MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Lactobacillus reuteri TD1

Total Repeats: 47540

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021872	TAT	2	6	209380	209385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4502	NC_021872	ACAT	2	8	209404	209411	50 %	25 %	0 %	25 %	526232183
4503	NC_021872	GCA	2	6	209425	209430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232183
4504	NC_021872	AATG	2	8	209554	209561	50 %	25 %	25 %	0 %	526232183
4505	NC_021872	AGA	2	6	209575	209580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232183
4506	NC_021872	TAAT	2	8	209634	209641	50 %	50 %	0 %	0 %	526232183
4507	NC_021872	ATT	2	6	209649	209654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4508	NC_021872	ACG	2	6	209734	209739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526232183
4509	NC_021872	TACTGG	2	12	209758	209769	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	526232183
4510	NC_021872	TAC	2	6	209805	209810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232183
4511	NC_021872	AAG	2	6	209822	209827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232183
4512	NC_021872	TAT	2	6	209832	209837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4513	NC_021872	GAT	2	6	209879	209884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232183
4514	NC_021872	TAAG	2	8	209898	209905	50 %	25 %	25 %	0 %	526232183
4515	NC_021872	GAA	2	6	209984	209989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232183
4516	NC_021872	ATT	2	6	210105	210110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4517	NC_021872	ATT	2	6	210183	210188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4518	NC_021872	TGA	2	6	210229	210234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232183
4519	NC_021872	CTA	2	6	210300	210305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232183
4520	NC_021872	ATT	2	6	210423	210428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4521	NC_021872	GAA	2	6	210430	210435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232183
4522	NC_021872	TAA	2	6	210451	210456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232183
4523	NC_021872	ATT	2	6	210461	210466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4524	NC_021872	TGA	2	6	210571	210576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232183
4525	NC_021872	AGTA	2	8	210620	210627	50 %	25 %	25 %	0 %	526232183
4526	NC_021872	TCCTG	2	10	210628	210637	0 %	40 %	20 %	40 %	526232183
4527	NC_021872	TTA	2	6	210653	210658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4528	NC_021872	ACT	2	6	210659	210664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526232183
4529	NC_021872	ATT	2	6	210737	210742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4530	NC_021872	GTTT	2	8	210816	210823	0 %	75 %	25 %	0 %	526232183
4531	NC_021872	GAT	3	9	210866	210874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232183
4532	NC_021872	TAA	2	6	210895	210900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232183
4533	NC_021872	A	6	6	210920	210925	100 %	0 %	0 %	0 %	526232183
4534	NC_021872	AACA	2	8	210983	210990	75 %	0 %	0 %	25 %	526232183
4535	NC_021872	ATTA	2	8	211039	211046	50 %	50 %	0 %	0 %	526232183
4536	NC_021872	CTT	2	6	211050	211055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232183
4537	NC_021872	AACA	2	8	211136	211143	75 %	0 %	0 %	25 %	526232183
4538	NC_021872	GAT	2	6	211154	211159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232183
4539	NC_021872	ATT	2	6	211190	211195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4540	NC_021872	TGA	2	6	211198	211203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232183
4541	NC_021872	TAAG	2	8	211266	211273	50 %	25 %	25 %	0 %	526232183
4542	NC_021872	GAA	2	6	211382	211387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232183
4543	NC_021872	TGG	2	6	211432	211437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232183
4544	NC_021872	ATT	2	6	211448	211453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232183
4545	NC_021872	TGG	2	6	211465	211470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232183
4546	NC_021872	ATG	2	6	211653	211658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232184
4547	NC_021872	GAT	3	9	211685	211693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232184
4548	NC_021872	ATCA	2	8	211699	211706	50 %	25 %	0 %	25 %	526232184
4549	NC_021872	ATA	2	6	211743	211748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232184
4550	NC_021872	TGA	2	6	211771	211776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232184
4551	NC_021872	TAA	2	6	211792	211797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232184
4552	NC_021872	TTA	2	6	211802	211807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232184
4553	NC_021872	CCTT	2	8	211808	211815	0 %	50 %	0 %	50 %	526232184
4554	NC_021872	TAA	2	6	211885	211890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232184
4555	NC_021872	ATG	2	6	211938	211943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232185
4556	NC_021872	ATTT	2	8	211971	211978	25 %	75 %	0 %	0 %	526232185
4557	NC_021872	AAT	2	6	212159	212164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232185
4558	NC_021872	AAAG	2	8	212221	212228	75 %	0 %	25 %	0 %	526232185
4559	NC_021872	AT	4	8	212236	212243	50 %	50 %	0 %	0 %	526232185
4560	NC_021872	ATT	2	6	212288	212293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232185
4561	NC_021872	ATG	2	6	212357	212362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232185
4562	NC_021872	TGG	2	6	212374	212379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232185
4563	NC_021872	TTA	2	6	212394	212399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232185
4564	NC_021872	AGT	2	6	212426	212431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232185
4565	NC_021872	ATT	2	6	212585	212590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232185
4566	NC_021872	GTA	2	6	212601	212606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232185
4567	NC_021872	TCT	2	6	212643	212648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526232185
4568	NC_021872	GAA	2	6	212762	212767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232185
4569	NC_021872	TGG	2	6	212768	212773	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232185
4570	NC_021872	AAT	2	6	212774	212779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232185
4571	NC_021872	GAT	2	6	212795	212800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232185
4572	NC_021872	TG	3	6	212868	212873	0 %	50 %	50 %	0 %	526232185
4573	NC_021872	GAA	2	6	212891	212896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232185
4574	NC_021872	AGA	2	6	212908	212913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232185
4575	NC_021872	AGTA	2	8	212921	212928	50 %	25 %	25 %	0 %	526232185
4576	NC_021872	AGA	2	6	212932	212937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232185
4577	NC_021872	TGAA	2	8	212949	212956	50 %	25 %	25 %	0 %	526232185
4578	NC_021872	A	6	6	212955	212960	100 %	0 %	0 %	0 %	526232185
4579	NC_021872	AGG	2	6	212997	213002	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526232185
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4581	NC_021872	ATT	2	6	213099	213104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232186
4582	NC_021872	GA	3	6	213129	213134	50 %	0 %	50 %	0 %	526232186
4583	NC_021872	AATT	2	8	213135	213142	50 %	50 %	0 %	0 %	526232186
4584	NC_021872	A	6	6	213158	213163	100 %	0 %	0 %	0 %	526232186
4585	NC_021872	GAA	2	6	213191	213196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232186
4586	NC_021872	ATT	2	6	213199	213204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232186
4587	NC_021872	AT	3	6	213286	213291	50 %	50 %	0 %	0 %	526232186
4588	NC_021872	TAA	2	6	213361	213366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232186
4589	NC_021872	ACTT	2	8	213402	213409	25 %	50 %	0 %	25 %	526232186
4590	NC_021872	TAAA	2	8	213420	213427	75 %	25 %	0 %	0 %	526232186
4591	NC_021872	A	6	6	213425	213430	100 %	0 %	0 %	0 %	526232186
4592	NC_021872	TGCT	2	8	213431	213438	0 %	50 %	25 %	25 %	526232186
4593	NC_021872	TTAA	2	8	213527	213534	50 %	50 %	0 %	0 %	526232186
4594	NC_021872	AGA	2	6	213556	213561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232186
4595	NC_021872	GCT	2	6	213650	213655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526232186
4596	NC_021872	AGA	2	6	213688	213693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232186
4597	NC_021872	TGA	2	6	213739	213744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232186
4598	NC_021872	ATG	2	6	213858	213863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232186
4599	NC_021872	AATT	2	8	213909	213916	50 %	50 %	0 %	0 %	526232186
4600	NC_021872	AAAGA	2	10	213917	213926	80 %	0 %	20 %	0 %	526232186
4601	NC_021872	TGAAAA	2	12	213961	213972	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	526232186
4602	NC_021872	AAG	2	6	214065	214070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232186
4603	NC_021872	ATA	2	6	214097	214102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232186
4604	NC_021872	A	6	6	214102	214107	100 %	0 %	0 %	0 %	526232186
4605	NC_021872	TGG	3	9	214108	214116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526232186
4606	NC_021872	A	6	6	214135	214140	100 %	0 %	0 %	0 %	526232186
4607	NC_021872	ATG	2	6	214146	214151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232186
4608	NC_021872	AT	3	6	214168	214173	50 %	50 %	0 %	0 %	526232186
4609	NC_021872	AAATTG	2	12	214224	214235	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	526232186
4610	NC_021872	TAAT	2	8	214281	214288	50 %	50 %	0 %	0 %	526232186
4611	NC_021872	ACC	2	6	214426	214431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526232186
4612	NC_021872	GAA	2	6	214436	214441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232186
4613	NC_021872	A	6	6	214467	214472	100 %	0 %	0 %	0 %	526232186
4614	NC_021872	ATGAA	2	10	214515	214524	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_021872	TAC	2	6	214532	214537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_021872	GTA	2	6	214553	214558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_021872	A	6	6	214601	214606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_021872	GTA	2	6	214608	214613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_021872	GAA	2	6	214668	214673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526232187
4620	NC_021872	ATT	2	6	214683	214688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232187
4621	NC_021872	ATT	2	6	214754	214759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232187
4622	NC_021872	ATT	2	6	214767	214772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232187
4623	NC_021872	ATG	2	6	214798	214803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232187
4624	NC_021872	AT	3	6	214805	214810	50 %	50 %	0 %	0 %	526232187
4625	NC_021872	ACA	2	6	214883	214888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526232187
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4627	NC_021872	ATT	2	6	214927	214932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526232187
4628	NC_021872	TGA	2	6	215003	215008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232187
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4632	NC_021872	A	6	6	215173	215178	100 %	0 %	0 %	0 %	526232187
4633	NC_021872	AT	3	6	215199	215204	50 %	50 %	0 %	0 %	526232187
4634	NC_021872	AT	4	8	215216	215223	50 %	50 %	0 %	0 %	526232187
4635	NC_021872	TAA	2	6	215234	215239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526232187
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4642	NC_021872	TAG	2	6	215522	215527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232187
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4648	NC_021872	GAT	2	6	215814	215819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526232187
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4653	NC_021872	A	6	6	215908	215913	100 %	0 %	0 %	0 %	526232187
4654	NC_021872	TAC	2	6	215919	215924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4655	NC_021872	GTA	2	6	215940	215945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4656	NC_021872	ATA	2	6	215960	215965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4682	NC_021872	TAA	2	6	216832	216837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4733	NC_021872	ACAA	2	8	219304	219311	75 %	0 %	0 %	25 %	526230851
4734	NC_021872	AAG	2	6	219326	219331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526230851
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4738	NC_021872	C	6	6	219470	219475	0 %	0 %	0 %	100 %	526230851
4739	NC_021872	CAAAA	2	10	219523	219532	80 %	0 %	0 %	20 %	526230851
4740	NC_021872	AAAT	2	8	219534	219541	75 %	25 %	0 %	0 %	526230851
4741	NC_021872	ATA	2	6	219572	219577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526230851
4742	NC_021872	T	6	6	219653	219658	0 %	100 %	0 %	0 %	526230851
4743	NC_021872	T	6	6	219695	219700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4744	NC_021872	A	6	6	219704	219709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4745	NC_021872	GTA	2	6	219755	219760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4746	NC_021872	AAC	2	6	219823	219828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4747	NC_021872	GTT	2	6	219896	219901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4748	NC_021872	ATA	2	6	219902	219907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4872	NC_021872	ATT	2	6	225205	225210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
4873	NC_021872	CAA	2	6	225214	225219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526230856
4874	NC_021872	ATC	2	6	225223	225228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230856
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4876	NC_021872	CAT	2	6	225367	225372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526230856
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4879	NC_021872	TATT	2	8	225482	225489	25 %	75 %	0 %	0 %	526230856
4880	NC_021872	ATT	2	6	225515	225520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526230856
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4955	NC_021872	T	6	6	228365	228370	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4956	NC_021872	TAGCT	2	10	228411	228420	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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