MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 2165

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021839	AAGGT	2	10	528	537	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021839	GAGAA	2	10	4968	4977	60 %	0 %	40 %	0 %	525929676
3	NC_021839	GAACA	2	10	5172	5181	60 %	0 %	20 %	20 %	525929677
4	NC_021839	GAACA	2	10	5394	5403	60 %	0 %	20 %	20 %	525929677
5	NC_021839	AAAGA	2	10	9636	9645	80 %	0 %	20 %	0 %	525929679
6	NC_021839	AAAAT	2	10	10350	10359	80 %	20 %	0 %	0 %	525929680
7	NC_021839	TGGAC	2	10	17500	17509	20 %	20 %	40 %	20 %	525929688
8	NC_021839	GGCAT	2	10	17821	17830	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_021839	CAAAG	2	10	18931	18940	60 %	0 %	20 %	20 %	525929692
10	NC_021839	TATTT	2	10	22585	22594	20 %	80 %	0 %	0 %	525929697
11	NC_021839	ATTTG	2	10	23305	23314	20 %	60 %	20 %	0 %	525929698
12	NC_021839	TACTG	2	10	24830	24839	20 %	40 %	20 %	20 %	525932159
13	NC_021839	TGAAA	2	10	27996	28005	60 %	20 %	20 %	0 %	525932161
14	NC_021839	TTATG	2	10	28190	28199	20 %	60 %	20 %	0 %	525932162
15	NC_021839	ATTTA	2	10	30928	30937	40 %	60 %	0 %	0 %	525932163
16	NC_021839	ATATG	2	10	31220	31229	40 %	40 %	20 %	0 %	525932163
17	NC_021839	ATTTG	2	10	31826	31835	20 %	60 %	20 %	0 %	525932163
18	NC_021839	ACAAA	2	10	31894	31903	80 %	0 %	0 %	20 %	525932163
19	NC_021839	TTTAA	2	10	31976	31985	40 %	60 %	0 %	0 %	525932163
20	NC_021839	GCTTG	2	10	33052	33061	0 %	40 %	40 %	20 %	525929700
21	NC_021839	ACGTG	2	10	34053	34062	20 %	20 %	40 %	20 %	525929700
22	NC_021839	AGTGA	2	10	39937	39946	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021839	TAAAA	2	10	40515	40524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021839	GGCTG	2	10	41033	41042	0 %	20 %	60 %	20 %	525929703
25	NC_021839	ATTAC	2	10	43137	43146	40 %	40 %	0 %	20 %	525932165
26	NC_021839	AAATC	2	10	46520	46529	60 %	20 %	0 %	20 %	525932167
27	NC_021839	TTGGG	2	10	47720	47729	0 %	40 %	60 %	0 %	525932168
28	NC_021839	AGTAA	2	10	48300	48309	60 %	20 %	20 %	0 %	525932168
29	NC_021839	AAAAT	2	10	48463	48472	80 %	20 %	0 %	0 %	525932168
30	NC_021839	GAATG	2	10	49068	49077	40 %	20 %	40 %	0 %	525932168
31	NC_021839	TGGCT	2	10	49164	49173	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_021839	GAAAC	2	10	50327	50336	60 %	0 %	20 %	20 %	525929704
33	NC_021839	ACTAA	2	10	50540	50549	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_021839	ATTGC	2	10	50698	50707	20 %	40 %	20 %	20 %	525929705
35	NC_021839	GGAAT	2	10	52075	52084	40 %	20 %	40 %	0 %	525929707
36	NC_021839	GTTTT	2	10	55042	55051	0 %	80 %	20 %	0 %	525932169
37	NC_021839	ATTTT	2	10	55407	55416	20 %	80 %	0 %	0 %	525932169
38	NC_021839	TATAA	2	10	55766	55775	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021839	AGGTA	2	10	56331	56340	40 %	20 %	40 %	0 %	525929709
40	NC_021839	AAAGA	2	10	58994	59003	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021839	ATTGT	2	10	60161	60170	20 %	60 %	20 %	0 %	525929713
42	NC_021839	CTCTT	2	10	61323	61332	0 %	60 %	0 %	40 %	525929715
43	NC_021839	ATGAA	2	10	61333	61342	60 %	20 %	20 %	0 %	525929715
44	NC_021839	CTTCT	2	10	61892	61901	0 %	60 %	0 %	40 %	525929715
45	NC_021839	CAAAT	2	10	62130	62139	60 %	20 %	0 %	20 %	525929715
46	NC_021839	AGTTA	2	10	63283	63292	40 %	40 %	20 %	0 %	525929717
47	NC_021839	CGATG	2	10	65489	65498	20 %	20 %	40 %	20 %	525929718
48	NC_021839	AGAAA	2	10	73502	73511	80 %	0 %	20 %	0 %	525929726
49	NC_021839	TGCAA	2	10	74466	74475	40 %	20 %	20 %	20 %	525929727
50	NC_021839	CGAAT	2	10	74820	74829	40 %	20 %	20 %	20 %	525929727
51	NC_021839	GACAA	2	10	76362	76371	60 %	0 %	20 %	20 %	525929728
52	NC_021839	ATGGC	2	10	77227	77236	20 %	20 %	40 %	20 %	525929728
53	NC_021839	GTTAC	2	10	77331	77340	20 %	40 %	20 %	20 %	525929728
54	NC_021839	TTATT	2	10	81550	81559	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021839	GTTAT	2	10	83111	83120	20 %	60 %	20 %	0 %	525929733
56	NC_021839	TAGAT	2	10	83977	83986	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021839	GTTTT	2	10	85106	85115	0 %	80 %	20 %	0 %	525929735
58	NC_021839	AATCG	2	10	85151	85160	40 %	20 %	20 %	20 %	525929735
59	NC_021839	ACTTT	2	10	88750	88759	20 %	60 %	0 %	20 %	525929738
60	NC_021839	TTTCG	2	10	89016	89025	0 %	60 %	20 %	20 %	525929738
61	NC_021839	TACAT	2	10	89128	89137	40 %	40 %	0 %	20 %	525929738
62	NC_021839	GATAT	2	10	92226	92235	40 %	40 %	20 %	0 %	525932174
63	NC_021839	TATTT	2	10	93642	93651	20 %	80 %	0 %	0 %	525932175
64	NC_021839	ATATT	2	10	93940	93949	40 %	60 %	0 %	0 %	525932175
65	NC_021839	ATGAA	2	10	95163	95172	60 %	20 %	20 %	0 %	525932176
66	NC_021839	TAAAA	2	10	95765	95774	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021839	AGGAA	2	10	98204	98213	60 %	0 %	40 %	0 %	525932179
68	NC_021839	ATATT	2	10	98327	98336	40 %	60 %	0 %	0 %	525932179
69	NC_021839	AAGAT	2	10	98996	99005	60 %	20 %	20 %	0 %	525932180
70	NC_021839	AAATA	2	10	99013	99022	80 %	20 %	0 %	0 %	525932180
71	NC_021839	GATAT	2	10	100490	100499	40 %	40 %	20 %	0 %	525932182
72	NC_021839	ACGAA	2	10	100523	100532	60 %	0 %	20 %	20 %	525932182
73	NC_021839	CTGAA	2	10	102146	102155	40 %	20 %	20 %	20 %	525929741
74	NC_021839	TGCTT	2	10	104685	104694	0 %	60 %	20 %	20 %	525929744
75	NC_021839	GAAAT	2	10	106329	106338	60 %	20 %	20 %	0 %	525929746
76	NC_021839	TTGTT	2	10	107573	107582	0 %	80 %	20 %	0 %	525932184
77	NC_021839	TTGTT	2	10	107585	107594	0 %	80 %	20 %	0 %	525932184
78	NC_021839	TTCTT	2	10	109642	109651	0 %	80 %	0 %	20 %	525929747
79	NC_021839	AATAA	2	10	109953	109962	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021839	ATTGT	2	10	111311	111320	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021839	TCAAG	2	10	111524	111533	40 %	20 %	20 %	20 %	525929750
82	NC_021839	CTTTC	2	10	111671	111680	0 %	60 %	0 %	40 %	525929750
83	NC_021839	GCCAA	2	10	112860	112869	40 %	0 %	20 %	40 %	525929751
84	NC_021839	AAATA	2	10	118890	118899	80 %	20 %	0 %	0 %	525929753
85	NC_021839	TAGTT	2	10	120771	120780	20 %	60 %	20 %	0 %	525932186
86	NC_021839	TTTTA	2	10	121318	121327	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021839	CAAAA	2	10	121668	121677	80 %	0 %	0 %	20 %	525932187
88	NC_021839	TCACT	2	10	121988	121997	20 %	40 %	0 %	40 %	525932187
89	NC_021839	TGAAG	2	10	123282	123291	40 %	20 %	40 %	0 %	525932187
90	NC_021839	AAACG	2	10	123525	123534	60 %	0 %	20 %	20 %	525932187
91	NC_021839	AGGAG	2	10	124709	124718	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021839	ATAGA	2	10	125013	125022	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021839	CAATT	2	10	131436	131445	40 %	40 %	0 %	20 %	525929755
94	NC_021839	AATAG	2	10	133397	133406	60 %	20 %	20 %	0 %	525932189
95	NC_021839	TAAAA	2	10	133477	133486	80 %	20 %	0 %	0 %	525932190
96	NC_021839	AAATG	2	10	133891	133900	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021839	CACAC	2	10	134825	134834	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
98	NC_021839	AAACT	2	10	135099	135108	60 %	20 %	0 %	20 %	525932194
99	NC_021839	AAATT	2	10	135455	135464	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021839	CCATT	2	10	138756	138765	20 %	40 %	0 %	40 %	525929760
101	NC_021839	AGTTC	2	10	138932	138941	20 %	40 %	20 %	20 %	525929760
102	NC_021839	TTCAC	2	10	141028	141037	20 %	40 %	0 %	40 %	525929763
103	NC_021839	AGTCC	2	10	141086	141095	20 %	20 %	20 %	40 %	525929763
104	NC_021839	ATTTC	2	10	141461	141470	20 %	60 %	0 %	20 %	525929764
105	NC_021839	ACAAA	2	10	143674	143683	80 %	0 %	0 %	20 %	525929768
106	NC_021839	ATTAT	2	10	144491	144500	40 %	60 %	0 %	0 %	525929769
107	NC_021839	AAATG	2	10	144887	144896	60 %	20 %	20 %	0 %	525929769
108	NC_021839	AAAAT	2	10	145827	145836	80 %	20 %	0 %	0 %	525932196
109	NC_021839	GGCAC	2	10	148051	148060	20 %	0 %	40 %	40 %	525929770
110	NC_021839	ATTAA	2	10	149054	149063	60 %	40 %	0 %	0 %	525929771
111	NC_021839	GTGAT	2	10	150105	150114	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021839	TGAAG	2	10	150372	150381	40 %	20 %	40 %	0 %	525929772
113	NC_021839	AAAAC	2	10	151918	151927	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_021839	GGCGG	2	10	153792	153801	0 %	0 %	80 %	20 %	525929773
115	NC_021839	GAAAC	2	10	155236	155245	60 %	0 %	20 %	20 %	525932197
116	NC_021839	ATGAT	2	10	156096	156105	40 %	40 %	20 %	0 %	525929775
117	NC_021839	CGATA	2	10	156982	156991	40 %	20 %	20 %	20 %	525929775
118	NC_021839	TTGAT	2	10	158959	158968	20 %	60 %	20 %	0 %	525929779
119	NC_021839	AAAAT	2	10	159210	159219	80 %	20 %	0 %	0 %	525929779
120	NC_021839	TGGTT	2	10	163525	163534	0 %	60 %	40 %	0 %	525929784
121	NC_021839	ATTTT	2	10	165462	165471	20 %	80 %	0 %	0 %	525932201
122	NC_021839	TAAAT	2	10	165906	165915	60 %	40 %	0 %	0 %	525932202
123	NC_021839	ATATT	2	10	166874	166883	40 %	60 %	0 %	0 %	525929786
124	NC_021839	AAATC	2	10	167082	167091	60 %	20 %	0 %	20 %	525929786
125	NC_021839	TTGGC	2	10	170174	170183	0 %	40 %	40 %	20 %	525929789
126	NC_021839	CAAAA	2	10	171104	171113	80 %	0 %	0 %	20 %	525929790
127	NC_021839	CAAAA	2	10	172790	172799	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_021839	CGAAA	2	10	173984	173993	60 %	0 %	20 %	20 %	525929793
129	NC_021839	GACGT	2	10	176495	176504	20 %	20 %	40 %	20 %	525929796
130	NC_021839	TGATT	2	10	178239	178248	20 %	60 %	20 %	0 %	525929798
131	NC_021839	ATAAA	2	10	178470	178479	80 %	20 %	0 %	0 %	525932204
132	NC_021839	CGGAA	2	10	178941	178950	40 %	0 %	40 %	20 %	525929799
133	NC_021839	GTTCT	2	10	181199	181208	0 %	60 %	20 %	20 %	525932210
134	NC_021839	TAGAT	2	10	182015	182024	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021839	TTTAA	2	10	183691	183700	40 %	60 %	0 %	0 %	525929800
136	NC_021839	CCAGC	2	10	183832	183841	20 %	0 %	20 %	60 %	525929800
137	NC_021839	TTAGT	2	10	185047	185056	20 %	60 %	20 %	0 %	525929801
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