MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 3519

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	TC	3	6	634	639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_021839	AT	3	6	834	839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021839	GA	3	6	1475	1480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021839	GA	3	6	1554	1559	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021839	GA	3	6	1810	1815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021839	AC	3	6	2485	2490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_021839	TG	3	6	2536	2541	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021839	GA	3	6	2756	2761	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021839	TC	3	6	3321	3326	0 %	50 %	0 %	50 %	525929674
10	NC_021839	CT	4	8	3630	3637	0 %	50 %	0 %	50 %	525929675
11	NC_021839	TG	3	6	4495	4500	0 %	50 %	50 %	0 %	525929676
12	NC_021839	GC	3	6	4521	4526	0 %	0 %	50 %	50 %	525929676
13	NC_021839	TA	3	6	4620	4625	50 %	50 %	0 %	0 %	525929676
14	NC_021839	CT	3	6	5229	5234	0 %	50 %	0 %	50 %	525929677
15	NC_021839	AT	3	6	6046	6051	50 %	50 %	0 %	0 %	525929677
16	NC_021839	GA	3	6	6071	6076	50 %	0 %	50 %	0 %	525929677
17	NC_021839	CG	3	6	6746	6751	0 %	0 %	50 %	50 %	525929677
18	NC_021839	TG	3	6	7722	7727	0 %	50 %	50 %	0 %	525929678
19	NC_021839	TA	3	6	8059	8064	50 %	50 %	0 %	0 %	525929678
20	NC_021839	TA	5	10	9162	9171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021839	GT	3	6	9220	9225	0 %	50 %	50 %	0 %	525929679
22	NC_021839	TC	3	6	12106	12111	0 %	50 %	0 %	50 %	525929682
23	NC_021839	AT	3	6	12999	13004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021839	AG	4	8	13095	13102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021839	GA	3	6	14002	14007	50 %	0 %	50 %	0 %	525929684
26	NC_021839	CA	3	6	16128	16133	50 %	0 %	0 %	50 %	525929686
27	NC_021839	AT	3	6	19431	19436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021839	GT	3	6	19951	19956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021839	GC	3	6	22287	22292	0 %	0 %	50 %	50 %	525929697
30	NC_021839	TG	3	6	23114	23119	0 %	50 %	50 %	0 %	525929698
31	NC_021839	AC	3	6	23282	23287	50 %	0 %	0 %	50 %	525929698
32	NC_021839	TG	3	6	23762	23767	0 %	50 %	50 %	0 %	525929698
33	NC_021839	AT	3	6	24155	24160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021839	GA	3	6	25263	25268	50 %	0 %	50 %	0 %	525932159
35	NC_021839	TC	3	6	25282	25287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_021839	AT	3	6	25345	25350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021839	TG	3	6	26302	26307	0 %	50 %	50 %	0 %	525932160
38	NC_021839	AT	3	6	26943	26948	50 %	50 %	0 %	0 %	525932161
39	NC_021839	AC	3	6	27961	27966	50 %	0 %	0 %	50 %	525932161
40	NC_021839	GT	3	6	28225	28230	0 %	50 %	50 %	0 %	525932162
41	NC_021839	TC	3	6	30047	30052	0 %	50 %	0 %	50 %	525929699
42	NC_021839	TA	3	6	31336	31341	50 %	50 %	0 %	0 %	525932163
43	NC_021839	AT	3	6	31515	31520	50 %	50 %	0 %	0 %	525932163
44	NC_021839	AC	3	6	33206	33211	50 %	0 %	0 %	50 %	525929700
45	NC_021839	CT	3	6	35712	35717	0 %	50 %	0 %	50 %	525929700
46	NC_021839	CA	3	6	37405	37410	50 %	0 %	0 %	50 %	525929701
47	NC_021839	CG	3	6	39897	39902	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_021839	GC	3	6	41306	41311	0 %	0 %	50 %	50 %	525929703
49	NC_021839	CA	4	8	41496	41503	50 %	0 %	0 %	50 %	525929703
50	NC_021839	AG	3	6	42397	42402	50 %	0 %	50 %	0 %	525932165
51	NC_021839	GA	4	8	43889	43896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021839	CG	3	6	43998	44003	0 %	0 %	50 %	50 %	525932166
53	NC_021839	AC	3	6	47607	47612	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_021839	GA	4	8	48359	48366	50 %	0 %	50 %	0 %	525932168
55	NC_021839	CA	3	6	51398	51403	50 %	0 %	0 %	50 %	525929706
56	NC_021839	CT	3	6	51782	51787	0 %	50 %	0 %	50 %	525929706
57	NC_021839	GT	3	6	52692	52697	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021839	AT	3	6	53167	53172	50 %	50 %	0 %	0 %	525929708
59	NC_021839	TA	3	6	54879	54884	50 %	50 %	0 %	0 %	525932169
60	NC_021839	AT	3	6	55141	55146	50 %	50 %	0 %	0 %	525932169
61	NC_021839	TA	3	6	55300	55305	50 %	50 %	0 %	0 %	525932169
62	NC_021839	GT	3	6	57260	57265	0 %	50 %	50 %	0 %	525929710
63	NC_021839	AT	3	6	57990	57995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021839	AG	5	10	59887	59896	50 %	0 %	50 %	0 %	525929713
65	NC_021839	AT	3	6	60051	60056	50 %	50 %	0 %	0 %	525929713
66	NC_021839	AC	3	6	60085	60090	50 %	0 %	0 %	50 %	525929713
67	NC_021839	AC	4	8	63045	63052	50 %	0 %	0 %	50 %	525929716
68	NC_021839	AG	3	6	63128	63133	50 %	0 %	50 %	0 %	525929716
69	NC_021839	AT	3	6	64644	64649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021839	CG	3	6	65387	65392	0 %	0 %	50 %	50 %	525929718
71	NC_021839	TA	3	6	65527	65532	50 %	50 %	0 %	0 %	525929718
72	NC_021839	AC	3	6	65651	65656	50 %	0 %	0 %	50 %	525929718
73	NC_021839	TA	3	6	66064	66069	50 %	50 %	0 %	0 %	525929718
74	NC_021839	AT	3	6	67416	67421	50 %	50 %	0 %	0 %	525932170
75	NC_021839	GT	3	6	68649	68654	0 %	50 %	50 %	0 %	525929721
76	NC_021839	TC	3	6	68933	68938	0 %	50 %	0 %	50 %	525929721
77	NC_021839	CG	3	6	70526	70531	0 %	0 %	50 %	50 %	525929723
78	NC_021839	CG	3	6	72345	72350	0 %	0 %	50 %	50 %	525929725
79	NC_021839	TG	3	6	72967	72972	0 %	50 %	50 %	0 %	525929725
80	NC_021839	AT	3	6	74363	74368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021839	AT	3	6	75213	75218	50 %	50 %	0 %	0 %	525929727
82	NC_021839	AG	3	6	75844	75849	50 %	0 %	50 %	0 %	525929727
83	NC_021839	GA	3	6	77317	77322	50 %	0 %	50 %	0 %	525929728
84	NC_021839	TC	3	6	77700	77705	0 %	50 %	0 %	50 %	525929729
85	NC_021839	AT	3	6	78481	78486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021839	TC	3	6	78905	78910	0 %	50 %	0 %	50 %	525929730
87	NC_021839	TA	3	6	79400	79405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021839	AG	3	6	79420	79425	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021839	AG	3	6	79493	79498	50 %	0 %	50 %	0 %	525929731
90	NC_021839	GC	3	6	79527	79532	0 %	0 %	50 %	50 %	525929731
91	NC_021839	TG	3	6	81098	81103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021839	AT	4	8	81417	81424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021839	AT	3	6	84030	84035	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021839	GT	3	6	84188	84193	0 %	50 %	50 %	0 %	525929734
95	NC_021839	TA	3	6	85919	85924	50 %	50 %	0 %	0 %	525929735
96	NC_021839	AT	3	6	87716	87721	50 %	50 %	0 %	0 %	525929736
97	NC_021839	AT	3	6	87953	87958	50 %	50 %	0 %	0 %	525929736
98	NC_021839	CT	3	6	89806	89811	0 %	50 %	0 %	50 %	525929739
99	NC_021839	AG	3	6	90163	90168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021839	AG	3	6	90436	90441	50 %	0 %	50 %	0 %	525932172
101	NC_021839	TA	3	6	90490	90495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021839	TA	3	6	91256	91261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021839	GT	3	6	93097	93102	0 %	50 %	50 %	0 %	525929740
104	NC_021839	AT	3	6	93227	93232	50 %	50 %	0 %	0 %	525929740
105	NC_021839	AT	3	6	93954	93959	50 %	50 %	0 %	0 %	525932175
106	NC_021839	AC	3	6	94299	94304	50 %	0 %	0 %	50 %	525932176
107	NC_021839	AT	3	6	94771	94776	50 %	50 %	0 %	0 %	525932176
108	NC_021839	AT	3	6	95755	95760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021839	TG	3	6	95809	95814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021839	GA	3	6	96394	96399	50 %	0 %	50 %	0 %	525932178
111	NC_021839	TA	3	6	96981	96986	50 %	50 %	0 %	0 %	525932178
112	NC_021839	TA	3	6	97796	97801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021839	AT	3	6	98009	98014	50 %	50 %	0 %	0 %	525932179
114	NC_021839	AT	3	6	98032	98037	50 %	50 %	0 %	0 %	525932179
115	NC_021839	GA	3	6	98671	98676	50 %	0 %	50 %	0 %	525932179
116	NC_021839	AG	3	6	99970	99975	50 %	0 %	50 %	0 %	525932182
117	NC_021839	CA	3	6	100627	100632	50 %	0 %	0 %	50 %	525932182
118	NC_021839	AT	3	6	101024	101029	50 %	50 %	0 %	0 %	525932183
119	NC_021839	AT	3	6	101188	101193	50 %	50 %	0 %	0 %	525932183
120	NC_021839	AC	3	6	102039	102044	50 %	0 %	0 %	50 %	525929741
121	NC_021839	GT	3	6	105211	105216	0 %	50 %	50 %	0 %	525929745
122	NC_021839	GC	3	6	106594	106599	0 %	0 %	50 %	50 %	525929746
123	NC_021839	GC	3	6	108104	108109	0 %	0 %	50 %	50 %	525932184
124	NC_021839	AT	3	6	109006	109011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021839	GA	3	6	110043	110048	50 %	0 %	50 %	0 %	525929748
126	NC_021839	AG	3	6	111224	111229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021839	TA	3	6	111276	111281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021839	TA	3	6	111960	111965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021839	TA	4	8	113063	113070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021839	AG	3	6	113082	113087	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021839	CG	3	6	113381	113386	0 %	0 %	50 %	50 %	525929752
132	NC_021839	AG	3	6	113744	113749	50 %	0 %	50 %	0 %	525929752
133	NC_021839	AT	3	6	114060	114065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021839	TA	3	6	114822	114827	50 %	50 %	0 %	0 %	525932185
135	NC_021839	AC	3	6	116614	116619	50 %	0 %	0 %	50 %	525932185
136	NC_021839	TA	3	6	117214	117219	50 %	50 %	0 %	0 %	525932185
137	NC_021839	AC	3	6	117256	117261	50 %	0 %	0 %	50 %	525932185
138	NC_021839	TA	3	6	117421	117426	50 %	50 %	0 %	0 %	525932185
139	NC_021839	AT	3	6	118316	118321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021839	AC	3	6	118734	118739	50 %	0 %	0 %	50 %	525929753
141	NC_021839	AC	3	6	119720	119725	50 %	0 %	0 %	50 %	525932186
142	NC_021839	TC	3	6	120032	120037	0 %	50 %	0 %	50 %	525932186
143	NC_021839	CT	3	6	121006	121011	0 %	50 %	0 %	50 %	525932186
144	NC_021839	AT	4	8	121148	121155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021839	TA	3	6	121177	121182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021839	AT	3	6	121444	121449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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