MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 189

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022051	ATCA	2	8	823	830	50 %	25 %	0 %	25 %	530341462
2	NC_022051	ATTT	3	12	1844	1855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022051	TTCT	2	8	1906	1913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_022051	GATA	2	8	1938	1945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022051	GACT	2	8	2011	2018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_022051	GAGG	2	8	2272	2279	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022051	CTAC	2	8	2327	2334	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_022051	TGAT	2	8	2690	2697	25 %	50 %	25 %	0 %	530341464
9	NC_022051	GAAA	2	8	3076	3083	75 %	0 %	25 %	0 %	530341464
10	NC_022051	GTTT	2	8	3365	3372	0 %	75 %	25 %	0 %	530341464
11	NC_022051	AATA	2	8	3547	3554	75 %	25 %	0 %	0 %	530341464
12	NC_022051	AAAG	2	8	4161	4168	75 %	0 %	25 %	0 %	530341465
13	NC_022051	AATA	2	8	4334	4341	75 %	25 %	0 %	0 %	530341465
14	NC_022051	TAAA	2	8	4560	4567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_022051	GTGA	2	8	4619	4626	25 %	25 %	50 %	0 %	530341466
16	NC_022051	CAAA	2	8	4675	4682	75 %	0 %	0 %	25 %	530341466
17	NC_022051	CATG	2	8	4763	4770	25 %	25 %	25 %	25 %	530341466
18	NC_022051	GTTT	2	8	5125	5132	0 %	75 %	25 %	0 %	530341467
19	NC_022051	TAAA	2	8	5143	5150	75 %	25 %	0 %	0 %	530341467
20	NC_022051	AATG	2	8	5905	5912	50 %	25 %	25 %	0 %	530341468
21	NC_022051	GATA	2	8	6560	6567	50 %	25 %	25 %	0 %	530341468
22	NC_022051	CCAT	2	8	7133	7140	25 %	25 %	0 %	50 %	530341468
23	NC_022051	TAAA	2	8	7443	7450	75 %	25 %	0 %	0 %	530341468
24	NC_022051	TGTT	2	8	8216	8223	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022051	CATC	2	8	8243	8250	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022051	GATA	2	8	8570	8577	50 %	25 %	25 %	0 %	530341470
27	NC_022051	TGCC	2	8	8667	8674	0 %	25 %	25 %	50 %	530341470
28	NC_022051	GTTT	2	8	9124	9131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022051	ATTA	2	8	9412	9419	50 %	50 %	0 %	0 %	530341471
30	NC_022051	AAAG	2	8	9422	9429	75 %	0 %	25 %	0 %	530341471
31	NC_022051	AAGA	2	8	10298	10305	75 %	0 %	25 %	0 %	530341471
32	NC_022051	AAAG	2	8	10511	10518	75 %	0 %	25 %	0 %	530341471
33	NC_022051	TTGG	2	8	10583	10590	0 %	50 %	50 %	0 %	530341471
34	NC_022051	ATGA	2	8	10653	10660	50 %	25 %	25 %	0 %	530341471
35	NC_022051	GCAT	2	8	10713	10720	25 %	25 %	25 %	25 %	530341472
36	NC_022051	TTAA	2	8	11311	11318	50 %	50 %	0 %	0 %	530341449
37	NC_022051	GAAT	2	8	11351	11358	50 %	25 %	25 %	0 %	530341449
38	NC_022051	TTTG	2	8	11591	11598	0 %	75 %	25 %	0 %	530341449
39	NC_022051	TCTT	2	8	12304	12311	0 %	75 %	0 %	25 %	530341473
40	NC_022051	CAAT	2	8	12420	12427	50 %	25 %	0 %	25 %	530341473
41	NC_022051	ATTT	2	8	12529	12536	25 %	75 %	0 %	0 %	530341473
42	NC_022051	TGGG	2	8	12709	12716	0 %	25 %	75 %	0 %	530341473
43	NC_022051	TATT	2	8	12987	12994	25 %	75 %	0 %	0 %	530341473
44	NC_022051	TTAT	2	8	13051	13058	25 %	75 %	0 %	0 %	530341473
45	NC_022051	TAAT	2	8	13434	13441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022051	TAAA	2	8	13448	13455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022051	ATTT	2	8	13725	13732	25 %	75 %	0 %	0 %	530341474
48	NC_022051	ATGG	2	8	14360	14367	25 %	25 %	50 %	0 %	530341474
49	NC_022051	CTAA	2	8	14837	14844	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_022051	TAAG	2	8	15080	15087	50 %	25 %	25 %	0 %	530341450
51	NC_022051	TTGA	2	8	15527	15534	25 %	50 %	25 %	0 %	530341450
52	NC_022051	CTTT	2	8	15797	15804	0 %	75 %	0 %	25 %	530341450
53	NC_022051	TTTC	2	8	15981	15988	0 %	75 %	0 %	25 %	530341451
54	NC_022051	TTGT	2	8	16143	16150	0 %	75 %	25 %	0 %	530341451
55	NC_022051	CCTT	2	8	16188	16195	0 %	50 %	0 %	50 %	530341452
56	NC_022051	AGAC	2	8	16252	16259	50 %	0 %	25 %	25 %	530341452
57	NC_022051	AAGC	2	8	16562	16569	50 %	0 %	25 %	25 %	530341475
58	NC_022051	TTGA	2	8	16946	16953	25 %	50 %	25 %	0 %	530341476
59	NC_022051	TTAC	2	8	17038	17045	25 %	50 %	0 %	25 %	530341476
60	NC_022051	GAAG	2	8	17254	17261	50 %	0 %	50 %	0 %	530341476
61	NC_022051	TAGT	2	8	17410	17417	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_022051	AATC	2	8	17431	17438	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_022051	GAAC	2	8	17531	17538	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_022051	TTTG	2	8	17604	17611	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022051	AAAG	2	8	17744	17751	75 %	0 %	25 %	0 %	530341477
66	NC_022051	GGTA	2	8	17880	17887	25 %	25 %	50 %	0 %	530341477
67	NC_022051	CTTC	2	8	18305	18312	0 %	50 %	0 %	50 %	530341453
68	NC_022051	CCGA	2	8	18581	18588	25 %	0 %	25 %	50 %	530341453
69	NC_022051	TCAT	2	8	18910	18917	25 %	50 %	0 %	25 %	530341453
70	NC_022051	ATGC	2	8	19203	19210	25 %	25 %	25 %	25 %	530341453
71	NC_022051	AATT	2	8	20745	20752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_022051	TAAA	2	8	20992	20999	75 %	25 %	0 %	0 %	530341480
73	NC_022051	AGGG	2	8	21249	21256	25 %	0 %	75 %	0 %	530341481
74	NC_022051	CGAA	2	8	21896	21903	50 %	0 %	25 %	25 %	530341481
75	NC_022051	AAGC	2	8	22072	22079	50 %	0 %	25 %	25 %	530341481
76	NC_022051	CTTG	2	8	22192	22199	0 %	50 %	25 %	25 %	530341481
77	NC_022051	AATT	2	8	23017	23024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_022051	TGGA	2	8	23607	23614	25 %	25 %	50 %	0 %	530341483
79	NC_022051	AAAG	2	8	23841	23848	75 %	0 %	25 %	0 %	530341454
80	NC_022051	GCTC	2	8	24004	24011	0 %	25 %	25 %	50 %	530341454
81	NC_022051	TTTC	2	8	24521	24528	0 %	75 %	0 %	25 %	530341484
82	NC_022051	AAGT	2	8	24553	24560	50 %	25 %	25 %	0 %	530341484
83	NC_022051	AACA	2	8	24704	24711	75 %	0 %	0 %	25 %	530341484
84	NC_022051	CGAT	2	8	24722	24729	25 %	25 %	25 %	25 %	530341484
85	NC_022051	CTTT	2	8	24935	24942	0 %	75 %	0 %	25 %	530341484
86	NC_022051	TTTC	2	8	25038	25045	0 %	75 %	0 %	25 %	530341484
87	NC_022051	CAAA	2	8	25278	25285	75 %	0 %	0 %	25 %	530341485
88	NC_022051	GATG	2	8	25438	25445	25 %	25 %	50 %	0 %	530341485
89	NC_022051	TTTG	2	8	25632	25639	0 %	75 %	25 %	0 %	530341485
90	NC_022051	TTTC	2	8	25948	25955	0 %	75 %	0 %	25 %	530341485
91	NC_022051	TCAT	2	8	26292	26299	25 %	50 %	0 %	25 %	530341485
92	NC_022051	CAAG	2	8	26571	26578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_022051	ATTA	2	8	26589	26596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_022051	ATAA	2	8	26604	26611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_022051	AGAA	2	8	26858	26865	75 %	0 %	25 %	0 %	530341486
96	NC_022051	AAGA	2	8	27317	27324	75 %	0 %	25 %	0 %	530341487
97	NC_022051	CAAA	3	12	27338	27349	75 %	0 %	0 %	25 %	530341487
98	NC_022051	AAGT	2	8	27588	27595	50 %	25 %	25 %	0 %	530341487
99	NC_022051	TAAA	2	8	28186	28193	75 %	25 %	0 %	0 %	530341487
100	NC_022051	GTAA	2	8	28245	28252	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_022051	AAGA	2	8	28865	28872	75 %	0 %	25 %	0 %	530341489
102	NC_022051	CAAT	2	8	28899	28906	50 %	25 %	0 %	25 %	530341489
103	NC_022051	AACC	2	8	29791	29798	50 %	0 %	0 %	50 %	530341490
104	NC_022051	AAGA	2	8	30612	30619	75 %	0 %	25 %	0 %	530341491
105	NC_022051	AACC	2	8	30827	30834	50 %	0 %	0 %	50 %	530341491
106	NC_022051	TCGC	2	8	31067	31074	0 %	25 %	25 %	50 %	530341492
107	NC_022051	GAAA	2	8	31114	31121	75 %	0 %	25 %	0 %	530341492
108	NC_022051	ATCC	2	8	31472	31479	25 %	25 %	0 %	50 %	530341492
109	NC_022051	AAGT	2	8	32581	32588	50 %	25 %	25 %	0 %	530341494
110	NC_022051	TTTA	2	8	32766	32773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022051	TTAG	2	8	32987	32994	25 %	50 %	25 %	0 %	530341495
112	NC_022051	CAAG	2	8	33059	33066	50 %	0 %	25 %	25 %	530341495
113	NC_022051	GAAA	2	8	34163	34170	75 %	0 %	25 %	0 %	530341496
114	NC_022051	GAAA	2	8	34283	34290	75 %	0 %	25 %	0 %	530341496
115	NC_022051	ACCG	2	8	34295	34302	25 %	0 %	25 %	50 %	530341496
116	NC_022051	ATTT	2	8	34455	34462	25 %	75 %	0 %	0 %	530341496
117	NC_022051	CCTT	2	8	34495	34502	0 %	50 %	0 %	50 %	530341496
118	NC_022051	ATGA	2	8	34955	34962	50 %	25 %	25 %	0 %	530341497
119	NC_022051	GAAA	2	8	35297	35304	75 %	0 %	25 %	0 %	530341497
120	NC_022051	CAAA	2	8	35613	35620	75 %	0 %	0 %	25 %	530341497
121	NC_022051	CATC	2	8	35807	35814	25 %	25 %	0 %	50 %	530341497
122	NC_022051	TTTG	2	8	35967	35974	0 %	75 %	25 %	0 %	530341497
123	NC_022051	GAAA	2	8	36207	36214	75 %	0 %	25 %	0 %	530341498
124	NC_022051	ATCG	2	8	36523	36530	25 %	25 %	25 %	25 %	530341498
125	NC_022051	ACTT	2	8	36692	36699	25 %	50 %	0 %	25 %	530341498
126	NC_022051	GAAA	2	8	36724	36731	75 %	0 %	25 %	0 %	530341498
127	NC_022051	ACTT	2	8	37491	37498	25 %	50 %	0 %	25 %	530341500
128	NC_022051	TTTC	2	8	37659	37666	0 %	75 %	0 %	25 %	530341500
129	NC_022051	AATA	2	8	37859	37866	75 %	25 %	0 %	0 %	530341500
130	NC_022051	AGAA	2	8	37891	37898	75 %	0 %	25 %	0 %	530341500
131	NC_022051	TTTG	2	8	38024	38031	0 %	75 %	25 %	0 %	530341500
132	NC_022051	TAAA	2	8	38431	38438	75 %	25 %	0 %	0 %	530341500
133	NC_022051	TTCC	2	8	38457	38464	0 %	50 %	0 %	50 %	530341500
134	NC_022051	ATTG	2	8	38633	38640	25 %	50 %	25 %	0 %	530341455
135	NC_022051	TGCA	2	8	38691	38698	25 %	25 %	25 %	25 %	530341455
136	NC_022051	CCAA	2	8	38911	38918	50 %	0 %	0 %	50 %	530341455
137	NC_022051	GGAA	2	8	39714	39721	50 %	0 %	50 %	0 %	530341455
138	NC_022051	TCAA	2	8	39847	39854	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_022051	AAGC	2	8	40277	40284	50 %	0 %	25 %	25 %	530341457
140	NC_022051	AATG	2	8	40460	40467	50 %	25 %	25 %	0 %	530341457
141	NC_022051	GATT	2	8	40489	40496	25 %	50 %	25 %	0 %	530341457
142	NC_022051	AAAC	2	8	40529	40536	75 %	0 %	0 %	25 %	530341457
143	NC_022051	AAGA	2	8	40566	40573	75 %	0 %	25 %	0 %	530341457
144	NC_022051	AAAC	2	8	40588	40595	75 %	0 %	0 %	25 %	530341457
145	NC_022051	ATCC	2	8	40605	40612	25 %	25 %	0 %	50 %	530341501
146	NC_022051	TCCC	2	8	40942	40949	0 %	25 %	0 %	75 %	530341501
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154	NC_022051	TGAT	2	8	44219	44226	25 %	50 %	25 %	0 %	530341505
155	NC_022051	TCTT	2	8	44640	44647	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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157	NC_022051	AAAG	2	8	45018	45025	75 %	0 %	25 %	0 %	530341507
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178	NC_022051	TTGA	2	8	51193	51200	25 %	50 %	25 %	0 %	530341514
179	NC_022051	GATA	2	8	51713	51720	50 %	25 %	25 %	0 %	530341515
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181	NC_022051	GAAT	2	8	52020	52027	50 %	25 %	25 %	0 %	530341516
182	NC_022051	ATGG	2	8	52304	52311	25 %	25 %	50 %	0 %	530341516
183	NC_022051	GAAC	2	8	52572	52579	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
184	NC_022051	TATT	2	8	52850	52857	25 %	75 %	0 %	0 %	530341517
185	NC_022051	TTTG	2	8	53205	53212	0 %	75 %	25 %	0 %	530341518
186	NC_022051	CGTA	2	8	53704	53711	25 %	25 %	25 %	25 %	530341519
187	NC_022051	ACTA	2	8	54238	54245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
188	NC_022051	ATCA	2	8	54974	54981	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
189	NC_022051	ATTA	2	8	55058	55065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.