MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 1345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022047	CAT	2	6	42182	42187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314167
1002	NC_022047	GAC	2	6	42214	42219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314167
1003	NC_022047	ACTT	2	8	42223	42230	25 %	50 %	0 %	25 %	530314167
1004	NC_022047	AGC	2	6	42236	42241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314167
1005	NC_022047	AAC	2	6	42247	42252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314167
1006	NC_022047	TAA	2	6	42265	42270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314167
1007	NC_022047	GCT	2	6	42333	42338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314167
1008	NC_022047	TTTC	2	8	42391	42398	0 %	75 %	0 %	25 %	530314167
1009	NC_022047	GCT	2	6	42406	42411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314167
1010	NC_022047	A	6	6	42440	42445	100 %	0 %	0 %	0 %	530314167
1011	NC_022047	AAG	2	6	42498	42503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314167
1012	NC_022047	AATA	2	8	42591	42598	75 %	25 %	0 %	0 %	530314167
1013	NC_022047	AGAA	2	8	42623	42630	75 %	0 %	25 %	0 %	530314167
1014	NC_022047	CATAA	2	10	42639	42648	60 %	20 %	0 %	20 %	530314167
1015	NC_022047	A	6	6	42647	42652	100 %	0 %	0 %	0 %	530314167
1016	NC_022047	CAA	2	6	42698	42703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314167
1017	NC_022047	ATC	2	6	42716	42721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314167
1018	NC_022047	TTTG	2	8	42756	42763	0 %	75 %	25 %	0 %	530314167
1019	NC_022047	AAT	2	6	42821	42826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314167
1020	NC_022047	A	6	6	42833	42838	100 %	0 %	0 %	0 %	530314167
1021	NC_022047	A	6	6	42879	42884	100 %	0 %	0 %	0 %	530314167
1022	NC_022047	CAA	2	6	42916	42921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314167
1023	NC_022047	T	6	6	42950	42955	0 %	100 %	0 %	0 %	530314167
1024	NC_022047	TAC	2	6	43064	43069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314167
1025	NC_022047	CTA	2	6	43072	43077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314167
1026	NC_022047	AC	3	6	43138	43143	50 %	0 %	0 %	50 %	530314167
1027	NC_022047	TAAA	2	8	43163	43170	75 %	25 %	0 %	0 %	530314167
1028	NC_022047	T	6	6	43171	43176	0 %	100 %	0 %	0 %	530314167
1029	NC_022047	TTCC	2	8	43189	43196	0 %	50 %	0 %	50 %	530314167
1030	NC_022047	A	6	6	43205	43210	100 %	0 %	0 %	0 %	530314167
1031	NC_022047	C	6	6	43235	43240	0 %	0 %	0 %	100 %	530314167
1032	NC_022047	TTC	3	9	43345	43353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314118
1033	NC_022047	ATTG	2	8	43365	43372	25 %	50 %	25 %	0 %	530314118
1034	NC_022047	TGCA	2	8	43423	43430	25 %	25 %	25 %	25 %	530314118
1035	NC_022047	ATC	2	6	43487	43492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314118
1036	NC_022047	T	6	6	43505	43510	0 %	100 %	0 %	0 %	530314118
1037	NC_022047	GATTT	2	10	43552	43561	20 %	60 %	20 %	0 %	530314118
1038	NC_022047	AAT	2	6	43612	43617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314118
1039	NC_022047	CCAA	2	8	43643	43650	50 %	0 %	0 %	50 %	530314118
1040	NC_022047	AAT	2	6	43729	43734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314118
1041	NC_022047	GTA	2	6	43759	43764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314118
1042	NC_022047	GAT	2	6	43781	43786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314118
1043	NC_022047	GTT	2	6	43788	43793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314118
1044	NC_022047	TAA	2	6	43805	43810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314118
1045	NC_022047	TGC	2	6	43834	43839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314118
1046	NC_022047	TCT	2	6	43862	43867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314118
1047	NC_022047	T	7	7	43885	43891	0 %	100 %	0 %	0 %	530314118
1048	NC_022047	CTT	2	6	43917	43922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314118
1049	NC_022047	TCC	2	6	43948	43953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314118
1050	NC_022047	TCA	2	6	43955	43960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314118
1051	NC_022047	AG	3	6	44047	44052	50 %	0 %	50 %	0 %	530314118
1052	NC_022047	A	6	6	44128	44133	100 %	0 %	0 %	0 %	530314118
1053	NC_022047	TGC	2	6	44197	44202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314118
1054	NC_022047	CTA	2	6	44325	44330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314118
1055	NC_022047	CAT	2	6	44334	44339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314118
1056	NC_022047	GGAA	2	8	44446	44453	50 %	0 %	50 %	0 %	530314118
1057	NC_022047	TCAA	2	8	44579	44586	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1058	NC_022047	TA	4	8	44602	44609	50 %	50 %	0 %	0 %	530314119
1059	NC_022047	TAA	2	6	44626	44631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314119
1060	NC_022047	T	6	6	44678	44683	0 %	100 %	0 %	0 %	530314119
1061	NC_022047	ATA	2	6	44792	44797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314119
1062	NC_022047	TAA	2	6	44803	44808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314119
1063	NC_022047	A	6	6	44807	44812	100 %	0 %	0 %	0 %	530314119
1064	NC_022047	T	8	8	44864	44871	0 %	100 %	0 %	0 %	530314119
1065	NC_022047	CTA	3	9	44925	44933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314119
1066	NC_022047	TGC	2	6	45003	45008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314120
1067	NC_022047	AAGC	2	8	45009	45016	50 %	0 %	25 %	25 %	530314120
1068	NC_022047	GAT	2	6	45042	45047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314120
1069	NC_022047	CTT	2	6	45065	45070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314120
1070	NC_022047	GGT	2	6	45108	45113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314120
1071	NC_022047	TAA	2	6	45146	45151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314120
1072	NC_022047	GAA	2	6	45162	45167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314120
1073	NC_022047	AATG	2	8	45192	45199	50 %	25 %	25 %	0 %	530314120
1074	NC_022047	TAA	2	6	45201	45206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314120
1075	NC_022047	GATT	2	8	45221	45228	25 %	50 %	25 %	0 %	530314120
1076	NC_022047	AAAC	2	8	45261	45268	75 %	0 %	0 %	25 %	530314120
1077	NC_022047	TAA	2	6	45272	45277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314120
1078	NC_022047	TCC	2	6	45291	45296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314120
1079	NC_022047	AAGA	2	8	45298	45305	75 %	0 %	25 %	0 %	530314120
1080	NC_022047	AAAC	2	8	45320	45327	75 %	0 %	0 %	25 %	530314120
1081	NC_022047	ATCC	2	8	45337	45344	25 %	25 %	0 %	50 %	530314168
1082	NC_022047	CTT	2	6	45388	45393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314168
1083	NC_022047	ATC	2	6	45410	45415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314168
1084	NC_022047	TTG	2	6	45478	45483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314168
1085	NC_022047	ATT	3	9	45614	45622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314168
1086	NC_022047	ATA	2	6	45647	45652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314168
1087	NC_022047	TCCC	2	8	45674	45681	0 %	25 %	0 %	75 %	530314168
1088	NC_022047	TGA	2	6	45688	45693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314168
1089	NC_022047	CAA	2	6	45709	45714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314168
1090	NC_022047	AAC	2	6	45761	45766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314168
1091	NC_022047	AAT	2	6	45773	45778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314168
1092	NC_022047	TCC	2	6	45804	45809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314168
1093	NC_022047	TTA	3	9	45828	45836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314168
1094	NC_022047	GTC	2	6	45864	45869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314168
1095	NC_022047	AGT	2	6	45894	45899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314168
1096	NC_022047	TGA	2	6	45924	45929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314168
1097	NC_022047	CTT	2	6	45943	45948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314168
1098	NC_022047	TCC	2	6	45986	45991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_022047	A	7	7	45994	46000	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1100	NC_022047	ACC	2	6	46023	46028	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1101	NC_022047	TCA	2	6	46048	46053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_022047	ATTG	2	8	46088	46095	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_022047	TA	3	6	46103	46108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_022047	ACAAA	2	10	46149	46158	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1105	NC_022047	TAA	2	6	46170	46175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_022047	TAT	2	6	46249	46254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_022047	ATT	2	6	46284	46289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_022047	CTTT	2	8	46290	46297	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1109	NC_022047	TTG	2	6	46330	46335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314169
1110	NC_022047	A	7	7	46401	46407	100 %	0 %	0 %	0 %	530314169
1111	NC_022047	TGTCAG	2	12	46426	46437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1112	NC_022047	ATA	2	6	46452	46457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_022047	A	7	7	46478	46484	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_022047	T	6	6	46509	46514	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_022047	ACT	2	6	46520	46525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_022047	T	7	7	46535	46541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_022047	CTTTT	2	10	46553	46562	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1118	NC_022047	GTA	2	6	46573	46578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_022047	ATA	2	6	46638	46643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022047	TTGA	2	8	46654	46661	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_022047	TA	3	6	46679	46684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_022047	CTT	2	6	46723	46728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_022047	T	7	7	46770	46776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_022047	AGT	2	6	46781	46786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_022047	AT	4	8	46850	46857	50 %	50 %	0 %	0 %	530314170
1126	NC_022047	ATA	2	6	46871	46876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314170
1127	NC_022047	TTTA	2	8	46997	47004	25 %	75 %	0 %	0 %	530314170
1128	NC_022047	ATT	2	6	47009	47014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_022047	GAA	2	6	47027	47032	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_022047	GAG	2	6	47040	47045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_022047	ATC	2	6	47089	47094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314171
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1145	NC_022047	TAA	2	6	47816	47821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1149	NC_022047	ACT	2	6	47910	47915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1151	NC_022047	TAA	2	6	47990	47995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1253	NC_022047	A	7	7	52283	52289	100 %	0 %	0 %	0 %	530314179
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