MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 280

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022045	AG	3	6	74	79	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022045	CT	4	8	215	222	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_022045	CT	3	6	1360	1365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_022045	TC	3	6	2797	2802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_022045	AT	3	6	3449	3454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022045	CT	3	6	3662	3667	0 %	50 %	0 %	50 %	530313894
7	NC_022045	AT	3	6	3781	3786	50 %	50 %	0 %	0 %	530313894
8	NC_022045	TG	3	6	3906	3911	0 %	50 %	50 %	0 %	530313894
9	NC_022045	AT	3	6	4546	4551	50 %	50 %	0 %	0 %	530313873
10	NC_022045	GC	3	6	5073	5078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_022045	TA	3	6	5248	5253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_022045	TG	3	6	5906	5911	0 %	50 %	50 %	0 %	530313895
13	NC_022045	AT	3	6	7573	7578	50 %	50 %	0 %	0 %	530313897
14	NC_022045	TA	3	6	7867	7872	50 %	50 %	0 %	0 %	530313897
15	NC_022045	CT	3	6	7894	7899	0 %	50 %	0 %	50 %	530313897
16	NC_022045	TC	4	8	8275	8282	0 %	50 %	0 %	50 %	530313898
17	NC_022045	AT	3	6	8679	8684	50 %	50 %	0 %	0 %	530313899
18	NC_022045	CT	3	6	9323	9328	0 %	50 %	0 %	50 %	530313899
19	NC_022045	AT	3	6	9723	9728	50 %	50 %	0 %	0 %	530313899
20	NC_022045	AT	3	6	10392	10397	50 %	50 %	0 %	0 %	530313900
21	NC_022045	AC	3	6	11151	11156	50 %	0 %	0 %	50 %	530313902
22	NC_022045	TC	3	6	12925	12930	0 %	50 %	0 %	50 %	530313905
23	NC_022045	TA	3	6	13068	13073	50 %	50 %	0 %	0 %	530313905
24	NC_022045	CT	3	6	13088	13093	0 %	50 %	0 %	50 %	530313905
25	NC_022045	GT	3	6	13100	13105	0 %	50 %	50 %	0 %	530313905
26	NC_022045	TC	3	6	13122	13127	0 %	50 %	0 %	50 %	530313905
27	NC_022045	AT	3	6	13910	13915	50 %	50 %	0 %	0 %	530313905
28	NC_022045	AT	3	6	14015	14020	50 %	50 %	0 %	0 %	530313905
29	NC_022045	TG	3	6	14223	14228	0 %	50 %	50 %	0 %	530313906
30	NC_022045	TG	3	6	14356	14361	0 %	50 %	50 %	0 %	530313906
31	NC_022045	CG	3	6	14718	14723	0 %	0 %	50 %	50 %	530313907
32	NC_022045	TC	3	6	15928	15933	0 %	50 %	0 %	50 %	530313908
33	NC_022045	TC	4	8	16591	16598	0 %	50 %	0 %	50 %	530313910
34	NC_022045	AG	4	8	17202	17209	50 %	0 %	50 %	0 %	530313911
35	NC_022045	CA	3	6	17666	17671	50 %	0 %	0 %	50 %	530313911
36	NC_022045	AT	3	6	17847	17852	50 %	50 %	0 %	0 %	530313911
37	NC_022045	AT	3	6	18059	18064	50 %	50 %	0 %	0 %	530313911
38	NC_022045	CT	3	6	20905	20910	0 %	50 %	0 %	50 %	530313915
39	NC_022045	AC	3	6	21299	21304	50 %	0 %	0 %	50 %	530313915
40	NC_022045	CT	3	6	22428	22433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_022045	CT	3	6	22435	22440	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_022045	TA	3	6	22818	22823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_022045	TA	4	8	22866	22873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_022045	TA	3	6	22906	22911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022045	TA	3	6	22938	22943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022045	TA	3	6	23030	23035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022045	AT	3	6	23139	23144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022045	GA	3	6	23155	23160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022045	TA	3	6	23179	23184	50 %	50 %	0 %	0 %	530313917
50	NC_022045	TC	3	6	23559	23564	0 %	50 %	0 %	50 %	530313917
51	NC_022045	AT	3	6	23870	23875	50 %	50 %	0 %	0 %	530313917
52	NC_022045	TC	3	6	25796	25801	0 %	50 %	0 %	50 %	530313919
53	NC_022045	TA	3	6	26155	26160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022045	AT	3	6	26288	26293	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
55	NC_022045	CT	3	6	26647	26652	0 %	50 %	0 %	50 %	530313920
56	NC_022045	TA	3	6	26711	26716	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
57	NC_022045	TA	3	6	26933	26938	50 %	50 %	0 %	0 %	530313920
58	NC_022045	TA	3	6	27060	27065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022045	AT	3	6	27478	27483	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
60	NC_022045	TA	3	6	27905	27910	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
61	NC_022045	AT	3	6	28271	28276	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
62	NC_022045	TA	3	6	28292	28297	50 %	50 %	0 %	0 %	530313921
63	NC_022045	TC	3	6	28449	28454	0 %	50 %	0 %	50 %	530313921
64	NC_022045	TA	3	6	28770	28775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_022045	TA	3	6	30011	30016	50 %	50 %	0 %	0 %	530313876
66	NC_022045	CG	3	6	31559	31564	0 %	0 %	50 %	50 %	530313877
67	NC_022045	TA	3	6	33066	33071	50 %	50 %	0 %	0 %	530313924
68	NC_022045	CT	3	6	34096	34101	0 %	50 %	0 %	50 %	530313925
69	NC_022045	AT	3	6	34477	34482	50 %	50 %	0 %	0 %	530313925
70	NC_022045	GC	3	6	34664	34669	0 %	0 %	50 %	50 %	530313925
71	NC_022045	AT	3	6	34749	34754	50 %	50 %	0 %	0 %	530313925
72	NC_022045	TA	3	6	35617	35622	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022045	TA	4	8	35688	35695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_022045	AT	4	8	35699	35706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022045	AG	3	6	36058	36063	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_022045	TC	3	6	37244	37249	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_022045	TC	3	6	37978	37983	0 %	50 %	0 %	50 %	530313881
78	NC_022045	AT	3	6	38875	38880	50 %	50 %	0 %	0 %	530313927
79	NC_022045	TA	3	6	39223	39228	50 %	50 %	0 %	0 %	530313928
80	NC_022045	TC	3	6	39231	39236	0 %	50 %	0 %	50 %	530313928
81	NC_022045	TC	4	8	39806	39813	0 %	50 %	0 %	50 %	530313929
82	NC_022045	CA	3	6	40062	40067	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_022045	CA	3	6	40498	40503	50 %	0 %	0 %	50 %	530313882
84	NC_022045	GC	3	6	40821	40826	0 %	0 %	50 %	50 %	530313930
85	NC_022045	TA	3	6	41014	41019	50 %	50 %	0 %	0 %	530313930
86	NC_022045	TA	3	6	41628	41633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022045	TA	3	6	41996	42001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_022045	TA	3	6	42007	42012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_022045	GA	3	6	42612	42617	50 %	0 %	50 %	0 %	530313934
90	NC_022045	TC	3	6	43597	43602	0 %	50 %	0 %	50 %	530313935
91	NC_022045	AC	3	6	43805	43810	50 %	0 %	0 %	50 %	530313935
92	NC_022045	AG	3	6	44567	44572	50 %	0 %	50 %	0 %	530313935
93	NC_022045	AC	3	6	46446	46451	50 %	0 %	0 %	50 %	530313937
94	NC_022045	AC	3	6	46512	46517	50 %	0 %	0 %	50 %	530313937
95	NC_022045	TA	3	6	46752	46757	50 %	50 %	0 %	0 %	530313937
96	NC_022045	AG	3	6	46816	46821	50 %	0 %	50 %	0 %	530313937
97	NC_022045	GA	3	6	48301	48306	50 %	0 %	50 %	0 %	530313937
98	NC_022045	AG	3	6	49068	49073	50 %	0 %	50 %	0 %	530313937
99	NC_022045	AT	3	6	49375	49380	50 %	50 %	0 %	0 %	530313938
100	NC_022045	TA	4	8	49644	49651	50 %	50 %	0 %	0 %	530313938
101	NC_022045	AG	3	6	51440	51445	50 %	0 %	50 %	0 %	530313939
102	NC_022045	TG	3	6	51900	51905	0 %	50 %	50 %	0 %	530313939
103	NC_022045	TA	3	6	52423	52428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_022045	AT	3	6	52489	52494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_022045	AT	3	6	54010	54015	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
106	NC_022045	AT	3	6	54043	54048	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
107	NC_022045	AT	3	6	54158	54163	50 %	50 %	0 %	0 %	530313940
108	NC_022045	TA	3	6	54723	54728	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
109	NC_022045	GA	3	6	54757	54762	50 %	0 %	50 %	0 %	530313941
110	NC_022045	AT	4	8	55192	55199	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
111	NC_022045	TA	3	6	56109	56114	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
112	NC_022045	AT	3	6	56152	56157	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
113	NC_022045	TG	3	6	56200	56205	0 %	50 %	50 %	0 %	530313941
114	NC_022045	TA	3	6	56301	56306	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
115	NC_022045	AT	3	6	56321	56326	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
116	NC_022045	TA	3	6	56475	56480	50 %	50 %	0 %	0 %	530313941
117	NC_022045	CT	3	6	56752	56757	0 %	50 %	0 %	50 %	530313942
118	NC_022045	AG	3	6	56930	56935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_022045	TA	3	6	57389	57394	50 %	50 %	0 %	0 %	530313943
120	NC_022045	AT	3	6	57535	57540	50 %	50 %	0 %	0 %	530313943
121	NC_022045	AG	3	6	57636	57641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_022045	CT	4	8	57776	57783	0 %	50 %	0 %	50 %	530313885
123	NC_022045	CT	3	6	58921	58926	0 %	50 %	0 %	50 %	530313885
124	NC_022045	TC	3	6	60353	60358	0 %	50 %	0 %	50 %	530313944
125	NC_022045	AT	3	6	61003	61008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_022045	CT	3	6	61216	61221	0 %	50 %	0 %	50 %	530313945
127	NC_022045	AT	3	6	61335	61340	50 %	50 %	0 %	0 %	530313945
128	NC_022045	TG	3	6	61459	61464	0 %	50 %	50 %	0 %	530313946
129	NC_022045	AT	3	6	62099	62104	50 %	50 %	0 %	0 %	530313886
130	NC_022045	GC	3	6	62626	62631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
131	NC_022045	TA	3	6	62801	62806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022045	TG	3	6	63459	63464	0 %	50 %	50 %	0 %	530313947
133	NC_022045	AT	3	6	65126	65131	50 %	50 %	0 %	0 %	530313949
134	NC_022045	TA	3	6	65420	65425	50 %	50 %	0 %	0 %	530313949
135	NC_022045	CT	3	6	65447	65452	0 %	50 %	0 %	50 %	530313949
136	NC_022045	TG	3	6	65750	65755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_022045	CA	3	6	66090	66095	50 %	0 %	0 %	50 %	530313950
138	NC_022045	TA	3	6	66964	66969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_022045	TG	3	6	67066	67071	0 %	50 %	50 %	0 %	530313952
140	NC_022045	TA	3	6	67310	67315	50 %	50 %	0 %	0 %	530313952
141	NC_022045	AT	3	6	67641	67646	50 %	50 %	0 %	0 %	530313952
142	NC_022045	TA	4	8	67723	67730	50 %	50 %	0 %	0 %	530313952
143	NC_022045	GA	3	6	68554	68559	50 %	0 %	50 %	0 %	530313952
144	NC_022045	AT	3	6	71637	71642	50 %	50 %	0 %	0 %	530313953
145	NC_022045	AT	3	6	73371	73376	50 %	50 %	0 %	0 %	530313955
146	NC_022045	TA	3	6	73735	73740	50 %	50 %	0 %	0 %	530313955
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.