MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776 plasmid

Total Repeats: 1345

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022046	TA	3	6	20638	20643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_022046	ATT	2	6	20645	20650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_022046	GTA	2	6	20652	20657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_022046	AATT	2	8	20681	20688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_022046	AT	3	6	20729	20734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_022046	A	7	7	20739	20745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_022046	AT	3	6	20761	20766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_022046	TA	4	8	20800	20807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_022046	TA	3	6	20850	20855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_022046	A	11	11	20892	20902	100 %	0 %	0 %	0 %	530314070
511	NC_022046	TTG	2	6	20904	20909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314070
512	NC_022046	ACA	2	6	20920	20925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314070
513	NC_022046	TAAA	2	8	20928	20935	75 %	25 %	0 %	0 %	530314070
514	NC_022046	A	6	6	20933	20938	100 %	0 %	0 %	0 %	530314070
515	NC_022046	A	7	7	21036	21042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_022046	TTTCCT	2	12	21135	21146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314071
517	NC_022046	AGGG	2	8	21185	21192	25 %	0 %	75 %	0 %	530314071
518	NC_022046	T	6	6	21202	21207	0 %	100 %	0 %	0 %	530314071
519	NC_022046	AG	3	6	21233	21238	50 %	0 %	50 %	0 %	530314071
520	NC_022046	GA	3	6	21239	21244	50 %	0 %	50 %	0 %	530314071
521	NC_022046	AGC	2	6	21282	21287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314071
522	NC_022046	AGC	2	6	21383	21388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314071
523	NC_022046	AAG	2	6	21481	21486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314071
524	NC_022046	GCT	2	6	21488	21493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314071
525	NC_022046	CAA	2	6	21600	21605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314071
526	NC_022046	GTCGAT	2	12	21621	21632	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	530314071
527	NC_022046	ACA	2	6	21635	21640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314071
528	NC_022046	TTTTA	2	10	21698	21707	20 %	80 %	0 %	0 %	530314071
529	NC_022046	TAC	2	6	21710	21715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314071
530	NC_022046	CGAA	2	8	21832	21839	50 %	0 %	25 %	25 %	530314071
531	NC_022046	TTC	2	6	21876	21881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314071
532	NC_022046	CTT	2	6	21908	21913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314071
533	NC_022046	ATTTCA	2	12	21929	21940	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	530314071
534	NC_022046	TGA	2	6	21946	21951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314071
535	NC_022046	AAT	2	6	21978	21983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314071
536	NC_022046	AAGC	2	8	22008	22015	50 %	0 %	25 %	25 %	530314071
537	NC_022046	GCA	2	6	22034	22039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314071
538	NC_022046	ATGTT	2	10	22108	22117	20 %	60 %	20 %	0 %	530314071
539	NC_022046	CTTG	2	8	22128	22135	0 %	50 %	25 %	25 %	530314071
540	NC_022046	CTGAA	2	10	22204	22213	40 %	20 %	20 %	20 %	530314071
541	NC_022046	GT	3	6	22369	22374	0 %	50 %	50 %	0 %	530314071
542	NC_022046	A	6	6	22386	22391	100 %	0 %	0 %	0 %	530314071
543	NC_022046	GAA	2	6	22512	22517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314071
544	NC_022046	A	6	6	22542	22547	100 %	0 %	0 %	0 %	530314071
545	NC_022046	ATT	2	6	22569	22574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314071
546	NC_022046	A	8	8	22666	22673	100 %	0 %	0 %	0 %	530314071
547	NC_022046	TTG	2	6	22699	22704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314071
548	NC_022046	CAG	2	6	22717	22722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314071
549	NC_022046	AG	3	6	22763	22768	50 %	0 %	50 %	0 %	530314071
550	NC_022046	AGT	2	6	22878	22883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314071
551	NC_022046	AATT	2	8	22953	22960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_022046	ACA	2	6	23013	23018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314072
553	NC_022046	ATG	2	6	23054	23059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314072
554	NC_022046	ACC	2	6	23154	23159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
555	NC_022046	A	8	8	23166	23173	100 %	0 %	0 %	0 %	530314073
556	NC_022046	A	6	6	23179	23184	100 %	0 %	0 %	0 %	530314073
557	NC_022046	TCA	2	6	23199	23204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314073
558	NC_022046	TAT	3	9	23425	23433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314073
559	NC_022046	TGGA	2	8	23543	23550	25 %	25 %	50 %	0 %	530314073
560	NC_022046	A	6	6	23589	23594	100 %	0 %	0 %	0 %	530314073
561	NC_022046	GAA	2	6	23607	23612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314073
562	NC_022046	AAG	2	6	23649	23654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314044
563	NC_022046	CTT	2	6	23722	23727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314044
564	NC_022046	CGA	2	6	23745	23750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314044
565	NC_022046	TTC	2	6	23756	23761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314044
566	NC_022046	TTC	2	6	23763	23768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314044
567	NC_022046	AAAG	2	8	23777	23784	75 %	0 %	25 %	0 %	530314044
568	NC_022046	GCTC	2	8	23940	23947	0 %	25 %	25 %	50 %	530314044
569	NC_022046	GA	3	6	24010	24015	50 %	0 %	50 %	0 %	530314044
570	NC_022046	T	7	7	24050	24056	0 %	100 %	0 %	0 %	530314044
571	NC_022046	AGA	2	6	24140	24145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314044
572	NC_022046	CTT	2	6	24393	24398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314074
573	NC_022046	TTTC	2	8	24457	24464	0 %	75 %	0 %	25 %	530314074
574	NC_022046	AAGT	2	8	24489	24496	50 %	25 %	25 %	0 %	530314074
575	NC_022046	TCT	2	6	24502	24507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314074
576	NC_022046	TCG	2	6	24532	24537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530314074
577	NC_022046	T	7	7	24564	24570	0 %	100 %	0 %	0 %	530314074
578	NC_022046	AACA	2	8	24640	24647	75 %	0 %	0 %	25 %	530314074
579	NC_022046	CGAT	2	8	24658	24665	25 %	25 %	25 %	25 %	530314074
580	NC_022046	TAA	2	6	24762	24767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314074
581	NC_022046	CTT	2	6	24780	24785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314074
582	NC_022046	T	6	6	24784	24789	0 %	100 %	0 %	0 %	530314074
583	NC_022046	T	7	7	24862	24868	0 %	100 %	0 %	0 %	530314074
584	NC_022046	CTTT	2	8	24871	24878	0 %	75 %	0 %	25 %	530314074
585	NC_022046	T	6	6	24876	24881	0 %	100 %	0 %	0 %	530314074
586	NC_022046	TTG	2	6	24897	24902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314074
587	NC_022046	TTTC	2	8	24974	24981	0 %	75 %	0 %	25 %	530314074
588	NC_022046	AATTC	2	10	24992	25001	40 %	40 %	0 %	20 %	530314074
589	NC_022046	CAT	2	6	25035	25040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314074
590	NC_022046	TCC	2	6	25042	25047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530314074
591	NC_022046	ATC	2	6	25075	25080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314075
592	NC_022046	TTC	2	6	25096	25101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314075
593	NC_022046	TCT	2	6	25103	25108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314075
594	NC_022046	CAAA	2	8	25214	25221	75 %	0 %	0 %	25 %	530314075
595	NC_022046	CTT	2	6	25251	25256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314075
596	NC_022046	AT	3	6	25262	25267	50 %	50 %	0 %	0 %	530314075
597	NC_022046	GATG	2	8	25374	25381	25 %	25 %	50 %	0 %	530314075
598	NC_022046	TGT	2	6	25425	25430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530314075
599	NC_022046	AT	3	6	25474	25479	50 %	50 %	0 %	0 %	530314075
600	NC_022046	TTTG	2	8	25568	25575	0 %	75 %	25 %	0 %	530314075
601	NC_022046	GAC	2	6	25587	25592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530314075
602	NC_022046	TG	3	6	25655	25660	0 %	50 %	50 %	0 %	530314075
603	NC_022046	TAC	2	6	25671	25676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530314075
604	NC_022046	TTTC	2	8	25884	25891	0 %	75 %	0 %	25 %	530314075
605	NC_022046	TTC	2	6	25954	25959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314075
606	NC_022046	T	6	6	26011	26016	0 %	100 %	0 %	0 %	530314075
607	NC_022046	AAT	2	6	26071	26076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314075
608	NC_022046	TTC	2	6	26077	26082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314075
609	NC_022046	AGG	2	6	26098	26103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	530314075
610	NC_022046	TC	4	8	26116	26123	0 %	50 %	0 %	50 %	530314075
611	NC_022046	ATA	2	6	26158	26163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314075
612	NC_022046	TCAT	2	8	26228	26235	25 %	50 %	0 %	25 %	530314075
613	NC_022046	GTA	2	6	26241	26246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314075
614	NC_022046	GAA	2	6	26399	26404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_022046	CAAG	2	8	26507	26514	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
616	NC_022046	ATTA	2	8	26525	26532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_022046	ATAA	2	8	26540	26547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022046	TTA	2	6	26611	26616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_022046	ACA	2	6	26621	26626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530314076
620	NC_022046	ATT	2	6	26675	26680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314076
621	NC_022046	T	6	6	26689	26694	0 %	100 %	0 %	0 %	530314076
622	NC_022046	AG	4	8	26727	26734	50 %	0 %	50 %	0 %	530314076
623	NC_022046	A	7	7	26741	26747	100 %	0 %	0 %	0 %	530314076
624	NC_022046	GAA	2	6	26774	26779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530314076
625	NC_022046	AGAA	2	8	26794	26801	75 %	0 %	25 %	0 %	530314076
626	NC_022046	TGA	2	6	26815	26820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314076
627	NC_022046	A	9	9	26829	26837	100 %	0 %	0 %	0 %	530314076
628	NC_022046	T	7	7	26844	26850	0 %	100 %	0 %	0 %	530314076
629	NC_022046	T	6	6	26858	26863	0 %	100 %	0 %	0 %	530314076
630	NC_022046	TTC	2	6	26940	26945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530314076
631	NC_022046	CCACT	2	10	27047	27056	20 %	20 %	0 %	60 %	530314076
632	NC_022046	T	6	6	27056	27061	0 %	100 %	0 %	0 %	530314076
633	NC_022046	T	6	6	27112	27117	0 %	100 %	0 %	0 %	530314076
634	NC_022046	ACAAAA	2	12	27133	27144	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	530314076
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765	NC_022046	GAT	2	6	31360	31365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530314082
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787	NC_022046	T	6	6	32351	32356	0 %	100 %	0 %	0 %	530314084
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795	NC_022046	TTTA	2	8	32703	32710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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797	NC_022046	A	6	6	32765	32770	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
798	NC_022046	AAATA	2	10	32795	32804	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
799	NC_022046	TAT	2	6	32809	32814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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807	NC_022046	T	7	7	33127	33133	0 %	100 %	0 %	0 %	530314085
808	NC_022046	TAT	2	6	33187	33192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530314085
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879	NC_022046	A	6	6	36336	36341	100 %	0 %	0 %	0 %	530314088
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888	NC_022046	GAAA	2	8	36661	36668	75 %	0 %	25 %	0 %	530314088
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892	NC_022046	TAA	2	6	37260	37265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530314090
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996	NC_022046	TA	3	6	41308	41313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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