23401	0 %	0 %	50 %	50 %	545628307
533	NC_022438	CGG	2	6	23459	23464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
534	NC_022438	GCG	2	6	23601	23606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
535	NC_022438	CGG	2	6	23665	23670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
536	NC_022438	CGA	2	6	23677	23682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628307
537	NC_022438	CGT	2	6	23705	23710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628307
538	NC_022438	GTC	2	6	23724	23729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628307
539	NC_022438	GCC	2	6	23781	23786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628307
540	NC_022438	GAT	2	6	23819	23824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628307
541	NC_022438	ACGAGC	2	12	23838	23849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628307
542	NC_022438	CTT	2	6	23891	23896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545628307
543	NC_022438	TTC	2	6	23897	23902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545628307
544	NC_022438	CCT	2	6	23905	23910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628307
545	NC_022438	CGG	3	9	23941	23949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
546	NC_022438	CGC	2	6	23975	23980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628307
547	NC_022438	GCC	2	6	23981	23986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628307
548	NC_022438	GTCG	2	8	24014	24021	0 %	25 %	50 %	25 %	545628307
549	NC_022438	CGG	2	6	24022	24027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
550	NC_022438	GGC	4	12	24053	24064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
551	NC_022438	C	6	6	24073	24078	0 %	0 %	0 %	100 %	545628307
552	NC_022438	GCG	2	6	24093	24098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
553	NC_022438	GCG	2	6	24111	24116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
554	NC_022438	CGG	2	6	24130	24135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
555	NC_022438	TTC	2	6	24138	24143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545628307
556	NC_022438	CGG	2	6	24200	24205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
557	NC_022438	ATCGCG	2	12	24225	24236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	545628307
558	NC_022438	GCCG	2	8	24262	24269	0 %	0 %	50 %	50 %	545628307
559	NC_022438	CGA	2	6	24286	24291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628307
560	NC_022438	CGAG	2	8	24295	24302	25 %	0 %	50 %	25 %	545628307
561	NC_022438	GTCG	2	8	24308	24315	0 %	25 %	50 %	25 %	545628307
562	NC_022438	GC	3	6	24413	24418	0 %	0 %	50 %	50 %	545628307
563	NC_022438	CAG	2	6	24461	24466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628307
564	NC_022438	CGG	2	6	24499	24504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
565	NC_022438	CGC	2	6	24509	24514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628307
566	NC_022438	GCG	3	9	24522	24530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628307
567	NC_022438	CGA	2	6	24538	24543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628307
568	NC_022438	CGGT	2	8	24555	24562	0 %	25 %	50 %	25 %	545628307
569	NC_022438	TCG	2	6	24589	24594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628307
570	NC_022438	CTT	2	6	24643	24648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545628307
571	NC_022438	CTG	2	6	24874	24879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_022438	TTC	2	6	24914	24919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545628308
573	NC_022438	CGGC	2	8	25011	25018	0 %	0 %	50 %	50 %	545628308
574	NC_022438	CCG	2	6	25082	25087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628308
575	NC_022438	TTGC	2	8	25112	25119	0 %	50 %	25 %	25 %	545628308
576	NC_022438	CAC	2	6	25122	25127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628308
577	NC_022438	CCA	2	6	25140	25145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628308
578	NC_022438	GACT	2	8	25172	25179	25 %	25 %	25 %	25 %	545628308
579	NC_022438	GA	3	6	25188	25193	50 %	0 %	50 %	0 %	545628308
580	NC_022438	CCA	2	6	25248	25253	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628308
581	NC_022438	CCG	2	6	25274	25279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628308
582	NC_022438	CGG	2	6	25290	25295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628308
583	NC_022438	GTC	2	6	25327	25332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628308
584	NC_022438	GC	3	6	25355	25360	0 %	0 %	50 %	50 %	545628308
585	NC_022438	GGGATG	2	12	25403	25414	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	545628308
586	NC_022438	TGA	2	6	25455	25460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628308
587	NC_022438	TCG	2	6	25581	25586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628308
588	NC_022438	GCTG	2	8	25623	25630	0 %	25 %	50 %	25 %	545628308
589	NC_022438	CGC	2	6	25644	25649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628308
590	NC_022438	CGG	2	6	25693	25698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628308
591	NC_022438	CGC	2	6	25707	25712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628308
592	NC_022438	TGA	2	6	25725	25730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628308
593	NC_022438	CAC	2	6	25867	25872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628308
594	NC_022438	CTG	2	6	25879	25884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628308
595	NC_022438	CTG	2	6	25909	25914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628308
596	NC_022438	TCG	2	6	25929	25934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628308
597	NC_022438	GAA	2	6	25990	25995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545628308
598	NC_022438	GTC	2	6	26023	26028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628308
599	NC_022438	CGG	2	6	26082	26087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628308
600	NC_022438	GGAC	2	8	26142	26149	25 %	0 %	50 %	25 %	545628308
601	NC_022438	CGA	2	6	26169	26174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628308
602	NC_022438	CG	4	8	26210	26217	0 %	0 %	50 %	50 %	545628308
603	NC_022438	TGCG	2	8	26223	26230	0 %	25 %	50 %	25 %	545628308
604	NC_022438	GAT	2	6	26263	26268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628308
605	NC_022438	CAG	2	6	26281	26286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628308
606	NC_022438	CAC	2	6	26348	26353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545628309
607	NC_022438	GTTG	2	8	26362	26369	0 %	50 %	50 %	0 %	545628309
608	NC_022438	CGA	2	6	26401	26406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628309
609	NC_022438	CGA	2	6	26419	26424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628309
610	NC_022438	GAG	2	6	26427	26432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628309
611	NC_022438	CCGC	2	8	26433	26440	0 %	0 %	25 %	75 %	545628309
612	NC_022438	CGC	2	6	26488	26493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628309
613	NC_022438	AG	3	6	26528	26533	50 %	0 %	50 %	0 %	545628309
614	NC_022438	GAG	2	6	26543	26548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628309
615	NC_022438	CGA	2	6	26596	26601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628309
616	NC_022438	CTC	2	6	26648	26653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628309
617	NC_022438	GAT	2	6	26666	26671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628309
618	NC_022438	CTGGCC	2	12	26705	26716	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	545628309
619	NC_022438	GCC	2	6	26735	26740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628309
620	NC_022438	CCG	2	6	26781	26786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628309
621	NC_022438	TCC	2	6	26787	26792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545628309
622	NC_022438	CGA	2	6	26866	26871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628309
623	NC_022438	GCC	2	6	26876	26881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628309
624	NC_022438	AGC	2	6	26889	26894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628309
625	NC_022438	GAG	2	6	26900	26905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545628309
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627	NC_022438	ATG	2	6	27027	27032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545628309
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729	NC_022438	GCCGG	2	10	31029	31038	0 %	0 %	60 %	40 %	545628313
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734	NC_022438	GCGA	2	8	31198	31205	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
735	NC_022438	GC	3	6	31213	31218	0 %	0 %	50 %	50 %	545628314
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739	NC_022438	CTTCG	2	10	31314	31323	0 %	40 %	20 %	40 %	545628314
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742	NC_022438	GT	3	6	31530	31535	0 %	50 %	50 %	0 %	545628314
743	NC_022438	AG	4	8	31537	31544	50 %	0 %	50 %	0 %	545628314
744	NC_022438	CGC	3	9	31657	31665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
745	NC_022438	GTTT	2	8	31676	31683	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
746	NC_022438	ATGA	2	8	31698	31705	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
747	NC_022438	CGA	2	6	31809	31814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
748	NC_022438	ACGGCT	2	12	31845	31856	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
749	NC_022438	TAC	2	6	31877	31882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
750	NC_022438	CAGATT	2	12	31901	31912	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
751	NC_022438	TCG	2	6	31949	31954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
752	NC_022438	ACG	2	6	32049	32054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
753	NC_022438	GAT	2	6	32065	32070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
754	NC_022438	ATGG	2	8	32179	32186	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
755	NC_022438	ACC	2	6	32246	32251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
756	NC_022438	AGC	2	6	32299	32304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_022438	TC	4	8	32306	32313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
758	NC_022438	CGAG	2	8	32316	32323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
759	NC_022438	CGC	2	6	32329	32334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
760	NC_022438	GCT	2	6	32350	32355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
761	NC_022438	GC	3	6	32357	32362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
762	NC_022438	GAA	2	6	32377	32382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
763	NC_022438	GCA	3	9	32443	32451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_022438	GCTG	2	8	32473	32480	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
765	NC_022438	CGA	2	6	32509	32514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
766	NC_022438	CGCGA	2	10	32532	32541	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
767	NC_022438	CTA	2	6	32543	32548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
768	NC_022438	CCG	2	6	32596	32601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
769	NC_022438	GGC	2	6	32635	32640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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772	NC_022438	AC	3	6	32779	32784	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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774	NC_022438	CG	3	6	32921	32926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
775	NC_022438	TGG	2	6	32928	32933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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781	NC_022438	GCCG	2	8	33224	33231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
782	NC_022438	GTG	2	6	33291	33296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
783	NC_022438	CG	4	8	33325	33332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
784	NC_022438	ACT	2	6	33393	33398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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786	NC_022438	CGC	2	6	33442	33447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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792	NC_022438	GCG	2	6	33574	33579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
793	NC_022438	CGG	2	6	33638	33643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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795	NC_022438	CCG	2	6	33653	33658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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883	NC_022438	GAC	2	6	37095	37100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628317
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888	NC_022438	ATCCTG	2	12	37242	37253	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545628317
889	NC_022438	CG	3	6	37264	37269	0 %	0 %	50 %	50 %	545628317
890	NC_022438	ATC	2	6	37305	37310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628317
891	NC_022438	CGTCAT	2	12	37337	37348	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	545628317
892	NC_022438	GCT	2	6	37367	37372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628317
893	NC_022438	CGA	2	6	37418	37423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628317
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899	NC_022438	CGG	2	6	37564	37569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628318
900	NC_022438	GC	3	6	37605	37610	0 %	0 %	50 %	50 %	545628318
901	NC_022438	TCG	2	6	37611	37616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628318
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903	NC_022438	CATGGT	2	12	37723	37734	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	545628318
904	NC_022438	ATC	2	6	37736	37741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545628318
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907	NC_022438	TCG	2	6	37791	37796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545628318
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924	NC_022438	CGG	2	6	38347	38352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545628318
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945	NC_022438	AG	3	6	38878	38883	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
946	NC_022438	AGAGA	2	10	38886	38895	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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954	NC_022438	ACG	2	6	39254	39259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628319
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974	NC_022438	TCC	2	6	40066	40071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
975	NC_022438	GC	3	6	40080	40085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
976	NC_022438	C	6	6	40158	40163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
977	NC_022438	CCGG	3	12	40195	40206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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982	NC_022438	GC	3	6	40407	40412	0 %	0 %	50 %	50 %	545628320
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984	NC_022438	GC	3	6	40445	40450	0 %	0 %	50 %	50 %	545628320
985	NC_022438	GC	3	6	40476	40481	0 %	0 %	50 %	50 %	545628320
986	NC_022438	CGA	2	6	40487	40492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628320
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995	NC_022438	TCC	2	6	40917	40922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
996	NC_022438	TAAAC	2	10	40961	40970	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
997	NC_022438	AT	3	6	40971	40976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
998	NC_022438	GAAA	2	8	41043	41050	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
999	NC_022438	CGA	2	6	41064	41069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545628321
1000	NC_022438	CGC	2	6	41082	41087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545628321

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