MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47501	NC_021872	GAA	2	6	2143720	2143725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232154
47502	NC_021872	T	7	7	2143769	2143775	0 %	100 %	0 %	0 %	526232154
47503	NC_021872	TAA	2	6	2143806	2143811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232154
47504	NC_021872	AAT	2	6	2143817	2143822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232154
47505	NC_021872	GTA	2	6	2143843	2143848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232154
47506	NC_021872	CTT	2	6	2143989	2143994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232154
47507	NC_021872	TGA	2	6	2144047	2144052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232154
47508	NC_021872	GAG	2	6	2144079	2144084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232154
47509	NC_021872	TCA	2	6	2144100	2144105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232154
47510	NC_021872	TTTG	2	8	2144111	2144118	0 %	75 %	25 %	0 %	526232154
47511	NC_021872	GAT	2	6	2144140	2144145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232154
47512	NC_021872	GAT	3	9	2144149	2144157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232154
47513	NC_021872	AGCA	2	8	2144286	2144293	50 %	0 %	25 %	25 %	526232154
47514	NC_021872	T	7	7	2144338	2144344	0 %	100 %	0 %	0 %	526232154
47515	NC_021872	T	6	6	2144373	2144378	0 %	100 %	0 %	0 %	526232155
47516	NC_021872	TAA	2	6	2144509	2144514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232155
47517	NC_021872	CGC	2	6	2144528	2144533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232155
47518	NC_021872	T	6	6	2144567	2144572	0 %	100 %	0 %	0 %	526232155
47519	NC_021872	T	6	6	2144690	2144695	0 %	100 %	0 %	0 %	526232155
47520	NC_021872	CTGCC	2	10	2144806	2144815	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
47521	NC_021872	CA	3	6	2144817	2144822	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47522	NC_021872	A	7	7	2144825	2144831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47523	NC_021872	ATA	2	6	2144862	2144867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232156
47524	NC_021872	CTT	2	6	2144962	2144967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232156
47525	NC_021872	CCT	2	6	2144998	2145003	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47526	NC_021872	TGGTT	2	10	2145016	2145025	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47527	NC_021872	GTA	2	6	2145064	2145069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47528	NC_021872	AC	3	6	2145072	2145077	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47529	NC_021872	TAA	2	6	2145088	2145093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47530	NC_021872	T	7	7	2145114	2145120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47531	NC_021872	ATT	2	6	2145122	2145127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47532	NC_021872	AAT	2	6	2145142	2145147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47533	NC_021872	CAA	2	6	2145188	2145193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47534	NC_021872	AGT	2	6	2145246	2145251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47535	NC_021872	CT	3	6	2145269	2145274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47536	NC_021872	AT	3	6	2145297	2145302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47537	NC_021872	ATT	2	6	2145363	2145368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47538	NC_021872	AC	3	6	2145374	2145379	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47539	NC_021872	T	6	6	2145394	2145399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47540	NC_021872	ATT	2	6	2145400	2145405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.