MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021872	A	6	6	24383	24388	100 %	0 %	0 %	0 %	526230744
502	NC_021872	A	6	6	24390	24395	100 %	0 %	0 %	0 %	526230744
503	NC_021872	AAGA	2	8	24420	24427	75 %	0 %	25 %	0 %	526230744
504	NC_021872	ATA	2	6	24472	24477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230744
505	NC_021872	TGG	2	6	24509	24514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230744
506	NC_021872	ACA	2	6	24522	24527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230744
507	NC_021872	TTC	2	6	24621	24626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230744
508	NC_021872	AAG	2	6	24641	24646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230744
509	NC_021872	AGG	2	6	24656	24661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230744
510	NC_021872	TGG	2	6	24707	24712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230744
511	NC_021872	GAG	2	6	24783	24788	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230744
512	NC_021872	GAT	2	6	24798	24803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230744
513	NC_021872	GAA	2	6	24804	24809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230744
514	NC_021872	GCAA	2	8	24825	24832	50 %	0 %	25 %	25 %	526230745
515	NC_021872	GTT	2	6	24844	24849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230745
516	NC_021872	CTT	2	6	24853	24858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230745
517	NC_021872	TTCAT	2	10	24865	24874	20 %	60 %	0 %	20 %	526230745
518	NC_021872	ACCA	2	8	24886	24893	50 %	0 %	0 %	50 %	526230745
519	NC_021872	CACGA	2	10	24911	24920	40 %	0 %	20 %	40 %	526230745
520	NC_021872	AAT	2	6	24928	24933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230745
521	NC_021872	CAA	2	6	24943	24948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230745
522	NC_021872	CAAT	2	8	24958	24965	50 %	25 %	0 %	25 %	526230745
523	NC_021872	TAATT	2	10	25044	25053	40 %	60 %	0 %	0 %	526230745
524	NC_021872	A	7	7	25062	25068	100 %	0 %	0 %	0 %	526230745
525	NC_021872	TGT	2	6	25101	25106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230745
526	NC_021872	CAAA	2	8	25107	25114	75 %	0 %	0 %	25 %	526230745
527	NC_021872	CGG	2	6	25147	25152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230745
528	NC_021872	TACT	2	8	25288	25295	25 %	50 %	0 %	25 %	526230745
529	NC_021872	ACC	2	6	25301	25306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230745
530	NC_021872	GT	3	6	25313	25318	0 %	50 %	50 %	0 %	526230745
531	NC_021872	GGATC	2	10	25377	25386	20 %	20 %	40 %	20 %	526230745
532	NC_021872	ATT	2	6	25402	25407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230745
533	NC_021872	ATG	2	6	25423	25428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230745
534	NC_021872	AC	3	6	25521	25526	50 %	0 %	0 %	50 %	526230745
535	NC_021872	ACC	2	6	25558	25563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230745
536	NC_021872	TCG	2	6	25581	25586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230745
537	NC_021872	CAA	2	6	25655	25660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230745
538	NC_021872	TAA	2	6	25683	25688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230745
539	NC_021872	GAC	2	6	25692	25697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230745
540	NC_021872	ATG	2	6	25727	25732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230745
541	NC_021872	GTGA	2	8	25735	25742	25 %	25 %	50 %	0 %	526230745
542	NC_021872	GTC	2	6	25748	25753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230745
543	NC_021872	CAAC	2	8	25949	25956	50 %	0 %	0 %	50 %	526230745
544	NC_021872	TGT	2	6	26019	26024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230745
545	NC_021872	AGG	2	6	26093	26098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230745
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547	NC_021872	TTG	2	6	26165	26170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230746
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549	NC_021872	TAA	2	6	26283	26288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230746
550	NC_021872	GCA	2	6	26289	26294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230746
551	NC_021872	ATATT	2	10	26301	26310	40 %	60 %	0 %	0 %	526230746
552	NC_021872	GAAA	2	8	26315	26322	75 %	0 %	25 %	0 %	526230746
553	NC_021872	TCTT	2	8	26382	26389	0 %	75 %	0 %	25 %	526230746
554	NC_021872	ATG	2	6	26441	26446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230746
555	NC_021872	A	6	6	26469	26474	100 %	0 %	0 %	0 %	526230746
556	NC_021872	ATG	2	6	26582	26587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230746
557	NC_021872	ACTT	2	8	26641	26648	25 %	50 %	0 %	25 %	526230746
558	NC_021872	TAA	2	6	26736	26741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230746
559	NC_021872	GGT	2	6	26753	26758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230746
560	NC_021872	ACT	3	9	26788	26796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230746
561	NC_021872	GAT	2	6	26797	26802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230746
562	NC_021872	CAA	2	6	26863	26868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230746
563	NC_021872	ATA	2	6	26939	26944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230746
564	NC_021872	GAG	2	6	26952	26957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_021872	ACC	2	6	27046	27051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230747
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567	NC_021872	GATC	2	8	27111	27118	25 %	25 %	25 %	25 %	526230747
568	NC_021872	TGGTGT	2	12	27173	27184	0 %	50 %	50 %	0 %	526230747
569	NC_021872	ATGGA	2	10	27199	27208	40 %	20 %	40 %	0 %	526230747
570	NC_021872	GGCA	2	8	27232	27239	25 %	0 %	50 %	25 %	526230747
571	NC_021872	ATT	2	6	27282	27287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230747
572	NC_021872	ATG	2	6	27346	27351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230747
573	NC_021872	CAC	2	6	27378	27383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230747
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577	NC_021872	TGA	2	6	27586	27591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230747
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597	NC_021872	TTC	2	6	28213	28218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230748
598	NC_021872	ATA	2	6	28224	28229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230748
599	NC_021872	AAG	2	6	28268	28273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230748
600	NC_021872	TGT	2	6	28291	28296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230748
601	NC_021872	TAA	2	6	28300	28305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230748
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606	NC_021872	AATT	2	8	28675	28682	50 %	50 %	0 %	0 %	526230748
607	NC_021872	ATT	2	6	28763	28768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230748
608	NC_021872	TTAA	2	8	28775	28782	50 %	50 %	0 %	0 %	526230748
609	NC_021872	TGG	2	6	28821	28826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230748
610	NC_021872	CAA	2	6	28875	28880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230748
611	NC_021872	ATG	2	6	28953	28958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230748
612	NC_021872	GGC	2	6	29008	29013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230748
613	NC_021872	TA	3	6	29016	29021	50 %	50 %	0 %	0 %	526230748
614	NC_021872	TAC	2	6	29054	29059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230748
615	NC_021872	CAA	2	6	29069	29074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230748
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618	NC_021872	CAA	2	6	29132	29137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230748
619	NC_021872	ATA	2	6	29139	29144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230748
620	NC_021872	AATG	2	8	29148	29155	50 %	25 %	25 %	0 %	526230748
621	NC_021872	T	6	6	29186	29191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021872	TTAA	2	8	29205	29212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
623	NC_021872	TGG	2	6	29246	29251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230749
624	NC_021872	AAT	2	6	29260	29265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230749
625	NC_021872	GTA	2	6	29305	29310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230749
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627	NC_021872	AGA	2	6	29340	29345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230749
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629	NC_021872	ACTTGA	2	12	29469	29480	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	526230749
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