MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listonella anguillarum M3 chromosome 1

Total Repeats: 59337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_022223	T	6	6	313213	313218	0 %	100 %	0 %	0 %	537453131
6002	NC_022223	AGCGG	2	10	313277	313286	20 %	0 %	60 %	20 %	537453131
6003	NC_022223	ATC	2	6	313363	313368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453131
6004	NC_022223	GCT	2	6	313391	313396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453131
6005	NC_022223	T	6	6	313437	313442	0 %	100 %	0 %	0 %	537453131
6006	NC_022223	CAT	2	6	313463	313468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453131
6007	NC_022223	T	6	6	313511	313516	0 %	100 %	0 %	0 %	537453131
6008	NC_022223	CAT	2	6	313635	313640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453131
6009	NC_022223	CAA	2	6	313878	313883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537453131
6010	NC_022223	AAG	2	6	313897	313902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537453131
6011	NC_022223	ATG	2	6	313929	313934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453131
6012	NC_022223	GAA	2	6	313944	313949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537453131
6013	NC_022223	TGA	2	6	313975	313980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453131
6014	NC_022223	TGCA	2	8	313984	313991	25 %	25 %	25 %	25 %	537453131
6015	NC_022223	TTC	2	6	314044	314049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537453131
6016	NC_022223	TCA	2	6	314051	314056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453131
6017	NC_022223	GAA	3	9	314082	314090	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537453131
6018	NC_022223	CGT	2	6	314091	314096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453131
6019	NC_022223	ATGT	2	8	314100	314107	25 %	50 %	25 %	0 %	537453131
6020	NC_022223	CG	3	6	314118	314123	0 %	0 %	50 %	50 %	537453131
6021	NC_022223	CGT	2	6	314157	314162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453131
6022	NC_022223	CA	3	6	314186	314191	50 %	0 %	0 %	50 %	537453131
6023	NC_022223	AAG	2	6	314260	314265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537453131
6024	NC_022223	GC	3	6	314303	314308	0 %	0 %	50 %	50 %	537453131
6025	NC_022223	A	6	6	314333	314338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_022223	TAA	2	6	314339	314344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6027	NC_022223	GGC	2	6	314424	314429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537453132
6028	NC_022223	TCG	2	6	314437	314442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453132
6029	NC_022223	TGGCA	2	10	314472	314481	20 %	20 %	40 %	20 %	537453132
6030	NC_022223	GC	3	6	314621	314626	0 %	0 %	50 %	50 %	537453132
6031	NC_022223	AGC	2	6	314763	314768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537453132
6032	NC_022223	TCG	2	6	314787	314792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453132
6033	NC_022223	GTT	2	6	314934	314939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6034	NC_022223	ACA	2	6	314947	314952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_022223	TTA	2	6	314984	314989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6036	NC_022223	TAA	2	6	314996	315001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6037	NC_022223	TGA	2	6	315010	315015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_022223	A	7	7	315033	315039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6039	NC_022223	TAT	2	6	315076	315081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_022223	CCG	2	6	315088	315093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6041	NC_022223	GC	3	6	315172	315177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6042	NC_022223	GTG	2	6	315220	315225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6043	NC_022223	ATT	2	6	315298	315303	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_022223	A	6	6	315340	315345	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_022223	CAT	2	6	315380	315385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6046	NC_022223	AG	3	6	315406	315411	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_022223	TC	3	6	315415	315420	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_022223	A	6	6	315430	315435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_022223	CTTTT	2	10	315524	315533	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
6050	NC_022223	GAAAA	2	10	315553	315562	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6051	NC_022223	GCAA	2	8	315569	315576	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6052	NC_022223	TGG	2	6	315597	315602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6053	NC_022223	ATT	2	6	315674	315679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6054	NC_022223	GAA	2	6	315715	315720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_022223	AT	3	6	315725	315730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_022223	ACC	2	6	315804	315809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6057	NC_022223	TAA	2	6	315811	315816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6058	NC_022223	TAA	2	6	315934	315939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6059	NC_022223	ACC	2	6	316050	316055	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6060	NC_022223	TAA	2	6	316057	316062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6061	NC_022223	TAA	2	6	316180	316185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6062	NC_022223	TC	3	6	316205	316210	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6063	NC_022223	TTA	2	6	316325	316330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6064	NC_022223	TTG	2	6	316348	316353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6065	NC_022223	T	6	6	316426	316431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6066	NC_022223	GTG	2	6	316533	316538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6067	NC_022223	TTTGA	2	10	316566	316575	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6068	NC_022223	TGT	2	6	316699	316704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6069	NC_022223	ACAG	2	8	316717	316724	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6070	NC_022223	A	6	6	316775	316780	100 %	0 %	0 %	0 %	537453133
6071	NC_022223	TTG	2	6	316861	316866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537453133
6072	NC_022223	GAA	2	6	317130	317135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537453133
6073	NC_022223	CTTT	2	8	317151	317158	0 %	75 %	0 %	25 %	537453133
6074	NC_022223	TGG	2	6	317222	317227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537453133
6075	NC_022223	TTA	2	6	317278	317283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537453133
6076	NC_022223	GTTG	2	8	317370	317377	0 %	50 %	50 %	0 %	537453133
6077	NC_022223	TCGCG	2	10	317423	317432	0 %	20 %	40 %	40 %	537453133
6078	NC_022223	CCG	2	6	317521	317526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537453133
6079	NC_022223	A	6	6	317541	317546	100 %	0 %	0 %	0 %	537453133
6080	NC_022223	CTG	2	6	317661	317666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453133
6081	NC_022223	TGGTT	2	10	317783	317792	0 %	60 %	40 %	0 %	537453133
6082	NC_022223	GCC	2	6	317926	317931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537453133
6083	NC_022223	GCCGA	2	10	318000	318009	20 %	0 %	40 %	40 %	537453133
6084	NC_022223	CGG	2	6	318125	318130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537453133
6085	NC_022223	TCAACG	2	12	318131	318142	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537453133
6086	NC_022223	TGA	2	6	318191	318196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453133
6087	NC_022223	TCA	2	6	318286	318291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453133
6088	NC_022223	GTT	2	6	318380	318385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537453133
6089	NC_022223	CAGC	2	8	318407	318414	25 %	0 %	25 %	50 %	537453133
6090	NC_022223	AGA	2	6	318452	318457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537453133
6091	NC_022223	GTA	2	6	318459	318464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453133
6092	NC_022223	A	6	6	318477	318482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_022223	GAAT	2	8	318518	318525	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_022223	ACA	2	6	318540	318545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6095	NC_022223	GGC	2	6	318620	318625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537453134
6096	NC_022223	ATG	2	6	318670	318675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453134
6097	NC_022223	AGC	2	6	318703	318708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537453134
6098	NC_022223	TGG	2	6	318713	318718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537453134
6099	NC_022223	TCGT	2	8	318754	318761	0 %	50 %	25 %	25 %	537453134
6100	NC_022223	GAT	2	6	318972	318977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453134
6101	NC_022223	ATT	2	6	319210	319215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537453134
6102	NC_022223	AGA	2	6	319268	319273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537453134
6103	NC_022223	GCG	2	6	319287	319292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537453134
6104	NC_022223	GAA	2	6	319353	319358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537453134
6105	NC_022223	CAT	2	6	319397	319402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453134
6106	NC_022223	CAA	2	6	319478	319483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537453134
6107	NC_022223	CAG	2	6	319522	319527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537453134
6108	NC_022223	CAA	2	6	319533	319538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537453134
6109	NC_022223	A	6	6	319593	319598	100 %	0 %	0 %	0 %	537453134
6110	NC_022223	TGA	2	6	319609	319614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453134
6111	NC_022223	AAC	2	6	319662	319667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537453134
6112	NC_022223	GCG	2	6	319704	319709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537453134
6113	NC_022223	TGT	2	6	319711	319716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537453134
6114	NC_022223	TGGC	2	8	319808	319815	0 %	25 %	50 %	25 %	537453134
6115	NC_022223	AG	3	6	319874	319879	50 %	0 %	50 %	0 %	537453134
6116	NC_022223	ACT	2	6	319906	319911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453134
6117	NC_022223	GTTG	2	8	319931	319938	0 %	50 %	50 %	0 %	537453134
6118	NC_022223	TGC	2	6	319981	319986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453134
6119	NC_022223	ACG	2	6	320011	320016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537453134
6120	NC_022223	G	6	6	320053	320058	0 %	0 %	100 %	0 %	537453134
6121	NC_022223	GCG	2	6	320169	320174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_022223	TTA	2	6	320207	320212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_022223	T	6	6	320255	320260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6124	NC_022223	T	6	6	320269	320274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6125	NC_022223	CAT	2	6	320311	320316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_022223	TGG	2	6	320399	320404	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537453135
6127	NC_022223	TTG	2	6	320447	320452	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537453135
6128	NC_022223	AGCG	2	8	320470	320477	25 %	0 %	50 %	25 %	537453135
6129	NC_022223	TTA	2	6	320537	320542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537453135
6130	NC_022223	ATC	2	6	320656	320661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453135
6131	NC_022223	TTCCA	2	10	320670	320679	20 %	40 %	0 %	40 %	537453135
6132	NC_022223	CTT	2	6	320712	320717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537453135
6133	NC_022223	GTG	2	6	320725	320730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537453135
6134	NC_022223	GCA	2	6	320738	320743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537453135
6135	NC_022223	GGTT	2	8	320812	320819	0 %	50 %	50 %	0 %	537453135
6136	NC_022223	TTGG	2	8	320850	320857	0 %	50 %	50 %	0 %	537453135
6137	NC_022223	TGC	2	6	320903	320908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453135
6138	NC_022223	TGC	2	6	320933	320938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453135
6139	NC_022223	GCTAAA	2	12	321004	321015	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	537453135
6140	NC_022223	TAC	2	6	321037	321042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453135
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6142	NC_022223	TGG	2	6	321107	321112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537453135
6143	NC_022223	CTTT	2	8	321159	321166	0 %	75 %	0 %	25 %	537453135
6144	NC_022223	TTG	2	6	321221	321226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537453135
6145	NC_022223	TGT	2	6	321237	321242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537453135
6146	NC_022223	TGC	3	9	321329	321337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453136
6147	NC_022223	T	6	6	321371	321376	0 %	100 %	0 %	0 %	537453136
6148	NC_022223	TGTC	2	8	321442	321449	0 %	50 %	25 %	25 %	537453136
6149	NC_022223	ATC	2	6	321488	321493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453136
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6151	NC_022223	CCTC	2	8	321519	321526	0 %	25 %	0 %	75 %	537453136
6152	NC_022223	TGGA	2	8	321528	321535	25 %	25 %	50 %	0 %	537453136
6153	NC_022223	TGA	2	6	321542	321547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453136
6154	NC_022223	CGGT	2	8	321640	321647	0 %	25 %	50 %	25 %	537453136
6155	NC_022223	CTG	2	6	321682	321687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453136
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6157	NC_022223	TGG	2	6	321838	321843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537453136
6158	NC_022223	CG	3	6	321875	321880	0 %	0 %	50 %	50 %	537453136
6159	NC_022223	GAA	2	6	321908	321913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537453136
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6163	NC_022223	CAT	2	6	322093	322098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453136
6164	NC_022223	TCT	2	6	322132	322137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537453136
6165	NC_022223	TGG	2	6	322146	322151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537453136
6166	NC_022223	CTAAA	2	10	322288	322297	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6167	NC_022223	GCC	2	6	322299	322304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6168	NC_022223	T	7	7	322319	322325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6169	NC_022223	ACCCA	2	10	322343	322352	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
6170	NC_022223	TGT	2	6	322386	322391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6171	NC_022223	ACT	2	6	322393	322398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6172	NC_022223	ATG	2	6	322423	322428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453137
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6179	NC_022223	A	6	6	322878	322883	100 %	0 %	0 %	0 %	537453137
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6184	NC_022223	A	6	6	323162	323167	100 %	0 %	0 %	0 %	537453137
6185	NC_022223	GAA	2	6	323188	323193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537453137
6186	NC_022223	GGC	2	6	323374	323379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6187	NC_022223	CTTT	2	8	323389	323396	0 %	75 %	0 %	25 %	537453138
6188	NC_022223	GTT	2	6	323422	323427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537453138
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6190	NC_022223	TCGACA	2	12	323478	323489	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	537453138
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6193	NC_022223	T	6	6	323565	323570	0 %	100 %	0 %	0 %	537453138
6194	NC_022223	TGG	2	6	323644	323649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537453138
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6209	NC_022223	GTT	2	6	324173	324178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6210	NC_022223	A	7	7	324181	324187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6211	NC_022223	TTG	2	6	324244	324249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537453139
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6227	NC_022223	GAT	2	6	325197	325202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6228	NC_022223	TGA	2	6	325205	325210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6229	NC_022223	ATTA	2	8	325298	325305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6230	NC_022223	TCA	2	6	325339	325344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537453140
6231	NC_022223	TGG	2	6	325460	325465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537453140
6232	NC_022223	AG	4	8	325595	325602	50 %	0 %	50 %	0 %	537453140
6233	NC_022223	TTC	2	6	325609	325614	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537453140
6234	NC_022223	ATT	2	6	325619	325624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537453140
6235	NC_022223	AG	3	6	325641	325646	50 %	0 %	50 %	0 %	537453140
6236	NC_022223	TTTTA	2	10	325650	325659	20 %	80 %	0 %	0 %	537453140
6237	NC_022223	TGA	2	6	325694	325699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453140
6238	NC_022223	T	7	7	325940	325946	0 %	100 %	0 %	0 %	537453140
6239	NC_022223	CGT	2	6	326013	326018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537453140
6240	NC_022223	GA	3	6	326023	326028	50 %	0 %	50 %	0 %	537453140
6241	NC_022223	TTTTTA	2	12	326097	326108	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6242	NC_022223	AT	3	6	326121	326126	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6243	NC_022223	CAG	2	6	326143	326148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6244	NC_022223	GGC	2	6	326152	326157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6245	NC_022223	GCT	2	6	326167	326172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6246	NC_022223	AT	3	6	326188	326193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6247	NC_022223	TTTA	2	8	326221	326228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6248	NC_022223	A	6	6	326238	326243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6249	NC_022223	ATT	2	6	326265	326270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6250	NC_022223	A	6	6	326294	326299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6377	NC_022223	GAT	2	6	332540	332545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537453145
6378	NC_022223	GT	3	6	332581	332586	0 %	50 %	50 %	0 %	537453145
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6380	NC_022223	ATT	2	6	332645	332650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537453145
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6433	NC_022223	AAT	2	6	335311	335316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6482	NC_022223	AT	3	6	337821	337826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6485	NC_022223	TTA	2	6	337862	337867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6499	NC_022223	TA	3	6	338682	338687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6500	NC_022223	CAA	2	6	338831	338836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537453150

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