MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021872	ATA	2	6	45043	45048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232168
1003	NC_021872	TAG	2	6	45055	45060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232168
1004	NC_021872	TAT	2	6	45095	45100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232168
1005	NC_021872	T	6	6	45120	45125	0 %	100 %	0 %	0 %	526232168
1006	NC_021872	CTC	2	6	45172	45177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526232168
1007	NC_021872	TTGG	2	8	45186	45193	0 %	50 %	50 %	0 %	526232168
1008	NC_021872	T	6	6	45198	45203	0 %	100 %	0 %	0 %	526232168
1009	NC_021872	AAG	2	6	45238	45243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232168
1010	NC_021872	ATT	2	6	45266	45271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232168
1011	NC_021872	TTA	2	6	45273	45278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232168
1012	NC_021872	ATT	2	6	45291	45296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232168
1013	NC_021872	AGT	2	6	45309	45314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232168
1014	NC_021872	ATTCAG	2	12	45339	45350	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526232168
1015	NC_021872	AT	3	6	45476	45481	50 %	50 %	0 %	0 %	526232168
1016	NC_021872	ATT	2	6	45512	45517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232168
1017	NC_021872	TTC	2	6	45526	45531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232168
1018	NC_021872	AAAATC	2	12	45582	45593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	526232168
1019	NC_021872	TAG	2	6	45634	45639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232168
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1021	NC_021872	TTAATA	2	12	45850	45861	50 %	50 %	0 %	0 %	526232168
1022	NC_021872	ATG	2	6	45940	45945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232168
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1024	NC_021872	ATT	2	6	45984	45989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232168
1025	NC_021872	ATT	2	6	46036	46041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232169
1026	NC_021872	ATG	2	6	46049	46054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232169
1027	NC_021872	TA	3	6	46069	46074	50 %	50 %	0 %	0 %	526232169
1028	NC_021872	TATGA	2	10	46123	46132	40 %	40 %	20 %	0 %	526232169
1029	NC_021872	AGG	2	6	46160	46165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232169
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1033	NC_021872	A	6	6	46359	46364	100 %	0 %	0 %	0 %	526232169
1034	NC_021872	AT	3	6	46416	46421	50 %	50 %	0 %	0 %	526232169
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1036	NC_021872	TGA	2	6	46512	46517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232169
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1039	NC_021872	TAG	2	6	46613	46618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232169
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1041	NC_021872	T	6	6	46920	46925	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_021872	AAAGT	2	10	47009	47018	60 %	20 %	20 %	0 %	526232170
1043	NC_021872	GCAA	2	8	47099	47106	50 %	0 %	25 %	25 %	526232170
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1047	NC_021872	TC	3	6	47203	47208	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_021872	T	6	6	47217	47222	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1054	NC_021872	ATG	2	6	47513	47518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230758
1055	NC_021872	TCA	2	6	47566	47571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230758
1056	NC_021872	CTG	2	6	47597	47602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230758
1057	NC_021872	GTT	2	6	47617	47622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230758
1058	NC_021872	CCT	2	6	47663	47668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_021872	TCC	2	6	47749	47754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230759
1060	NC_021872	TCA	2	6	47766	47771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230759
1061	NC_021872	CAT	2	6	47772	47777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230759
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1067	NC_021872	GGC	2	6	47950	47955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230759
1068	NC_021872	CAG	2	6	48036	48041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230759
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1100	NC_021872	TAG	2	6	49561	49566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230760
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1104	NC_021872	T	6	6	49889	49894	0 %	100 %	0 %	0 %	526230760
1105	NC_021872	AGT	2	6	49895	49900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230760
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1108	NC_021872	A	6	6	49940	49945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_021872	CTT	2	6	49980	49985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_021872	CTG	2	6	50062	50067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021872	AGA	2	6	50095	50100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021872	TCA	2	6	50134	50139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021872	TCC	2	6	50145	50150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_021872	ATT	2	6	50164	50169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1118	NC_021872	TTGA	2	8	50205	50212	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1122	NC_021872	ATA	2	6	50259	50264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_021872	ATT	2	6	50284	50289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021872	TTTAA	2	10	50298	50307	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_021872	T	8	8	50329	50336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021872	T	7	7	50338	50344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021872	T	6	6	50351	50356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021872	ATA	2	6	50381	50386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021872	ATT	2	6	50431	50436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230761
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1131	NC_021872	ATATT	2	10	50721	50730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_021872	GAG	2	6	50736	50741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_021872	ATGA	2	8	50787	50794	50 %	25 %	25 %	0 %	526230762
1134	NC_021872	AGA	2	6	50879	50884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230762
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1243	NC_021872	TTA	2	6	54966	54971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_021872	TTAC	2	8	55119	55126	25 %	50 %	0 %	25 %	526230763
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1256	NC_021872	CTA	2	6	55329	55334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230763
1257	NC_021872	GCT	2	6	55361	55366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1258	NC_021872	CAA	3	9	55379	55387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1259	NC_021872	CAA	3	9	55397	55405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1260	NC_021872	GCA	2	6	55424	55429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1261	NC_021872	GCT	2	6	55463	55468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1262	NC_021872	CAA	2	6	55475	55480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1263	NC_021872	CAA	2	6	55508	55513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1264	NC_021872	CAAGC	2	10	55542	55551	40 %	0 %	20 %	40 %	526230763
1265	NC_021872	GCT	3	9	55556	55564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1266	NC_021872	AAT	2	6	55565	55570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1267	NC_021872	TGCTAA	2	12	55684	55695	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230763
1268	NC_021872	ACT	2	6	55715	55720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230763
1269	NC_021872	ATG	2	6	55722	55727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1270	NC_021872	TTA	2	6	55873	55878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230763
1271	NC_021872	GCT	2	6	55916	55921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1272	NC_021872	ATG	2	6	55983	55988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1273	NC_021872	CTG	2	6	56016	56021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1274	NC_021872	TAA	2	6	56131	56136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1275	NC_021872	ATG	2	6	56139	56144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1276	NC_021872	AGTA	2	8	56173	56180	50 %	25 %	25 %	0 %	526230763
1277	NC_021872	GTT	2	6	56210	56215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230763
1278	NC_021872	ATA	3	9	56241	56249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1279	NC_021872	TAG	2	6	56293	56298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1280	NC_021872	ATT	2	6	56300	56305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230763
1281	NC_021872	AAT	2	6	56306	56311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1282	NC_021872	ACT	2	6	56390	56395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230763
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1284	NC_021872	AC	3	6	56486	56491	50 %	0 %	0 %	50 %	526230763
1285	NC_021872	CTT	2	6	56513	56518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230763
1286	NC_021872	TGA	2	6	56563	56568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1287	NC_021872	CAT	2	6	56613	56618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230763
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1289	NC_021872	TAACT	2	10	56665	56674	40 %	40 %	0 %	20 %	526230763
1290	NC_021872	AAG	2	6	56676	56681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230763
1291	NC_021872	TAA	2	6	56758	56763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1292	NC_021872	AAC	2	6	56826	56831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1293	NC_021872	GCACAA	2	12	56852	56863	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	526230763
1294	NC_021872	AGCT	2	8	56896	56903	25 %	25 %	25 %	25 %	526230763
1295	NC_021872	AAC	2	6	56916	56921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230763
1296	NC_021872	ATG	2	6	56928	56933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1297	NC_021872	ATG	2	6	56958	56963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230763
1298	NC_021872	TGC	2	6	56995	57000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
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1300	NC_021872	GCT	2	6	57089	57094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1301	NC_021872	TGC	2	6	57103	57108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1302	NC_021872	GCT	2	6	57284	57289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
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1306	NC_021872	TGT	2	6	57388	57393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230763
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1312	NC_021872	TGC	2	6	57643	57648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
1313	NC_021872	TAC	2	6	57649	57654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230763
1314	NC_021872	AAT	2	6	57656	57661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230763
1315	NC_021872	CTG	2	6	57687	57692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230763
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1319	NC_021872	ATC	2	6	57784	57789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230763
1320	NC_021872	TCT	2	6	57806	57811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230763
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1322	NC_021872	AAG	2	6	57875	57880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230763
1323	NC_021872	TAA	2	6	57904	57909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1324	NC_021872	ACA	2	6	57912	57917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1325	NC_021872	ATCA	2	8	57985	57992	50 %	25 %	0 %	25 %	526230764
1326	NC_021872	ATT	3	9	58006	58014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230764
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1329	NC_021872	TGC	2	6	58133	58138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230764
1330	NC_021872	TGC	2	6	58149	58154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230764
1331	NC_021872	CTG	2	6	58253	58258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230764
1332	NC_021872	GTT	2	6	58296	58301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230764
1333	NC_021872	TAT	2	6	58374	58379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230764
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1335	NC_021872	GTTT	2	8	58396	58403	0 %	75 %	25 %	0 %	526230764
1336	NC_021872	CAT	2	6	58491	58496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230764
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1339	NC_021872	AT	3	6	58546	58551	50 %	50 %	0 %	0 %	526230764
1340	NC_021872	ATT	2	6	58559	58564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230764
1341	NC_021872	TCC	2	6	58566	58571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	526230764
1342	NC_021872	TAA	2	6	58578	58583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230764
1343	NC_021872	AGAA	2	8	58644	58651	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1344	NC_021872	AATGA	2	10	58676	58685	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1345	NC_021872	GGA	2	6	58688	58693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1346	NC_021872	ATT	2	6	58718	58723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230765
1347	NC_021872	TGG	2	6	58724	58729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230765
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1349	NC_021872	TTTAT	2	10	58853	58862	20 %	80 %	0 %	0 %	526230765
1350	NC_021872	AAAAGC	2	12	58947	58958	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	526230765
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1352	NC_021872	CAT	2	6	59017	59022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230765
1353	NC_021872	TGA	2	6	59038	59043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230765
1354	NC_021872	TGA	2	6	59113	59118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230765
1355	NC_021872	GCA	2	6	59123	59128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230765
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1359	NC_021872	TTG	2	6	59382	59387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230765
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1361	NC_021872	CGG	2	6	59494	59499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230765
1362	NC_021872	AAGAT	2	10	59562	59571	60 %	20 %	20 %	0 %	526230765
1363	NC_021872	ATC	2	6	59580	59585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230765
1364	NC_021872	CCAA	2	8	59593	59600	50 %	0 %	0 %	50 %	526230765
1365	NC_021872	TTGCA	2	10	59619	59628	20 %	40 %	20 %	20 %	526230765
1366	NC_021872	A	6	6	59661	59666	100 %	0 %	0 %	0 %	526230765
1367	NC_021872	TAAT	2	8	59688	59695	50 %	50 %	0 %	0 %	526230765
1368	NC_021872	CGA	2	6	59740	59745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230765
1369	NC_021872	TTA	2	6	59887	59892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230765
1370	NC_021872	ATG	2	6	59924	59929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230765
1371	NC_021872	TTAAA	2	10	59982	59991	60 %	40 %	0 %	0 %	526230765
1372	NC_021872	TTTA	2	8	60008	60015	25 %	75 %	0 %	0 %	526230765
1373	NC_021872	CTG	2	6	60143	60148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230765
1374	NC_021872	TC	3	6	60197	60202	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1375	NC_021872	ACGA	2	8	60219	60226	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1376	NC_021872	AAT	2	6	60245	60250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1377	NC_021872	ATT	2	6	60339	60344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1378	NC_021872	AT	3	6	60369	60374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1379	NC_021872	CAG	2	6	60460	60465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230766
1380	NC_021872	ATC	2	6	60472	60477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230766
1381	NC_021872	TTGA	2	8	60486	60493	25 %	50 %	25 %	0 %	526230766
1382	NC_021872	CTG	2	6	60523	60528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230766
1383	NC_021872	TAT	2	6	60540	60545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230766
1384	NC_021872	GCTT	2	8	60671	60678	0 %	50 %	25 %	25 %	526230766
1385	NC_021872	ACA	2	6	60713	60718	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230766
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1499	NC_021872	TACT	2	8	65191	65198	25 %	50 %	0 %	25 %	526230767
1500	NC_021872	AGA	2	6	65233	65238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230767

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