MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain N1-011A plasmid

Total Repeats: 3513

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022045	A	6	6	42795	42800	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_022045	TAAT	2	8	42819	42826	50 %	50 %	0 %	0 %	530313935
1003	NC_022045	CTTTCA	2	12	42827	42838	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	530313935
1004	NC_022045	ACC	2	6	42911	42916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313935
1005	NC_022045	TGA	2	6	42947	42952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313935
1006	NC_022045	TAA	2	6	42977	42982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
1007	NC_022045	GTC	2	6	43032	43037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313935
1008	NC_022045	GCT	2	6	43114	43119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313935
1009	NC_022045	CAT	2	6	43130	43135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313935
1010	NC_022045	TTGC	2	8	43256	43263	0 %	50 %	25 %	25 %	530313935
1011	NC_022045	ATA	2	6	43291	43296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
1012	NC_022045	T	6	6	43298	43303	0 %	100 %	0 %	0 %	530313935
1013	NC_022045	TAA	2	6	43328	43333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
1014	NC_022045	TCAC	2	8	43435	43442	25 %	25 %	0 %	50 %	530313935
1015	NC_022045	ATA	2	6	43509	43514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
1016	NC_022045	GATG	2	8	43554	43561	25 %	25 %	50 %	0 %	530313935
1017	NC_022045	TC	3	6	43597	43602	0 %	50 %	0 %	50 %	530313935
1018	NC_022045	TAA	2	6	43616	43621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
1019	NC_022045	TGC	2	6	43659	43664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313935
1020	NC_022045	ATG	2	6	43666	43671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313935
1021	NC_022045	TAT	2	6	43682	43687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313935
1022	NC_022045	ACC	2	6	43729	43734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313935
1023	NC_022045	CCA	2	6	43786	43791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313935
1024	NC_022045	TCT	2	6	43795	43800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313935
1025	NC_022045	AC	3	6	43805	43810	50 %	0 %	0 %	50 %	530313935
1026	NC_022045	AAC	2	6	43878	43883	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313935
1027	NC_022045	CCA	2	6	43948	43953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313935
1028	NC_022045	GCG	2	6	43984	43989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	530313935
1029	NC_022045	AAT	2	6	43995	44000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
1030	NC_022045	CAA	2	6	44030	44035	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313935
1031	NC_022045	CCT	2	6	44066	44071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313935
1032	NC_022045	AAT	2	6	44082	44087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
1033	NC_022045	TCT	2	6	44104	44109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313935
1034	NC_022045	CTT	2	6	44141	44146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313935
1035	NC_022045	ATC	2	6	44172	44177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313935
1036	NC_022045	T	7	7	44182	44188	0 %	100 %	0 %	0 %	530313935
1037	NC_022045	GCT	2	6	44215	44220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	530313935
1038	NC_022045	CCAT	2	8	44254	44261	25 %	25 %	0 %	50 %	530313935
1039	NC_022045	T	6	6	44267	44272	0 %	100 %	0 %	0 %	530313935
1040	NC_022045	CTT	2	6	44357	44362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313935
1041	NC_022045	CAC	2	6	44451	44456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	530313935
1042	NC_022045	AGC	2	6	44487	44492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313935
1043	NC_022045	AAT	2	6	44496	44501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
1044	NC_022045	TCA	2	6	44510	44515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313935
1045	NC_022045	TCCT	2	8	44556	44563	0 %	50 %	0 %	50 %	530313935
1046	NC_022045	AG	3	6	44567	44572	50 %	0 %	50 %	0 %	530313935
1047	NC_022045	CCT	2	6	44578	44583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313935
1048	NC_022045	AAAT	2	8	44597	44604	75 %	25 %	0 %	0 %	530313935
1049	NC_022045	TCC	2	6	44626	44631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	530313935
1050	NC_022045	AATA	2	8	44664	44671	75 %	25 %	0 %	0 %	530313935
1051	NC_022045	AAT	2	6	44683	44688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
1052	NC_022045	T	6	6	44695	44700	0 %	100 %	0 %	0 %	530313935
1053	NC_022045	TAA	2	6	44702	44707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313935
1054	NC_022045	TTCT	2	8	44748	44755	0 %	75 %	0 %	25 %	530313935
1055	NC_022045	TTG	2	6	44799	44804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313935
1056	NC_022045	AAT	2	6	45028	45033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	530313936
1057	NC_022045	CTT	2	6	45074	45079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313936
1058	NC_022045	TGG	2	6	45093	45098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	530313936
1059	NC_022045	TCA	2	6	45195	45200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313936
1060	NC_022045	TCCAG	2	10	45246	45255	20 %	20 %	20 %	40 %	530313936
1061	NC_022045	TCA	2	6	45279	45284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313936
1062	NC_022045	TAT	2	6	45423	45428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_022045	T	6	6	45520	45525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_022045	ATT	2	6	45544	45549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022045	AGG	2	6	45584	45589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_022045	GAGT	2	8	45615	45622	25 %	25 %	50 %	0 %	530313883
1067	NC_022045	AATTTG	2	12	45635	45646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	530313883
1068	NC_022045	TTAT	2	8	45771	45778	25 %	75 %	0 %	0 %	530313883
1069	NC_022045	TTGA	2	8	45812	45819	25 %	50 %	25 %	0 %	530313883
1070	NC_022045	AGC	2	6	45979	45984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313883
1071	NC_022045	A	7	7	45997	46003	100 %	0 %	0 %	0 %	530313883
1072	NC_022045	G	6	6	46004	46009	0 %	0 %	100 %	0 %	530313883
1073	NC_022045	TCAA	2	8	46027	46034	50 %	25 %	0 %	25 %	530313883
1074	NC_022045	AAC	2	6	46111	46116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	530313883
1075	NC_022045	GGAA	2	8	46136	46143	50 %	0 %	50 %	0 %	530313883
1076	NC_022045	AACT	2	8	46145	46152	50 %	25 %	0 %	25 %	530313883
1077	NC_022045	CAG	2	6	46176	46181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	530313937
1078	NC_022045	CTT	2	6	46196	46201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313937
1079	NC_022045	ATC	2	6	46268	46273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313937
1080	NC_022045	TCCA	2	8	46361	46368	25 %	25 %	0 %	50 %	530313937
1081	NC_022045	AC	3	6	46446	46451	50 %	0 %	0 %	50 %	530313937
1082	NC_022045	AC	3	6	46512	46517	50 %	0 %	0 %	50 %	530313937
1083	NC_022045	CAAT	2	8	46519	46526	50 %	25 %	0 %	25 %	530313937
1084	NC_022045	TTA	2	6	46539	46544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313937
1085	NC_022045	ATG	2	6	46560	46565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313937
1086	NC_022045	A	7	7	46583	46589	100 %	0 %	0 %	0 %	530313937
1087	NC_022045	ATT	2	6	46616	46621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313937
1088	NC_022045	AGA	2	6	46642	46647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313937
1089	NC_022045	TTC	2	6	46695	46700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313937
1090	NC_022045	GTT	2	6	46741	46746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313937
1091	NC_022045	TA	3	6	46752	46757	50 %	50 %	0 %	0 %	530313937
1092	NC_022045	AG	3	6	46816	46821	50 %	0 %	50 %	0 %	530313937
1093	NC_022045	A	6	6	46838	46843	100 %	0 %	0 %	0 %	530313937
1094	NC_022045	CAAT	2	8	46875	46882	50 %	25 %	0 %	25 %	530313937
1095	NC_022045	TTC	2	6	46908	46913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	530313937
1096	NC_022045	A	7	7	46971	46977	100 %	0 %	0 %	0 %	530313937
1097	NC_022045	T	6	6	46996	47001	0 %	100 %	0 %	0 %	530313937
1098	NC_022045	ATC	3	9	47007	47015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313937
1099	NC_022045	GATC	2	8	47023	47030	25 %	25 %	25 %	25 %	530313937
1100	NC_022045	TGAT	2	8	47154	47161	25 %	50 %	25 %	0 %	530313937
1101	NC_022045	AGA	2	6	47324	47329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313937
1102	NC_022045	AAAT	2	8	47406	47413	75 %	25 %	0 %	0 %	530313937
1103	NC_022045	A	6	6	47419	47424	100 %	0 %	0 %	0 %	530313937
1104	NC_022045	A	6	6	47474	47479	100 %	0 %	0 %	0 %	530313937
1105	NC_022045	GAA	2	6	47501	47506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313937
1106	NC_022045	A	6	6	47554	47559	100 %	0 %	0 %	0 %	530313937
1107	NC_022045	GAAG	2	8	47588	47595	50 %	0 %	50 %	0 %	530313937
1108	NC_022045	TGA	2	6	47614	47619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313937
1109	NC_022045	ACTC	2	8	47649	47656	25 %	25 %	0 %	50 %	530313937
1110	NC_022045	TGA	2	6	47674	47679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313937
1111	NC_022045	ATT	2	6	47724	47729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313937
1112	NC_022045	A	7	7	47764	47770	100 %	0 %	0 %	0 %	530313937
1113	NC_022045	A	7	7	47809	47815	100 %	0 %	0 %	0 %	530313937
1114	NC_022045	GAAAA	2	10	47933	47942	80 %	0 %	20 %	0 %	530313937
1115	NC_022045	ATTAGG	2	12	47959	47970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313937
1116	NC_022045	AAG	2	6	48060	48065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313937
1117	NC_022045	TCAA	2	8	48248	48255	50 %	25 %	0 %	25 %	530313937
1118	NC_022045	CAT	2	6	48272	48277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313937
1119	NC_022045	GTT	2	6	48284	48289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	530313937
1120	NC_022045	GA	3	6	48301	48306	50 %	0 %	50 %	0 %	530313937
1121	NC_022045	GCTT	2	8	48327	48334	0 %	50 %	25 %	25 %	530313937
1122	NC_022045	GAA	2	6	48359	48364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313937
1123	NC_022045	A	6	6	48454	48459	100 %	0 %	0 %	0 %	530313937
1124	NC_022045	ATT	2	6	48466	48471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313937
1125	NC_022045	TTA	2	6	48503	48508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	530313937
1126	NC_022045	TCA	2	6	48513	48518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	530313937
1127	NC_022045	TGA	2	6	48544	48549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	530313937
1128	NC_022045	GAA	2	6	48557	48562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	530313937
1129	NC_022045	A	6	6	48643	48648	100 %	0 %	0 %	0 %	530313937
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1252	NC_022045	A	6	6	53241	53246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_022045	A	7	7	53375	53381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_022045	A	6	6	53392	53397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_022045	TAA	2	6	53404	53409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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