MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 67465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021840	AGC	2	6	157559	157564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934330
3502	NC_021840	GCG	2	6	157620	157625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934330
3503	NC_021840	ATT	2	6	157629	157634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934330
3504	NC_021840	GAA	2	6	157653	157658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934330
3505	NC_021840	ATT	2	6	157685	157690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934330
3506	NC_021840	GAA	2	6	157704	157709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934330
3507	NC_021840	AAC	2	6	157729	157734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934330
3508	NC_021840	GAT	2	6	157755	157760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934330
3509	NC_021840	ATTA	2	8	157824	157831	50 %	50 %	0 %	0 %	525934330
3510	NC_021840	TTG	2	6	157902	157907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525934330
3511	NC_021840	CTA	2	6	157951	157956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934330
3512	NC_021840	TGG	2	6	158000	158005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934330
3513	NC_021840	AAAC	2	8	158120	158127	75 %	0 %	0 %	25 %	525934330
3514	NC_021840	ACAA	2	8	158164	158171	75 %	0 %	0 %	25 %	525934330
3515	NC_021840	AGA	2	6	158240	158245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934330
3516	NC_021840	AAC	2	6	158270	158275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934330
3517	NC_021840	GCA	2	6	158280	158285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934330
3518	NC_021840	AAGA	2	8	158301	158308	75 %	0 %	25 %	0 %	525934330
3519	NC_021840	ATT	2	6	158319	158324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934330
3520	NC_021840	GAAAC	2	10	158335	158344	60 %	0 %	20 %	20 %	525934330
3521	NC_021840	ATT	2	6	158380	158385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934330
3522	NC_021840	AACTTT	2	12	158439	158450	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3523	NC_021840	TAAA	2	8	158479	158486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_021840	TTTG	2	8	158496	158503	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_021840	T	6	6	158520	158525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_021840	ACTAA	2	10	158548	158557	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3527	NC_021840	AGG	2	6	158568	158573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_021840	A	7	7	158587	158593	100 %	0 %	0 %	0 %	525934331
3529	NC_021840	GAA	2	6	158594	158599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934331
3530	NC_021840	ATTGC	2	10	158706	158715	20 %	40 %	20 %	20 %	525934331
3531	NC_021840	CAA	2	6	158747	158752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934331
3532	NC_021840	CTC	2	6	158795	158800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525934331
3533	NC_021840	AAG	2	6	158910	158915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934331
3534	NC_021840	ACT	2	6	158965	158970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934331
3535	NC_021840	A	7	7	158980	158986	100 %	0 %	0 %	0 %	525934331
3536	NC_021840	ATT	2	6	158998	159003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934331
3537	NC_021840	TCA	2	6	159022	159027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934332
3538	NC_021840	AAT	2	6	159079	159084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934332
3539	NC_021840	A	6	6	159101	159106	100 %	0 %	0 %	0 %	525934332
3540	NC_021840	CTTT	2	8	159183	159190	0 %	75 %	0 %	25 %	525934332
3541	NC_021840	ACC	2	6	159213	159218	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934332
3542	NC_021840	ACT	2	6	159276	159281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934332
3543	NC_021840	ATT	2	6	159347	159352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934332
3544	NC_021840	CA	3	6	159406	159411	50 %	0 %	0 %	50 %	525934332
3545	NC_021840	CAG	2	6	159450	159455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934332
3546	NC_021840	A	6	6	159500	159505	100 %	0 %	0 %	0 %	525934332
3547	NC_021840	A	6	6	159507	159512	100 %	0 %	0 %	0 %	525934332
3548	NC_021840	TCA	2	6	159679	159684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934332
3549	NC_021840	CT	3	6	159790	159795	0 %	50 %	0 %	50 %	525934332
3550	NC_021840	ACC	2	6	159895	159900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934332
3551	NC_021840	CGC	2	6	159914	159919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525934332
3552	NC_021840	ATAA	3	12	159957	159968	75 %	25 %	0 %	0 %	525934332
3553	NC_021840	AGA	2	6	160007	160012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_021840	AGG	2	6	160023	160028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_021840	ATTT	2	8	160057	160064	25 %	75 %	0 %	0 %	525934333
3556	NC_021840	GGAAT	2	10	160083	160092	40 %	20 %	40 %	0 %	525934333
3557	NC_021840	CGC	2	6	160124	160129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525934333
3558	NC_021840	TACAAG	2	12	160203	160214	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525934333
3559	NC_021840	ACGC	2	8	160218	160225	25 %	0 %	25 %	50 %	525934333
3560	NC_021840	CGAAAT	2	12	160257	160268	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525934333
3561	NC_021840	GAA	2	6	160279	160284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934333
3562	NC_021840	AAC	2	6	160340	160345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934333
3563	NC_021840	GAA	2	6	160351	160356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934333
3564	NC_021840	CGG	2	6	160404	160409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525934333
3565	NC_021840	TTA	2	6	160416	160421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934333
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3567	NC_021840	TCG	2	6	160490	160495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934333
3568	NC_021840	TTA	3	9	160519	160527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934333
3569	NC_021840	TGC	2	6	160532	160537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934333
3570	NC_021840	AAG	2	6	160565	160570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934333
3571	NC_021840	A	7	7	160633	160639	100 %	0 %	0 %	0 %	525934333
3572	NC_021840	GT	3	6	160700	160705	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3573	NC_021840	ACAT	2	8	160747	160754	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3574	NC_021840	ATT	2	6	160783	160788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934334
3575	NC_021840	ATT	2	6	160806	160811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934334
3576	NC_021840	TCA	2	6	160857	160862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3577	NC_021840	CCAA	2	8	160911	160918	50 %	0 %	0 %	50 %	525934334
3578	NC_021840	TTA	2	6	160975	160980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934334
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3580	NC_021840	CGT	2	6	161165	161170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934334
3581	NC_021840	AT	3	6	161175	161180	50 %	50 %	0 %	0 %	525934334
3582	NC_021840	GCA	2	6	161238	161243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934334
3583	NC_021840	CAT	2	6	161261	161266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3584	NC_021840	ATG	3	9	161289	161297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934334
3585	NC_021840	AATG	2	8	161310	161317	50 %	25 %	25 %	0 %	525934334
3586	NC_021840	TAC	2	6	161371	161376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3587	NC_021840	ATG	2	6	161397	161402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934334
3588	NC_021840	CTA	2	6	161495	161500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3589	NC_021840	CTT	2	6	161567	161572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934334
3590	NC_021840	GTA	2	6	161712	161717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934334
3591	NC_021840	TCG	2	6	161944	161949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934334
3592	NC_021840	TCA	2	6	161977	161982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3593	NC_021840	CGGA	2	8	162076	162083	25 %	0 %	50 %	25 %	525934334
3594	NC_021840	TAT	2	6	162116	162121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934334
3595	NC_021840	TCA	2	6	162136	162141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934334
3596	NC_021840	CAAC	2	8	162226	162233	50 %	0 %	0 %	50 %	525934334
3597	NC_021840	CAG	2	6	162239	162244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934334
3598	NC_021840	A	7	7	162263	162269	100 %	0 %	0 %	0 %	525934334
3599	NC_021840	AATT	2	8	162352	162359	50 %	50 %	0 %	0 %	525934334
3600	NC_021840	AGC	2	6	162373	162378	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934334
3601	NC_021840	ACC	2	6	162526	162531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934334
3602	NC_021840	GAA	3	9	162618	162626	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934334
3603	NC_021840	A	6	6	162630	162635	100 %	0 %	0 %	0 %	525934334
3604	NC_021840	TAT	3	9	162661	162669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3605	NC_021840	ATT	2	6	162727	162732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936708
3606	NC_021840	AAGT	2	8	162768	162775	50 %	25 %	25 %	0 %	525936708
3607	NC_021840	TA	3	6	162887	162892	50 %	50 %	0 %	0 %	525936708
3608	NC_021840	TTC	2	6	162961	162966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936708
3609	NC_021840	TTG	2	6	162984	162989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936708
3610	NC_021840	GTTTT	2	10	163050	163059	0 %	80 %	20 %	0 %	525936708
3611	NC_021840	A	6	6	163104	163109	100 %	0 %	0 %	0 %	525936708
3612	NC_021840	AT	3	6	163149	163154	50 %	50 %	0 %	0 %	525936708
3613	NC_021840	GAG	2	6	163185	163190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525936708
3614	NC_021840	TA	3	6	163308	163313	50 %	50 %	0 %	0 %	525936708
3615	NC_021840	ATTTT	2	10	163415	163424	20 %	80 %	0 %	0 %	525936708
3616	NC_021840	GTT	2	6	163521	163526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525936708
3617	NC_021840	CAT	2	6	163587	163592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936708
3618	NC_021840	GGA	2	6	163619	163624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525936708
3619	NC_021840	CTT	2	6	163626	163631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936708
3620	NC_021840	T	7	7	163637	163643	0 %	100 %	0 %	0 %	525936708
3621	NC_021840	TGTT	2	8	163659	163666	0 %	75 %	25 %	0 %	525936708
3622	NC_021840	AGC	2	6	163669	163674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936708
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3624	NC_021840	TATAA	2	10	163774	163783	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3998	NC_021840	AGA	2	6	181136	181141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934351
3999	NC_021840	GAA	2	6	181233	181238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934351
4000	NC_021840	CAG	2	6	181284	181289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934351

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