MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021872	GGAC	2	8	252521	252528	25 %	0 %	50 %	25 %	526232196
5502	NC_021872	TGG	2	6	252536	252541	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232196
5503	NC_021872	CAA	2	6	252758	252763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232196
5504	NC_021872	A	6	6	252770	252775	100 %	0 %	0 %	0 %	526232196
5505	NC_021872	TGG	2	6	252847	252852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232196
5506	NC_021872	TTC	2	6	252963	252968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232196
5507	NC_021872	ACC	2	6	252976	252981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232196
5508	NC_021872	TTA	2	6	252987	252992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232196
5509	NC_021872	GAT	2	6	253021	253026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232196
5510	NC_021872	AGC	2	6	253063	253068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232196
5511	NC_021872	AGA	2	6	253081	253086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232196
5512	NC_021872	CGG	2	6	253187	253192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5513	NC_021872	TCT	2	6	253269	253274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_021872	TAA	2	6	253295	253300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5515	NC_021872	GGA	2	6	253370	253375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_021872	TTGC	2	8	253412	253419	0 %	50 %	25 %	25 %	526230879
5517	NC_021872	GTC	2	6	253443	253448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230879
5518	NC_021872	ATG	2	6	253535	253540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230879
5519	NC_021872	TTA	2	6	253563	253568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230879
5520	NC_021872	A	7	7	253612	253618	100 %	0 %	0 %	0 %	526230879
5521	NC_021872	TGT	3	9	253633	253641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230879
5522	NC_021872	ACA	2	6	253745	253750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230879
5523	NC_021872	AGC	2	6	253825	253830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230879
5524	NC_021872	GAT	2	6	253838	253843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230879
5525	NC_021872	ATT	2	6	253844	253849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230879
5526	NC_021872	TGA	2	6	253869	253874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230879
5527	NC_021872	AGC	2	6	253892	253897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230879
5528	NC_021872	TGG	2	6	253960	253965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230879
5529	NC_021872	GAT	2	6	254053	254058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230879
5530	NC_021872	CTT	2	6	254119	254124	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230879
5531	NC_021872	GTT	2	6	254162	254167	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230879
5532	NC_021872	ATA	2	6	254247	254252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230879
5533	NC_021872	TGT	2	6	254365	254370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230879
5534	NC_021872	GTG	2	6	254391	254396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230879
5535	NC_021872	GATT	2	8	254403	254410	25 %	50 %	25 %	0 %	526230879
5536	NC_021872	TCT	2	6	254437	254442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230879
5537	NC_021872	TAT	2	6	254453	254458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230879
5538	NC_021872	ATT	2	6	254477	254482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230879
5539	NC_021872	ATTT	2	8	254503	254510	25 %	75 %	0 %	0 %	526230879
5540	NC_021872	CCA	2	6	254640	254645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230880
5541	NC_021872	TGA	2	6	254731	254736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230880
5542	NC_021872	CAG	2	6	254765	254770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230880
5543	NC_021872	AGC	2	6	254788	254793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230880
5544	NC_021872	TA	3	6	254907	254912	50 %	50 %	0 %	0 %	526230880
5545	NC_021872	CTT	2	6	254919	254924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230880
5546	NC_021872	AATG	2	8	254929	254936	50 %	25 %	25 %	0 %	526230880
5547	NC_021872	A	6	6	255055	255060	100 %	0 %	0 %	0 %	526230880
5548	NC_021872	TGA	2	6	255127	255132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230880
5549	NC_021872	ATA	2	6	255177	255182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230880
5550	NC_021872	CAA	2	6	255189	255194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230880
5551	NC_021872	AAT	2	6	255362	255367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230880
5552	NC_021872	GAAA	2	8	255410	255417	75 %	0 %	25 %	0 %	526230880
5553	NC_021872	TCG	2	6	255448	255453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230880
5554	NC_021872	ATT	2	6	255481	255486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230880
5555	NC_021872	GAA	2	6	255497	255502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230880
5556	NC_021872	TGT	2	6	255529	255534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230880
5557	NC_021872	TGA	2	6	255601	255606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230880
5558	NC_021872	TTTTC	2	10	255642	255651	0 %	80 %	0 %	20 %	526230880
5559	NC_021872	CTG	2	6	255702	255707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230880
5560	NC_021872	AGTT	2	8	255711	255718	25 %	50 %	25 %	0 %	526230880
5561	NC_021872	GCG	2	6	255751	255756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230880
5562	NC_021872	A	6	6	255773	255778	100 %	0 %	0 %	0 %	526230880
5563	NC_021872	ACA	2	6	255814	255819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230880
5564	NC_021872	AAG	2	6	255839	255844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230880
5565	NC_021872	TGA	2	6	255850	255855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230880
5566	NC_021872	ACG	2	6	255907	255912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230880
5567	NC_021872	TAA	2	6	255940	255945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230880
5568	NC_021872	ATA	2	6	255972	255977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230880
5569	NC_021872	CAA	2	6	256029	256034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230880
5570	NC_021872	ATGC	2	8	256082	256089	25 %	25 %	25 %	25 %	526230880
5571	NC_021872	TGATT	2	10	256111	256120	20 %	60 %	20 %	0 %	526230880
5572	NC_021872	GGACA	2	10	256125	256134	40 %	0 %	40 %	20 %	526230880
5573	NC_021872	TATT	2	8	256155	256162	25 %	75 %	0 %	0 %	526230880
5574	NC_021872	ATT	2	6	256176	256181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230880
5575	NC_021872	GGA	2	6	256282	256287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230880
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5577	NC_021872	CTAAT	2	10	256329	256338	40 %	40 %	0 %	20 %	526230880
5578	NC_021872	CGG	2	6	256346	256351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230880
5579	NC_021872	ACG	2	6	256364	256369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230880
5580	NC_021872	TTG	2	6	256394	256399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230880
5581	NC_021872	GATAA	2	10	256409	256418	60 %	20 %	20 %	0 %	526230880
5582	NC_021872	GAAA	2	8	256437	256444	75 %	0 %	25 %	0 %	526230880
5583	NC_021872	TTG	2	6	256451	256456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230880
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5585	NC_021872	TTA	2	6	256490	256495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230880
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5587	NC_021872	CTAA	2	8	256727	256734	50 %	25 %	0 %	25 %	526230880
5588	NC_021872	TGA	2	6	256738	256743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230880
5589	NC_021872	AAATT	2	10	256876	256885	60 %	40 %	0 %	0 %	526230880
5590	NC_021872	AAG	2	6	256910	256915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_021872	AC	3	6	256986	256991	50 %	0 %	0 %	50 %	526230881
5592	NC_021872	ATT	2	6	257039	257044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230881
5593	NC_021872	GAT	2	6	257086	257091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230881
5594	NC_021872	AGA	2	6	257101	257106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230881
5595	NC_021872	ATT	2	6	257121	257126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230881
5596	NC_021872	TTC	2	6	257147	257152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526230881
5597	NC_021872	TTG	2	6	257196	257201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230881
5598	NC_021872	CTA	2	6	257247	257252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230881
5599	NC_021872	GTG	2	6	257283	257288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526230881
5600	NC_021872	TCAT	2	8	257328	257335	25 %	50 %	0 %	25 %	526230881
5601	NC_021872	GA	3	6	257428	257433	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_021872	T	6	6	257438	257443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5603	NC_021872	TTG	2	6	257474	257479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230882
5604	NC_021872	ATC	2	6	257555	257560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230882
5605	NC_021872	AGA	2	6	257601	257606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230882
5606	NC_021872	TAG	2	6	257845	257850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526230882
5607	NC_021872	ACC	2	6	257892	257897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526230882
5608	NC_021872	GTC	2	6	257899	257904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230882
5609	NC_021872	T	7	7	258048	258054	0 %	100 %	0 %	0 %	526230882
5610	NC_021872	A	6	6	258094	258099	100 %	0 %	0 %	0 %	526230882
5611	NC_021872	TAA	2	6	258122	258127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230882
5612	NC_021872	T	7	7	258184	258190	0 %	100 %	0 %	0 %	526230882
5613	NC_021872	CAT	2	6	258202	258207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230882
5614	NC_021872	TTA	2	6	258213	258218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230882
5615	NC_021872	AGG	2	6	258227	258232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230882
5616	NC_021872	TGGTG	2	10	258255	258264	0 %	40 %	60 %	0 %	526230882
5617	NC_021872	AAT	2	6	258341	258346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230882
5618	NC_021872	GAG	2	6	258353	258358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526230882
5619	NC_021872	ATT	2	6	258443	258448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_021872	TAG	2	6	258482	258487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_021872	ATTAAA	2	12	258495	258506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5623	NC_021872	CAA	2	6	258575	258580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5993	NC_021872	TGATGT	2	12	275657	275668	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	526230898
5994	NC_021872	TAT	2	6	275669	275674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230898
5995	NC_021872	CA	3	6	275758	275763	50 %	0 %	0 %	50 %	526230898
5996	NC_021872	AGA	2	6	275821	275826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230898
5997	NC_021872	CGT	2	6	275838	275843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526230898
5998	NC_021872	GTT	2	6	275871	275876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526230898
5999	NC_021872	GAC	2	6	275877	275882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526230898
6000	NC_021872	GCG	2	6	275893	275898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526230898

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