MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Listeria monocytogenes strain J1776

Total Repeats: 67464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_021839	ACG	2	6	219089	219094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5002	NC_021839	ACAAA	2	10	219103	219112	80 %	0 %	0 %	20 %	525932217
5003	NC_021839	AAG	2	6	219179	219184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5004	NC_021839	AAAC	2	8	219208	219215	75 %	0 %	0 %	25 %	525932217
5005	NC_021839	CTT	2	6	219231	219236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932217
5006	NC_021839	ACCA	2	8	219344	219351	50 %	0 %	0 %	50 %	525932217
5007	NC_021839	AGA	2	6	219438	219443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5008	NC_021839	AAAT	2	8	219543	219550	75 %	25 %	0 %	0 %	525932217
5009	NC_021839	AGC	2	6	219621	219626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5010	NC_021839	TGAAG	2	10	219648	219657	40 %	20 %	40 %	0 %	525932217
5011	NC_021839	ATG	2	6	219713	219718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5012	NC_021839	CG	4	8	219720	219727	0 %	0 %	50 %	50 %	525932217
5013	NC_021839	GCC	2	6	219895	219900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525932217
5014	NC_021839	TAAA	2	8	219926	219933	75 %	25 %	0 %	0 %	525932217
5015	NC_021839	CGA	2	6	219935	219940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5016	NC_021839	A	6	6	220210	220215	100 %	0 %	0 %	0 %	525932217
5017	NC_021839	TAG	2	6	220217	220222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5018	NC_021839	ATA	2	6	220232	220237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932217
5019	NC_021839	AT	3	6	220410	220415	50 %	50 %	0 %	0 %	525932217
5020	NC_021839	GAA	2	6	220455	220460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5021	NC_021839	CAA	2	6	220469	220474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932217
5022	NC_021839	GAATTC	2	12	220495	220506	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525932217
5023	NC_021839	ATG	2	6	220511	220516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5024	NC_021839	TATT	2	8	220609	220616	25 %	75 %	0 %	0 %	525932217
5025	NC_021839	CTG	2	6	220703	220708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5026	NC_021839	GAA	2	6	220822	220827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5027	NC_021839	ACC	2	6	220855	220860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932217
5028	NC_021839	CCAA	2	8	220879	220886	50 %	0 %	0 %	50 %	525932217
5029	NC_021839	AGA	2	6	220887	220892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5030	NC_021839	TCA	2	6	220917	220922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932217
5031	NC_021839	GAAC	2	8	220993	221000	50 %	0 %	25 %	25 %	525932217
5032	NC_021839	ACT	2	6	221003	221008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932217
5033	NC_021839	TTG	2	6	221018	221023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932217
5034	NC_021839	AAT	2	6	221041	221046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932217
5035	NC_021839	AGT	2	6	221091	221096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5036	NC_021839	GGC	2	6	221146	221151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525932217
5037	NC_021839	GAA	3	9	221314	221322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5038	NC_021839	A	6	6	221374	221379	100 %	0 %	0 %	0 %	525932217
5039	NC_021839	CCA	2	6	221398	221403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932217
5040	NC_021839	AGA	3	9	221451	221459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5041	NC_021839	AACA	2	8	221556	221563	75 %	0 %	0 %	25 %	525932217
5042	NC_021839	AGA	2	6	221634	221639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5043	NC_021839	ACAA	2	8	221666	221673	75 %	0 %	0 %	25 %	525932217
5044	NC_021839	TTA	2	6	221734	221739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932217
5045	NC_021839	AGA	2	6	221766	221771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5046	NC_021839	AAC	2	6	221784	221789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932217
5047	NC_021839	GAA	2	6	221800	221805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5048	NC_021839	A	7	7	221839	221845	100 %	0 %	0 %	0 %	525932217
5049	NC_021839	CAA	2	6	221872	221877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932217
5050	NC_021839	AGA	2	6	221900	221905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5051	NC_021839	ATG	2	6	221924	221929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5052	NC_021839	AAAG	2	8	221940	221947	75 %	0 %	25 %	0 %	525932217
5053	NC_021839	AAG	2	6	222014	222019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5054	NC_021839	AAG	2	6	222035	222040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5055	NC_021839	ACG	2	6	222163	222168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5056	NC_021839	GTG	2	6	222272	222277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932217
5057	NC_021839	CAG	2	6	222287	222292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5058	NC_021839	ACTT	2	8	222296	222303	25 %	50 %	0 %	25 %	525932217
5059	NC_021839	TCAG	2	8	222393	222400	25 %	25 %	25 %	25 %	525932217
5060	NC_021839	CGG	2	6	222414	222419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525932217
5061	NC_021839	AAC	2	6	222507	222512	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932217
5062	NC_021839	CATC	2	8	222641	222648	25 %	25 %	0 %	50 %	525932217
5063	NC_021839	CGG	2	6	222657	222662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525932217
5064	NC_021839	AAC	2	6	222734	222739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932217
5065	NC_021839	AAAGGA	2	12	222751	222762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5066	NC_021839	CAG	2	6	222831	222836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5067	NC_021839	CTGG	2	8	222866	222873	0 %	25 %	50 %	25 %	525932217
5068	NC_021839	AGT	2	6	222909	222914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5069	NC_021839	GTG	2	6	222932	222937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525932217
5070	NC_021839	CAA	2	6	222965	222970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932217
5071	NC_021839	AC	3	6	222982	222987	50 %	0 %	0 %	50 %	525932217
5072	NC_021839	AAG	2	6	223016	223021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5073	NC_021839	AGA	2	6	223056	223061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5074	NC_021839	ATT	2	6	223100	223105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932217
5075	NC_021839	CTT	2	6	223142	223147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932217
5076	NC_021839	AGT	2	6	223197	223202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5077	NC_021839	ACCA	2	8	223209	223216	50 %	0 %	0 %	50 %	525932217
5078	NC_021839	AATCA	2	10	223221	223230	60 %	20 %	0 %	20 %	525932217
5079	NC_021839	GAC	2	6	223282	223287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5080	NC_021839	A	6	6	223317	223322	100 %	0 %	0 %	0 %	525932217
5081	NC_021839	ACG	2	6	223328	223333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5082	NC_021839	CAGC	2	8	223352	223359	25 %	0 %	25 %	50 %	525932217
5083	NC_021839	GAA	2	6	223366	223371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5084	NC_021839	CAA	2	6	223437	223442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932217
5085	NC_021839	A	7	7	223441	223447	100 %	0 %	0 %	0 %	525932217
5086	NC_021839	ATG	2	6	223457	223462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5087	NC_021839	ACG	2	6	223520	223525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5088	NC_021839	ACC	2	6	223537	223542	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525932217
5089	NC_021839	A	7	7	223544	223550	100 %	0 %	0 %	0 %	525932217
5090	NC_021839	A	7	7	223574	223580	100 %	0 %	0 %	0 %	525932217
5091	NC_021839	TAA	2	6	223668	223673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932217
5092	NC_021839	CAAA	2	8	223798	223805	75 %	0 %	0 %	25 %	525932217
5093	NC_021839	CGA	2	6	223812	223817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5094	NC_021839	ACG	2	6	223847	223852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5095	NC_021839	CAA	2	6	223919	223924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932217
5096	NC_021839	CAG	2	6	224096	224101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5097	NC_021839	TAG	2	6	224163	224168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5098	NC_021839	GCA	2	6	224212	224217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5099	NC_021839	ACA	2	6	224237	224242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932217
5100	NC_021839	AAC	2	6	224256	224261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525932217
5101	NC_021839	ATG	2	6	224270	224275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5102	NC_021839	CAAC	2	8	224280	224287	50 %	0 %	0 %	50 %	525932217
5103	NC_021839	CA	3	6	224352	224357	50 %	0 %	0 %	50 %	525932217
5104	NC_021839	ATG	2	6	224405	224410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5105	NC_021839	AGC	2	6	224518	224523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5106	NC_021839	A	7	7	224529	224535	100 %	0 %	0 %	0 %	525932217
5107	NC_021839	GAGC	2	8	224541	224548	25 %	0 %	50 %	25 %	525932217
5108	NC_021839	TACG	2	8	224562	224569	25 %	25 %	25 %	25 %	525932217
5109	NC_021839	ATG	2	6	224570	224575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5110	NC_021839	TCG	2	6	224580	224585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5111	NC_021839	GAC	2	6	224610	224615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5112	NC_021839	AGT	2	6	224676	224681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5113	NC_021839	GAT	2	6	224701	224706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5114	NC_021839	GATGAA	2	12	224721	224732	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525932217
5115	NC_021839	TAT	2	6	224746	224751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932217
5116	NC_021839	ATG	2	6	224822	224827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5117	NC_021839	AGA	2	6	224862	224867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932217
5118	NC_021839	TTA	2	6	224943	224948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932217
5119	NC_021839	GT	3	6	224963	224968	0 %	50 %	50 %	0 %	525932217
5120	NC_021839	GACCCA	2	12	224980	224991	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525932217
5121	NC_021839	TGA	2	6	224994	224999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5122	NC_021839	GAC	2	6	225001	225006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525932217
5123	NC_021839	AAT	3	9	225037	225045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932217
5124	NC_021839	TGA	2	6	225050	225055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932217
5125	NC_021839	TTG	2	6	225137	225142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525932217
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5127	NC_021839	A	6	6	225187	225192	100 %	0 %	0 %	0 %	525932217
5128	NC_021839	AAT	2	6	225220	225225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932217
5129	NC_021839	A	8	8	225313	225320	100 %	0 %	0 %	0 %	525932217
5130	NC_021839	ATA	2	6	225335	225340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932217
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5133	NC_021839	GA	3	6	225395	225400	50 %	0 %	50 %	0 %	525932217
5134	NC_021839	AAAG	2	8	225430	225437	75 %	0 %	25 %	0 %	525932217
5135	NC_021839	CAT	2	6	225512	225517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932217
5136	NC_021839	AGG	2	6	225531	225536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5137	NC_021839	TAAAAA	2	12	225549	225560	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525932218
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5140	NC_021839	A	7	7	225624	225630	100 %	0 %	0 %	0 %	525932218
5141	NC_021839	T	6	6	225642	225647	0 %	100 %	0 %	0 %	525932218
5142	NC_021839	GAA	2	6	225653	225658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932218
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5144	NC_021839	TGA	2	6	225727	225732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932218
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5153	NC_021839	AT	3	6	225936	225941	50 %	50 %	0 %	0 %	525932218
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5163	NC_021839	A	6	6	226232	226237	100 %	0 %	0 %	0 %	525932218
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5168	NC_021839	AGGG	2	8	226396	226403	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5169	NC_021839	AAATC	2	10	226420	226429	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5170	NC_021839	ATAA	2	8	226451	226458	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5181	NC_021839	A	6	6	226903	226908	100 %	0 %	0 %	0 %	525932219
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5186	NC_021839	AT	4	8	227000	227007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5187	NC_021839	A	7	7	227012	227018	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5188	NC_021839	AATTAG	2	12	227183	227194	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525932220
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5205	NC_021839	ATT	2	6	227871	227876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5207	NC_021839	TA	3	6	227990	227995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5208	NC_021839	AGC	2	6	228017	228022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5210	NC_021839	TACG	2	8	228061	228068	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5211	NC_021839	ATG	2	6	228069	228074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5227	NC_021839	A	6	6	228668	228673	100 %	0 %	0 %	0 %	525932222
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5230	NC_021839	GAAAC	2	10	228713	228722	60 %	0 %	20 %	20 %	525932222
5231	NC_021839	TTA	2	6	228834	228839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932222
5232	NC_021839	A	7	7	228875	228881	100 %	0 %	0 %	0 %	525932222
5233	NC_021839	AGAA	2	8	228887	228894	75 %	0 %	25 %	0 %	525932222
5234	NC_021839	TAA	2	6	228907	228912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932222
5235	NC_021839	ATT	2	6	228920	228925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525932222
5236	NC_021839	AAAATT	2	12	228950	228961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525932222
5237	NC_021839	GAAA	2	8	228977	228984	75 %	0 %	25 %	0 %	525932222
5238	NC_021839	AG	3	6	229012	229017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_021839	GAA	2	6	229038	229043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932223
5240	NC_021839	ATG	2	6	229096	229101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525932223
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5242	NC_021839	CTT	2	6	229130	229135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525932223
5243	NC_021839	GAA	2	6	229197	229202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932223
5244	NC_021839	AT	3	6	229220	229225	50 %	50 %	0 %	0 %	525932223
5245	NC_021839	ACT	2	6	229247	229252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525932223
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5247	NC_021839	AAG	2	6	229353	229358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525932223
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5361	NC_021839	GA	3	6	233204	233209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5362	NC_021839	AGA	2	6	233262	233267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5364	NC_021839	GAA	2	6	233364	233369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5365	NC_021839	T	7	7	233455	233461	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5366	NC_021839	T	6	6	233541	233546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5367	NC_021839	TAT	3	9	233560	233568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_021839	TA	3	6	233593	233598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5369	NC_021839	GAA	2	6	233599	233604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5370	NC_021839	A	7	7	233608	233614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5371	NC_021839	AAT	2	6	233654	233659	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5372	NC_021839	AACAT	2	10	233697	233706	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5373	NC_021839	TA	4	8	233761	233768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5374	NC_021839	GAAC	2	8	233783	233790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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