MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41502	NC_021839	AAT	2	6	1813470	1813475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931227
41503	NC_021839	TCT	2	6	1813476	1813481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931227
41504	NC_021839	AGA	2	6	1813511	1813516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931227
41505	NC_021839	CTT	2	6	1813540	1813545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931227
41506	NC_021839	A	8	8	1813582	1813589	100 %	0 %	0 %	0 %	525931227
41507	NC_021839	TG	3	6	1813628	1813633	0 %	50 %	50 %	0 %	525931227
41508	NC_021839	GTTTG	2	10	1813661	1813670	0 %	60 %	40 %	0 %	525931227
41509	NC_021839	TCG	2	6	1813756	1813761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931227
41510	NC_021839	AAT	3	9	1813862	1813870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41511	NC_021839	T	6	6	1813979	1813984	0 %	100 %	0 %	0 %	525931228
41512	NC_021839	TCT	2	6	1813990	1813995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931228
41513	NC_021839	CCA	2	6	1814008	1814013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931228
41514	NC_021839	TTC	2	6	1814157	1814162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931228
41515	NC_021839	GCA	2	6	1814215	1814220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931228
41516	NC_021839	CTA	2	6	1814246	1814251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931228
41517	NC_021839	TCG	2	6	1814254	1814259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931228
41518	NC_021839	TAA	2	6	1814285	1814290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931228
41519	NC_021839	CTT	2	6	1814300	1814305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931228
41520	NC_021839	TAC	2	6	1814391	1814396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931228
41521	NC_021839	GTT	2	6	1814414	1814419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931228
41522	NC_021839	TC	3	6	1814473	1814478	0 %	50 %	0 %	50 %	525931228
41523	NC_021839	CTT	2	6	1814480	1814485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931228
41524	NC_021839	GATC	2	8	1814537	1814544	25 %	25 %	25 %	25 %	525931228
41525	NC_021839	TCA	2	6	1814593	1814598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41526	NC_021839	TGA	2	6	1814629	1814634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931229
41527	NC_021839	AGT	2	6	1814646	1814651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931229
41528	NC_021839	TAA	2	6	1814674	1814679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931229
41529	NC_021839	CAC	2	6	1814734	1814739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931229
41530	NC_021839	GTTC	2	8	1814796	1814803	0 %	50 %	25 %	25 %	525931229
41531	NC_021839	CGC	2	6	1814827	1814832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525931229
41532	NC_021839	TCA	2	6	1814931	1814936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931229
41533	NC_021839	T	6	6	1814972	1814977	0 %	100 %	0 %	0 %	525931229
41534	NC_021839	GAT	2	6	1814987	1814992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931229
41535	NC_021839	T	6	6	1814994	1814999	0 %	100 %	0 %	0 %	525931229
41536	NC_021839	GGAAGT	2	12	1815054	1815065	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	525931229
41537	NC_021839	CAC	2	6	1815145	1815150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931229
41538	NC_021839	GAC	2	6	1815161	1815166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931229
41539	NC_021839	GTT	2	6	1815216	1815221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525931229
41540	NC_021839	CAT	2	6	1815247	1815252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931229
41541	NC_021839	TCT	2	6	1815261	1815266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931229
41542	NC_021839	TTTG	2	8	1815318	1815325	0 %	75 %	25 %	0 %	525931229
41543	NC_021839	GTTAG	2	10	1815387	1815396	20 %	40 %	40 %	0 %	525931229
41544	NC_021839	CGGT	2	8	1815463	1815470	0 %	25 %	50 %	25 %	525931229
41545	NC_021839	ATA	2	6	1815521	1815526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931229
41546	NC_021839	TTCT	2	8	1815554	1815561	0 %	75 %	0 %	25 %	525931229
41547	NC_021839	GA	4	8	1815624	1815631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41548	NC_021839	A	8	8	1815636	1815643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41549	NC_021839	TCT	3	9	1815676	1815684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931230
41550	NC_021839	GCG	2	6	1815695	1815700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525931230
41551	NC_021839	TGA	2	6	1815779	1815784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931230
41552	NC_021839	TAA	2	6	1815792	1815797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931230
41553	NC_021839	ATTC	2	8	1815968	1815975	25 %	50 %	0 %	25 %	525931230
41554	NC_021839	ACAA	2	8	1816065	1816072	75 %	0 %	0 %	25 %	525931230
41555	NC_021839	ATA	2	6	1816120	1816125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931231
41556	NC_021839	TCT	2	6	1816126	1816131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931231
41557	NC_021839	T	6	6	1816155	1816160	0 %	100 %	0 %	0 %	525931231
41558	NC_021839	ATT	2	6	1816180	1816185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931231
41559	NC_021839	ATA	2	6	1816196	1816201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931231
41560	NC_021839	CTC	2	6	1816215	1816220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525931231
41561	NC_021839	ACT	2	6	1816304	1816309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931231
41562	NC_021839	CGCT	2	8	1816310	1816317	0 %	25 %	25 %	50 %	525931231
41563	NC_021839	TCT	2	6	1816334	1816339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931231
41564	NC_021839	AATG	2	8	1816503	1816510	50 %	25 %	25 %	0 %	525931231
41565	NC_021839	TGA	2	6	1816517	1816522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931231
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41569	NC_021839	TTCTGC	2	12	1816729	1816740	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525931231
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41571	NC_021839	CTT	2	6	1816803	1816808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931231
41572	NC_021839	CAG	2	6	1816884	1816889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931231
41573	NC_021839	T	6	6	1816917	1816922	0 %	100 %	0 %	0 %	525931231
41574	NC_021839	CAC	2	6	1816933	1816938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525931231
41575	NC_021839	ACT	2	6	1817018	1817023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931231
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41577	NC_021839	TCA	2	6	1817081	1817086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931231
41578	NC_021839	ATTC	2	8	1817099	1817106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41579	NC_021839	CTTT	2	8	1817110	1817117	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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41583	NC_021839	TAA	2	6	1817270	1817275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931232
41584	NC_021839	ATC	2	6	1817276	1817281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931232
41585	NC_021839	TCT	2	6	1817367	1817372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931232
41586	NC_021839	ATA	2	6	1817397	1817402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931232
41587	NC_021839	TA	3	6	1817423	1817428	50 %	50 %	0 %	0 %	525931232
41588	NC_021839	AT	3	6	1817439	1817444	50 %	50 %	0 %	0 %	525931232
41589	NC_021839	TCT	2	6	1817445	1817450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931232
41590	NC_021839	CG	3	6	1817506	1817511	0 %	0 %	50 %	50 %	525931232
41591	NC_021839	AGC	2	6	1817522	1817527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525931232
41592	NC_021839	GAA	2	6	1817540	1817545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931232
41593	NC_021839	GCT	2	6	1817592	1817597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931232
41594	NC_021839	T	7	7	1817632	1817638	0 %	100 %	0 %	0 %	525931232
41595	NC_021839	TTC	3	9	1817663	1817671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931232
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41597	NC_021839	CTTT	2	8	1817799	1817806	0 %	75 %	0 %	25 %	525931232
41598	NC_021839	TTC	2	6	1817972	1817977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525931232
41599	NC_021839	AT	3	6	1818009	1818014	50 %	50 %	0 %	0 %	525931232
41600	NC_021839	TAGAAC	2	12	1818037	1818048	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525931232
41601	NC_021839	GAT	2	6	1818128	1818133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525931232
41602	NC_021839	ATA	2	6	1818164	1818169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931232
41603	NC_021839	T	6	6	1818184	1818189	0 %	100 %	0 %	0 %	525931232
41604	NC_021839	TAA	2	6	1818203	1818208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931233
41605	NC_021839	AATTCC	2	12	1818227	1818238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931233
41606	NC_021839	TAA	2	6	1818245	1818250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931233
41607	NC_021839	T	6	6	1818275	1818280	0 %	100 %	0 %	0 %	525931233
41608	NC_021839	AAG	2	6	1818297	1818302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931233
41609	NC_021839	CAT	2	6	1818364	1818369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525931233
41610	NC_021839	T	6	6	1818484	1818489	0 %	100 %	0 %	0 %	525931233
41611	NC_021839	T	6	6	1818493	1818498	0 %	100 %	0 %	0 %	525931233
41612	NC_021839	AATA	2	8	1818527	1818534	75 %	25 %	0 %	0 %	525931233
41613	NC_021839	ATA	2	6	1818539	1818544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525931233
41614	NC_021839	AAG	2	6	1818575	1818580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931233
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41616	NC_021839	TAT	2	6	1818712	1818717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525931233
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41618	NC_021839	TCC	2	6	1818759	1818764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525931233
41619	NC_021839	AAG	2	6	1818838	1818843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525931233
41620	NC_021839	TTTATC	2	12	1818851	1818862	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525931233
41621	NC_021839	GATTG	2	10	1818913	1818922	20 %	40 %	40 %	0 %	525931233
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41623	NC_021839	T	7	7	1818983	1818989	0 %	100 %	0 %	0 %	525931233
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41633	NC_021839	AAAT	2	8	1819749	1819756	75 %	25 %	0 %	0 %	525931234
41634	NC_021839	TGC	2	6	1819776	1819781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525931234
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41711	NC_021839	GA	3	6	1823029	1823034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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