MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021839	AAGA	2	8	177112	177119	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_021839	TTG	2	6	177189	177194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929797
4003	NC_021839	AGA	2	6	177235	177240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929797
4004	NC_021839	CAAG	2	8	177290	177297	50 %	0 %	25 %	25 %	525929797
4005	NC_021839	CA	3	6	177352	177357	50 %	0 %	0 %	50 %	525929797
4006	NC_021839	AGC	2	6	177394	177399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929797
4007	NC_021839	CAA	2	6	177401	177406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929797
4008	NC_021839	A	6	6	177405	177410	100 %	0 %	0 %	0 %	525929797
4009	NC_021839	CCG	2	6	177424	177429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525929797
4010	NC_021839	CAT	2	6	177457	177462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929797
4011	NC_021839	TAG	2	6	177472	177477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929797
4012	NC_021839	TCA	2	6	177478	177483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929797
4013	NC_021839	A	6	6	177485	177490	100 %	0 %	0 %	0 %	525929797
4014	NC_021839	AAG	2	6	177516	177521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929797
4015	NC_021839	GAAA	2	8	177532	177539	75 %	0 %	25 %	0 %	525929797
4016	NC_021839	ATC	2	6	177570	177575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929797
4017	NC_021839	T	6	6	177609	177614	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021839	ATA	2	6	177637	177642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_021839	TG	3	6	177695	177700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_021839	TA	3	6	177701	177706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021839	A	6	6	177706	177711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021839	ATA	2	6	177730	177735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929798
4023	NC_021839	GAA	2	6	177743	177748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929798
4024	NC_021839	T	8	8	177752	177759	0 %	100 %	0 %	0 %	525929798
4025	NC_021839	CAA	2	6	177803	177808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929798
4026	NC_021839	CAG	2	6	177818	177823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929798
4027	NC_021839	GAC	2	6	177840	177845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929798
4028	NC_021839	GCA	2	6	177868	177873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929798
4029	NC_021839	ACA	2	6	177875	177880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929798
4030	NC_021839	A	6	6	177942	177947	100 %	0 %	0 %	0 %	525929798
4031	NC_021839	TG	3	6	178000	178005	0 %	50 %	50 %	0 %	525929798
4032	NC_021839	CAA	2	6	178028	178033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929798
4033	NC_021839	AC	3	6	178133	178138	50 %	0 %	0 %	50 %	525929798
4034	NC_021839	A	6	6	178162	178167	100 %	0 %	0 %	0 %	525929798
4035	NC_021839	CAA	2	6	178189	178194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929798
4036	NC_021839	A	7	7	178230	178236	100 %	0 %	0 %	0 %	525929798
4037	NC_021839	TGATT	2	10	178239	178248	20 %	60 %	20 %	0 %	525929798
4038	NC_021839	TTC	2	6	178249	178254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929798
4039	NC_021839	AAT	2	6	178321	178326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929798
4040	NC_021839	A	6	6	178363	178368	100 %	0 %	0 %	0 %	525929798
4041	NC_021839	AAT	2	6	178403	178408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929798
4042	NC_021839	T	6	6	178437	178442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_021839	AGG	2	6	178449	178454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021839	ATAAA	2	10	178470	178479	80 %	20 %	0 %	0 %	525932204
4045	NC_021839	GAA	2	6	178493	178498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932204
4046	NC_021839	AGT	2	6	178510	178515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932204
4047	NC_021839	AAAG	2	8	178535	178542	75 %	0 %	25 %	0 %	525932204
4048	NC_021839	A	7	7	178561	178567	100 %	0 %	0 %	0 %	525932204
4049	NC_021839	GGA	2	6	178619	178624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525932204
4050	NC_021839	TCT	2	6	178663	178668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932204
4051	NC_021839	CA	3	6	178684	178689	50 %	0 %	0 %	50 %	525932204
4052	NC_021839	CCA	2	6	178753	178758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932204
4053	NC_021839	AAC	2	6	178768	178773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932204
4054	NC_021839	A	6	6	178802	178807	100 %	0 %	0 %	0 %	525932204
4055	NC_021839	GAA	2	6	178856	178861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932204
4056	NC_021839	T	6	6	178868	178873	0 %	100 %	0 %	0 %	525932204
4057	NC_021839	GCA	2	6	178913	178918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929799
4058	NC_021839	CGGAA	2	10	178941	178950	40 %	0 %	40 %	20 %	525929799
4059	NC_021839	CAT	2	6	178953	178958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929799
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4061	NC_021839	GCG	2	6	179078	179083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525929799
4062	NC_021839	GAA	2	6	179168	179173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929799
4063	NC_021839	CATC	2	8	179193	179200	25 %	25 %	0 %	50 %	525929799
4064	NC_021839	AAC	2	6	179212	179217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929799
4065	NC_021839	GAT	2	6	179270	179275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929799
4066	NC_021839	TTTTTG	2	12	179349	179360	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525929799
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4070	NC_021839	GCT	2	6	179433	179438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929799
4071	NC_021839	ATA	3	9	179489	179497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929799
4072	NC_021839	GTT	2	6	179528	179533	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929799
4073	NC_021839	ACC	2	6	179587	179592	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525929799
4074	NC_021839	ATC	2	6	179642	179647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929799
4075	NC_021839	TTC	2	6	179684	179689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525929799
4076	NC_021839	T	7	7	179715	179721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_021839	TAT	2	6	179723	179728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_021839	TGA	2	6	179814	179819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932205
4079	NC_021839	ATC	2	6	179820	179825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932205
4080	NC_021839	TCG	2	6	179826	179831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932205
4081	NC_021839	AGT	2	6	179834	179839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932205
4082	NC_021839	TAT	2	6	179848	179853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932205
4083	NC_021839	A	7	7	179904	179910	100 %	0 %	0 %	0 %	525932205
4084	NC_021839	GAA	2	6	179941	179946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932205
4085	NC_021839	T	6	6	179957	179962	0 %	100 %	0 %	0 %	525932205
4086	NC_021839	T	6	6	179976	179981	0 %	100 %	0 %	0 %	525932205
4087	NC_021839	TGG	2	6	180048	180053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932206
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4089	NC_021839	AT	3	6	180071	180076	50 %	50 %	0 %	0 %	525932206
4090	NC_021839	T	7	7	180122	180128	0 %	100 %	0 %	0 %	525932206
4091	NC_021839	AAGT	2	8	180142	180149	50 %	25 %	25 %	0 %	525932206
4092	NC_021839	ACA	2	6	180158	180163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932206
4093	NC_021839	ATA	2	6	180275	180280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_021839	TTTC	2	8	180302	180309	0 %	75 %	0 %	25 %	525932207
4095	NC_021839	ATT	2	6	180314	180319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932207
4096	NC_021839	AAC	2	6	180369	180374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932207
4097	NC_021839	A	7	7	180403	180409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_021839	AGG	2	6	180420	180425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4099	NC_021839	CTA	2	6	180426	180431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_021839	T	6	6	180440	180445	0 %	100 %	0 %	0 %	525932208
4101	NC_021839	ATT	2	6	180452	180457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932208
4102	NC_021839	AGG	2	6	180559	180564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_021839	CTA	2	6	180565	180570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_021839	T	6	6	180579	180584	0 %	100 %	0 %	0 %	525932209
4105	NC_021839	AAC	2	6	180646	180651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932209
4106	NC_021839	AGG	2	6	180749	180754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_021839	A	7	7	180769	180775	100 %	0 %	0 %	0 %	525932210
4108	NC_021839	CAG	2	6	180791	180796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932210
4109	NC_021839	TCA	2	6	180859	180864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932210
4110	NC_021839	TTG	2	6	180908	180913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932210
4111	NC_021839	ATC	2	6	181044	181049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932210
4112	NC_021839	TAA	2	6	181119	181124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932210
4113	NC_021839	AC	3	6	181134	181139	50 %	0 %	0 %	50 %	525932210
4114	NC_021839	GTTCT	2	10	181199	181208	0 %	60 %	20 %	20 %	525932210
4115	NC_021839	CAA	2	6	181211	181216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932210
4116	NC_021839	TTA	2	6	181292	181297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_021839	AGA	2	6	181302	181307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_021839	ATCA	2	8	181315	181322	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4119	NC_021839	ATG	2	6	181439	181444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932211
4120	NC_021839	AAC	2	6	181476	181481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932211
4121	NC_021839	GTAACC	2	12	181498	181509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525932211
4122	NC_021839	CAG	2	6	181511	181516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932211
4123	NC_021839	TTA	2	6	181541	181546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932211
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4125	NC_021839	A	6	6	181675	181680	100 %	0 %	0 %	0 %	525932211
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