MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021839	ATTTG	2	10	23305	23314	20 %	60 %	20 %	0 %	525929698
502	NC_021839	TGG	2	6	23371	23376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929698
503	NC_021839	ACC	2	6	23472	23477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525929698
504	NC_021839	AAG	2	6	23478	23483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929698
505	NC_021839	CTG	2	6	23535	23540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525929698
506	NC_021839	A	6	6	23543	23548	100 %	0 %	0 %	0 %	525929698
507	NC_021839	CAA	2	6	23569	23574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525929698
508	NC_021839	GTGAGC	2	12	23583	23594	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525929698
509	NC_021839	ATT	2	6	23646	23651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525929698
510	NC_021839	GTT	2	6	23744	23749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929698
511	NC_021839	TG	3	6	23762	23767	0 %	50 %	50 %	0 %	525929698
512	NC_021839	ATTGAT	2	12	23777	23788	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525929698
513	NC_021839	GCA	2	6	23865	23870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929698
514	NC_021839	GCA	2	6	23984	23989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525929698
515	NC_021839	ACT	2	6	24005	24010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525929698
516	NC_021839	A	7	7	24020	24026	100 %	0 %	0 %	0 %	525929698
517	NC_021839	TGA	2	6	24031	24036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929698
518	NC_021839	TTG	2	6	24072	24077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525929698
519	NC_021839	AGA	2	6	24082	24087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525929698
520	NC_021839	AAT	2	6	24106	24111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525929698
521	NC_021839	ATG	2	6	24136	24141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929698
522	NC_021839	AGC	2	6	24149	24154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_021839	AT	3	6	24155	24160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_021839	TGC	2	6	24168	24173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_021839	TTC	2	6	24174	24179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_021839	TGT	2	6	24184	24189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_021839	ATA	2	6	24239	24244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_021839	GATA	2	8	24277	24284	50 %	25 %	25 %	0 %	525932159
529	NC_021839	ACT	2	6	24338	24343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932159
530	NC_021839	A	6	6	24388	24393	100 %	0 %	0 %	0 %	525932159
531	NC_021839	TGC	2	6	24403	24408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932159
532	NC_021839	ATT	2	6	24423	24428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932159
533	NC_021839	TAA	2	6	24433	24438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932159
534	NC_021839	CAA	2	6	24446	24451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932159
535	NC_021839	GAT	2	6	24472	24477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932159
536	NC_021839	T	7	7	24508	24514	0 %	100 %	0 %	0 %	525932159
537	NC_021839	TTG	2	6	24522	24527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932159
538	NC_021839	CTAT	2	8	24541	24548	25 %	50 %	0 %	25 %	525932159
539	NC_021839	GATT	2	8	24645	24652	25 %	50 %	25 %	0 %	525932159
540	NC_021839	AGA	2	6	24676	24681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932159
541	NC_021839	ATT	2	6	24752	24757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932159
542	NC_021839	TGA	2	6	24763	24768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932159
543	NC_021839	ATT	2	6	24795	24800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932159
544	NC_021839	TAA	2	6	24801	24806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932159
545	NC_021839	TACTG	2	10	24830	24839	20 %	40 %	20 %	20 %	525932159
546	NC_021839	TAAAAA	2	12	24847	24858	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525932159
547	NC_021839	CTTT	2	8	24905	24912	0 %	75 %	0 %	25 %	525932159
548	NC_021839	TGA	2	6	24913	24918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932159
549	NC_021839	TTA	2	6	24938	24943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932159
550	NC_021839	AGA	2	6	24982	24987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932159
551	NC_021839	T	6	6	25011	25016	0 %	100 %	0 %	0 %	525932159
552	NC_021839	TGC	2	6	25033	25038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932159
553	NC_021839	TGC	2	6	25051	25056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932159
554	NC_021839	A	7	7	25057	25063	100 %	0 %	0 %	0 %	525932159
555	NC_021839	AAC	2	6	25155	25160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932159
556	NC_021839	TAA	3	9	25254	25262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932159
557	NC_021839	GA	3	6	25263	25268	50 %	0 %	50 %	0 %	525932159
558	NC_021839	TC	3	6	25282	25287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
559	NC_021839	TTA	2	6	25288	25293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_021839	ATT	2	6	25333	25338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_021839	AT	3	6	25345	25350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_021839	GAA	2	6	25419	25424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932160
563	NC_021839	TAT	2	6	25443	25448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932160
564	NC_021839	TTG	2	6	25462	25467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932160
565	NC_021839	GAT	2	6	25582	25587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932160
566	NC_021839	A	6	6	25591	25596	100 %	0 %	0 %	0 %	525932160
567	NC_021839	TGAATC	2	12	25632	25643	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525932160
568	NC_021839	GCG	2	6	25684	25689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525932160
569	NC_021839	GAT	2	6	25768	25773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932160
570	NC_021839	ATA	2	6	25784	25789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932160
571	NC_021839	GCT	2	6	25807	25812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932160
572	NC_021839	CGG	2	6	25847	25852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525932160
573	NC_021839	TAT	2	6	25867	25872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932160
574	NC_021839	T	6	6	25883	25888	0 %	100 %	0 %	0 %	525932160
575	NC_021839	GAT	2	6	25894	25899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932160
576	NC_021839	AAT	2	6	26098	26103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932160
577	NC_021839	TGT	2	6	26109	26114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932160
578	NC_021839	AAAT	2	8	26156	26163	75 %	25 %	0 %	0 %	525932160
579	NC_021839	ATG	2	6	26272	26277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932160
580	NC_021839	TG	3	6	26302	26307	0 %	50 %	50 %	0 %	525932160
581	NC_021839	T	6	6	26528	26533	0 %	100 %	0 %	0 %	525932160
582	NC_021839	TAG	2	6	26555	26560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932160
583	NC_021839	AAGA	2	8	26581	26588	75 %	0 %	25 %	0 %	525932160
584	NC_021839	ATG	2	6	26661	26666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932161
585	NC_021839	AAG	2	6	26670	26675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932161
586	NC_021839	ATT	2	6	26677	26682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932161
587	NC_021839	TAT	2	6	26900	26905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932161
588	NC_021839	AT	3	6	26943	26948	50 %	50 %	0 %	0 %	525932161
589	NC_021839	GTT	2	6	26961	26966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932161
590	NC_021839	TCT	2	6	26983	26988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932161
591	NC_021839	A	7	7	27045	27051	100 %	0 %	0 %	0 %	525932161
592	NC_021839	GAT	2	6	27122	27127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932161
593	NC_021839	ATTT	2	8	27217	27224	25 %	75 %	0 %	0 %	525932161
594	NC_021839	TGGA	2	8	27296	27303	25 %	25 %	50 %	0 %	525932161
595	NC_021839	GCTACT	2	12	27324	27335	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525932161
596	NC_021839	T	6	6	27342	27347	0 %	100 %	0 %	0 %	525932161
597	NC_021839	TTGC	2	8	27354	27361	0 %	50 %	25 %	25 %	525932161
598	NC_021839	CTT	2	6	27363	27368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932161
599	NC_021839	TTG	2	6	27468	27473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932161
600	NC_021839	GCA	2	6	27477	27482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932161
601	NC_021839	GCG	2	6	27660	27665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525932161
602	NC_021839	ATGG	2	8	27669	27676	25 %	25 %	50 %	0 %	525932161
603	NC_021839	ATTT	2	8	27691	27698	25 %	75 %	0 %	0 %	525932161
604	NC_021839	CAA	2	6	27750	27755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932161
605	NC_021839	ATAA	2	8	27768	27775	75 %	25 %	0 %	0 %	525932161
606	NC_021839	ATCT	2	8	27786	27793	25 %	50 %	0 %	25 %	525932161
607	NC_021839	TGG	2	6	27800	27805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932161
608	NC_021839	CATT	2	8	27925	27932	25 %	50 %	0 %	25 %	525932161
609	NC_021839	AC	3	6	27961	27966	50 %	0 %	0 %	50 %	525932161
610	NC_021839	AAG	2	6	27982	27987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932161
611	NC_021839	TGAAA	2	10	27996	28005	60 %	20 %	20 %	0 %	525932161
612	NC_021839	TTG	2	6	28030	28035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932162
613	NC_021839	TTATG	2	10	28190	28199	20 %	60 %	20 %	0 %	525932162
614	NC_021839	TTG	2	6	28217	28222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932162
615	NC_021839	GT	3	6	28225	28230	0 %	50 %	50 %	0 %	525932162
616	NC_021839	T	6	6	28468	28473	0 %	100 %	0 %	0 %	525932162
617	NC_021839	ATG	2	6	28507	28512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932162
618	NC_021839	CGA	2	6	28520	28525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932162
619	NC_021839	TAT	2	6	28569	28574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932162
620	NC_021839	TGGA	2	8	28609	28616	25 %	25 %	50 %	0 %	525932162
621	NC_021839	AAC	2	6	28698	28703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932162
622	NC_021839	GGCT	2	8	28731	28738	0 %	25 %	50 %	25 %	525932162
623	NC_021839	ATTG	2	8	28743	28750	25 %	50 %	25 %	0 %	525932162
624	NC_021839	TTTA	2	8	28771	28778	25 %	75 %	0 %	0 %	525932162
625	NC_021839	GTG	2	6	28811	28816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932162
626	NC_021839	TGG	2	6	28869	28874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929699
627	NC_021839	GAT	2	6	29031	29036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525929699
628	NC_021839	GGT	2	6	29037	29042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929699
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630	NC_021839	TGG	2	6	29152	29157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525929699
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