MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021872	TTG	2	6	110695	110700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230794
2502	NC_021872	AGGC	2	8	110708	110715	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2503	NC_021872	TTA	2	6	110732	110737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2504	NC_021872	TAT	2	6	110742	110747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_021872	T	7	7	110761	110767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_021872	ATT	2	6	110795	110800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_021872	GAAA	2	8	110818	110825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_021872	TTC	2	6	110834	110839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_021872	CAT	2	6	110915	110920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230795
2510	NC_021872	GA	3	6	110981	110986	50 %	0 %	50 %	0 %	526230795
2511	NC_021872	GGA	2	6	111072	111077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230795
2512	NC_021872	CAA	3	9	111079	111087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230795
2513	NC_021872	CTT	2	6	111106	111111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230795
2514	NC_021872	GAA	2	6	111124	111129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230795
2515	NC_021872	CTT	2	6	111130	111135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230795
2516	NC_021872	ATT	2	6	111170	111175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230795
2517	NC_021872	GAT	2	6	111215	111220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230795
2518	NC_021872	ATC	2	6	111302	111307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230795
2519	NC_021872	CTT	2	6	111334	111339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230795
2520	NC_021872	TGTT	2	8	111353	111360	0 %	75 %	25 %	0 %	526230795
2521	NC_021872	TTA	2	6	111456	111461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230795
2522	NC_021872	CTG	2	6	111514	111519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230795
2523	NC_021872	TGA	2	6	111637	111642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230795
2524	NC_021872	TCA	2	6	111660	111665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230795
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2529	NC_021872	GAT	2	6	111926	111931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230795
2530	NC_021872	TTG	3	9	111953	111961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230795
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2532	NC_021872	GTG	2	6	112015	112020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230795
2533	NC_021872	TAG	2	6	112152	112157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230795
2534	NC_021872	CGA	2	6	112185	112190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230795
2535	NC_021872	TGT	2	6	112239	112244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230795
2536	NC_021872	ATT	2	6	112259	112264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_021872	TAAT	2	8	112352	112359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_021872	TTA	2	6	112395	112400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2539	NC_021872	TAA	2	6	112431	112436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_021872	T	6	6	112441	112446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_021872	TAG	2	6	112461	112466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2542	NC_021872	ATAA	2	8	112488	112495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2543	NC_021872	TGC	2	6	112523	112528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230796
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2545	NC_021872	TTA	2	6	112569	112574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230796
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2547	NC_021872	TGAT	2	8	112615	112622	25 %	50 %	25 %	0 %	526230796
2548	NC_021872	GTT	2	6	112674	112679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230796
2549	NC_021872	GCT	2	6	112680	112685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230796
2550	NC_021872	TCG	2	6	112691	112696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230796
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2553	NC_021872	CAAT	2	8	113044	113051	50 %	25 %	0 %	25 %	526230796
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2557	NC_021872	TCT	2	6	113295	113300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230797
2558	NC_021872	CGGT	2	8	113545	113552	0 %	25 %	50 %	25 %	526230797
2559	NC_021872	TAAT	2	8	113553	113560	50 %	50 %	0 %	0 %	526230797
2560	NC_021872	AGG	2	6	113637	113642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230797
2561	NC_021872	CAAC	2	8	113663	113670	50 %	0 %	0 %	50 %	526230797
2562	NC_021872	CAA	2	6	113726	113731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230797
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2564	NC_021872	CTG	2	6	113880	113885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230797
2565	NC_021872	CAT	2	6	113893	113898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230797
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2567	NC_021872	TGT	2	6	113926	113931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230797
2568	NC_021872	TAC	2	6	113975	113980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230797
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2571	NC_021872	GAT	3	9	114176	114184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230797
2572	NC_021872	CAG	2	6	114225	114230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230797
2573	NC_021872	ACG	2	6	114234	114239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230797
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2575	NC_021872	GCAG	2	8	114275	114282	25 %	0 %	50 %	25 %	526230797
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2582	NC_021872	ACGG	2	8	114747	114754	25 %	0 %	50 %	25 %	526230798
2583	NC_021872	AGA	2	6	114762	114767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230798
2584	NC_021872	TTG	2	6	114890	114895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230798
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2589	NC_021872	GTC	2	6	115043	115048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230798
2590	NC_021872	AGC	2	6	115102	115107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230798
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2592	NC_021872	GTG	2	6	115211	115216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230798
2593	NC_021872	ATG	2	6	115232	115237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230798
2594	NC_021872	AATTT	2	10	115267	115276	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_021872	T	7	7	115312	115318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_021872	ATC	2	6	115331	115336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2597	NC_021872	TACT	2	8	115400	115407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2598	NC_021872	GAT	2	6	115412	115417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2600	NC_021872	A	6	6	115427	115432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_021872	TA	3	6	115463	115468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_021872	T	6	6	115472	115477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_021872	AGG	2	6	115478	115483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_021872	AAT	2	6	115484	115489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_021872	GAA	2	6	115501	115506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232176
2606	NC_021872	GCAA	2	8	115527	115534	50 %	0 %	25 %	25 %	526232176
2607	NC_021872	GAAT	2	8	115614	115621	50 %	25 %	25 %	0 %	526232176
2608	NC_021872	AGC	2	6	115675	115680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232176
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2610	NC_021872	TCAAG	2	10	115883	115892	40 %	20 %	20 %	20 %	526232176
2611	NC_021872	GCT	2	6	115913	115918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232176
2612	NC_021872	CTA	2	6	115923	115928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232176
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2614	NC_021872	CTG	2	6	115971	115976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232176
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2618	NC_021872	TTAA	2	8	116048	116055	50 %	50 %	0 %	0 %	526232176
2619	NC_021872	ATA	2	6	116253	116258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232176
2620	NC_021872	TAG	2	6	116374	116379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232176
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2622	NC_021872	CTA	2	6	116559	116564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232176
2623	NC_021872	TAA	2	6	116629	116634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232176
2624	NC_021872	GGT	2	6	116648	116653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232176
2625	NC_021872	CTTAA	2	10	116705	116714	40 %	40 %	0 %	20 %	526232176
2626	NC_021872	ATG	2	6	116769	116774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232176
2627	NC_021872	CTC	2	6	116860	116865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232176
2628	NC_021872	ACG	2	6	117036	117041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232176
2629	NC_021872	TTAA	2	8	117047	117054	50 %	50 %	0 %	0 %	526232176
2630	NC_021872	ACT	2	6	117083	117088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232176
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2634	NC_021872	TAC	2	6	117329	117334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232176
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2636	NC_021872	TCA	2	6	117467	117472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232176
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2640	NC_021872	CAG	2	6	117612	117617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232176
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2642	NC_021872	GGT	2	6	117683	117688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232176
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2654	NC_021872	CAT	2	6	118278	118283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232176
2655	NC_021872	TAC	2	6	118285	118290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232176
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2657	NC_021872	TAC	2	6	118333	118338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232176
2658	NC_021872	GTAACT	2	12	118439	118450	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526232176
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2663	NC_021872	GCT	2	6	118607	118612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232176
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2744	NC_021872	CAG	2	6	123534	123539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232176
2745	NC_021872	TAA	2	6	123619	123624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232176
2746	NC_021872	TAC	2	6	123742	123747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232176
2747	NC_021872	AAGGT	2	10	123753	123762	40 %	20 %	40 %	0 %	526232176
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2758	NC_021872	TCA	2	6	124512	124517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2759	NC_021872	T	6	6	124538	124543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2760	NC_021872	TTAT	2	8	124547	124554	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2761	NC_021872	GATA	2	8	124575	124582	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2762	NC_021872	ATAA	2	8	124690	124697	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2763	NC_021872	TTC	2	6	124732	124737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2764	NC_021872	TAA	2	6	124756	124761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2765	NC_021872	A	6	6	124777	124782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2766	NC_021872	AT	3	6	124794	124799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2767	NC_021872	CAA	2	6	124811	124816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2768	NC_021872	T	7	7	124869	124875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2769	NC_021872	TA	3	6	124885	124890	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2770	NC_021872	TAT	2	6	124929	124934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2771	NC_021872	TCAA	2	8	124942	124949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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2775	NC_021872	TGC	2	6	125090	125095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
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2779	NC_021872	AGCA	2	8	125192	125199	50 %	0 %	25 %	25 %	526232177
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2863	NC_021872	AACA	2	8	129304	129311	75 %	0 %	0 %	25 %	526232177
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2865	NC_021872	AAT	3	9	129402	129410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232177
2866	NC_021872	CAC	2	6	129484	129489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232177
2867	NC_021872	TAC	2	6	129554	129559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2868	NC_021872	GAC	2	6	129681	129686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2869	NC_021872	TAAC	2	8	129748	129755	50 %	25 %	0 %	25 %	526232177
2870	NC_021872	ACT	2	6	129780	129785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
2871	NC_021872	A	6	6	129808	129813	100 %	0 %	0 %	0 %	526232177
2872	NC_021872	TAC	2	6	129852	129857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
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2875	NC_021872	ACT	2	6	130023	130028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232177
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2880	NC_021872	CAG	2	6	130429	130434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232177
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2883	NC_021872	CTG	2	6	130630	130635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2884	NC_021872	CTG	2	6	130639	130644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
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2893	NC_021872	CTG	2	6	131326	131331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
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2984	NC_021872	ATT	2	6	137694	137699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232177
2985	NC_021872	CTG	2	6	137719	137724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2986	NC_021872	CAA	2	6	137811	137816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232177
2987	NC_021872	TTAC	2	8	137833	137840	25 %	50 %	0 %	25 %	526232177
2988	NC_021872	CCAA	2	8	137931	137938	50 %	0 %	0 %	50 %	526232177
2989	NC_021872	GTT	2	6	138030	138035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526232177
2990	NC_021872	ACG	2	6	138039	138044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2991	NC_021872	AAG	2	6	138183	138188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232177
2992	NC_021872	AAT	2	6	138210	138215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232177
2993	NC_021872	GCT	2	6	138219	138224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232177
2994	NC_021872	GAAA	2	8	138271	138278	75 %	0 %	25 %	0 %	526232177
2995	NC_021872	AGA	2	6	138287	138292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232177
2996	NC_021872	CAA	2	6	138414	138419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2997	NC_021872	T	6	6	138462	138467	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2998	NC_021872	GAT	2	6	138487	138492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2999	NC_021872	CATTT	2	10	138537	138546	20 %	60 %	0 %	20 %	526232178
3000	NC_021872	A	6	6	138559	138564	100 %	0 %	0 %	0 %	526232178

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