MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1817 plasmid

Total Repeats: 1345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022047	TCA	2	6	21628	21633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314143
502	NC_022047	T	7	7	21654	21660	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
503	NC_022047	TA	3	6	21671	21676	50 %	50 %	0 %	0 %	530314143
504	NC_022047	TTGA	2	8	21677	21684	25 %	50 %	25 %	0 %	530314143
505	NC_022047	T	6	6	21699	21704	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
506	NC_022047	TCC	2	6	21714	21719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314143
507	NC_022047	CCT	2	6	21721	21726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314143
508	NC_022047	CTA	2	6	21737	21742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314143
509	NC_022047	GTT	2	6	21754	21759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314143
510	NC_022047	TTAC	2	8	21769	21776	25 %	50 %	0 %	25 %	530314143
511	NC_022047	GCT	2	6	21787	21792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314143
512	NC_022047	GCA	2	6	21820	21825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314143
513	NC_022047	T	7	7	21839	21845	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
514	NC_022047	CAA	2	6	21848	21853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314143
515	NC_022047	ACC	3	9	21867	21875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314143
516	NC_022047	A	6	6	21893	21898	100 %	0 %	0 %	0 %	530314143
517	NC_022047	TTGGA	2	10	21900	21909	20 %	40 %	40 %	0 %	530314143
518	NC_022047	TCA	3	9	21958	21966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314143
519	NC_022047	GAAG	2	8	21985	21992	50 %	0 %	50 %	0 %	530314143
520	NC_022047	ATC	2	6	21999	22004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314143
521	NC_022047	TCT	2	6	22024	22029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314143
522	NC_022047	T	6	6	22113	22118	0 %	100 %	0 %	0 %	530314143
523	NC_022047	TAGT	2	8	22141	22148	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022047	AATC	2	8	22162	22169	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
525	NC_022047	T	9	9	22189	22197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_022047	AAT	2	6	22201	22206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_022047	A	6	6	22219	22224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_022047	A	6	6	22238	22243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_022047	GAA	2	6	22247	22252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_022047	GAAC	2	8	22262	22269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
531	NC_022047	TC	3	6	22297	22302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
532	NC_022047	T	6	6	22303	22308	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022047	TTTG	2	8	22335	22342	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
534	NC_022047	TTG	2	6	22375	22380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_022047	GAG	2	6	22381	22386	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_022047	ATCGAG	2	12	22403	22414	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	530314144
537	NC_022047	AAC	2	6	22457	22462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314144
538	NC_022047	AAAG	2	8	22475	22482	75 %	0 %	25 %	0 %	530314144
539	NC_022047	GAA	2	6	22507	22512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314144
540	NC_022047	AGC	2	6	22547	22552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314144
541	NC_022047	AGA	2	6	22578	22583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314144
542	NC_022047	GGTA	2	8	22611	22618	25 %	25 %	50 %	0 %	530314144
543	NC_022047	GA	3	6	22667	22672	50 %	0 %	50 %	0 %	530314144
544	NC_022047	T	6	6	22794	22799	0 %	100 %	0 %	0 %	530314116
545	NC_022047	T	6	6	22844	22849	0 %	100 %	0 %	0 %	530314116
546	NC_022047	GTC	2	6	22851	22856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314116
547	NC_022047	GGA	2	6	22878	22883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314116
548	NC_022047	GCA	2	6	22893	22898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314116
549	NC_022047	A	6	6	22911	22916	100 %	0 %	0 %	0 %	530314116
550	NC_022047	CAT	2	6	22973	22978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314116
551	NC_022047	CTTC	2	8	23036	23043	0 %	50 %	0 %	50 %	530314116
552	NC_022047	TCTAT	2	10	23071	23080	20 %	60 %	0 %	20 %	530314116
553	NC_022047	CGA	2	6	23081	23086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314116
554	NC_022047	A	6	6	23144	23149	100 %	0 %	0 %	0 %	530314116
555	NC_022047	CTT	2	6	23214	23219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314116
556	NC_022047	CCGA	2	8	23312	23319	25 %	0 %	25 %	50 %	530314116
557	NC_022047	CCT	2	6	23410	23415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314116
558	NC_022047	TAT	2	6	23454	23459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314116
559	NC_022047	ATT	2	6	23577	23582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314116
560	NC_022047	TGG	2	6	23590	23595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314116
561	NC_022047	AAG	2	6	23596	23601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314116
562	NC_022047	ATC	2	6	23620	23625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314116
563	NC_022047	TCAT	2	8	23641	23648	25 %	50 %	0 %	25 %	530314116
564	NC_022047	CCA	2	6	23693	23698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530314116
565	NC_022047	A	7	7	23698	23704	100 %	0 %	0 %	0 %	530314116
566	NC_022047	CTT	2	6	23744	23749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314116
567	NC_022047	ATG	2	6	23776	23781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314116
568	NC_022047	TGG	2	6	23807	23812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314116
569	NC_022047	ATGC	2	8	23934	23941	25 %	25 %	25 %	25 %	530314116
570	NC_022047	TAG	2	6	23950	23955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314116
571	NC_022047	TGT	2	6	24093	24098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314145
572	NC_022047	TAA	2	6	24131	24136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314145
573	NC_022047	ATT	2	6	24179	24184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314145
574	NC_022047	TAA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314145
575	NC_022047	T	8	8	24254	24261	0 %	100 %	0 %	0 %	530314145
576	NC_022047	AAC	2	6	24357	24362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314146
577	NC_022047	A	6	6	24407	24412	100 %	0 %	0 %	0 %	530314146
578	NC_022047	AT	3	6	24593	24598	50 %	50 %	0 %	0 %	530314146
579	NC_022047	T	6	6	24635	24640	0 %	100 %	0 %	0 %	530314146
580	NC_022047	T	7	7	24653	24659	0 %	100 %	0 %	0 %	530314146
581	NC_022047	GTA	2	6	24662	24667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314146
582	NC_022047	ATT	2	6	24685	24690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314146
583	NC_022047	ATC	2	6	24714	24719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314146
584	NC_022047	TTG	2	6	24774	24779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314146
585	NC_022047	CAG	2	6	24806	24811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314146
586	NC_022047	AATAAA	2	12	24858	24869	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	530314146
587	NC_022047	TCA	2	6	24877	24882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314146
588	NC_022047	AG	3	6	24903	24908	50 %	0 %	50 %	0 %	530314146
589	NC_022047	CTT	2	6	24923	24928	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314146
590	NC_022047	A	6	6	24949	24954	100 %	0 %	0 %	0 %	530314146
591	NC_022047	ATA	2	6	24988	24993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314146
592	NC_022047	CTT	2	6	25037	25042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314146
593	NC_022047	CAT	2	6	25079	25084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314146
594	NC_022047	TCA	2	6	25126	25131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314146
595	NC_022047	T	6	6	25143	25148	0 %	100 %	0 %	0 %	530314146
596	NC_022047	AAT	2	6	25167	25172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314146
597	NC_022047	GTG	2	6	25183	25188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530314146
598	NC_022047	TAA	3	9	25226	25234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314146
599	NC_022047	T	6	6	25269	25274	0 %	100 %	0 %	0 %	530314146
600	NC_022047	TTC	2	6	25278	25283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314146
601	NC_022047	TA	3	6	25284	25289	50 %	50 %	0 %	0 %	530314146
602	NC_022047	TC	3	6	25308	25313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
603	NC_022047	CCT	2	6	25315	25320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_022047	AT	3	6	25324	25329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
605	NC_022047	TAA	2	6	25333	25338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_022047	ATA	2	6	25378	25383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
607	NC_022047	A	6	6	25410	25415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_022047	TA	3	6	25433	25438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_022047	ATT	2	6	25440	25445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_022047	GTA	2	6	25447	25452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_022047	AATT	2	8	25476	25483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_022047	AT	3	6	25524	25529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_022047	A	7	7	25534	25540	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_022047	AT	3	6	25556	25561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022047	TA	4	8	25595	25602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_022047	TA	3	6	25645	25650	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022047	A	11	11	25687	25697	100 %	0 %	0 %	0 %	530314147
618	NC_022047	TTG	2	6	25699	25704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314147
619	NC_022047	ACA	2	6	25715	25720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314147
620	NC_022047	TAAA	2	8	25723	25730	75 %	25 %	0 %	0 %	530314147
621	NC_022047	A	6	6	25728	25733	100 %	0 %	0 %	0 %	530314147
622	NC_022047	A	7	7	25831	25837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_022047	TTTCCT	2	12	25930	25941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314148
624	NC_022047	AGGG	2	8	25980	25987	25 %	0 %	75 %	0 %	530314148
625	NC_022047	T	6	6	25997	26002	0 %	100 %	0 %	0 %	530314148
626	NC_022047	AG	3	6	26028	26033	50 %	0 %	50 %	0 %	530314148
627	NC_022047	GA	3	6	26034	26039	50 %	0 %	50 %	0 %	530314148
628	NC_022047	AGC	2	6	26077	26082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314148
629	NC_022047	AGC	2	6	26178	26183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314148
630	NC_022047	AAG	2	6	26276	26281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314148
631	NC_022047	GCT	2	6	26283	26288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314148
632	NC_022047	CAA	2	6	26395	26400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314148
633	NC_022047	GTCGAT	2	12	26416	26427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530314148
634	NC_022047	ACA	2	6	26430	26435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314148
635	NC_022047	TTTTA	2	10	26493	26502	20 %	80 %	0 %	0 %	530314148
636	NC_022047	TAC	2	6	26505	26510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314148
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639	NC_022047	CTT	2	6	26703	26708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314148
640	NC_022047	ATTTCA	2	12	26724	26735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530314148
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646	NC_022047	CTTG	2	8	26923	26930	0 %	50 %	25 %	25 %	530314148
647	NC_022047	CTGAA	2	10	26999	27008	40 %	20 %	20 %	20 %	530314148
648	NC_022047	GT	3	6	27164	27169	0 %	50 %	50 %	0 %	530314148
649	NC_022047	A	6	6	27181	27186	100 %	0 %	0 %	0 %	530314148
650	NC_022047	GAA	2	6	27307	27312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314148
651	NC_022047	A	6	6	27337	27342	100 %	0 %	0 %	0 %	530314148
652	NC_022047	ATT	2	6	27364	27369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314148
653	NC_022047	A	8	8	27461	27468	100 %	0 %	0 %	0 %	530314148
654	NC_022047	TTG	2	6	27494	27499	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314148
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657	NC_022047	AGT	2	6	27673	27678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314148
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659	NC_022047	ACA	2	6	27808	27813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314149
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662	NC_022047	A	8	8	27961	27968	100 %	0 %	0 %	0 %	530314150
663	NC_022047	A	6	6	27974	27979	100 %	0 %	0 %	0 %	530314150
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674	NC_022047	AAAG	2	8	28572	28579	75 %	0 %	25 %	0 %	530314117
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724	NC_022047	ATAA	2	8	31335	31342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
725	NC_022047	TTA	2	6	31406	31411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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730	NC_022047	A	7	7	31536	31542	100 %	0 %	0 %	0 %	530314153
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747	NC_022047	CAAA	3	12	32069	32080	75 %	0 %	0 %	25 %	530314154
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753	NC_022047	GA	3	6	32190	32195	50 %	0 %	50 %	0 %	530314154
754	NC_022047	AAGT	2	8	32319	32326	50 %	25 %	25 %	0 %	530314154
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758	NC_022047	GAT	2	6	32465	32470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314154
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760	NC_022047	TGA	2	6	32524	32529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314154
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762	NC_022047	A	6	6	32573	32578	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
763	NC_022047	AAC	2	6	32599	32604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314154
764	NC_022047	A	6	6	32615	32620	100 %	0 %	0 %	0 %	530314154
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