MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021872	GCT	2	6	65239	65244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230767
1502	NC_021872	CAG	2	6	65345	65350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230767
1503	NC_021872	ATG	2	6	65351	65356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1504	NC_021872	ACC	2	6	65380	65385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230767
1505	NC_021872	TGCTAA	2	12	65413	65424	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230767
1506	NC_021872	GGT	2	6	65438	65443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230767
1507	NC_021872	GAT	2	6	65453	65458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1508	NC_021872	AGCT	2	8	65460	65467	25 %	25 %	25 %	25 %	526230767
1509	NC_021872	GAA	2	6	65468	65473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230767
1510	NC_021872	TA	3	6	65475	65480	50 %	50 %	0 %	0 %	526230767
1511	NC_021872	A	6	6	65509	65514	100 %	0 %	0 %	0 %	526230767
1512	NC_021872	CTT	2	6	65539	65544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230767
1513	NC_021872	AATT	2	8	65620	65627	50 %	50 %	0 %	0 %	526230767
1514	NC_021872	CGG	2	6	65633	65638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230767
1515	NC_021872	CAA	2	6	65642	65647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230767
1516	NC_021872	CCA	2	6	65714	65719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230767
1517	NC_021872	GAC	2	6	65720	65725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230767
1518	NC_021872	TGA	2	6	65826	65831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1519	NC_021872	TGG	2	6	65865	65870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230767
1520	NC_021872	ATT	2	6	65917	65922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230767
1521	NC_021872	ACG	2	6	65955	65960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230767
1522	NC_021872	AAC	2	6	66033	66038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230767
1523	NC_021872	ACG	2	6	66069	66074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230767
1524	NC_021872	TTA	2	6	66103	66108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230767
1525	NC_021872	GAA	2	6	66110	66115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230767
1526	NC_021872	TAA	2	6	66124	66129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230767
1527	NC_021872	CAAC	2	8	66134	66141	50 %	0 %	0 %	50 %	526230767
1528	NC_021872	ATG	2	6	66156	66161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1529	NC_021872	AGA	2	6	66184	66189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230767
1530	NC_021872	GAT	2	6	66203	66208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1531	NC_021872	GAT	2	6	66229	66234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1532	NC_021872	GAAC	2	8	66335	66342	50 %	0 %	25 %	25 %	526230767
1533	NC_021872	TAA	2	6	66352	66357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230767
1534	NC_021872	TAA	2	6	66376	66381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230767
1535	NC_021872	ATG	2	6	66405	66410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1536	NC_021872	ATG	2	6	66446	66451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1537	NC_021872	TTG	2	6	66455	66460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230767
1538	NC_021872	CAA	2	6	66479	66484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230767
1539	NC_021872	TAAC	2	8	66528	66535	50 %	25 %	0 %	25 %	526230767
1540	NC_021872	TAC	2	6	66578	66583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230767
1541	NC_021872	GCT	2	6	66584	66589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230767
1542	NC_021872	CTT	2	6	66641	66646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230767
1543	NC_021872	CTT	2	6	66688	66693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230767
1544	NC_021872	GCTT	2	8	66696	66703	0 %	50 %	25 %	25 %	526230767
1545	NC_021872	TTG	2	6	66738	66743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230767
1546	NC_021872	CCA	2	6	66808	66813	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230767
1547	NC_021872	GCAA	2	8	66817	66824	50 %	0 %	25 %	25 %	526230767
1548	NC_021872	AGC	2	6	67054	67059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230767
1549	NC_021872	GAT	2	6	67112	67117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1550	NC_021872	CGC	2	6	67137	67142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526230767
1551	NC_021872	TTA	2	6	67239	67244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230767
1552	NC_021872	GAA	2	6	67259	67264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230767
1553	NC_021872	TTG	2	6	67281	67286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230767
1554	NC_021872	CAA	2	6	67418	67423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230767
1555	NC_021872	AGA	2	6	67447	67452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230767
1556	NC_021872	GGC	2	6	67486	67491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230767
1557	NC_021872	CTA	2	6	67665	67670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230767
1558	NC_021872	AAC	2	6	67672	67677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230767
1559	NC_021872	CAA	3	9	67757	67765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230767
1560	NC_021872	ATA	2	6	67794	67799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230767
1561	NC_021872	ACT	2	6	67829	67834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230767
1562	NC_021872	TGA	2	6	67897	67902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1563	NC_021872	TTG	2	6	67923	67928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230767
1564	NC_021872	TAG	2	6	67947	67952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1565	NC_021872	GCA	2	6	67979	67984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230767
1566	NC_021872	AGA	2	6	68034	68039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230767
1567	NC_021872	ATC	2	6	68061	68066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230767
1568	NC_021872	ATT	2	6	68104	68109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230767
1569	NC_021872	TGA	3	9	68128	68136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230767
1570	NC_021872	A	6	6	68173	68178	100 %	0 %	0 %	0 %	526230767
1571	NC_021872	ATT	2	6	68189	68194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230767
1572	NC_021872	AAG	2	6	68292	68297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230767
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1574	NC_021872	A	6	6	68481	68486	100 %	0 %	0 %	0 %	526230768
1575	NC_021872	CGA	2	6	68502	68507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230768
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1577	NC_021872	TTA	2	6	68636	68641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230768
1578	NC_021872	CGAC	2	8	68706	68713	25 %	0 %	25 %	50 %	526230768
1579	NC_021872	GCG	2	6	68900	68905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230768
1580	NC_021872	ATC	2	6	68922	68927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230768
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1582	NC_021872	TCTT	2	8	68946	68953	0 %	75 %	0 %	25 %	526230768
1583	NC_021872	ATC	3	9	69018	69026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230768
1584	NC_021872	ACA	2	6	69085	69090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230768
1585	NC_021872	TTGT	2	8	69108	69115	0 %	75 %	25 %	0 %	526230768
1586	NC_021872	TGA	2	6	69118	69123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230768
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1588	NC_021872	AATTT	2	10	69159	69168	40 %	60 %	0 %	0 %	526230768
1589	NC_021872	TTAA	2	8	69209	69216	50 %	50 %	0 %	0 %	526230768
1590	NC_021872	AAG	2	6	69219	69224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230768
1591	NC_021872	CAA	2	6	69257	69262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230768
1592	NC_021872	AGA	2	6	69286	69291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230768
1593	NC_021872	AAAT	2	8	69315	69322	75 %	25 %	0 %	0 %	526230768
1594	NC_021872	CT	3	6	69361	69366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1598	NC_021872	G	6	6	69728	69733	0 %	0 %	100 %	0 %	526230769
1599	NC_021872	TCCT	2	8	69762	69769	0 %	50 %	0 %	50 %	526230769
1600	NC_021872	GGAAC	2	10	69795	69804	40 %	0 %	40 %	20 %	526230769
1601	NC_021872	ATGCA	2	10	69813	69822	40 %	20 %	20 %	20 %	526230769
1602	NC_021872	CTG	2	6	69870	69875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230769
1603	NC_021872	CAA	2	6	69911	69916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230769
1604	NC_021872	TGA	2	6	69930	69935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230769
1605	NC_021872	CCA	2	6	69937	69942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230769
1606	NC_021872	ACTGTA	2	12	70019	70030	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230769
1607	NC_021872	CAC	2	6	70044	70049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230769
1608	NC_021872	ATG	2	6	70140	70145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230769
1609	NC_021872	TCAA	2	8	70182	70189	50 %	25 %	0 %	25 %	526230769
1610	NC_021872	GTT	2	6	70229	70234	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230769
1611	NC_021872	AAG	2	6	70280	70285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230769
1612	NC_021872	A	6	6	70291	70296	100 %	0 %	0 %	0 %	526230769
1613	NC_021872	CAG	2	6	70298	70303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230769
1614	NC_021872	GGC	2	6	70306	70311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230769
1615	NC_021872	TGTC	2	8	70363	70370	0 %	50 %	25 %	25 %	526230769
1616	NC_021872	GC	3	6	70452	70457	0 %	0 %	50 %	50 %	526230769
1617	NC_021872	GAT	2	6	70471	70476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230769
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1619	NC_021872	TG	3	6	70521	70526	0 %	50 %	50 %	0 %	526230769
1620	NC_021872	T	6	6	70620	70625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_021872	T	6	6	70640	70645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_021872	TTA	2	6	70649	70654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_021872	AAT	2	6	70671	70676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_021872	TAA	2	6	70713	70718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_021872	CAA	2	6	70774	70779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_021872	ATT	2	6	70793	70798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021872	CAA	2	6	70806	70811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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