MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1926

Total Repeats: 67465

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021840	GAT	2	6	223034	223039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936724
5002	NC_021840	AGC	3	9	223069	223077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
5003	NC_021840	TCA	2	6	223098	223103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936724
5004	NC_021840	CGG	2	6	223174	223179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525936724
5005	NC_021840	A	6	6	223275	223280	100 %	0 %	0 %	0 %	525936724
5006	NC_021840	TAC	2	6	223471	223476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936724
5007	NC_021840	CAG	2	6	223479	223484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
5008	NC_021840	A	6	6	223574	223579	100 %	0 %	0 %	0 %	525936724
5009	NC_021840	ACA	3	9	223679	223687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936724
5010	NC_021840	TAG	2	6	223713	223718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936724
5011	NC_021840	ACCA	2	8	223723	223730	50 %	0 %	0 %	50 %	525936724
5012	NC_021840	CAA	2	6	223820	223825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936724
5013	NC_021840	GAT	2	6	223844	223849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936724
5014	NC_021840	ACA	2	6	223886	223891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936724
5015	NC_021840	GAC	2	6	223924	223929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
5016	NC_021840	ACAA	2	8	223934	223941	75 %	0 %	0 %	25 %	525936724
5017	NC_021840	AGA	2	6	223993	223998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525936724
5018	NC_021840	AAC	2	6	224046	224051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936724
5019	NC_021840	A	6	6	224066	224071	100 %	0 %	0 %	0 %	525936724
5020	NC_021840	GCA	2	6	224102	224107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
5021	NC_021840	CGAA	2	8	224142	224149	50 %	0 %	25 %	25 %	525936724
5022	NC_021840	ACC	2	6	224254	224259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525936724
5023	NC_021840	AACT	2	8	224418	224425	50 %	25 %	0 %	25 %	525936724
5024	NC_021840	CAA	2	6	224441	224446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936724
5025	NC_021840	ACG	2	6	224507	224512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
5026	NC_021840	AC	3	6	224622	224627	50 %	0 %	0 %	50 %	525936724
5027	NC_021840	TAC	2	6	224713	224718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936724
5028	NC_021840	CTA	2	6	224727	224732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936724
5029	NC_021840	GCA	2	6	224753	224758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
5030	NC_021840	AATC	2	8	224765	224772	50 %	25 %	0 %	25 %	525936724
5031	NC_021840	GCG	2	6	224786	224791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525936724
5032	NC_021840	GAT	2	6	224822	224827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936724
5033	NC_021840	CTA	2	6	224922	224927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936724
5034	NC_021840	GCA	2	6	224930	224935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
5035	NC_021840	GCA	2	6	224960	224965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
5036	NC_021840	CAA	2	6	224967	224972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936724
5037	NC_021840	GAAT	2	8	225028	225035	50 %	25 %	25 %	0 %	525936724
5038	NC_021840	A	6	6	225095	225100	100 %	0 %	0 %	0 %	525936724
5039	NC_021840	TAT	2	6	225106	225111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936724
5040	NC_021840	GCG	2	6	225132	225137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525936724
5041	NC_021840	A	6	6	225179	225184	100 %	0 %	0 %	0 %	525936724
5042	NC_021840	TA	3	6	225222	225227	50 %	50 %	0 %	0 %	525936724
5043	NC_021840	AC	3	6	225264	225269	50 %	0 %	0 %	50 %	525936724
5044	NC_021840	AAC	2	6	225367	225372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936724
5045	NC_021840	TGA	2	6	225409	225414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936724
5046	NC_021840	TA	3	6	225429	225434	50 %	50 %	0 %	0 %	525936724
5047	NC_021840	AAC	2	6	225454	225459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936724
5048	NC_021840	GCA	2	6	225548	225553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
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5050	NC_021840	CAAA	2	8	225641	225648	75 %	0 %	0 %	25 %	525936724
5051	NC_021840	AGC	2	6	225700	225705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
5052	NC_021840	AGC	2	6	225754	225759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936724
5053	NC_021840	A	6	6	225783	225788	100 %	0 %	0 %	0 %	525936724
5054	NC_021840	AACG	2	8	225793	225800	50 %	0 %	25 %	25 %	525936724
5055	NC_021840	ACTT	2	8	225865	225872	25 %	50 %	0 %	25 %	525936724
5056	NC_021840	CAA	2	6	225887	225892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525936724
5057	NC_021840	TAG	2	6	225987	225992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936724
5058	NC_021840	A	6	6	226055	226060	100 %	0 %	0 %	0 %	525936724
5059	NC_021840	TAT	2	6	226066	226071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936724
5060	NC_021840	GCAA	2	8	226121	226128	50 %	0 %	25 %	25 %	525936724
5061	NC_021840	AGT	2	6	226129	226134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936724
5062	NC_021840	AGT	2	6	226144	226149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936724
5063	NC_021840	A	6	6	226256	226261	100 %	0 %	0 %	0 %	525936724
5064	NC_021840	CCG	2	6	226291	226296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_021840	TTG	2	6	226301	226306	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_021840	TGG	2	6	226307	226312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_021840	AT	3	6	226324	226329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_021840	AGAA	2	8	226475	226482	75 %	0 %	25 %	0 %	525934379
5069	NC_021840	A	7	7	226494	226500	100 %	0 %	0 %	0 %	525934379
5070	NC_021840	AAT	2	6	226504	226509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525934379
5071	NC_021840	TTA	2	6	226510	226515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934379
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5074	NC_021840	A	6	6	226601	226606	100 %	0 %	0 %	0 %	525934379
5075	NC_021840	TAT	2	6	226635	226640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934379
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5077	NC_021840	A	6	6	226756	226761	100 %	0 %	0 %	0 %	525934379
5078	NC_021840	AAG	2	6	226781	226786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525934379
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5080	NC_021840	A	7	7	226815	226821	100 %	0 %	0 %	0 %	525934379
5081	NC_021840	ATT	2	6	226831	226836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934379
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5087	NC_021840	TTA	2	6	227033	227038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525934379
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5089	NC_021840	AAG	2	6	227128	227133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_021840	T	7	7	227157	227163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_021840	A	6	6	227201	227206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_021840	ATT	2	6	227239	227244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936725
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5094	NC_021840	TGA	2	6	227266	227271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936725
5095	NC_021840	AAT	2	6	227297	227302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936725
5096	NC_021840	TGG	2	6	227426	227431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525936725
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5099	NC_021840	CTT	2	6	227647	227652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936725
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5102	NC_021840	TAG	2	6	227803	227808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936725
5103	NC_021840	CAT	2	6	227812	227817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936725
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5105	NC_021840	ATG	2	6	227841	227846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936725
5106	NC_021840	TAT	2	6	227902	227907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936725
5107	NC_021840	CTA	2	6	227929	227934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936725
5108	NC_021840	CAG	2	6	227968	227973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525936725
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5110	NC_021840	TC	3	6	228040	228045	0 %	50 %	0 %	50 %	525936725
5111	NC_021840	TTA	2	6	228072	228077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525936725
5112	NC_021840	TAA	2	6	228089	228094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936725
5113	NC_021840	T	6	6	228102	228107	0 %	100 %	0 %	0 %	525936725
5114	NC_021840	GTA	2	6	228171	228176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936725
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5119	NC_021840	TCT	2	6	228753	228758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936725
5120	NC_021840	TAGTT	2	10	228779	228788	20 %	60 %	20 %	0 %	525936725
5121	NC_021840	T	6	6	228838	228843	0 %	100 %	0 %	0 %	525936725
5122	NC_021840	ATC	2	6	228866	228871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936725
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5252	NC_021840	AAT	2	6	234819	234824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525936727
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5281	NC_021840	AGT	2	6	236471	236476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525936727
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5283	NC_021840	A	7	7	236570	236576	100 %	0 %	0 %	0 %	525936727
5284	NC_021840	CTG	2	6	236596	236601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525936727
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5318	NC_021840	AAG	2	6	238571	238576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5370	NC_021840	CAT	2	6	240542	240547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525936728
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5372	NC_021840	A	6	6	240617	240622	100 %	0 %	0 %	0 %	525936728
5373	NC_021840	CTT	2	6	240821	240826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525936728
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