MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 3513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022045	ACA	2	6	63525	63530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313947
1502	NC_022045	GTT	2	6	63542	63547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313947
1503	NC_022045	TTC	2	6	63602	63607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313947
1504	NC_022045	AGA	2	6	63621	63626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313947
1505	NC_022045	CAA	2	6	63667	63672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313947
1506	NC_022045	ACT	2	6	63678	63683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313947
1507	NC_022045	TGC	2	6	63716	63721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313947
1508	NC_022045	CAA	2	6	63745	63750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313947
1509	NC_022045	T	6	6	63758	63763	0 %	100 %	0 %	0 %	530313947
1510	NC_022045	AGA	2	6	63817	63822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313947
1511	NC_022045	ACC	2	6	63866	63871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313947
1512	NC_022045	AGT	2	6	63920	63925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313947
1513	NC_022045	ATG	2	6	64006	64011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313947
1514	NC_022045	TCT	2	6	64053	64058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313947
1515	NC_022045	AAGA	2	8	64083	64090	75 %	0 %	25 %	0 %	530313947
1516	NC_022045	T	6	6	64136	64141	0 %	100 %	0 %	0 %	530313947
1517	NC_022045	CTA	2	6	64183	64188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313947
1518	NC_022045	ATTT	2	8	64241	64248	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_022045	CTT	2	6	64266	64271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_022045	AAT	2	6	64361	64366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_022045	AGG	2	6	64380	64385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_022045	CAG	2	6	64420	64425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313948
1523	NC_022045	ATT	2	6	64432	64437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313948
1524	NC_022045	CTA	2	6	64449	64454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313948
1525	NC_022045	ACG	2	6	64525	64530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313948
1526	NC_022045	ACT	2	6	64560	64565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313948
1527	NC_022045	GAAAAA	2	12	64578	64589	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	530313948
1528	NC_022045	GAAA	2	8	64706	64713	75 %	0 %	25 %	0 %	530313948
1529	NC_022045	AGC	2	6	64725	64730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313948
1530	NC_022045	AGG	2	6	64809	64814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_022045	ATT	2	6	64864	64869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313949
1532	NC_022045	CTA	2	6	64881	64886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313949
1533	NC_022045	CAC	2	6	64956	64961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313949
1534	NC_022045	ACT	2	6	64992	64997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313949
1535	NC_022045	ACA	2	6	65000	65005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313949
1536	NC_022045	AAAC	2	8	65019	65026	75 %	0 %	0 %	25 %	530313949
1537	NC_022045	AT	3	6	65126	65131	50 %	50 %	0 %	0 %	530313949
1538	NC_022045	AGC	2	6	65157	65162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313949
1539	NC_022045	A	6	6	65251	65256	100 %	0 %	0 %	0 %	530313949
1540	NC_022045	GAACA	2	10	65282	65291	60 %	0 %	20 %	20 %	530313949
1541	NC_022045	ATC	2	6	65330	65335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313949
1542	NC_022045	TA	3	6	65420	65425	50 %	50 %	0 %	0 %	530313949
1543	NC_022045	AGA	2	6	65426	65431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313949
1544	NC_022045	AAG	2	6	65438	65443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313949
1545	NC_022045	CT	3	6	65447	65452	0 %	50 %	0 %	50 %	530313949
1546	NC_022045	ATT	2	6	65484	65489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313949
1547	NC_022045	TCA	2	6	65590	65595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_022045	ATT	2	6	65622	65627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_022045	TG	3	6	65750	65755	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_022045	CCA	2	6	65780	65785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1551	NC_022045	ATGA	2	8	65832	65839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_022045	GCA	2	6	65900	65905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_022045	TTG	2	6	66069	66074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313950
1554	NC_022045	CA	3	6	66090	66095	50 %	0 %	0 %	50 %	530313950
1555	NC_022045	CAAA	2	8	66102	66109	75 %	0 %	0 %	25 %	530313950
1556	NC_022045	CTGCCG	2	12	66114	66125	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	530313950
1557	NC_022045	CAA	2	6	66144	66149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313950
1558	NC_022045	GCC	2	6	66175	66180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	530313950
1559	NC_022045	TGC	2	6	66182	66187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313950
1560	NC_022045	GTT	2	6	66230	66235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313950
1561	NC_022045	CCAT	2	8	66321	66328	25 %	25 %	0 %	50 %	530313950
1562	NC_022045	TCC	2	6	66373	66378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1563	NC_022045	TTA	2	6	66420	66425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_022045	AAT	2	6	66444	66449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_022045	CATTA	2	10	66473	66482	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1566	NC_022045	A	7	7	66482	66488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_022045	ATA	2	6	66496	66501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_022045	CTG	2	6	66601	66606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1569	NC_022045	GAG	2	6	66635	66640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_022045	AAAAC	2	10	66796	66805	80 %	0 %	0 %	20 %	530313951
1571	NC_022045	TGG	2	6	66829	66834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313951
1572	NC_022045	A	6	6	66932	66937	100 %	0 %	0 %	0 %	530313951
1573	NC_022045	AAG	2	6	66948	66953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_022045	TA	3	6	66964	66969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_022045	ATAA	2	8	66973	66980	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_022045	TG	3	6	67066	67071	0 %	50 %	50 %	0 %	530313952
1577	NC_022045	CAT	2	6	67085	67090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313952
1578	NC_022045	CAA	2	6	67105	67110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313952
1579	NC_022045	GTTC	2	8	67258	67265	0 %	50 %	25 %	25 %	530313952
1580	NC_022045	ACA	2	6	67269	67274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313952
1581	NC_022045	TA	3	6	67310	67315	50 %	50 %	0 %	0 %	530313952
1582	NC_022045	ACC	2	6	67319	67324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313952
1583	NC_022045	ACAT	2	8	67335	67342	50 %	25 %	0 %	25 %	530313952
1584	NC_022045	T	6	6	67381	67386	0 %	100 %	0 %	0 %	530313952
1585	NC_022045	T	6	6	67424	67429	0 %	100 %	0 %	0 %	530313952
1586	NC_022045	TGT	2	6	67513	67518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313952
1587	NC_022045	ATA	2	6	67533	67538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313952
1588	NC_022045	TGAT	2	8	67598	67605	25 %	50 %	25 %	0 %	530313952
1589	NC_022045	AT	3	6	67641	67646	50 %	50 %	0 %	0 %	530313952
1590	NC_022045	TA	4	8	67723	67730	50 %	50 %	0 %	0 %	530313952
1591	NC_022045	GTT	2	6	67734	67739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313952
1592	NC_022045	AAT	2	6	67859	67864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313952
1593	NC_022045	ATC	2	6	67871	67876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313952
1594	NC_022045	AGT	2	6	67967	67972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313952
1595	NC_022045	ATTCTC	2	12	67979	67990	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530313952
1596	NC_022045	TATT	2	8	68020	68027	25 %	75 %	0 %	0 %	530313952
1597	NC_022045	GTAA	2	8	68117	68124	50 %	25 %	25 %	0 %	530313952
1598	NC_022045	GTTT	2	8	68130	68137	0 %	75 %	25 %	0 %	530313952
1599	NC_022045	T	7	7	68139	68145	0 %	100 %	0 %	0 %	530313952
1600	NC_022045	CTGC	2	8	68185	68192	0 %	25 %	25 %	50 %	530313952
1601	NC_022045	TAT	2	6	68194	68199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313952
1602	NC_022045	ACC	2	6	68202	68207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313952
1603	NC_022045	TCT	2	6	68235	68240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313952
1604	NC_022045	ACA	2	6	68241	68246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313952
1605	NC_022045	AAT	2	6	68262	68267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313952
1606	NC_022045	TTG	2	6	68378	68383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313952
1607	NC_022045	T	6	6	68471	68476	0 %	100 %	0 %	0 %	530313952
1608	NC_022045	CTT	2	6	68536	68541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313952
1609	NC_022045	GA	3	6	68554	68559	50 %	0 %	50 %	0 %	530313952
1610	NC_022045	ATA	2	6	68587	68592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313952
1611	NC_022045	TCA	2	6	68634	68639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313952
1612	NC_022045	T	6	6	68684	68689	0 %	100 %	0 %	0 %	530313952
1613	NC_022045	TAA	2	6	68768	68773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313952
1614	NC_022045	TTC	3	9	68810	68818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313952
1615	NC_022045	CGTA	2	8	68830	68837	25 %	25 %	25 %	25 %	530313952
1616	NC_022045	ATC	2	6	68843	68848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313952
1617	NC_022045	ACT	2	6	68874	68879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313952
1618	NC_022045	TCA	2	6	68880	68885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313952
1619	NC_022045	ATAATG	2	12	68893	68904	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	530313952
1620	NC_022045	TCT	2	6	68931	68936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313952
1621	NC_022045	ATGG	2	8	68951	68958	25 %	25 %	50 %	0 %	530313952
1622	NC_022045	TCA	2	6	68988	68993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313952
1623	NC_022045	CAA	2	6	69004	69009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313952
1624	NC_022045	CAA	2	6	69046	69051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313952
1625	NC_022045	AAC	2	6	69144	69149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313952
1626	NC_022045	T	8	8	69295	69302	0 %	100 %	0 %	0 %	530313952
1627	NC_022045	T	7	7	69309	69315	0 %	100 %	0 %	0 %	530313952
1628	NC_022045	AAT	2	6	69376	69381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313952
1629	NC_022045	TCA	2	6	69471	69476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313952
1630	NC_022045	ATAATC	2	12	69477	69488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	530313952
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1642	NC_022045	T	6	6	69987	69992	0 %	100 %	0 %	0 %	530313952
1643	NC_022045	T	7	7	70059	70065	0 %	100 %	0 %	0 %	530313952
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1646	NC_022045	TCC	2	6	70190	70195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1745	NC_022045	TGAT	2	8	73934	73941	25 %	50 %	25 %	0 %	530313955
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1752	NC_022045	TAA	2	6	74438	74443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313955
1753	NC_022045	A	7	7	74447	74453	100 %	0 %	0 %	0 %	530313955
1754	NC_022045	AGA	2	6	74507	74512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313955
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