MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 67465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021840	ACA	2	6	23921	23926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934232
502	NC_021840	GCA	2	6	24012	24017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934232
503	NC_021840	TAA	2	6	24036	24041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934232
504	NC_021840	A	6	6	24040	24045	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_021840	TGT	2	6	24066	24071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021840	TTC	2	6	24094	24099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_021840	GTA	2	6	24130	24135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_021840	AGG	2	6	24149	24154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
509	NC_021840	AT	3	6	24170	24175	50 %	50 %	0 %	0 %	525934233
510	NC_021840	ATT	2	6	24265	24270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934233
511	NC_021840	TAG	2	6	24275	24280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934233
512	NC_021840	CAA	2	6	24365	24370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934233
513	NC_021840	AAG	2	6	24386	24391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934233
514	NC_021840	A	6	6	24396	24401	100 %	0 %	0 %	0 %	525934233
515	NC_021840	TGA	2	6	24408	24413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934233
516	NC_021840	AATA	2	8	24452	24459	75 %	25 %	0 %	0 %	525934233
517	NC_021840	AGG	2	6	24465	24470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021840	A	6	6	24528	24533	100 %	0 %	0 %	0 %	525934234
519	NC_021840	TTA	2	6	24607	24612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934234
520	NC_021840	TAAA	2	8	24616	24623	75 %	25 %	0 %	0 %	525934234
521	NC_021840	GCA	2	6	24627	24632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934234
522	NC_021840	AGA	2	6	24644	24649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934234
523	NC_021840	ACA	2	6	24676	24681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934234
524	NC_021840	ATA	2	6	24712	24717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934234
525	NC_021840	A	6	6	24725	24730	100 %	0 %	0 %	0 %	525934234
526	NC_021840	ACA	2	6	24738	24743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934234
527	NC_021840	GCA	2	6	24744	24749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934234
528	NC_021840	ATG	2	6	24781	24786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934234
529	NC_021840	CGT	2	6	24791	24796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934234
530	NC_021840	A	6	6	24806	24811	100 %	0 %	0 %	0 %	525934234
531	NC_021840	TGG	2	6	24926	24931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934234
532	NC_021840	TTC	2	6	24932	24937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934234
533	NC_021840	GGT	2	6	24939	24944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934234
534	NC_021840	GCA	2	6	24960	24965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934234
535	NC_021840	TGG	2	6	24998	25003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934234
536	NC_021840	CAG	2	6	25018	25023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934234
537	NC_021840	TCT	2	6	25095	25100	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934234
538	NC_021840	A	6	6	25124	25129	100 %	0 %	0 %	0 %	525934234
539	NC_021840	AGA	2	6	25133	25138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934234
540	NC_021840	TTAT	2	8	25145	25152	25 %	75 %	0 %	0 %	525934234
541	NC_021840	AACC	2	8	25197	25204	50 %	0 %	0 %	50 %	525934234
542	NC_021840	TTA	2	6	25397	25402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934234
543	NC_021840	CTT	2	6	25423	25428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934234
544	NC_021840	ATCT	2	8	25432	25439	25 %	50 %	0 %	25 %	525934234
545	NC_021840	CGTT	2	8	25451	25458	0 %	50 %	25 %	25 %	525934234
546	NC_021840	ACT	2	6	25482	25487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934234
547	NC_021840	AGA	2	6	25490	25495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934234
548	NC_021840	CGT	2	6	25542	25547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934234
549	NC_021840	TTA	2	6	25580	25585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934234
550	NC_021840	TAC	2	6	25593	25598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934234
551	NC_021840	A	6	6	25599	25604	100 %	0 %	0 %	0 %	525934234
552	NC_021840	CAA	2	6	25608	25613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934234
553	NC_021840	TTAA	2	8	25623	25630	50 %	50 %	0 %	0 %	525934234
554	NC_021840	ATG	2	6	25660	25665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934234
555	NC_021840	TTA	2	6	25666	25671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934234
556	NC_021840	ACA	2	6	25689	25694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934234
557	NC_021840	ACT	2	6	25846	25851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934234
558	NC_021840	GAA	2	6	25854	25859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934234
559	NC_021840	ACA	2	6	25899	25904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934234
560	NC_021840	AGG	2	6	25930	25935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934234
561	NC_021840	TCT	2	6	26009	26014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934235
562	NC_021840	CAAATA	2	12	26040	26051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525934235
563	NC_021840	TAAA	2	8	26094	26101	75 %	25 %	0 %	0 %	525934235
564	NC_021840	A	7	7	26282	26288	100 %	0 %	0 %	0 %	525934235
565	NC_021840	AGA	3	9	26311	26319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
566	NC_021840	AGA	2	6	26425	26430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
567	NC_021840	GAA	2	6	26498	26503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
568	NC_021840	AAG	2	6	26550	26555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
569	NC_021840	CAA	2	6	26596	26601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934235
570	NC_021840	CGTA	2	8	26602	26609	25 %	25 %	25 %	25 %	525934235
571	NC_021840	GAA	2	6	26624	26629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
572	NC_021840	TCG	2	6	26680	26685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934235
573	NC_021840	GAA	2	6	26690	26695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
574	NC_021840	AAG	2	6	26727	26732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
575	NC_021840	CGA	2	6	26737	26742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934235
576	NC_021840	TAG	2	6	26769	26774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934235
577	NC_021840	ATTT	2	8	26775	26782	25 %	75 %	0 %	0 %	525934235
578	NC_021840	TGA	2	6	26785	26790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934235
579	NC_021840	ATG	2	6	26880	26885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934235
580	NC_021840	T	6	6	26921	26926	0 %	100 %	0 %	0 %	525934235
581	NC_021840	ATTAA	2	10	27062	27071	60 %	40 %	0 %	0 %	525934235
582	NC_021840	TCT	2	6	27089	27094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934235
583	NC_021840	A	6	6	27104	27109	100 %	0 %	0 %	0 %	525934235
584	NC_021840	TGG	2	6	27133	27138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934235
585	NC_021840	AGT	2	6	27151	27156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934235
586	NC_021840	GCAA	2	8	27316	27323	50 %	0 %	25 %	25 %	525934235
587	NC_021840	CCA	2	6	27326	27331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934235
588	NC_021840	TAA	2	6	27337	27342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934235
589	NC_021840	ATT	2	6	27343	27348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934235
590	NC_021840	AGA	2	6	27352	27357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934235
591	NC_021840	GCT	2	6	27402	27407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_021840	TATT	2	8	27412	27419	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_021840	CTTTT	2	10	27472	27481	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
594	NC_021840	AAC	2	6	27483	27488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_021840	TTAT	2	8	27538	27545	25 %	75 %	0 %	0 %	525934236
596	NC_021840	ATC	2	6	27567	27572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934236
597	NC_021840	AGCA	2	8	27607	27614	50 %	0 %	25 %	25 %	525934236
598	NC_021840	CAA	2	6	27637	27642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934236
599	NC_021840	GAT	2	6	27654	27659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934236
600	NC_021840	TGC	2	6	27668	27673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934236
601	NC_021840	GAA	2	6	27675	27680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934236
602	NC_021840	TCGAT	2	10	27692	27701	20 %	40 %	20 %	20 %	525934236
603	NC_021840	AGC	2	6	27710	27715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934236
604	NC_021840	TTA	2	6	27742	27747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934236
605	NC_021840	AGC	2	6	27866	27871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934236
606	NC_021840	TTA	2	6	27919	27924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934236
607	NC_021840	TTA	2	6	28004	28009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934236
608	NC_021840	AAAGTA	2	12	28050	28061	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525934236
609	NC_021840	TGG	2	6	28127	28132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934236
610	NC_021840	A	6	6	28138	28143	100 %	0 %	0 %	0 %	525934236
611	NC_021840	GAC	2	6	28164	28169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525934236
612	NC_021840	TTA	2	6	28183	28188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934236
613	NC_021840	A	6	6	28194	28199	100 %	0 %	0 %	0 %	525934236
614	NC_021840	GAG	2	6	28243	28248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525934236
615	NC_021840	TTAT	2	8	28270	28277	25 %	75 %	0 %	0 %	525934236
616	NC_021840	AGA	2	6	28307	28312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934236
617	NC_021840	TTAA	2	8	28320	28327	50 %	50 %	0 %	0 %	525934236
618	NC_021840	TGG	2	6	28343	28348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525934236
619	NC_021840	ACA	2	6	28379	28384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525934236
620	NC_021840	T	7	7	28471	28477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_021840	ATT	2	6	28522	28527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_021840	GAT	2	6	28631	28636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934237
623	NC_021840	AAT	2	6	28637	28642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934237
624	NC_021840	T	7	7	28672	28678	0 %	100 %	0 %	0 %	525934237
625	NC_021840	AGA	2	6	28697	28702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934237
626	NC_021840	AGTA	2	8	28715	28722	50 %	25 %	25 %	0 %	525934237
627	NC_021840	TAA	2	6	28742	28747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934237
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629	NC_021840	ATA	2	6	28786	28791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934237
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763	NC_021840	T	7	7	33984	33990	0 %	100 %	0 %	0 %	525934242
764	NC_021840	GTATTA	2	12	34054	34065	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525934242
765	NC_021840	T	6	6	34066	34071	0 %	100 %	0 %	0 %	525934242
766	NC_021840	TA	3	6	34085	34090	50 %	50 %	0 %	0 %	525934242
767	NC_021840	TCT	2	6	34129	34134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525934242
768	NC_021840	TAT	2	6	34191	34196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934242
769	NC_021840	CGATA	2	10	34215	34224	40 %	20 %	20 %	20 %	525934242
770	NC_021840	T	6	6	34231	34236	0 %	100 %	0 %	0 %	525934242
771	NC_021840	TAT	2	6	34239	34244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934242
772	NC_021840	ATG	2	6	34310	34315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934242
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776	NC_021840	AAT	2	6	34537	34542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934242
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785	NC_021840	A	6	6	34998	35003	100 %	0 %	0 %	0 %	525934242
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801	NC_021840	T	6	6	35557	35562	0 %	100 %	0 %	0 %	525934242
802	NC_021840	TTAAT	2	10	35603	35612	40 %	60 %	0 %	0 %	525934242
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827	NC_021840	A	6	6	36494	36499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
828	NC_021840	GGA	3	9	36525	36533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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832	NC_021840	AGA	2	6	36722	36727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934244
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852	NC_021840	TAT	2	6	37314	37319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934244
853	NC_021840	ATA	2	6	37324	37329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934244
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861	NC_021840	AT	3	6	37745	37750	50 %	50 %	0 %	0 %	525934245
862	NC_021840	AAAAT	2	10	37788	37797	80 %	20 %	0 %	0 %	525934245
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878	NC_021840	AAT	2	6	38547	38552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934246
879	NC_021840	TAC	2	6	38588	38593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934246
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881	NC_021840	A	7	7	38695	38701	100 %	0 %	0 %	0 %	525934246
882	NC_021840	GAT	2	6	38727	38732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934246
883	NC_021840	TAAT	2	8	38737	38744	50 %	50 %	0 %	0 %	525934246
884	NC_021840	TGC	2	6	38879	38884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525934246
885	NC_021840	AGT	2	6	38960	38965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525934246
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887	NC_021840	CCA	2	6	39030	39035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525934246
888	NC_021840	ATC	2	6	39040	39045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525934246
889	NC_021840	TTTA	2	8	39119	39126	25 %	75 %	0 %	0 %	525934246
890	NC_021840	ATA	2	6	39310	39315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934246
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