MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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47002	NC_021872	TTTTTA	2	12	2120891	2120902	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	526232663
47003	NC_021872	CAA	2	6	2120965	2120970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232663
47004	NC_021872	TAA	2	6	2121001	2121006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232663
47005	NC_021872	AT	3	6	2121021	2121026	50 %	50 %	0 %	0 %	526232663
47006	NC_021872	AAT	2	6	2121070	2121075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232663
47007	NC_021872	TC	3	6	2121086	2121091	0 %	50 %	0 %	50 %	526232663
47008	NC_021872	ATTTTT	2	12	2121134	2121145	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	526232663
47009	NC_021872	TCT	2	6	2121147	2121152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232663
47010	NC_021872	A	6	6	2121228	2121233	100 %	0 %	0 %	0 %	526232664
47011	NC_021872	CTT	2	6	2121260	2121265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232664
47012	NC_021872	TTA	2	6	2121380	2121385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232664
47013	NC_021872	ATA	2	6	2121497	2121502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47014	NC_021872	ATT	2	6	2121529	2121534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47015	NC_021872	CTA	2	6	2121545	2121550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47016	NC_021872	TTC	2	6	2121575	2121580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47017	NC_021872	CAA	2	6	2121617	2121622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47018	NC_021872	A	6	6	2121632	2121637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47019	NC_021872	A	6	6	2121694	2121699	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47020	NC_021872	TTAA	2	8	2121701	2121708	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47021	NC_021872	A	7	7	2121758	2121764	100 %	0 %	0 %	0 %	526232665
47022	NC_021872	ACC	2	6	2121793	2121798	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232665
47023	NC_021872	CTG	2	6	2121799	2121804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232665
47024	NC_021872	CAC	2	6	2121809	2121814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232665
47025	NC_021872	GAA	2	6	2121816	2121821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232665
47026	NC_021872	AT	3	6	2121830	2121835	50 %	50 %	0 %	0 %	526232665
47027	NC_021872	GAA	2	6	2121881	2121886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232665
47028	NC_021872	TTA	2	6	2121904	2121909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232665
47029	NC_021872	GAT	2	6	2121912	2121917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232665
47030	NC_021872	A	6	6	2121918	2121923	100 %	0 %	0 %	0 %	526232665
47031	NC_021872	AAT	2	6	2122047	2122052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232665
47032	NC_021872	CGA	2	6	2122094	2122099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232665
47033	NC_021872	TTA	2	6	2122144	2122149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232665
47034	NC_021872	GATT	2	8	2122181	2122188	25 %	50 %	25 %	0 %	526232665
47035	NC_021872	ATT	2	6	2122200	2122205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232665
47036	NC_021872	ACC	2	6	2122214	2122219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232665
47037	NC_021872	T	7	7	2122250	2122256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47038	NC_021872	G	6	6	2122257	2122262	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
47039	NC_021872	T	7	7	2122265	2122271	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47040	NC_021872	A	6	6	2122311	2122316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47041	NC_021872	AT	3	6	2122402	2122407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47042	NC_021872	TTA	2	6	2122495	2122500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47043	NC_021872	AAT	2	6	2122505	2122510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47044	NC_021872	TC	3	6	2122517	2122522	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47045	NC_021872	ATTT	2	8	2122583	2122590	25 %	75 %	0 %	0 %	526232666
47046	NC_021872	AGA	2	6	2122726	2122731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232666
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47049	NC_021872	AGCA	2	8	2122969	2122976	50 %	0 %	25 %	25 %	526232666
47050	NC_021872	A	7	7	2123001	2123007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47051	NC_021872	ATC	2	6	2123078	2123083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232140
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47053	NC_021872	CCA	2	6	2123226	2123231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232140
47054	NC_021872	CTT	2	6	2123242	2123247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232140
47055	NC_021872	TGC	2	6	2123250	2123255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232140
47056	NC_021872	GTA	2	6	2123264	2123269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232140
47057	NC_021872	TA	3	6	2123305	2123310	50 %	50 %	0 %	0 %	526232140
47058	NC_021872	GAG	2	6	2123364	2123369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232140
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47072	NC_021872	TA	3	6	2124052	2124057	50 %	50 %	0 %	0 %	526232140
47073	NC_021872	T	6	6	2124065	2124070	0 %	100 %	0 %	0 %	526232140
47074	NC_021872	A	6	6	2124107	2124112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47075	NC_021872	TAT	2	6	2124123	2124128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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47077	NC_021872	AATA	2	8	2124227	2124234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47078	NC_021872	GAAT	2	8	2124285	2124292	50 %	25 %	25 %	0 %	526232141
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47080	NC_021872	TCAA	2	8	2124330	2124337	50 %	25 %	0 %	25 %	526232141
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47084	NC_021872	TTA	3	9	2124567	2124575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232141
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47089	NC_021872	GA	3	6	2124836	2124841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47090	NC_021872	TTTC	2	8	2124850	2124857	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47091	NC_021872	CTTT	2	8	2124860	2124867	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47092	NC_021872	TAA	2	6	2124908	2124913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47093	NC_021872	ATA	2	6	2124919	2124924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47094	NC_021872	AGG	2	6	2124940	2124945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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47105	NC_021872	TTG	2	6	2125334	2125339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232142
47106	NC_021872	TGA	2	6	2125436	2125441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232142
47107	NC_021872	TTA	2	6	2125453	2125458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232142
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47109	NC_021872	A	6	6	2125611	2125616	100 %	0 %	0 %	0 %	526232142
47110	NC_021872	AGAA	2	8	2125676	2125683	75 %	0 %	25 %	0 %	526232667
47111	NC_021872	A	6	6	2125786	2125791	100 %	0 %	0 %	0 %	526232667
47112	NC_021872	A	6	6	2125837	2125842	100 %	0 %	0 %	0 %	526232667
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47117	NC_021872	A	7	7	2126027	2126033	100 %	0 %	0 %	0 %	526232667
47118	NC_021872	TG	3	6	2126083	2126088	0 %	50 %	50 %	0 %	526232667
47119	NC_021872	ATG	3	9	2126111	2126119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232667
47120	NC_021872	CGAT	2	8	2126129	2126136	25 %	25 %	25 %	25 %	526232667
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47364	NC_021872	TTC	2	6	2137341	2137346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232150
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47473	NC_021872	A	7	7	2142528	2142534	100 %	0 %	0 %	0 %	526232152
47474	NC_021872	TAA	2	6	2142553	2142558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47475	NC_021872	ACT	2	6	2142589	2142594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47476	NC_021872	CAA	2	6	2142651	2142656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47477	NC_021872	GTG	2	6	2142725	2142730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232153
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47480	NC_021872	ACT	2	6	2142810	2142815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232153
47481	NC_021872	CTT	2	6	2142850	2142855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232153
47482	NC_021872	CGT	2	6	2142858	2142863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232153
47483	NC_021872	TGC	2	6	2142902	2142907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232153
47484	NC_021872	AT	3	6	2142925	2142930	50 %	50 %	0 %	0 %	526232153
47485	NC_021872	TAA	2	6	2143033	2143038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232153
47486	NC_021872	GCC	2	6	2143138	2143143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232153
47487	NC_021872	TTC	2	6	2143232	2143237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232153
47488	NC_021872	TTA	2	6	2143267	2143272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232153
47489	NC_021872	CGT	2	6	2143293	2143298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232153
47490	NC_021872	GAA	2	6	2143330	2143335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232153
47491	NC_021872	CTTTT	2	10	2143385	2143394	0 %	80 %	0 %	20 %	526232153
47492	NC_021872	CTT	2	6	2143396	2143401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232153
47493	NC_021872	TTG	2	6	2143405	2143410	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232153
47494	NC_021872	TAAT	2	8	2143448	2143455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47495	NC_021872	TAAA	2	8	2143478	2143485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47496	NC_021872	CAA	2	6	2143494	2143499	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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47498	NC_021872	CCG	2	6	2143531	2143536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526232154
47499	NC_021872	TTCACG	2	12	2143606	2143617	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	526232154
47500	NC_021872	TAC	2	6	2143675	2143680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232154

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