MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 1344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022051	CAG	2	6	22	27	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_022051	TGAAGC	2	12	29	40	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_022051	TAA	3	9	82	90	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022051	CAA	2	6	175	180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_022051	ATG	2	6	197	202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022051	T	6	6	384	389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022051	T	6	6	432	437	0 %	100 %	0 %	0 %	530341461
8	NC_022051	CAA	2	6	666	671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341461
9	NC_022051	CTACTT	2	12	672	683	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530341461
10	NC_022051	TAT	2	6	684	689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341461
11	NC_022051	TCC	2	6	715	720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_022051	TGA	3	9	756	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341462
13	NC_022051	AT	3	6	796	801	50 %	50 %	0 %	0 %	530341462
14	NC_022051	ATCA	2	8	823	830	50 %	25 %	0 %	25 %	530341462
15	NC_022051	CAAGA	2	10	897	906	60 %	0 %	20 %	20 %	530341462
16	NC_022051	T	7	7	949	955	0 %	100 %	0 %	0 %	530341462
17	NC_022051	CTG	2	6	966	971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341462
18	NC_022051	TCC	2	6	979	984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341462
19	NC_022051	TAG	2	6	996	1001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341462
20	NC_022051	ACC	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341462
21	NC_022051	AAT	2	6	1096	1101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341462
22	NC_022051	ATT	2	6	1140	1145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341463
23	NC_022051	CAA	2	6	1150	1155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341463
24	NC_022051	CAA	2	6	1190	1195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341463
25	NC_022051	CTT	2	6	1226	1231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341463
26	NC_022051	CAG	2	6	1238	1243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341463
27	NC_022051	TAC	2	6	1247	1252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341463
28	NC_022051	A	6	6	1309	1314	100 %	0 %	0 %	0 %	530341463
29	NC_022051	T	6	6	1390	1395	0 %	100 %	0 %	0 %	530341463
30	NC_022051	AAT	2	6	1396	1401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341463
31	NC_022051	T	6	6	1404	1409	0 %	100 %	0 %	0 %	530341463
32	NC_022051	CTG	2	6	1487	1492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341463
33	NC_022051	ATA	2	6	1522	1527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341463
34	NC_022051	GAT	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022051	A	7	7	1732	1738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022051	T	6	6	1741	1746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022051	ATC	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_022051	CTA	2	6	1809	1814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_022051	TAG	2	6	1830	1835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022051	ATTT	3	12	1844	1855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_022051	AAC	2	6	1875	1880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_022051	TTCT	2	8	1906	1913	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022051	GATA	2	8	1938	1945	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022051	GTT	2	6	1957	1962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022051	T	7	7	1979	1985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022051	TGT	2	6	1992	1997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022051	GACT	2	8	2011	2018	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_022051	A	6	6	2082	2087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022051	AGA	2	6	2127	2132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_022051	A	6	6	2165	2170	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022051	CT	3	6	2229	2234	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_022051	GAGG	2	8	2272	2279	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_022051	CTAC	2	8	2327	2334	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_022051	A	7	7	2363	2369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022051	A	6	6	2378	2383	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022051	AAG	2	6	2394	2399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341464
57	NC_022051	TTA	2	6	2408	2413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341464
58	NC_022051	A	7	7	2453	2459	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
59	NC_022051	TA	3	6	2580	2585	50 %	50 %	0 %	0 %	530341464
60	NC_022051	TGAT	2	8	2690	2697	25 %	50 %	25 %	0 %	530341464
61	NC_022051	AT	3	6	2729	2734	50 %	50 %	0 %	0 %	530341464
62	NC_022051	A	6	6	2743	2748	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
63	NC_022051	T	7	7	2830	2836	0 %	100 %	0 %	0 %	530341464
64	NC_022051	TGC	2	6	2860	2865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341464
65	NC_022051	TGC	2	6	2910	2915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341464
66	NC_022051	GCA	2	6	3011	3016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341464
67	NC_022051	TAA	2	6	3031	3036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341464
68	NC_022051	GAAA	2	8	3076	3083	75 %	0 %	25 %	0 %	530341464
69	NC_022051	CTA	2	6	3159	3164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341464
70	NC_022051	CTA	2	6	3330	3335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341464
71	NC_022051	A	6	6	3340	3345	100 %	0 %	0 %	0 %	530341464
72	NC_022051	GTTT	2	8	3365	3372	0 %	75 %	25 %	0 %	530341464
73	NC_022051	AGA	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341464
74	NC_022051	ATT	2	6	3490	3495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341464
75	NC_022051	T	6	6	3494	3499	0 %	100 %	0 %	0 %	530341464
76	NC_022051	AGA	2	6	3523	3528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341464
77	NC_022051	AATA	2	8	3547	3554	75 %	25 %	0 %	0 %	530341464
78	NC_022051	AAT	2	6	3608	3613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341464
79	NC_022051	ATC	2	6	3626	3631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341464
80	NC_022051	CAA	2	6	3639	3644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_022051	AT	3	6	3663	3668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_022051	T	7	7	3704	3710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_022051	TCAAT	2	10	3763	3772	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_022051	AAG	2	6	3796	3801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_022051	ATT	2	6	3852	3857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341465
86	NC_022051	AG	3	6	3884	3889	50 %	0 %	50 %	0 %	530341465
87	NC_022051	ATT	2	6	4020	4025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341465
88	NC_022051	AAAG	2	8	4161	4168	75 %	0 %	25 %	0 %	530341465
89	NC_022051	GCC	2	6	4174	4179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530341465
90	NC_022051	AAT	2	6	4247	4252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341465
91	NC_022051	AT	3	6	4273	4278	50 %	50 %	0 %	0 %	530341465
92	NC_022051	TTTCT	2	10	4315	4324	0 %	80 %	0 %	20 %	530341465
93	NC_022051	AATA	2	8	4334	4341	75 %	25 %	0 %	0 %	530341465
94	NC_022051	TG	3	6	4377	4382	0 %	50 %	50 %	0 %	530341465
95	NC_022051	AGT	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341465
96	NC_022051	ATG	2	6	4468	4473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341465
97	NC_022051	TTC	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_022051	AAT	2	6	4550	4555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_022051	TAAA	2	8	4560	4567	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_022051	GTGA	2	8	4619	4626	25 %	25 %	50 %	0 %	530341466
101	NC_022051	A	8	8	4639	4646	100 %	0 %	0 %	0 %	530341466
102	NC_022051	CAAA	2	8	4675	4682	75 %	0 %	0 %	25 %	530341466
103	NC_022051	A	6	6	4701	4706	100 %	0 %	0 %	0 %	530341466
104	NC_022051	CAA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341466
105	NC_022051	CATG	2	8	4763	4770	25 %	25 %	25 %	25 %	530341466
106	NC_022051	CAA	2	6	4778	4783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341466
107	NC_022051	TTA	2	6	4979	4984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341466
108	NC_022051	GA	3	6	5040	5045	50 %	0 %	50 %	0 %	530341466
109	NC_022051	ATA	2	6	5071	5076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341466
110	NC_022051	T	6	6	5077	5082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_022051	GAT	2	6	5096	5101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_022051	A	6	6	5111	5116	100 %	0 %	0 %	0 %	530341467
113	NC_022051	GTTT	2	8	5125	5132	0 %	75 %	25 %	0 %	530341467
114	NC_022051	A	8	8	5133	5140	100 %	0 %	0 %	0 %	530341467
115	NC_022051	TAAA	2	8	5143	5150	75 %	25 %	0 %	0 %	530341467
116	NC_022051	GAT	2	6	5162	5167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
117	NC_022051	TAG	2	6	5179	5184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
118	NC_022051	ATC	2	6	5211	5216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341467
119	NC_022051	TACTT	2	10	5249	5258	20 %	60 %	0 %	20 %	530341467
120	NC_022051	AT	3	6	5276	5281	50 %	50 %	0 %	0 %	530341467
121	NC_022051	TCC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341467
122	NC_022051	AT	3	6	5297	5302	50 %	50 %	0 %	0 %	530341467
123	NC_022051	CCA	2	6	5303	5308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341467
124	NC_022051	GCA	2	6	5340	5345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341467
125	NC_022051	TGA	2	6	5375	5380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
126	NC_022051	CTT	2	6	5398	5403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341467
127	NC_022051	TTG	2	6	5404	5409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341467
128	NC_022051	GTA	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341467
129	NC_022051	TGG	2	6	5446	5451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530341467
130	NC_022051	CT	3	6	5464	5469	0 %	50 %	0 %	50 %	530341467
131	NC_022051	ATA	2	6	5483	5488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341467
132	NC_022051	TTATT	2	10	5524	5533	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022051	TAT	2	6	5548	5553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_022051	TAA	2	6	5589	5594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_022051	A	7	7	5653	5659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_022051	AAG	2	6	5677	5682	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022051	CTT	2	6	5701	5706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_022051	TGT	2	6	5712	5717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022051	TCA	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
140	NC_022051	TAG	3	9	5821	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341468
141	NC_022051	AATG	2	8	5905	5912	50 %	25 %	25 %	0 %	530341468
142	NC_022051	TCG	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341468
143	NC_022051	CAG	2	6	5949	5954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341468
144	NC_022051	CAT	2	6	6024	6029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341468
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146	NC_022051	TAT	2	6	6057	6062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341468
147	NC_022051	TAT	2	6	6168	6173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341468
148	NC_022051	ATA	2	6	6185	6190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
149	NC_022051	GT	3	6	6191	6196	0 %	50 %	50 %	0 %	530341468
150	NC_022051	GCA	2	6	6230	6235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341468
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159	NC_022051	T	7	7	6991	6997	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
160	NC_022051	CTT	2	6	7020	7025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341468
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164	NC_022051	CCAT	2	8	7133	7140	25 %	25 %	0 %	50 %	530341468
165	NC_022051	T	6	6	7146	7151	0 %	100 %	0 %	0 %	530341468
166	NC_022051	ATA	2	6	7169	7174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341468
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173	NC_022051	CCA	2	6	7457	7462	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530341468
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195	NC_022051	TAT	2	6	8230	8235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_022051	TAA	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_022051	ATA	2	6	8379	8384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_022051	TAA	2	6	8390	8395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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218	NC_022051	GTTT	2	8	9124	9131	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
219	NC_022051	AT	3	6	9186	9191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
220	NC_022051	AAT	2	6	9194	9199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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223	NC_022051	A	7	7	9233	9239	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
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225	NC_022051	A	7	7	9310	9316	100 %	0 %	0 %	0 %	530341471
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230	NC_022051	AAAG	2	8	9422	9429	75 %	0 %	25 %	0 %	530341471
231	NC_022051	ATA	2	6	9555	9560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341471
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259	NC_022051	AAATAT	2	12	10722	10733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341472
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266	NC_022051	GAAT	2	8	11351	11358	50 %	25 %	25 %	0 %	530341449
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271	NC_022051	CTC	2	6	11513	11518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341449
272	NC_022051	TTTG	2	8	11591	11598	0 %	75 %	25 %	0 %	530341449
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274	NC_022051	TCC	2	6	11716	11721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341449
275	NC_022051	CTT	2	6	11759	11764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341449
276	NC_022051	ATA	2	6	11778	11783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341449
277	NC_022051	TAA	2	6	11910	11915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341449
278	NC_022051	T	7	7	11918	11924	0 %	100 %	0 %	0 %	530341449
279	NC_022051	CTTTG	2	10	11972	11981	0 %	60 %	20 %	20 %	530341449
280	NC_022051	CTA	2	6	12027	12032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
281	NC_022051	CAT	2	6	12098	12103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
282	NC_022051	A	6	6	12110	12115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_022051	AT	3	6	12163	12168	50 %	50 %	0 %	0 %	530341473
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399	NC_022051	TTGA	2	8	16946	16953	25 %	50 %	25 %	0 %	530341476
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420	NC_022051	T	9	9	17458	17466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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