MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Listeria monocytogenes strain R2-502

Total Repeats: 2232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021838	AGCTT	2	10	2079	2088	20 %	40 %	20 %	20 %	525924643
2	NC_021838	GTATT	2	10	2315	2324	20 %	60 %	20 %	0 %	525924643
3	NC_021838	TGACT	2	10	2576	2585	20 %	40 %	20 %	20 %	525924643
4	NC_021838	TGCCA	2	10	4011	4020	20 %	20 %	20 %	40 %	525924644
5	NC_021838	TAATC	2	10	5292	5301	40 %	40 %	0 %	20 %	525927167
6	NC_021838	TGATT	2	10	6218	6227	20 %	60 %	20 %	0 %	525927169
7	NC_021838	GCGTA	2	10	6952	6961	20 %	20 %	40 %	20 %	525924646
8	NC_021838	ATAAA	2	10	9267	9276	80 %	20 %	0 %	0 %	525927172
9	NC_021838	CCACT	2	10	9654	9663	20 %	20 %	0 %	60 %	525927173
10	NC_021838	GCTTA	2	10	12344	12353	20 %	40 %	20 %	20 %	525924649
11	NC_021838	TTCTG	2	10	12907	12916	0 %	60 %	20 %	20 %	525924649
12	NC_021838	CTTCA	2	10	13615	13624	20 %	40 %	0 %	40 %	525927179
13	NC_021838	TCAAT	2	10	14262	14271	40 %	40 %	0 %	20 %	525927181
14	NC_021838	AATGA	2	10	14750	14759	60 %	20 %	20 %	0 %	525924650
15	NC_021838	AGAAT	2	10	14840	14849	60 %	20 %	20 %	0 %	525924650
16	NC_021838	CAAAA	2	10	14934	14943	80 %	0 %	0 %	20 %	525924650
17	NC_021838	AAAAG	2	10	15029	15038	80 %	0 %	20 %	0 %	525924650
18	NC_021838	ACTTG	2	10	15249	15258	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_021838	TATAA	2	10	15332	15341	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021838	TGAAC	2	10	15393	15402	40 %	20 %	20 %	20 %	525927183
21	NC_021838	AGAAA	2	10	15460	15469	80 %	0 %	20 %	0 %	525927183
22	NC_021838	TTATT	2	10	15900	15909	20 %	80 %	0 %	0 %	525927185
23	NC_021838	ATATG	2	10	16327	16336	40 %	40 %	20 %	0 %	525927185
24	NC_021838	AAAAT	2	10	16552	16561	80 %	20 %	0 %	0 %	525927185
25	NC_021838	CTTTT	2	10	17640	17649	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_021838	CTTTT	2	10	18753	18762	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021838	AAATG	2	10	18971	18980	60 %	20 %	20 %	0 %	525927189
28	NC_021838	AAAGG	2	10	20793	20802	60 %	0 %	40 %	0 %	525924651
29	NC_021838	TCACT	2	10	21039	21048	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_021838	AATCC	2	10	22768	22777	40 %	20 %	0 %	40 %	525924652
31	NC_021838	GTTTG	2	10	25857	25866	0 %	60 %	40 %	0 %	525924655
32	NC_021838	GATGT	2	10	25867	25876	20 %	40 %	40 %	0 %	525924655
33	NC_021838	ATTTT	2	10	26688	26697	20 %	80 %	0 %	0 %	525924656
34	NC_021838	TTTAC	2	10	26870	26879	20 %	60 %	0 %	20 %	525924657
35	NC_021838	GAATT	2	10	28136	28145	40 %	40 %	20 %	0 %	525924658
36	NC_021838	CAAAT	2	10	30078	30087	60 %	20 %	0 %	20 %	525924660
37	NC_021838	TTTCT	2	10	31010	31019	0 %	80 %	0 %	20 %	525924660
38	NC_021838	ATATT	2	10	31384	31393	40 %	60 %	0 %	0 %	525924662
39	NC_021838	GAATC	2	10	32262	32271	40 %	20 %	20 %	20 %	525924662
40	NC_021838	TTTAT	2	10	36301	36310	20 %	80 %	0 %	0 %	525924668
41	NC_021838	CTATA	2	10	36483	36492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_021838	TTTCT	2	10	37904	37913	0 %	80 %	0 %	20 %	525924670
43	NC_021838	GGTTT	2	10	41025	41034	0 %	60 %	40 %	0 %	525924671
44	NC_021838	AGATA	2	10	41637	41646	60 %	20 %	20 %	0 %	525924672
45	NC_021838	TGTTT	2	10	41929	41938	0 %	80 %	20 %	0 %	525924672
46	NC_021838	GAAAA	2	10	42580	42589	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021838	TCGAA	2	10	49838	49847	40 %	20 %	20 %	20 %	525924679
48	NC_021838	AAATG	2	10	50142	50151	60 %	20 %	20 %	0 %	525924679
49	NC_021838	CGACA	2	10	50793	50802	40 %	0 %	20 %	40 %	525924679
50	NC_021838	TTATC	2	10	50810	50819	20 %	60 %	0 %	20 %	525924679
51	NC_021838	AAACC	2	10	51475	51484	60 %	0 %	0 %	40 %	525924680
52	NC_021838	AAATA	2	10	53585	53594	80 %	20 %	0 %	0 %	525924681
53	NC_021838	TCCGT	2	10	53696	53705	0 %	40 %	20 %	40 %	525924681
54	NC_021838	TTAAT	2	10	53994	54003	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021838	TTACC	2	10	57998	58007	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_021838	CACGA	2	10	59719	59728	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_021838	AATTA	2	10	60878	60887	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021838	CTTCG	2	10	61696	61705	0 %	40 %	20 %	40 %	525924682
59	NC_021838	GTTTG	2	10	63760	63769	0 %	60 %	40 %	0 %	525924684
60	NC_021838	ATTTT	2	10	64171	64180	20 %	80 %	0 %	0 %	525924685
61	NC_021838	CTTTC	2	10	67988	67997	0 %	60 %	0 %	40 %	525924688
62	NC_021838	TAAAA	2	10	69585	69594	80 %	20 %	0 %	0 %	525924689
63	NC_021838	AAGTT	2	10	72220	72229	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021838	TTCCA	2	10	73154	73163	20 %	40 %	0 %	40 %	525924693
65	NC_021838	TAATT	2	10	73953	73962	40 %	60 %	0 %	0 %	525924693
66	NC_021838	TCGTA	2	10	74209	74218	20 %	40 %	20 %	20 %	525924693
67	NC_021838	TTTTA	2	10	74277	74286	20 %	80 %	0 %	0 %	525924693
68	NC_021838	GTTCT	2	10	76268	76277	0 %	60 %	20 %	20 %	525924696
69	NC_021838	TATGA	2	10	76520	76529	40 %	40 %	20 %	0 %	525924696
70	NC_021838	TAATA	2	10	77146	77155	60 %	40 %	0 %	0 %	525924697
71	NC_021838	GAATG	2	10	78294	78303	40 %	20 %	40 %	0 %	525924699
72	NC_021838	AAAAT	2	10	80364	80373	80 %	20 %	0 %	0 %	525924702
73	NC_021838	ATTGA	2	10	80459	80468	40 %	40 %	20 %	0 %	525924702
74	NC_021838	ATCTG	2	10	81958	81967	20 %	40 %	20 %	20 %	525924703
75	NC_021838	GTTTC	2	10	84915	84924	0 %	60 %	20 %	20 %	525924705
76	NC_021838	GTAAA	2	10	85047	85056	60 %	20 %	20 %	0 %	525924705
77	NC_021838	CAAAC	2	10	88173	88182	60 %	0 %	0 %	40 %	525924709
78	NC_021838	CAACG	2	10	89584	89593	40 %	0 %	20 %	40 %	525924709
79	NC_021838	AAAAC	2	10	90078	90087	80 %	0 %	0 %	20 %	525924709
80	NC_021838	AATTT	2	10	90352	90361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021838	TGATG	2	10	90987	90996	20 %	40 %	40 %	0 %	525924711
82	NC_021838	ATATG	2	10	91874	91883	40 %	40 %	20 %	0 %	525924712
83	NC_021838	TCCAT	2	10	92905	92914	20 %	40 %	0 %	40 %	525924713
84	NC_021838	TAATA	2	10	94995	95004	60 %	40 %	0 %	0 %	525924716
85	NC_021838	TTATG	2	10	95683	95692	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021838	AAACT	2	10	96135	96144	60 %	20 %	0 %	20 %	525924717
87	NC_021838	AAACA	2	10	97899	97908	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_021838	TACGT	2	10	98728	98737	20 %	40 %	20 %	20 %	525924720
89	NC_021838	TCCAT	2	10	98936	98945	20 %	40 %	0 %	40 %	525924720
90	NC_021838	CATTT	2	10	103014	103023	20 %	60 %	0 %	20 %	525924724
91	NC_021838	TATTT	2	10	103741	103750	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021838	GGAAA	2	10	104209	104218	60 %	0 %	40 %	0 %	525924725
93	NC_021838	ACTTC	2	10	104539	104548	20 %	40 %	0 %	40 %	525924725
94	NC_021838	CAAAA	2	10	104846	104855	80 %	0 %	0 %	20 %	525924725
95	NC_021838	TATTT	2	10	105040	105049	20 %	80 %	0 %	0 %	525924726
96	NC_021838	GTAAT	2	10	105084	105093	40 %	40 %	20 %	0 %	525924726
97	NC_021838	TTTTC	2	10	107229	107238	0 %	80 %	0 %	20 %	525924728
98	NC_021838	TCCTC	2	10	108140	108149	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_021838	AATCA	2	10	108867	108876	60 %	20 %	0 %	20 %	525924730
100	NC_021838	ATAAC	2	10	111858	111867	60 %	20 %	0 %	20 %	525924734
101	NC_021838	AAAAT	2	10	114064	114073	80 %	20 %	0 %	0 %	525924737
102	NC_021838	ATTCC	2	10	114112	114121	20 %	40 %	0 %	40 %	525924737
103	NC_021838	ATACC	2	10	114356	114365	40 %	20 %	0 %	40 %	525924737
104	NC_021838	ATAAG	2	10	118187	118196	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021838	ATACC	2	10	121236	121245	40 %	20 %	0 %	40 %	525924745
106	NC_021838	CTTTT	2	10	122936	122945	0 %	80 %	0 %	20 %	525924747
107	NC_021838	GGATT	2	10	123201	123210	20 %	40 %	40 %	0 %	525924748
108	NC_021838	CTCTT	2	10	123706	123715	0 %	60 %	0 %	40 %	525924749
109	NC_021838	TAAAT	2	10	125082	125091	60 %	40 %	0 %	0 %	525924751
110	NC_021838	GTTTT	2	10	126770	126779	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021838	AACCC	2	10	127816	127825	40 %	0 %	0 %	60 %	525927196
112	NC_021838	ACTGA	2	10	129117	129126	40 %	20 %	20 %	20 %	525924752
113	NC_021838	ACCAA	2	10	130588	130597	60 %	0 %	0 %	40 %	525924752
114	NC_021838	TTCCA	2	10	132522	132531	20 %	40 %	0 %	40 %	525924753
115	NC_021838	ACGGC	2	10	138718	138727	20 %	0 %	40 %	40 %	525924757
116	NC_021838	TTTAG	2	10	140824	140833	20 %	60 %	20 %	0 %	525924758
117	NC_021838	AGAAA	2	10	142961	142970	80 %	0 %	20 %	0 %	525924761
118	NC_021838	CGACA	2	10	143251	143260	40 %	0 %	20 %	40 %	525924761
119	NC_021838	CGGTT	2	10	143331	143340	0 %	40 %	40 %	20 %	525924761
120	NC_021838	TTTGA	2	10	144185	144194	20 %	60 %	20 %	0 %	525924763
121	NC_021838	TTTCA	2	10	146084	146093	20 %	60 %	0 %	20 %	525924764
122	NC_021838	CACGT	2	10	146558	146567	20 %	20 %	20 %	40 %	525924764
123	NC_021838	ATTTT	2	10	147021	147030	20 %	80 %	0 %	0 %	525924764
124	NC_021838	AATTT	2	10	148471	148480	40 %	60 %	0 %	0 %	525924766
125	NC_021838	TAGTG	2	10	153238	153247	20 %	40 %	40 %	0 %	525924770
126	NC_021838	CTAAA	2	10	155335	155344	60 %	20 %	0 %	20 %	525924771
127	NC_021838	TTTCA	2	10	156687	156696	20 %	60 %	0 %	20 %	525924772
128	NC_021838	TTTTA	2	10	158210	158219	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021838	TTAAT	2	10	158262	158271	40 %	60 %	0 %	0 %	525924775
130	NC_021838	GTTTT	2	10	158546	158555	0 %	80 %	20 %	0 %	525924775
131	NC_021838	TTGTT	2	10	159231	159240	0 %	80 %	20 %	0 %	525924775
132	NC_021838	TTGCC	2	10	160192	160201	0 %	40 %	20 %	40 %	525924776
133	NC_021838	TAACT	2	10	162830	162839	40 %	40 %	0 %	20 %	525927197
134	NC_021838	CCCGC	2	10	163517	163526	0 %	0 %	20 %	80 %	525924778
135	NC_021838	CTTTT	2	10	164357	164366	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_021838	AATCA	2	10	165766	165775	60 %	20 %	0 %	20 %	525924780
137	NC_021838	GTTTC	2	10	166299	166308	0 %	60 %	20 %	20 %	525924780
138	NC_021838	TCATA	2	10	170652	170661	40 %	40 %	0 %	20 %	525924784
139	NC_021838	CTTTT	2	10	170938	170947	0 %	80 %	0 %	20 %	525924784
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244	NC_021838	GATAT	2	10	323840	323849	40 %	40 %	20 %	0 %	525927248
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249	NC_021838	AATTA	2	10	330528	330537	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_021838	TAAGA	2	10	330952	330961	60 %	20 %	20 %	0 %	525924903
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252	NC_021838	CAAGG	2	10	334954	334963	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
253	NC_021838	GAAAA	2	10	334985	334994	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_021838	GTTCG	2	10	335134	335143	0 %	40 %	40 %	20 %	525927249
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256	NC_021838	TTTTC	2	10	341257	341266	0 %	80 %	0 %	20 %	525927253
257	NC_021838	CTGTT	2	10	344372	344381	0 %	60 %	20 %	20 %	525927253
258	NC_021838	AATAT	2	10	344929	344938	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021838	TGGAT	2	10	345221	345230	20 %	40 %	40 %	0 %	525927254
260	NC_021838	AAACG	2	10	347936	347945	60 %	0 %	20 %	20 %	525924910
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267	NC_021838	GTTAA	2	10	353896	353905	40 %	40 %	20 %	0 %	525924917
268	NC_021838	GAAGA	2	10	354434	354443	60 %	0 %	40 %	0 %	525924917
269	NC_021838	AAACT	2	10	356250	356259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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