MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022051	CAAGA	2	10	897	906	60 %	0 %	20 %	20 %	530341462
2	NC_022051	TCAAT	2	10	3763	3772	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_022051	TTTCT	2	10	4315	4324	0 %	80 %	0 %	20 %	530341465
4	NC_022051	TACTT	2	10	5249	5258	20 %	60 %	0 %	20 %	530341467
5	NC_022051	TTATT	2	10	5524	5533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022051	CTTTG	2	10	11972	11981	0 %	60 %	20 %	20 %	530341449
7	NC_022051	TATAC	2	10	12656	12665	40 %	40 %	0 %	20 %	530341473
8	NC_022051	TGTTA	2	10	12805	12814	20 %	60 %	20 %	0 %	530341473
9	NC_022051	TAGTA	2	10	13385	13394	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_022051	TGAAA	2	10	16369	16378	60 %	20 %	20 %	0 %	530341452
11	NC_022051	TTGGA	2	10	17169	17178	20 %	40 %	40 %	0 %	530341476
12	NC_022051	TCTAT	2	10	18340	18349	20 %	60 %	0 %	20 %	530341453
13	NC_022051	TTTTA	2	10	21762	21771	20 %	80 %	0 %	0 %	530341481
14	NC_022051	ATGTT	2	10	22172	22181	20 %	60 %	20 %	0 %	530341481
15	NC_022051	CTGAA	2	10	22268	22277	40 %	20 %	20 %	20 %	530341481
16	NC_022051	AATTC	2	10	25056	25065	40 %	40 %	0 %	20 %	530341484
17	NC_022051	CCACT	2	10	27111	27120	20 %	20 %	0 %	60 %	530341486
18	NC_022051	TTATC	2	10	27372	27381	20 %	60 %	0 %	20 %	530341487
19	NC_022051	GTATT	2	10	29260	29269	20 %	60 %	20 %	0 %	530341490
20	NC_022051	GAAAA	2	10	29520	29529	80 %	0 %	20 %	0 %	530341490
21	NC_022051	AAAAG	2	10	32801	32810	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_022051	AAATA	2	10	32858	32867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022051	GATCG	2	10	32960	32969	20 %	20 %	40 %	20 %	530341495
24	NC_022051	CAAGA	2	10	34245	34254	60 %	0 %	20 %	20 %	530341496
25	NC_022051	AAACA	2	10	34470	34479	80 %	0 %	0 %	20 %	530341496
26	NC_022051	GGGTG	2	10	34685	34694	0 %	20 %	80 %	0 %	530341496
27	NC_022051	GAATT	2	10	36187	36196	40 %	40 %	20 %	0 %	530341498
28	NC_022051	CATAA	2	10	37907	37916	60 %	20 %	0 %	20 %	530341500
29	NC_022051	GATTT	2	10	38820	38829	20 %	60 %	20 %	0 %	530341455
30	NC_022051	ACAAA	2	10	41417	41426	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_022051	CTTTT	2	10	41821	41830	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_022051	AGAAA	2	10	43683	43692	80 %	0 %	20 %	0 %	530341505
33	NC_022051	TAAAC	2	10	43929	43938	60 %	20 %	0 %	20 %	530341505
34	NC_022051	TTAAT	2	10	46504	46513	40 %	60 %	0 %	0 %	530341510
35	NC_022051	TTAAC	2	10	47591	47600	40 %	40 %	0 %	20 %	530341512
36	NC_022051	TTAGT	2	10	50300	50309	20 %	60 %	20 %	0 %	530341514
37	NC_022051	AGATG	2	10	52426	52435	40 %	20 %	40 %	0 %	530341516
38	NC_022051	AAATC	2	10	52555	52564	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_022051	GTTTT	2	10	53981	53990	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022051	CATAC	2	10	55396	55405	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.