MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926 plasmid

Total Repeats: 1344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022051	ATA	2	6	20647	20652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022051	A	6	6	20679	20684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022051	TA	3	6	20702	20707	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022051	ATT	2	6	20709	20714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022051	GTA	2	6	20716	20721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022051	AATT	2	8	20745	20752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022051	AT	3	6	20793	20798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022051	A	7	7	20803	20809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022051	AT	3	6	20825	20830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022051	TA	4	8	20864	20871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_022051	TA	3	6	20914	20919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_022051	A	11	11	20956	20966	100 %	0 %	0 %	0 %	530341480
513	NC_022051	TTG	2	6	20968	20973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341480
514	NC_022051	ACA	2	6	20984	20989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341480
515	NC_022051	TAAA	2	8	20992	20999	75 %	25 %	0 %	0 %	530341480
516	NC_022051	A	6	6	20997	21002	100 %	0 %	0 %	0 %	530341480
517	NC_022051	A	7	7	21100	21106	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_022051	TTTCCT	2	12	21199	21210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341481
519	NC_022051	AGGG	2	8	21249	21256	25 %	0 %	75 %	0 %	530341481
520	NC_022051	T	6	6	21266	21271	0 %	100 %	0 %	0 %	530341481
521	NC_022051	AG	3	6	21297	21302	50 %	0 %	50 %	0 %	530341481
522	NC_022051	GA	3	6	21303	21308	50 %	0 %	50 %	0 %	530341481
523	NC_022051	AGC	2	6	21346	21351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341481
524	NC_022051	AGC	2	6	21447	21452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341481
525	NC_022051	AAG	2	6	21545	21550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341481
526	NC_022051	GCT	2	6	21552	21557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341481
527	NC_022051	CAA	2	6	21664	21669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341481
528	NC_022051	GTCGAT	2	12	21685	21696	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530341481
529	NC_022051	ACA	2	6	21699	21704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341481
530	NC_022051	TTTTA	2	10	21762	21771	20 %	80 %	0 %	0 %	530341481
531	NC_022051	TAC	2	6	21774	21779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341481
532	NC_022051	CGAA	2	8	21896	21903	50 %	0 %	25 %	25 %	530341481
533	NC_022051	TTC	2	6	21940	21945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341481
534	NC_022051	CTT	2	6	21972	21977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341481
535	NC_022051	ATTTCA	2	12	21993	22004	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530341481
536	NC_022051	TGA	2	6	22010	22015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341481
537	NC_022051	AAT	2	6	22042	22047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341481
538	NC_022051	AAGC	2	8	22072	22079	50 %	0 %	25 %	25 %	530341481
539	NC_022051	GCA	2	6	22098	22103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341481
540	NC_022051	ATGTT	2	10	22172	22181	20 %	60 %	20 %	0 %	530341481
541	NC_022051	CTTG	2	8	22192	22199	0 %	50 %	25 %	25 %	530341481
542	NC_022051	CTGAA	2	10	22268	22277	40 %	20 %	20 %	20 %	530341481
543	NC_022051	GT	3	6	22433	22438	0 %	50 %	50 %	0 %	530341481
544	NC_022051	A	6	6	22450	22455	100 %	0 %	0 %	0 %	530341481
545	NC_022051	GAA	2	6	22576	22581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341481
546	NC_022051	A	6	6	22606	22611	100 %	0 %	0 %	0 %	530341481
547	NC_022051	ATT	2	6	22633	22638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341481
548	NC_022051	A	8	8	22730	22737	100 %	0 %	0 %	0 %	530341481
549	NC_022051	TTG	2	6	22763	22768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341481
550	NC_022051	CAG	2	6	22781	22786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341481
551	NC_022051	AG	3	6	22827	22832	50 %	0 %	50 %	0 %	530341481
552	NC_022051	AGT	2	6	22942	22947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341481
553	NC_022051	AATT	2	8	23017	23024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_022051	ACA	2	6	23077	23082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341482
555	NC_022051	ATG	2	6	23118	23123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341482
556	NC_022051	ACC	2	6	23218	23223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
557	NC_022051	A	8	8	23230	23237	100 %	0 %	0 %	0 %	530341483
558	NC_022051	A	6	6	23243	23248	100 %	0 %	0 %	0 %	530341483
559	NC_022051	TCA	2	6	23263	23268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341483
560	NC_022051	TAT	3	9	23489	23497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341483
561	NC_022051	TGGA	2	8	23607	23614	25 %	25 %	50 %	0 %	530341483
562	NC_022051	A	6	6	23653	23658	100 %	0 %	0 %	0 %	530341483
563	NC_022051	GAA	2	6	23671	23676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341483
564	NC_022051	AAG	2	6	23713	23718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341454
565	NC_022051	CTT	2	6	23786	23791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341454
566	NC_022051	CGA	2	6	23809	23814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341454
567	NC_022051	TTC	2	6	23820	23825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341454
568	NC_022051	TTC	2	6	23827	23832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341454
569	NC_022051	AAAG	2	8	23841	23848	75 %	0 %	25 %	0 %	530341454
570	NC_022051	GCTC	2	8	24004	24011	0 %	25 %	25 %	50 %	530341454
571	NC_022051	GA	3	6	24074	24079	50 %	0 %	50 %	0 %	530341454
572	NC_022051	T	7	7	24114	24120	0 %	100 %	0 %	0 %	530341454
573	NC_022051	AGA	2	6	24204	24209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341454
574	NC_022051	CTT	2	6	24457	24462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341484
575	NC_022051	TTTC	2	8	24521	24528	0 %	75 %	0 %	25 %	530341484
576	NC_022051	AAGT	2	8	24553	24560	50 %	25 %	25 %	0 %	530341484
577	NC_022051	TCT	2	6	24566	24571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341484
578	NC_022051	TCG	2	6	24596	24601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530341484
579	NC_022051	T	7	7	24628	24634	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
580	NC_022051	AACA	2	8	24704	24711	75 %	0 %	0 %	25 %	530341484
581	NC_022051	CGAT	2	8	24722	24729	25 %	25 %	25 %	25 %	530341484
582	NC_022051	TAA	2	6	24826	24831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341484
583	NC_022051	CTT	2	6	24844	24849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341484
584	NC_022051	T	6	6	24848	24853	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
585	NC_022051	T	7	7	24926	24932	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
586	NC_022051	CTTT	2	8	24935	24942	0 %	75 %	0 %	25 %	530341484
587	NC_022051	T	6	6	24940	24945	0 %	100 %	0 %	0 %	530341484
588	NC_022051	TTG	2	6	24961	24966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341484
589	NC_022051	TTTC	2	8	25038	25045	0 %	75 %	0 %	25 %	530341484
590	NC_022051	AATTC	2	10	25056	25065	40 %	40 %	0 %	20 %	530341484
591	NC_022051	CAT	2	6	25099	25104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341484
592	NC_022051	TCC	2	6	25106	25111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530341484
593	NC_022051	ATC	2	6	25139	25144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341485
594	NC_022051	TTC	2	6	25160	25165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341485
595	NC_022051	TCT	2	6	25167	25172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341485
596	NC_022051	CAAA	2	8	25278	25285	75 %	0 %	0 %	25 %	530341485
597	NC_022051	CTT	2	6	25315	25320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341485
598	NC_022051	AT	3	6	25326	25331	50 %	50 %	0 %	0 %	530341485
599	NC_022051	GATG	2	8	25438	25445	25 %	25 %	50 %	0 %	530341485
600	NC_022051	TGT	2	6	25489	25494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530341485
601	NC_022051	AT	3	6	25538	25543	50 %	50 %	0 %	0 %	530341485
602	NC_022051	TTTG	2	8	25632	25639	0 %	75 %	25 %	0 %	530341485
603	NC_022051	GAC	2	6	25651	25656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530341485
604	NC_022051	TG	3	6	25719	25724	0 %	50 %	50 %	0 %	530341485
605	NC_022051	TAC	2	6	25735	25740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530341485
606	NC_022051	TTTC	2	8	25948	25955	0 %	75 %	0 %	25 %	530341485
607	NC_022051	TTC	2	6	26018	26023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341485
608	NC_022051	T	6	6	26075	26080	0 %	100 %	0 %	0 %	530341485
609	NC_022051	AAT	2	6	26135	26140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341485
610	NC_022051	TTC	2	6	26141	26146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341485
611	NC_022051	AGG	2	6	26162	26167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530341485
612	NC_022051	TC	4	8	26180	26187	0 %	50 %	0 %	50 %	530341485
613	NC_022051	ATA	2	6	26222	26227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530341485
614	NC_022051	TCAT	2	8	26292	26299	25 %	50 %	0 %	25 %	530341485
615	NC_022051	GTA	2	6	26305	26310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341485
616	NC_022051	GAA	2	6	26463	26468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022051	CAAG	2	8	26571	26578	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
618	NC_022051	ATTA	2	8	26589	26596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022051	ATAA	2	8	26604	26611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_022051	TTA	2	6	26675	26680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_022051	ACA	2	6	26685	26690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530341486
622	NC_022051	ATT	2	6	26739	26744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530341486
623	NC_022051	T	6	6	26753	26758	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
624	NC_022051	AG	4	8	26791	26798	50 %	0 %	50 %	0 %	530341486
625	NC_022051	A	7	7	26805	26811	100 %	0 %	0 %	0 %	530341486
626	NC_022051	GAA	2	6	26838	26843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341486
627	NC_022051	AGAA	2	8	26858	26865	75 %	0 %	25 %	0 %	530341486
628	NC_022051	TGA	2	6	26879	26884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530341486
629	NC_022051	A	9	9	26893	26901	100 %	0 %	0 %	0 %	530341486
630	NC_022051	T	7	7	26908	26914	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
631	NC_022051	T	6	6	26922	26927	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
632	NC_022051	TTC	2	6	27004	27009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530341486
633	NC_022051	CCACT	2	10	27111	27120	20 %	20 %	0 %	60 %	530341486
634	NC_022051	T	6	6	27120	27125	0 %	100 %	0 %	0 %	530341486
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766	NC_022051	GAA	2	6	31394	31399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530341492
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1000	NC_022051	TAA	2	6	41438	41443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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